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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000041_pilon:843600..848396+ Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_040602 ID=XLOC_040602|Name=XLOC_040602|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=4797bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000041_pilon:843600..848396+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAAACCACAAGTTCCTTGGAAAAGTTGCTTCAATTCGTGGAATACACC
TAATTGTAGAGAAGATAACCATAAACCGAGTTAGTGTTTGCCAGAAACTG
TTAGAGTTAAGATACACAAATCAACTACATATCACATTTCTCACGATAGC
TCCTCATTTTCAGCTTAACAGCTTGATTTTGTTCACTAAAGTTCCTTGGT
TTACTATAAAATTGTTAtcaattttagatattttaacaaTGTTTTCCTTT
ATCCTGGGACTTACGCGTTATATATATTAGTTTTCTTGACTGATCTTGAC
CTGTCCATCCTGAATTCCCACACTTcttaatttacttttattttcaaaga
gcTTGAGTGGTCATGCCCTTCCAGCAATGGTACTTGGTACAATTACACAG
TGGCCACACTTCCCAAGAACTCGTCATTGTGCAACAAATTCCTGGTCCAC
GAGCCAACCTCGCCCAGTATTGAATTCTGGGAACGTCGTGTTCTGCAAAT
TACAAATGGACTGGATGAAAGCGGTGATGTTCAGTATGAATTGTTGATTT
GTTTGGTGGTTGCTTGGATACTTGTTTTCGTGTGTTTGTTCAAAGGAATC
AAAACATCCGGCAAGGTATTTTAGCCTATTTTATCCACTTTGTGCAAAAT
CGCGTCGTTAATACGTCGAAATATCCTAAAGCCACGTATACTTTTTGcaa
tagttttattttattctttagGTTTCAAAACTTGATAAAGCggggggggt
tagaataaaaatttcctgggtgggtgtaaaatttttgaaaaggagactaa
tacagcagaataattataaagaaatatatttCATCAAATTGTTTGGTTTT
TTATACCTATTTATCGCTATTTCCTCTGCAATGAAATACACACCTATGAG
AATTAAATCGCTGATTCACTGTGATAATCATTGAGTCGGGATTTGAGACA
GAAATACTGGGTCGTCCCAGCTGTGCTCCTCCgtcaaaaagaaagtaaaa
atacTTGGAAAATATAATAATATGTGCGCTCTTTCTCCTTTTCAGGTGGT
ATATTTTACAGCAACATTCCCTTACATAGTAATGTTTATTCTCCTTATTC
GTGGCGCCATTTTGGAAGGAGCATCCGAGGGTATCAAATACTACCTGATG
CCTTCATTTGATAAACTGAAAGATGCCAAAGTGTGGGTGGCTGCTGCAAC
TCAAATCTTCTACTCCCTTGGGATTGGTTTTGGTTCGTTGATCGCTTTTG
GAAGTTACAACAAAGTCAATAATAATATTGTGAGGTAAAAAGTTCATCTC
TGCTACTGCTACTGTAATATCCtttatcccgcatcagtaagattctagtg
atttcattggtcaaaagacatcacgtggaggtgggatataaACCGTATCC
TGTCTTCTTCgcgttcgattgagaaaaaaagaagacattgcatattgacg
aatgcgctttcgaatgttttgttttgaaaagacttgaaatcgaaattgaa
atggTCGGGGTTGAGAAAGTCAACAAACAGGAAATCTTtgaagttatttt
gatttttacttttcttgagtTTATATGGATACAACAAGACTTTTAATTGC
GATGTTATAAAATGTCACTCTCACGGATCCCACAAACTCggcaagcctcg
ccaccaatacagtttttactgaccctgtatatcccgtatcccacctcgag
aagaccgtgtaactaatattATCCCGCATCAGTGAGATTCTaacgatttc
attggtcaaaagacatcacgtggaggtgggatatgTACCGTATCTGTCTT
CCTCACGTTCgattaagaaaaaaaagaagacattgcatattgacgaatgt
gctttcgaatgttttgatcaagattcgaatgttttgttttgaaaagactt
gaaatcgaaattgaaatggTCGGGGTTGAGAAAgtcaacaaacaaaaaat
cttcagttattttgatttttacttttcttgagtTTAATGGATACAGCAAG
ATTTTTAATTGCGATGttataaaatgtaactttcacGGATCTCCCTTTCA
CTGTTTGATTTACTTTGTAGCTCTTTGTTGATGTAAGTATTTACTTGGAT
TTTTTCGTGGTTTTGGAAAAGATGCAAGGgacttcaacgggataaatcCG
TTGCACGCGGTCGTCTCGAGaagcctcgccaccaatacggttttactgac
cctatatatcccgtatcccacctcgagaagaccgtgtaactaatagaATT
CTTTACCTTTTCACCCAAGAAATAGTGAAAACTTAACATGTACTTAAAAG
ACGAACTTAATTAAGCGATTCCTTTATTTTCAACTTGTACATTTTTGAAG
TCTGgcgataaattttattttcaatccggcAAATTGTCCCCATCAAGAAA
GCAAGAAAGAAGTTTCTAGCTTGTGGCCgaagtcaaagaaaaaaaatgta
ttagTACAAGTTTTGCCAGAAGCTAAGCTCACTCATACATTGATTATTAC
CATTTAAGTAATTCGACCGTGAGGTGCTTGTTCGAGGAAGTACGGTAATT
CTAAATATAAAGAACTTGCGTTTACGAGGGAATGACCCAAAGTTTAAATT
AACCTTTCTCTTCATTTCATTTCAGAGATGCGATCGCTCTTTCATTGACG
AATTGTATGACGTCAGTGTTCGCTGGTTTTGTTGTATTCAGTGTTCTTGG
TCACATGGCGCATAAAAGCAAGCTCTCCATACAAAAAGTCGCAACCCAAG
GTATATTACACCTCAACCCCTTATTCGTGCAGCTCAAGAATCTATCTAAT
CTACCTGAACATACTTGGACAAGTAATGGTcgaatgatatttttttaaag
atacatcCGATTCAAGTATATACCGAGACTCGTAGCTTTATAGAGTGTAA
TTTCCAAGACCATATACTTGGACAAGTATTAGTCgaatgatattttttaa
aagatacatCTGATTTAAGTATATACCGAGACTCGTAGCTTTATAGAGTG
TAATTTCCAAGATCTGCAAAAGGTTAATCCAGagactttaaattcaaaat
ttaagaattttcaaagcaaCTTTAGATTTAAAATCAGACAATAACACAAc
atattgattttttgtttcaggACCTGGCTTGATATTCGTGGTTTATCCAG
AAGGCCTAGCCCAGATGCCAGTCTCCACTCTGTGGGGCGTCTTATTTTTC
TTCATGATCCTGATGATCGGGTTAGATACGCAGTTCGCCATGCTAGAGGC
TGTCATTGTTGGCCTGTCTGATGAATACAAAGTACTGCGTCAGCATAAAA
CTACTTTCATTTTCGTCATTTGTTTATTAGCTTTGTTATTTGGCATCTCC
ATGGTTACTCAGGTACGTTTCATTATACATCCAATTTACTCTCTTTTATT
CAAATCTTCAAAGACCAGGAATTTTCCTTAAAAGGTAAAAAGACATAAGT
TACGTACACTTCATCACTTCATTATGTCAGCTAAAATTACTGACCTAACC
TAAACAGGGGTGTGAACCTAAACAGGGGTGTGATTAGCTGTAGTTTTTTA
AAACCGGGTGAAAAAGAGTCTTCAATGAATTAGTTTATCAAGTGATGGGA
GATTAACATCTCAGCTAACTTTGCATTTTTCAGGGCTAAAGAATACTGTT
CTAGGACACTGCtgttcaagttttattttttaaagtgtAGACAAATTAGT
ATATCAAGCGATGTTAAAATTAAAACTCTGCTCCAAATCAAGCATTCTaa
attaaatttatatttttcagggtggtatgtacatcttcaacattttcaac
tggCAATCAGGGGGCGTTTCCCTTCTCATTCTGGCTTTCATAGAAGTTTG
TGCTATATCTTACGGATACGGAGCCGATAGGTTTGAAAAAGACTTGGAGT
TAATCCTGGGAAGAAAACCGTCCCGTTGGTGGAAGATTTGTTGGAAATAT
CTTTCGCCTTTTGTGATCTTGGCAACGTTGATTTCAAGCTTGGTGCAATG
GAAGGGAATCACTCCTTAGATTCTTAGGTCAAGATTACAGCTCtcactat
tttctttttagctGGGAGGATTATTTCTTATGGACCCTTACTTCAACGAA
AATCATTTACGATCAATTTTGCTGGTTTTTGTAAAACCTTGTACCTTTAG
CCTTTCtaTtgaaCgatATGAattttatgaTAGCCCAATGTATTTAGTGG
TCTTACAGTAATGTAGCTTTTTGGATTTACATATAGAATATACAGTAgtg
tttctttaactcgaacctctgttactcgaatgcctccttaactcgaacaa
gttgtCTCGTCCTTcaattaacaatgccttatataTCTTATTCAATAAAT
GGAAATTtgcttaactcaaacaagtttatATTCGTGCgtgttcaagttaa
ggagactccactgtacattaaagtctctttaactcgaatttctataactc
gaatttctccataacttgaactaattaacaatgccttataaaccctactc
cataactcgaaatttcctaaactcgaacaaatttgtgttccccgtgcggg
tttgagttatggagattccatTTGTACCATCTTTTTCAGTTATCCAGTGT
ACGGTGAAGTTATCGGATGGTTCCTCGCCCTAACATCAGTCATTTGGATT
CCACTCGTCGCTctctataaaatgaaattctctgCTTCTGGTTCAATATG
TAATCGTTTACGTCATCTTTTAACACCCAATATGGCGGAATTGCGTCAGG
TTGCCCTGGACAATGGTTTGAATACAAGTTTTGATGCAAATGCTTGA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000041_pilon:843600..848396+ >XLOC_040602 ID=XLOC_040602|Name=XLOC_040602|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2832bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000041_pilon:843600..848396+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAAACCACAAGTTCCTTGGAAAAGTTGCTTCAATTCGTGGAATACACC
TAATTGTAGAGAAGATAACCATAAACCGAATGAAACCACAAGTTCCTTGG
AAAAGTTGCTTCAATTCGTGGAATACACCTAATTGTAGAGAAGATAACCA
TAAACCGAagcTTGAGTGGTCATGCCCTTCCAGCAATGGTACTTGGTACA
ATTACACAGTGGCCACACTTCCCAAGAACTCGTCATTGTGCAACAAATTC
CTGGTCCACGAGCCAACCTCGCCCAGTATTGAATTCTGGGAACGTCGTGT
TCTGCAAATTACAAATGGACTGGATGAAAGCGGTGATGTTCAGTATGAAT
TGTTGATTTGTTTGGTGGTTGCTTGGATACTTGTTTTCGTGTGTTTGTTC
AAAGGAATCAAAACATCCGGCAAGagcTTGAGTGGTCATGCCCTTCCAGC
AATGGTACTTGGTACAATTACACAGTGGCCACACTTCCCAAGAACTCGTC
ATTGTGCAACAAATTCCTGGTCCACGAGCCAACCTCGCCCAGTATTGAAT
TCTGGGAACGTCGTGTTCTGCAAATTACAAATGGACTGGATGAAAGCGGT
GATGTTCAGTATGAATTGTTGATTTGTTTGGTGGTTGCTTGGATACTTGT
TTTCGTGTGTTTGTTCAAAGGAATCAAAACATCCGGCAAGGTGGTATATT
TTACAGCAACATTCCCTTACATAGTAATGTTTATTCTCCTTATTCGTGGC
GCCATTTTGGAAGGAGCATCCGAGGGTATCAAATACTACCTGATGCCTTC
ATTTGATAAACTGAAAGATGCCAAAGTGTGGGTGGCTGCTGCAACTCAAA
TCTTCTACTCCCTTGGGATTGGTTTTGGTTCGTTGATCGCTTTTGGAAGT
TACAACAAAGTCAATAATAATATTGTGAGGTGGTATATTTTACAGCAACA
TTCCCTTACATAGTAATGTTTATTCTCCTTATTCGTGGCGCCATTTTGGA
AGGAGCATCCGAGGGTATCAAATACTACCTGATGCCTTCATTTGATAAAC
TGAAAGATGCCAAAGTGTGGGTGGCTGCTGCAACTCAAATCTTCTACTCC
CTTGGGATTGGTTTTGGTTCGTTGATCGCTTTTGGAAGTTACAACAAAGT
CAATAATAATATTGTGAGAGATGCGATCGCTCTTTCATTGACGAATTGTA
TGACGTCAGTGTTCGCTGGTTTTGTTGTATTCAGTGTTCTTGGTCACATG
GCGCATAAAAGCAAGCTCTCCATACAAAAAGTCGCAACCCAAGAGATGCG
ATCGCTCTTTCATTGACGAATTGTATGACGTCAGTGTTCGCTGGTTTTGT
TGTATTCAGTGTTCTTGGTCACATGGCGCATAAAAGCAAGCTCTCCATAC
AAAAAGTCGCAACCCAAGgACCTGGCTTGATATTCGTGGTTTATCCAGAA
GGCCTAGCCCAGATGCCAGTCTCCACTCTGTGGGGCGTCTTATTTTTCTT
CATGATCCTGATGATCGGGTTAGATACGCAGTTCGCCATGCTAGAGGCTG
TCATTGTTGGCCTGTCTGATGAATACAAAGTACTGCGTCAGCATAAAACT
ACTTTCATTTTCGTCATTTGTTTATTAGCTTTGTTATTTGGCATCTCCAT
GGTTACTCAGgACCTGGCTTGATATTCGTGGTTTATCCAGAAGGCCTAGC
CCAGATGCCAGTCTCCACTCTGTGGGGCGTCTTATTTTTCTTCATGATCC
TGATGATCGGGTTAGATACGCAGTTCGCCATGCTAGAGGCTGTCATTGTT
GGCCTGTCTGATGAATACAAAGTACTGCGTCAGCATAAAACTACTTTCAT
TTTCGTCATTTGTTTATTAGCTTTGTTATTTGGCATCTCCATGGTTACTC
AGggtggtatgtacatcttcaacattttcaactggCAATCAGGGGGCGTT
TCCCTTCTCATTCTGGCTTTCATAGAAGTTTGTGCTATATCTTACGGATA
CGGAGCCGATAGGTTTGAAAAAGACTTGGAGTTAATCCTGGGAAGAAAAC
CGTCCCGTTGGTGGAAGATTTGTTGGAAATATCTTTCGCCTTTTGTGATC
TTGGCAACGTTGATTTCAAGCTTGGTGCAATGGAAGGGAATCACTCCTTA
GATTCTTAGggtggtatgtacatcttcaacattttcaactggCAATCAGG
GGGCGTTTCCCTTCTCATTCTGGCTTTCATAGAAGTTTGTGCTATATCTT
ACGGATACGGAGCCGATAGGTTTGAAAAAGACTTGGAGTTAATCCTGGGA
AGAAAACCGTCCCGTTGGTGGAAGATTTGTTGGAAATATCTTTCGCCTTT
TGTGATCTTGGCAACGTTGATTTCAAGCTTGGTGCAATGGAAGGGAATCA
CTCCTTAGATTCTTAGTTATCCAGTGTACGGTGAAGTTATCGGATGGTTC
CTCGCCCTAACATCAGTCATTTGGATTCCACTCGTCGCTctctataaaat
gaaattctctgCTTCTGGTTCAATATGTAATCGTTTACGTCATCTTTTAA
CACCCAATATGGCGGAATTGCGTCAGGTTGCCCTGGACAATGGTTTGAAT
ACAAGTTTTGATGCAAATGCTTGATTATCCAGTGTACGGTGAAGTTATCG
GATGGTTCCTCGCCCTAACATCAGTCATTTGGATTCCACTCGTCGCTctc
tataaaatgaaattctctgCTTCTGGTTCAATATGTAATCGTTTACGTCA
TCTTTTAACACCCAATATGGCGGAATTGCGTCAGGTTGCCCTGGACAATG
GTTTGAATACAAGTTTTGATGCAAATGCTTGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000041_pilon | genome | sc0000041_pilon:843600..848396 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 1210-1416:4591 |
| Aaloc | 952-1206:3771 |
| Aaloc | 712-951:3123 |
| Aaloc | 586-708:2627 |
| Aaloc | 346-582:1046 |
| Aaloc | 82-345:352 |
| Aaloc | 1-78:1 |
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