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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000044_pilon:424262..428944+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_040502 ID=XLOC_040502|Name=XLOC_040502|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=4683bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000044_pilon:424262..428944+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGTTTGGAAGCTATTGGTAAGTATCAACTCTGCGTCACATTTACATTT
TAggatctacacgtttttttataagattgtacaatttttttttaaaaaac
gtgtacattgaatttcaaacatttcaaaGTTTGTGCCTATGATCATACAT
CTCTTTCCAAGTGGCCcgatgaaatctttttttacgTAATTTTCAGCATT
TCTTTCAGTGTAAATGACGAGAATCGGTTTcagtttgaaaatggaaataa
aatttcagggtattATTAATTTTTCACAGGAGAAAAGTAGAGAaattttg
cctgaattttgattaattgattatgatttagaattatttaagaatgtttt
ttaaCGCTCAAAATACACGCTTCTCGAGATAAATCAACAGCATGCcgggc
ctcgttttcaaatgaaataattaCTTCAAACAGCAACATTTACGTATGTA
ATATGTTTCCTAAAAAAcctttttcgattttgacaCAAAACCGTAGACAC
TTGCAAACATTAATCGTATCTGACGATGTTGAAGTATCGTAGAAGAAAGT
CTTTGAGAACGAGTAGGCTCGCAATTATTTCATACatttcgagaagagtg
tattattGCTAAATTTTAAGAATCACGAGACTCATTCCTATCTATGTAAC
CTGATAAGagctggtcataattttcttacggagctttagcgtggtgggca
gataaaacaatcacaatctgatctcaggttaaatTTATGTACTTATTACT
AACTTACTTAAACAAAAACTATCTGTTTGAATCTTGTTTAGATTACCGTT
GCTTTAATTTTTGTGACGTTTTCTGACGCAAGTTTTGAGATTCATGCATC
TCATGGTAACCTTGAAATCAAGACAATTGGACAAAACGGTGAAGTCACTC
ATTATGAGAAAATTCATGACAACAACAATGAAAATGTACGTACATGAATT
TATTAATTTATCCTAGCCCGGGGGATTAGACgggagtctacttctggctg
aactttgctttctaataatttttgatgacgctagtccagtgaagtagact
aggagcatctGACGAGGAtgccattttgagaaaaaaatacttaaaatcca
aataacaaaaaagctgcttgaagttgaaaaatataattaagaatgagaaa
caaacatcaataatagattttgaattccttattttcaaataaaaacattg
cttcattctttttttcctGGCGTAAGGGCGGTgcaagcaaaagcatatta
ccgggtcacttaatcgcgccatccagtctataaaaaaactttaagtggAC
CCTTGGCTAGGGTgcgtgggtttaccaactgacgggtatgtgcggcggat
AAATTAGCTTTTAAAATCGTCAATCATACTCTTACAGtgtatttttctca
aatctttaaatctcaaaattttctgcAAAGATTTGCTGAAAATTCCACCC
TTACTGTGTATCGTTGCTGCTACAAAACATTAATAATATGTCCATTTAAC
GTTCAACCAACGTTGTGCTCCAGTTGGAGTTCTCTTATTCTAGAATACAT
AGGATACAAATTCACTACACTGAAATGAGTCATCCTGAAATAAAGTTAAA
TATGTCGAATACTCTATAAAGATTAGAAATACGATATCAATAAACTTTGa
aagttgacactctctaattctaTAAAGCTCACCAAGCCAAACGCtgtgac
tcaaatttgtttatcaggccTTTTGCCcccctactacaggccttagaaca
atcgctcattttgctatccgatcacaaGCTTAACAAATatcaaacaagac
gacttgaagtcgaaaatttcgcctagaacttaaactacataggaaaaaca
agaagttaagattgaagccaatttgaaatcttctttacatcgagccttga
tgaaacaattttacaagaacaacgaggcttaaaatcgctaaaaaaaaaaa
gagagaccaatttaagaacaattgttgtttaatttttaagaactaataaa
caaaggtaatatcaccgtctattaaaagttattgatttgattcttataaa
gtaaatgcttataagaaaaatgattaTGCTCATAATGtgtgccgtccctt
gtttactttgtaagaactaattaccgaaaggtatagcaccgtctatcaag
agttattgatttgattcttataaagtatatgcttataagaaaaatgaata
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aaaggtatatcaccgtctatcaagatgtattgatttgattcttataaagt
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ttactttgtaagaactaattaccgaaaggtatatcaccgtctatcaagag
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atgcttataagaaaaataaatatgcacaTATTGTGCTCcattctttgttt
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cgcaaaaatcgtccgtggttatacgagcgtgtaatttgtaaattaaattt
actttcgctatgcgaaattaacaaGTCACTATAATTCAACATTTTATAAT
TTAGAAGCCCTCGTCAAGTTCCTTGAACTTTCCTCGCTATACAGTACAAA
GGCTaatctttcaaatcaaatttggaaatttttggaGACCAACTTTTCCG
TAAATAGTTTATACAATGTCAATTAACTAATTTCATCATGATTTGTTTTC
TTACATAGATCTATGCTCCACAAAAAAGAGCATTACCAGCCCACAAATCT
TTTCATTATGCTTCAATGGTGAATATGGTGAGAAGATCAAAACGACATAA
TATTGTCGATAGTTGCACTATCTCTACAATCAACCAAGATATTTTCGTTA
ACAAGTGCAATGCAACGATCTATAACTTGAAGGTGGGTTGCTTCCTTGTG
AAGCAAATGATACACcctatctcacagccccggtggagctttttcccaca
gtggggataaagatttatattgaaatctcaatgggaaTGAAAATTATGTT
GTTCCAAGGCTAAAATATCCAGTGGAATGGTTTTAAAgtgcaattttaaa
acattGTCGAAATTCGAAAGAGAATgaaatcaatttcaatttcccaGTAA
AAGTGAAATCCTAGagtattttaaagttttgccaaatttgCCATCAGTGG
TTCTGGGAACCAAGCGAGTCTGTGCCATTGAGAATTCATTGCTCATTTAA
GACATCCCTGTTACCTGGTGAAAATTGGGGTGAATAAAAGGCACTGGCAG
ATTTAAGACAATacatagagcaagtacgtcggaaacatgcgaaggagtgc
aacgctcgttaaaaaaatgaaattaccatTAATCAAATCTCTTCATCTGA
TAAATTCGACgaggtctaaaaccgcctatgaaaGGAGTGCTAAATGTCAA
TAGGGTTGAAACATTTTTGGTTTTGATGGATTGGGATTCACAAAATTTAG
CTTTTTATAACTaaaaaaaGTtagttgctgattttttttttcaacttgga
TGAGAACTGCGATTCTCCTATGTGGTGGATTCATAACTTTTACCGATTCT
TTCATGGTCACACCAAGTTTTGAAACAGGGTTGTTTAGCTTCCTTGgaaa
ttattaatttttgaaacatccccttttcacagacccggtaggattcttTT
AGCCGATGAGGATAAAAATTACGGACTTGGGGATTGATATTATTTATGGC
Aggagatttcaatttttttgtcttcaagtcagaaaattcagtggggatgg
gaaaaatgataaaaattttgcagtgagggttggtttatttcattatttta
agtGGGGAGAAAAATTGGAGTatgattttccactggggacgataatttgg
ctaatttttccagtgggaagggatcccagtgggtctgtgaaaagggagTG
TTTTGAATATAGCAGTTGCAAAGACGTAGAGGAGGGCACCACTTCTTTCC
CTGGATTTTTCAACTTATCTTGACACTTTTCTTAGTTACtgcccagctga
cacacaacgttggtTCGACGCCCacctaatgttcacaacgtctatataac
gttagatgaacgttgaaacaacgttgtgtgccagctgggtgaaCATAATT
TTTCATCACTAGGTTTGCTCTGGTAGTTGCCCAGCAAATGAAACAGATTA
CTTTGGATGTCGGATGTCAGGCTCACGAGAGTTAGAGGTCGATCTCCATT
GTCCTGATTCAACCACAATCAAACCGAGTATTATGGTCAAAGATGCAAGT
CATTGCGAATgcaagaaattgccaaaattctAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000044_pilon:424262..428944+ >XLOC_040502 ID=XLOC_040502|Name=XLOC_040502|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1014bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000044_pilon:424262..428944+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGTTTGGAAGCTATTGATGGTTTGGAAGCTATTGATTACCGTTGCTTT
AATTTTTGTGACGTTTTCTGACGCAAGTTTTGAGATTCATGCATCTCATG
GTAACCTTGAAATCAAGACAATTGGACAAAACGGTGAAGTCACTCATTAT
GAGAAAATTCATGACAACAACAATGAAAATATTACCGTTGCTTTAATTTT
TGTGACGTTTTCTGACGCAAGTTTTGAGATTCATGCATCTCATGGTAACC
TTGAAATCAAGACAATTGGACAAAACGGTGAAGTCACTCATTATGAGAAA
ATTCATGACAACAACAATGAAAATATCTATGCTCCACAAAAAAGAGCATT
ACCAGCCCACAAATCTTTTCATTATGCTTCAATGGTGAATATGGTGAGAA
GATCAAAACGACATAATATTGTCGATAGTTGCACTATCTCTACAATCAAC
CAAGATATTTTCGTTAACAAGTGCAATGCAACGATCTATAACTTGAAGAT
CTATGCTCCACAAAAAAGAGCATTACCAGCCCACAAATCTTTTCATTATG
CTTCAATGGTGAATATGGTGAGAAGATCAAAACGACATAATATTGTCGAT
AGTTGCACTATCTCTACAATCAACCAAGATATTTTCGTTAACAAGTGCAA
TGCAACGATCTATAACTTGAAGGTTTGCTCTGGTAGTTGCCCAGCAAATG
AAACAGATTACTTTGGATGTCGGATGTCAGGCTCACGAGAGTTAGAGGTC
GATCTCCATTGTCCTGATTCAACCACAATCAAACCGAGTATTATGGTCAA
AGATGCAAGTCATTGCGAATgcaagaaattgccaaaattctAAGTTTGCT
CTGGTAGTTGCCCAGCAAATGAAACAGATTACTTTGGATGTCGGATGTCA
GGCTCACGAGAGTTAGAGGTCGATCTCCATTGTCCTGATTCAACCACAAT
CAAACCGAGTATTATGGTCAAAGATGCAAGTCATTGCGAATgcaagaaat
tgccaaaattctAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000044_pilon | genome | sc0000044_pilon:424262..428944 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 337-507:4513 |
| Aaloc | 163-336:3109 |
| Aaloc | 19-162:792 |
| Aaloc | 1-18:1 |
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