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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000125_pilon:291653..294499- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_040497 ID=XLOC_040497|Name=XLOC_040497|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=2847bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000125_pilon:291653..294499- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
AATGTCAGCCCAAGTGACAAAATCCCACTTTATGAGGGCGAAGACACCCA
TAAAGGGAGAGCAATGCCAGAATGCAGTCACACGTTTTTATACTACTTTA
AAAAGATTTGTTATACACATTTACCAATACTGACCTGGCTTCCAAAATAT
AATTTACATAATTTACAATGTGATCTTATTGCTGGGATAACAGTTGGTTT
GATGGTTGTACCTCAAGCATTAGCATATGCTTCCATTGCTAGATTAAGTA
ATGAGTATGGTTTGTTTTCTTCATTCATTGGAGTTTTTGTTTACACTCTG
TTTGGGACATCAAAAGATGTCACTATTGGTCCTACAGCTATTTTATCATT
GATGACCGCTAGTTATAATGTTCCTCATTGTGTTGACACTGCAGTTGTTT
TATCGCTTTATGTTGGTATTATTTTACTATTGATGGGCATTTTTCGACTT
GGTTTTCTGGTGAGATTTGTATCTGTTCCTGTTATTTCAGCGTTTACATC
AGCTGCAGCTCTGACCATAGCTTGTGGTCAATTAAAAGATTGGAATGGCT
TGGAACACGTCCCTAGAGACTTCTTTGGTAACTTAACCTATATTTTTAAA
CACATTAAGGAATGGAATACCTATGATTTAGTGTATGGTTTAGTATGTGT
TGTAGTTTTATGTTTGATGAGGCTGTTGCCACGTTTGAATCGCGTGCAAG
AAGACACACCAAGCTATTCACGCCTTCTTCGAAAAGTTGCTTGGTTCTGT
GGTATTGGTAAAAATGCAATCGTGGTCATTTTTTCGTGCCTACTGATGTA
CATCTTCTCAATCTACAAAATCAATCATGATTTCACCCTTATTGAAAATA
TCAATGCTGGTTTACCACCTTTCAAAGTAAGTGTCATATACAGATTTTCA
TTATTATTATTTTTTTTTTTTAGAAAAAGTCAAAAGAAATGCTTTACTTC
ATGAAGCCTAATAACACTTTGCCATTGCTCATATGCAATTGTGTCTTTTA
AATATGAGCATTTTACGCCCTTTTCTCAGATCTCCCTCTCCCGGCCCCCT
GAATCTTTCTTAGTCTATCAGAATCCATCATTACCTTTGATTTTTCATCA
CTTTTAAGGTTTTATTGATTATTTATTCAGGGGGTGTATTGTATTCATTT
CTTTGGTTTACCCTCTAGTAAGACGACAAAGCATTAACAATTAAGATACC
CACTAGCTTACTCCTTTGTTTACTTTTAGCCACCAGTGTTTCCCTTACAT
TGTGATATCAACAAGACGATCATAGATGATGATTTACCTCAATCAATATC
AGTTGTATCCTTCACAGAAAGCGTTAAATATTTCAGTACTGGCCTAGCTG
TCATTCCTTTACTAGCATTTATGGAAGCAATGGCTATTGGGAAAGGTAAG
GCAGTTTTATTTATTACTGAATTTTGACAAGTGTATGTTCTTCTTTGATA
AAAGATGTTGATTTCACCCTTACACTAAAAACAACAAAAACTATAACTCT
GTAAAATATACCCTCAAAAAAACAAAGACAAAAAACTCTCAGACATGAAC
TGATTGAAACTTTTATATTTATAATCTTCATAGCATTTGGTCGTATAAAC
AATTACAAGATCATACCAACACAAGAGTTGGTTGCTTTAGGGGTGGCAAA
CCTGGCTGGTTGTTTTGTTTCAGCCTATCCAGTCACCGGTAGTTTTTCCA
GGACAGCAGTCAATTCTCAAAGTGGTGTCAAAACTCCTTTGTCTGGTAAG
TGGCGATTGGAGGCCCTTTTTGAGTATGAGTAATAATGGAAAGGACAAAT
TGTATAATCATGTTAAACAATAATCCCGTTACGATTATTGTATAACATTG
AGTCTGAAGCCCGATTGGCTAGAGTAGATTCTCTAAACGCGTCTAGGACA
CGCCGCAATCATGACGACGGATTGTATCTAGCGGTTCCTTTGTTTTTGAG
GACTCCATTTTTTGAAATCTAGCGATAGATTTATTTTTCAATCCGGCGTT
TGTGTAGAATAACGCGCGGGCGTTCTGGATGGGAAATACTAGTGGCCTCA
TTTCCCATCCAGGAGTCTCAAGTCTAGCAGTTCGGGCTTGGAAATCAATG
TCGTATAATCATTTAGCACCTGCTGTGCATTAAATGACCCCAGTTTAAAA
ATAAGAGTTTCATAAAATTACTTCTTTTTGAACTCTGTATTTTCTTTTTC
TAATAGGTATATTCTCTGGTACCATCGTTGTGCTTGCTACACAATATCTG
ACGCAGTATTTCCACTACATTCCGAAAGCATGTCTTGGATCCGTCATTAT
TTGCGCAGTCATCAACATGGTAGATCTAAACATAGTTCGATCCATATGGA
AAGTCAACAAAATCGACCTCATCCCATACACAATCACTTTCTTAGCCTGT
TTTTACACACTTGAAACAGGTTTGATCCTTGGTATTGCATCCAGTCTAAT
CTTATTATTAAAATCAAGCGTCAGCCCACCATTACGCGTAGAACAAGGCG
ATGTGCAGGTCATCACAGTTCAAAACGGAGTCTTGTATCCTGGCATTGAG
AAAATAGTAAACAAAGTTGACGAATTGTTTAGCCTGAGTTCCTTACCCTC
TGCTATTGTGTTAGACTTGAAAAATGTTGTTGAAATTGATTACACAGTAG
CTGCAGAGCTTCACGAGCTTGTCTTGCAGTTGAGAAAATGTGTGAAACAA
GACACCGATTTTTGGATTATCAATGCTAATTTTCAAGTGAAGAAAATTTT
GTTGTTGTCTAATATGCAAGACACTTTGACAACTTGGGAACATTTGCAAG
AGAGCTATGCTGGTGCACGGAGGAACTCCCTTCCTTCAATGACATGA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000125_pilon:291653..294499- >XLOC_040497 ID=XLOC_040497|Name=XLOC_040497|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3690bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000125_pilon:291653..294499- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
AATGTCAGCCCAAGTGACAAAATCCCACTTTATGAGGGCGAAGACACCCA
TAAAGGGAGAGCAATGCCAGAATGCAGTCACACGTTTTTATACTACTTTA
AAAAGATTTGTTATACACATTTACCAATACTGACCTGGCTTCCAAAATAT
AATTTACATAATTTACAATGTGATCTTATTGCTGGGATAACAGTTGGTTT
GATGGTTGTACCTCAAGCATTAGCATATGCTTCCATTGCTAGATTAAGTA
ATGAGTATGGTTTGTTTTCTTCATTCATTGGAGTTTTTGTTTACACTCTG
TTTGGGACATCAAAAGATGTCACTATTGGTCCTACAGCTATTTTATCATT
GATGACCGCTAGTTATAATGTTCCTCATTGTGTTGACACTGCAGTTGTTT
TATCGCTTTATGTTGGTATTATTTTACTATTGATGGGCATTTTTCGACTT
GGTTTTCTGGTGAGATTTGTATCTGTTCCTGTTATTTCAGCGTTTACATC
AGCTGCAGCTCTGACCATAGCTTGTGGTCAATTAAAAGATTGGAATGGCT
TGGAACACGTCCCTAGAGACTTCTTTGGTAACTTAACCTATATTTTTAAA
CACATTAAGGAATGGAATACCTATGATTTAGTGTATGGTTTAGTATGTGT
TGTAGTTTTATGTTTGATGAGGCTGTTGCCACGTTTGAATCGCGTGCAAG
AAGACACACCAAGCTATTCACGCCTTCTTCGAAAAGTTGCTTGGTTCTGT
GGTATTGGTAAAAATGCAATCGTGGTCATTTTTTCGTGCCTACTGATGTA
CATCTTCTCAATCTACAAAATCAATCATGATTTCACCCTTATTGAAAATA
TCAATGCTGGTTTACCACCTTTCAAAAATGTCAGCCCAAGTGACAAAATC
CCACTTTATGAGGGCGAAGACACCCATAAAGGGAGAGCAATGCCAGAATG
CAGTCACACGTTTTTATACTACTTTAAAAAGATTTGTTATACACATTTAC
CAATACTGACCTGGCTTCCAAAATATAATTTACATAATTTACAATGTGAT
CTTATTGCTGGGATAACAGTTGGTTTGATGGTTGTACCTCAAGCATTAGC
ATATGCTTCCATTGCTAGATTAAGTAATGAGTATGGTTTGTTTTCTTCAT
TCATTGGAGTTTTTGTTTACACTCTGTTTGGGACATCAAAAGATGTCACT
ATTGGTCCTACAGCTATTTTATCATTGATGACCGCTAGTTATAATGTTCC
TCATTGTGTTGACACTGCAGTTGTTTTATCGCTTTATGTTGGTATTATTT
TACTATTGATGGGCATTTTTCGACTTGGTTTTCTGGTGAGATTTGTATCT
GTTCCTGTTATTTCAGCGTTTACATCAGCTGCAGCTCTGACCATAGCTTG
TGGTCAATTAAAAGATTGGAATGGCTTGGAACACGTCCCTAGAGACTTCT
TTGGTAACTTAACCTATATTTTTAAACACATTAAGGAATGGAATACCTAT
GATTTAGTGTATGGTTTAGTATGTGTTGTAGTTTTATGTTTGATGAGGCT
GTTGCCACGTTTGAATCGCGTGCAAGAAGACACACCAAGCTATTCACGCC
TTCTTCGAAAAGTTGCTTGGTTCTGTGGTATTGGTAAAAATGCAATCGTG
GTCATTTTTTCGTGCCTACTGATGTACATCTTCTCAATCTACAAAATCAA
TCATGATTTCACCCTTATTGAAAATATCAATGCTGGTTTACCACCTTTCA
AACCACCAGTGTTTCCCTTACATTGTGATATCAACAAGACGATCATAGAT
GATGATTTACCTCAATCAATATCAGTTGTATCCTTCACAGAAAGCGTTAA
ATATTTCAGTACTGGCCTAGCTGTCATTCCTTTACTAGCATTTATGGAAG
CAATGGCTATTGGGAAAGCCACCAGTGTTTCCCTTACATTGTGATATCAA
CAAGACGATCATAGATGATGATTTACCTCAATCAATATCAGTTGTATCCT
TCACAGAAAGCGTTAAATATTTCAGTACTGGCCTAGCTGTCATTCCTTTA
CTAGCATTTATGGAAGCAATGGCTATTGGGAAAGCATTTGGTCGTATAAA
CAATTACAAGATCATACCAACACAAGAGTTGGTTGCTTTAGGGGTGGCAA
ACCTGGCTGGTTGTTTTGTTTCAGCCTATCCAGTCACCGGTAGTTTTTCC
AGGACAGCAGTCAATTCTCAAAGTGGTGTCAAAACTCCTTTGTCTGCATT
TGGTCGTATAAACAATTACAAGATCATACCAACACAAGAGTTGGTTGCTT
TAGGGGTGGCAAACCTGGCTGGTTGTTTTGTTTCAGCCTATCCAGTCACC
GGTAGTTTTTCCAGGACAGCAGTCAATTCTCAAAGTGGTGTCAAAACTCC
TTTGTCTGGTATATTCTCTGGTACCATCGTTGTGCTTGCTACACAATATC
TGACGCAGTATTTCCACTACATTCCGAAAGCATGTCTTGGATCCGTCATT
ATTTGCGCAGTCATCAACATGGTAGATCTAAACATAGTTCGATCCATATG
GAAAGTCAACAAAATCGACCTCATCCCATACACAATCACTTTCTTAGCCT
GTTTTTACACACTTGAAACAGGTTTGATCCTTGGTATTGCATCCAGTCTA
ATCTTATTATTAAAATCAAGCGTCAGCCCACCATTACGCGTAGAACAAGG
CGATGTGCAGGTCATCACAGTTCAAAACGGAGTCTTGTATCCTGGCATTG
AGAAAATAGTAAACAAAGTTGACGAATTGTTTAGCCTGAGTTCCTTACCC
TCTGCTATTGTGTTAGACTTGAAAAATGTTGTTGAAATTGATTACACAGT
AGCTGCAGAGCTTCACGAGCTTGTCTTGCAGTTGAGAAAATGTGTGAAAC
AAGACACCGATTTTTGGATTATCAATGCTAATTTTCAAGTGAAGAAAATT
TTGTTGTTGTCTAATATGCAAGACACTTTGACAACTTGGGAACATTTGCA
AGAGAGCTATGCTGGTGCACGGAGGAACTCCCTTCCTTCAATGACATGAG
TATATTCTCTGGTACCATCGTTGTGCTTGCTACACAATATCTGACGCAGT
ATTTCCACTACATTCCGAAAGCATGTCTTGGATCCGTCATTATTTGCGCA
GTCATCAACATGGTAGATCTAAACATAGTTCGATCCATATGGAAAGTCAA
CAAAATCGACCTCATCCCATACACAATCACTTTCTTAGCCTGTTTTTACA
CACTTGAAACAGGTTTGATCCTTGGTATTGCATCCAGTCTAATCTTATTA
TTAAAATCAAGCGTCAGCCCACCATTACGCGTAGAACAAGGCGATGTGCA
GGTCATCACAGTTCAAAACGGAGTCTTGTATCCTGGCATTGAGAAAATAG
TAAACAAAGTTGACGAATTGTTTAGCCTGAGTTCCTTACCCTCTGCTATT
GTGTTAGACTTGAAAAATGTTGTTGAAATTGATTACACAGTAGCTGCAGA
GCTTCACGAGCTTGTCTTGCAGTTGAGAAAATGTGTGAAACAAGACACCG
ATTTTTGGATTATCAATGCTAATTTTCAAGTGAAGAAAATTTTGTTGTTG
TCTAATATGCAAGACACTTTGACAACTTGGGAACATTTGCAAGAGAGCTA
TGCTGGTGCACGGAGGAACTCCCTTCCTTCAATGACATGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000125_pilon | genome | sc0000125_pilon:291653..294499 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 1228-1866:640 |
| Aaloc | 1066-1224:1263 |
| Aaloc | 898-1062:1619 |
| Aaloc | 22-897:2848 |
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