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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000125_pilon:278798..286767- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_040496 ID=XLOC_040496|Name=XLOC_040496|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=7970bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000125_pilon:278798..286767- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGCGTACAAAAATGTCTTTCAAGGCGGCAATTTTTATGGTGTTGTTTTT
GAGAACGTCCAAAGCAGCCATTTCTTATGATGACTGTAAGGCTGGCGATG
CAATCTTCAAGAAATCGAAAACAGAGCTTATTATTCATGGATCAGTGGAA
TGGGAAGAATCTTTTCAGGTATAATACGATTATTTCCTTTTTTCATCTTA
GACACTCACTCACTTAAGAATATTCTTTTCAAAATGGCTCTTCTTGCTCT
GCTGATTGTGAACATCTTCACACCTGTTCCATCCCAGCTGACTTATTTAA
CGTTGTTACAATGTTCACGTTCACCTAACGGTATATGGGTGTTGTGGAAA
TTATGTTTGTAGATTTTGAAGATACTGTGACTGCATTCTTTCTATTTATA
GGTTACAAACGATATGCAATGCTCAATGGCGTGTAGGAAACATACCAATT
GTCAATCGGCTATTGTAAACGAGTCAAATACATGTACTTTAAGGGATGTC
AACCGACGTTCAGCTCAAGTTACCTTCAAACCAAATCCTTCGTTAAGGTA
TTTTATGATTTGTTACTAACTGTCTAGCTGGAAATATGAATTTTGGACAA
TAGTATTTTTCCCAAGAACTGTTTTATAGTAGTCTGAATCGCAGACTACT
ATAGATTTATTGGGGGTGAAAGATGTATTGTCAAAGGGGTATCGGAAAAA
TTTCCATGTCATTATTGGTTGATTTAATGCTTGTCAACTGGGTGGGTTTC
TGATGCTTGTCCAGGGGTGGGTGAAACACTTGTTGGAGAGCCTTTGTTAG
CAACTTTATTGTTTGAAATTGTTTCCATGGTAACGTATTTGGCTTCATCA
AACAAGTTATAATTATTTTTGAAGAAATATTTCATATTAGTTACTCCATA
TCTCAGTTTAAGCACCAAACAATTTACGACGGATGGTTTTATTTAGGGCG
TAACCGATTAAACTTTCTTAGTCTAAATCCTGATCTATGACATGAATTTT
AAGTAGCAAGTTTTGTGCTTTTTAGTCCTCAACTTCGAAAATAGCCCATT
TAAAACGTAAAACTCGTCGTCATGATTAACCTCGCTAATATGAACGAAAG
CGCGGATGAAGTCATTAACATTCATTTTTCAAACAATCTTGTCTTTTCAT
TTTGTAGGTATTTTGAGCGCCACACATGCCCACCAAGTGTAGAACAAGCT
TTTATAGCTTTCGTATCTGATGTTGAAAATTGTAAAGACATTTACGCGAA
GGGTCATTTACAAAATGGCATTTACGCTATCAAGCTAAGCTCTGGTGTTT
ACCAGCCAATACGTTGTAACATGGTTAATCAAGGTAAATTTTTTACTCGC
CCGCCCTGTCTCCTCGCTTATGACCTTGTGAGTATTTCAATTCTAGAGGA
AACCCCCGCCCGCCTTTGCGTCAATAATTATTTTTGTATTAGCGAAATGT
TTTGCAAAATCGATCCACCAAGAGTTCTTGATGATTCTATGTCAATACAA
CCAGAGCATAATCATATTAGGTTTGACAAAAAATAATTCAATCAATTTAG
ATCCGTCAGTTTTTCCTTTCACGAATCTCCAGCTAATAAAATGTTGAAAA
ACTACTACTACTTCCTGTATTAGCCACTTTTTTCAGAGTCGTTAAAATTT
TCAGGTCTGTTCATTTATCTGTGATAAAAGATGAAGAACATGCAATATCC
GCCAAATAAACGCCACCAAATAGTATCATCCGCGAAATTCAGTCCCCGTG
ATTGAAACTAAACTATGCATTTCTATCCAATTAAAGTATTCCTATTTAAT
TTTCTACAGATGAAGGAGGCTGGACTATAGTTTTGAGACGGATTAGTGGT
ATAGTGCCATTTGATAAAAATTGGGAAACATTCAAATCTGGTTTTGGTTC
ACTAGATACGGAATTTTATATCGGGAATGAACGATTCCATCAATTAACTC
AAAATGGAACTCAAAAGTTTTTTATCAAAATGGTTTTAAGAGGAGGTAAG
AGATATAGAGGTGGTAGAAGAGCGTATATTTCTTGACTGCACAAAAATGA
AAAAGGCGAATTTTATAAAGAAATTCCATTTTTAACACTCCCCTCTTCAA
ACCTTTGGTACATTTTCCATCAAAGAAATGAATAGGGTTAAGGTTTGTCG
TGTTCAAATTTCTTTACTTCTTTTTGCCATCATATTTCATACTTTTGGTA
CGATAGTAATTGACAGTTTGTATTTTCAAGGTGTAGATATCTTATTTGCT
ATCTCAGTGCAAATTAAAATGTATGAAAATAATACCAATGCCAATGAAAG
AAAACTTGATACGTTTTTCTTCTACATAATATTTCAGGCAACGTCCGAAA
TATGATTTTTGACGAAGTGCGCATTGGTTCCGAAGCTGAAAAATATTCAT
TGAACATAGGTAACTATCTTTCCCCATGAGTGATGGCCAACTTGGTCAAA
TGTGTCAGTGCTACAAAACAGGGGTTCGTGGTTCGAATCCCCGCTCTTTC
CCCATGTTCCATTCAGTTCATAGATAGCCCAGCCGGTTGGCTACGGACCC
CGTAAAAACAATGAAAAAAAATGTCTAAAAAGTCCTAGATTACTGGGCTA
CGCATGTAAAGTAGCGACTTTATCTATCTATAGGTGATGCAATGACTGGT
TCTTACGTAACCTCAGGAGGTAAATTGAAGAACCAGAATGACGGAAAGAA
ATTTACTACTTATGACCAGGATAACGACAATGCAGGTAATTATCTCTTGT
AGTTTCCAGTGCTCAGACCACGACGATGCGTAGAGTTACGGATTTCGCCC
AAGCGGTCATTTAACATCTTTTCAGTACACCCGATCATCGCCGTTGATTT
TTCCTTTATTATCTCTGTACATACAGTTTTGAGCTTTTTAGAAAGGTCGA
GAACATTTGTTGACGTAGCAATAATATATGCGAAAATTGTTGGTTTTTTT
TTGCTTACATTTCATGGAGAAAATGCAAAGTCGGATCGCTGTGTCCTGGG
AAAAACCTACAAATTTGTTGAAATTCTTTTCAAAGTTGTCTATATCTCAG
GCAATTATATTTTTCGAATTCAAATCCACTAAAATTTTTCTAAAAAAAAC
GGTACAAATCATATTGCCTAGACTTTGATAGATATTTTTAATATCTGTAA
AAGATAACATATACAAAGTATATAATATTAAAGGTTCTTAACTTCCCGTA
AAACACGAGTAAATTAAACCACCAGGAACGAAATATTATACATATGAATT
TTAAATAATTTCAGATAACGTCAATTGTAGTCACAACAATGAAAATCTCG
GATGGTGGTATCAACAATGTGGTGCTGTAAATCTTCATGGTGTTTGGAGT
TATACTAATGGTGGGTCACCCGGAATCCGCTGGGGTGGTGGAGTTGATGA
GGTCAATGGGCAAAGAGAAAACATTGAAAAGGTTTATTACTACATCAAGT
GACTTTCAAACCTGTGCATGATGGTCTGGTTGAAAATTCTTTTGTACGTT
TTTTTTTCAAATCGTGCAAGATTTTTTTGTATTCTCAACTTCAGTTGAGC
AAAATCTGAGAATGTCTGTCTGTCTGTCTGTCTGTCTGTCTGTCTGTCTG
TCTGTCTGTCTGTCTGTCTGTCTGTCTGTCTGTCTGTCTGTCTGTCTGTC
TGTCTGTCTGTCTGTCTGTCTGTCTGTCTGTCTGTCTGTCTGTCTGTCTG
TCTGTCTGTCTGTCTGTCTGTCTGTCTGTCTGTCTGTCTGTCTGTCTGTC
TGTCTGTCTGTCTGTCTGTCTGTCTGTCTGTCTGTCACCTCAAAACTTTG
GGGCAGGCCGGACTCTTCAAAAATGGTCCGATTTGGCTGAAATCTTGCAC
ACTTGTTCCTTGGGTGAATATCTGGGGGTATTTTTTTTTCATTTTTTCAA
AATTTTGACTTTTAGAGGCGTGGTCATGAGTTTTAACTTCAAAACGAGGC
TAAAAATTTTCTTTTATCAAAAGTTTTCCTTTTCAATTTCAATTTTTTAT
GTTTTACGAGTAATTTAAAAGATATTGAAGTTGAGCCAGTGCGGTTATAA
CGTCCGACATTTTAGGAATATTGAGTGTAATTTTTGGATTTATAAAGTTA
CAAATATCTTTACAGAATTATTGACTTGATCATTTAATTTGTACCGTTTT
AAATGTTTTTAAAGTCAACCTTTTCTCTTCAGTTTGGGTAAGAGCATATT
CGGTGAGGTTTTCAACAAAATCTTATTACAGACCGGCAGGAATCAATAAA
TCTATCTTTCCTTTCGTAACTTTTTTATATTCTTTTTTTTTTAATTAATT
GTATAACTTTTGTATATACTTAACCATTATGCAGTACGCAATGCTGATGA
GTCCCAATAAGGACGAAATGCATACACCTGCTCTGTCAGCCAAACCTCCT
AATTGAGTATAGTTGGACAAAAACTCTATGAATTTCTTTAATATATACAA
TTTTTTTTAATCTCAGCCATTGAGTTTTAAGCCCGAAATGCTAGAGTAGA
ATCTCTAACCTTTCCCAGGCAAGGAAAAGTGAAGCCACTCATTCCCCATC
CAAAAGTTTCTACTCCAGCCCCTACGGGGCTTTAAACTCAATGAAGTCAG
CCCACATGTAAATAGTACACTTATTTAACACTTTATTACAATACTTTATT
TATTTGAAAAAAAAACTGTTTAGGAATTATCGTCCTGACACCACCCAATG
AAGATTCCTTTTAATCAGAGAATTGATAATCCACCATTATTTCTTCAGTA
TACAGGGAAGTTAAACCCGACTGAGATATTGCCAATTCAAAGACCGACGA
CCATTTCCGATGAACGATAGGGTTGATAGTTGTCTACTTTTTAGCTGGAG
TGTGGAGTAGCAAATACCATTTTGGAATTTTTAGATGATACGTGACATGC
GAAGAAGTAGCGGTGAAAAGTGACATTTGTGTTACGTAATTTAGACCGCC
ATCGGGGCATAGTTTAGAACGCCATAGGGGCATGATAATATGACGTAAAA
ATAACAATTAGGGTACATAATGACTCTAAGGCAGTCCCATGGTCTAGCAT
GCGAGACGACTAATTCAGACATAGTAAAAAAAGACAAAATGTAGTAGCTA
TACTAACTGATACTATTATAACAATTTTCGTGTTATCATATAACACCCGT
ATTACTCTATTACACGGATATTAAACGGCTCCAGTTTAGCAATCCTGCTA
AACGTATCTGTACCTCCCAACGAACGATATTTCATAGAGCCACACCCTGT
ATGGCGTTTTTTCCTTTTTTGGGCTTCGCGATCCTTTAAGGTGTAAATTT
CATTAATTTTCTTTACAAGGGGTGGACGAACCTTTTGGATACCCCTGGAT
TTCCCCTCGAAAAGTTCTTCCACACCCTGTTAGATATGAAATAGAATGAC
GCATGGGCATTAATTACTACATGGATGTTCTTAACTTTTTGAGTTTTAAG
TCTAAAAATATTCTTAACATGTTCTGACTTTCACCATTTTGTGAGTATTT
TTGCCTATTCTCCTAAGAAATCGGGTGTTTAAGGGTCTGCAATGACCATC
AAAGCCTTGTGTTCTTATAGAAAAACATGTATCAAGGTTCATTTATACTT
GGTAACCATTCGGGCGTATTTGAATTTGAAATTGAATCTTGAATCTTGCA
TTTTTTTATATTAGACCTCCCTGTTAATAATCATTTAATGTCTTCGATGT
CATCAAAGGCAGAGAAAGAAATCTAAGCCCACGTTCATTCCGTTATGTGT
ATTTTTTACAATAACACTGAATACAATAGGCTGTCTGAATTCAATTATTC
TGTGCAGAAATTATGCGCAGGTACTTAAAGCAAATTCTAGCCCTTCTGAA
GAACACATTCCCAGAAAACGAATCTATACAAATAACGGATTTTTAAAAGA
ACAAACCTTGTTGCTAGGTTACCCTCCCGTGCTTTAAATATCATCTCTGC
GCATGGGTAGTTAATGTTATCTTATCGTCCCTTATCTATAAAACAAAGTT
ACATTCCATAACTCAACAAGATAACACGTGTGACTTATTTGTTACCATGG
TAGCCAAGAAATGAAAACATTTTTCGTGTTTATCATCAAACGACCTCAAA
CGTTGCGGTCTTTTTTTTTTACTTTCCATGTCACCGAAAAAAAACCTAGG
GGCGATTTTTTCGCCAAATCGAGACTAAAACTTTGAGACAGCCTGGAGAC
CTCAAATATGGTAGGCTTGCCGGAAATTTTGCACACTTGTTCCTTGGGTG
AATATCTGGGGGTGTTTATTTTCATTTTTCTTCCACCCTATTATTTAAAA
AACATCTACGATCGGGCCTCTGAGTTAGTTCGAAAAATACTGAAGTTGTG
GTGCCCAGTGCGTTGCACACGTTCGACATACCCAATTTTTCGATTTTACA
CTAACTTAAATGGCAATTTCTGCATTTTAAAAAGATTAATGTATAACTTT
TTTTATATGTCCTGTTAAACCTACCTTTTTAGAATTTAAAAATCAAAAAA
TTGAAATGAAAAAATTAAATGAAGAAGAAAACGAAGAGTTTTTCGAAGAA
GAGTATTTCACCTTTCAAAGCCCTAATATTGATAAAAATCAAACATTTTG
GATTTTTTTTTGGTTCAGGTGATGTATCTATTTTAAAAATATCTAAAAAC
ATAATTTCGGAAAATTTTTGTGGAAGTATCTTTCCTTTGAAATCTCCAAA
AAACCTCATTTTTGGCAATTTTCTCCATTAAATTTCCATAGGAAAACAGC
TATAACTTGGGATGTAACCAAATAGAAAATTTTTCCGAAAAAATCTAAAT
AAAGAAATTATTTGTCATTAACTTAAAAAAAGTTTGAAACAATAAAATGA
TTTCCCCAAGGAGATTAGGCTTTTTTTTGTGAACAGTATATGAATAGCAT
CGTTACGATGTTTTATTAAGATCCATGCCATACTTATTCCTTAATTACTC
ATGATGTAATTACTTAAATTAATTTTTTCAAAAGCAGTTTGTTCTTAAAC
ATGTCAAAGAAGCGAAAACATAAGGTTTTATCTTAAAATTCTGAAATTAA
TTTTTCACTACGACCAGAGCCCTTCAACCTGTTGGATTCCTAAGCTTTAC
ACCATCACATAAGAAACAGAAACTTTTGTCTAAAGCTCGGCTATGCTCTT
ACCTAATTTTTGTAATTTCCGGCCTAATTATTTAAGCTATATATATTTGA
TACGCCTGCTTTATTGATTTATTGGTTAAAAAGGACTTGAAATCAGTATT
TATTTTGTAGCCATTTGGTTTGGGTCGTTCTTCATTATTTGTCGCCCATG
TTGTTTGTATAAAAAAAGCCGTGCGAACATAAAAACCCAACTTATTTAAA
CTGGTGATTTTAAATTCCCGTTTACAATAAAGTTCTTACCGAGTTACTGA
TACAGGGCTGTCCTCCTTTTGAAATATTGTTAAGGCTGCATTAAAAAAAA
TGCCGGTTTACCGTTCACTTGACCCAAGACTTTGAAGGTGGGTCTTTCGG
TCGGGAAAAACCTTTATGAAATTTATAAAAAACAATAGTCGATCAATAGG
TGACTTTAAAAGGAGATGAAAGCGGACGATCGAGCAAGTAGGGAATTTAA
GATTCTTAAGCTTCAGAAAGAACGGGACAAACAAGAAACGGGTTTTGATT
TAAAGATTTGAAATATTTGAAGAAAGAAGATTTTTTCTTTGAAATAATAA
TTTTTTTTTGTGTCGTCAGGTTTCGAGGTAGGGTCGGGTGATGGCCAAAT
CGTAATTAGCGTGTCCAATAATAAAAATAAATAGTCCAGCTTAATTTAGA
GGTTATTAACTGTGTTTCATTTTTATCTTTGATTTTCTTATAATCATGCT
TTGATCTCATTTTTATCTCTCGCCCTACCACTAGATTACATGTGCGTCCA
TCCACGAATGTCAACTATATCAAACATCAAAGAGATTGCGACACCTACCT
CAACAATGTGCGTTAAGTGA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000125_pilon:278798..286767- >XLOC_040496 ID=XLOC_040496|Name=XLOC_040496|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1668bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000125_pilon:278798..286767- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGCGTACAAAAATGTCTTTCAAGGCGGCAATTTTTATGGTGTTGTTTTT
GAGAACGTCCAAAGCAGCCATTTCTTATGATGACTGTAAGGCTGGCGATG
CAATCTTCAAGAAATCGAAAACAGAGCTTATTATTCATGGATCAGTGGAA
TGGGAAGAATCTTTTCAGATGCGTACAAAAATGTCTTTCAAGGCGGCAAT
TTTTATGGTGTTGTTTTTGAGAACGTCCAAAGCAGCCATTTCTTATGATG
ACTGTAAGGCTGGCGATGCAATCTTCAAGAAATCGAAAACAGAGCTTATT
ATTCATGGATCAGTGGAATGGGAAGAATCTTTTCAGGTTACAAACGATAT
GCAATGCTCAATGGCGTGTAGGAAACATACCAATTGTCAATCGGCTATTG
TAAACGAGTCAAATACATGTACTTTAAGGGATGTCAACCGACGTTCAGCT
CAAGTTACCTTCAAACCAAATCCTTCGTTAAGGTTACAAACGATATGCAA
TGCTCAATGGCGTGTAGGAAACATACCAATTGTCAATCGGCTATTGTAAA
CGAGTCAAATACATGTACTTTAAGGGATGTCAACCGACGTTCAGCTCAAG
TTACCTTCAAACCAAATCCTTCGTTAAGGTATTTTGAGCGCCACACATGC
CCACCAAGTGTAGAACAAGCTTTTATAGCTTTCGTATCTGATGTTGAAAA
TTGTAAAGACATTTACGCGAAGGGTCATTTACAAAATGGCATTTACGCTA
TCAAGCTAAGCTCTGGTGTTTACCAGCCAATACGTTGTAACATGGTTAAT
CAAGGTATTTTGAGCGCCACACATGCCCACCAAGTGTAGAACAAGCTTTT
ATAGCTTTCGTATCTGATGTTGAAAATTGTAAAGACATTTACGCGAAGGG
TCATTTACAAAATGGCATTTACGCTATCAAGCTAAGCTCTGGTGTTTACC
AGCCAATACGTTGTAACATGGTTAATCAAGATGAAGGAGGCTGGACTATA
GTTTTGAGACGGATTAGTGGTATAGTGCCATTTGATAAAAATTGGGAAAC
ATTCAAATCTGGTTTTGGTTCACTAGATACGGAATTTTATATCGGGAATG
AACGATTCCATCAATTAACTCAAAATGGAACTCAAAAGTTTTTTATCAAA
ATGGTTTTAAGAGGAGATGAAGGAGGCTGGACTATAGTTTTGAGACGGAT
TAGTGGTATAGTGCCATTTGATAAAAATTGGGAAACATTCAAATCTGGTT
TTGGTTCACTAGATACGGAATTTTATATCGGGAATGAACGATTCCATCAA
TTAACTCAAAATGGAACTCAAAAGTTTTTTATCAAAATGGTTTTAAGAGG
AGGCAACGTCCGAAATATGATTTTTGACGAAGTGCGCATTGGTTCCGAAG
CTGAAAAATATTCATTGAACATAGGCAACGTCCGAAATATGATTTTTGAC
GAAGTGCGCATTGGTTCCGAAGCTGAAAAATATTCATTGAACATAGATTA
CATGTGCGTCCATCCACGAATGTCAACTATATCAAACATCAAAGAGATTG
CGACACCTACCTCAACAATGTGCGTTAAGTGAATTACATGTGCGTCCATC
CACGAATGTCAACTATATCAAACATCAAAGAGATTGCGACACCTACCTCA
ACAATGTGCGTTAAGTGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000125_pilon | genome | sc0000125_pilon:278798..286767 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 751-834:85 |
| Aaloc | 679-747:5632 |
| Aaloc | 493-675:6160 |
| Aaloc | 316-489:6813 |
| Aaloc | 169-312:7570 |
| Aaloc | 1-168:7971 |
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