XLOC_040492 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_040492
Unique NameXLOC_040492
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000125_pilon:173797..185497-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_040492 ID=XLOC_040492|Name=XLOC_040492|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=11701bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000125_pilon:173797..185497- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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CTTACTTGGTCACCATTCATTGCGTAAGAGTTCTTTAAAACTTTCACAAA AATTTATATTCCCACTACACGGTCACGTGATTTAAAAATTCGATTTTGAA GATTAGTCAAAAAAATTTTCATTACATGGTCACATGACTTGAAAAGTTAG ATTTTGCAGATCAGTCAAAATAATTTATCCTTACTTGGTCACATGACTTG AAAGTTAGATTTTGCAGATCAGTCCTGATCAGTCAAAAAAATTTATCCTT ACTTGGTCACATGATTTGAAAGTTAGATTTTGCAGATAAGTCAAAAAAAT TTATCCTTACTTGGTCACATGACTTGAAAGTAAGATTTTACAGATTAGTC AAAAAAATTTATCCTTACTTGGTCACATGACTTGAAAGTTAGATTTTGCA GATAAGTCAACAAAATTTATCCTTAATTGGTCACATGACTTGAAAGTAAG ATTTTGCAGATTAGTCAAAAAAAATTATCCTTACTTGGTCACATGACTTG AAAGTTAGATTTTGCAGATAAGTCAACAAAATTTATCCTTACTTGGTCAC ATGACTTGAAAGTAAGATTTTGCAGATTAGTCAAAAAAATTTATCCTTAC TTGGTCACATGACTTGAAAGTTAGATTTTGCAGATAAGTCAACAAAATTT ATCTTTACTTGGTCACATGACTTGAAAGTTAGATTTTGCAGATTAGTCAA AAAAATTTATCCTTAATTGGTCATGTTTACATCAAACACTACTTGGTCAC GCCTTTTCACTCATAAGAAATGTTCATTATTTGGATCATAAACCACGCCT TTTTACTTATAAAAAATGTTCATAGTTTGGTCCAAAGACATCAAACACTA CTTGGTTGCGCCTTTTTACTCATAAGAAATATTCCAAATTTGGACCGAAA ACACAAAATACTACTTGGTCACGCCTTTTTATTCATTAGAAATCTTTATA TTTTGGACCAAAAACATCAAACACTACTTCGTCATGCCTTTTCACTCATA AGAAATGTTCATAATTTTGATCAAACAAACCAAACAATACTCCGTCGCGC GTTTTTCCTCATCAGAAATGTTCATAGGCTACGTCATATCTTCCTTCGTT TCGAGCGTAAAACTCCTACTCTTCGGGCTATGAGCACTGCTCTTGTTTTG AATATTGAAATTCTCCAGATAAATCGCATGCGCACTGAGGTTTTAATGAA ACAATAGAAAGTTTCGAAACCTAAGCCAATCAGTTGTGTTCTAAACATTC TTTTATTCAATATCTCTATTGATAAACATCTTTTGTGAATGTTGTCTATT ATGTTTAAACCTATTAATAAGTAATTCCCGGTGGGGGTCACTAGTGGCCG CCTATAGCAGTGCCTATAGACCAAGAGTAAGGCCTAAAAGCCTGGATCTG TCTATTGTGTAGACTAAAATGTTCATAGTTTGGATAAAAAACACCAAACA CTACTTGGTCGCGACTCTTTACTCCTTAAACATTCAGATATTTTTCACAC AAAACCCCACCAAATGTTACTTAATCATATCTTTCATTAAAAGCTCTCGT CACTTCCATTATTCGTCCAAAAATGTCTTCGATATTTAAAGAGTTTTACG TTATATTGAAAGTTCAGGTGAAGAGGAGTTGCTAACTTGCACTTTTAGTA CATTTGTGGCCGAAACGCCCGACGAGACAGAATGAGATACACGTTTTTTT TTTTATAAGAACGTCAAAAATTTTCGAAGCCTTCGGATGTTCTTAGTTTT TTGGATTTGAAGCCTAAAAATGTTCTTAAAATGTTCTTATTTTCAGCATT TTTTGAGCATTTTGATGTAATTTCTTAAGAAATTGCATGTTTTTAAGTCT ACAAAGCCTTAGTATGTTCTTAGAATGTTCTTAAATTTTTGGGCTCAAAG 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000125_pilon:173797..185497-

>XLOC_040492 ID=XLOC_040492|Name=XLOC_040492|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=4776bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000125_pilon:173797..185497- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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AGAGAAACATCTTCGACTATTCCAAATAATTATCAAGAACCTTGTAAGAG
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GGACTCGGCAAAAATCAGCGTGTTACCACGGAGTAATTCCTCCTAACAAT
ATCAATAATATTCGAAATTTTAACGAATGCCAACGAAAGTGCGAACAAGA
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GGTTGCTACTTGATGAAAGACACTTCTTCCACTGTACCACGTGATTATTC
AGAACCTTGTAAAACTACCACTCATCCAGAAGACTATTTATATGCTGAAA
TAATTGAGCAATGTGGTATCAGCAAAGTTATACAGAAAAGAATTATTGGG
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CGCCCTACTGGAACTTGAAACGGAAGTGGAAATAACGGATAGAGTTCGCA
CTATTTGTCTACCAAAGAAATATCAACAAAGTGAGAATCATTTCGATAAT
GATGAATGCTATATTACTGGCTGGGGAAAAATGCAGAATGACAATCCAAA
AATTCCAAAACATGGGGTGAACACGTGAGACAAATCAGAGGTGATGGGAC
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ATCACCTGGTAAAGCTAGTGGCTATGGGAGAGTTACCCACGTTTTGGATT
GGATTGAGGAGAAAACTGGAATAACCTTTTAAACTTTGCAAGAAGCAACT
GTTAGAGTGTACACAAAAGAAGAGTGTTTAAACGATCGGGGAAATAACAG
AATCGATGACAGTATATTTTGTGCCGGATATCGTCGAGGTGGAAAAGACA
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TGGATTCTCTGGGGTGTTACTTCTTTTGGAAAGAGACCATGTGCATCACC
TGGTAAAGCTAGTGGCTATGGGAGAGTTACCCACGTTTTGGATTGGATTG
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Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_040492XLOC_040492-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000125_pilongenomesc0000125_pilon:173797..185497 -
Properties
Property NameValue
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