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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000125_pilon:173797..185497- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_040492 ID=XLOC_040492|Name=XLOC_040492|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=11701bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000125_pilon:173797..185497- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ATGAAAAGTTTAATTTTATCACTTGTGCTGTTCAATATATTCACCAAAGT
CGTTAGTCAAGGTAAACATATTACTCTTTTTAAAACTATATACTAAACTT
AATATCTACAGTATGCAAATCTTCGGCCCCGGTGAAACTTTTTCTTACAG
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GTGAATTTCGAATGGGGATGAAATCATTGTCAATCTCTTAGTAGGGCTGA
AATTCTAGGGTATTTTTCCCATCGGGGACGAAATTTCCAGCGGGTCTGTG
ACACATGTGCCAAAATATTCTAAAACCTACCAAGATGCTAAAAAATGCTT
CAATTCGAACATATTACATACCGTTGAAAAGATAATTCAGAGCACTAAGA
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TACTGAACTCTTGATTCTTTGGTGCTAGAAACTGTGCAGTATACCAAAAA
TGAAACTAGTAGAATAAAGGAATTCAAGATTAATTTTTTCTCCATCGTTT
TCATCTCAACAATCATTGTGTTCTAGATGATCTTTTCAACGCTATATATT
TTGTTAGACTTGAAAAATTGCTCGAGGAATTGCTTGTAAAATGGCAGGTT
AGACAAGATTTAATGCACGCTCGTTAGTTATTAGTCCAGCTGTCGCACGT
TGGTAAGAATATTATGGGACTCTTTTAAAATATATTTGATTCTCACTTTA
GCTTTGACTAAAGAATGGGCTACTCCGAAATTGGCATGTATATATGGACA
CAATGCTAAAATATATTTCAATGTTCAAAATTTGAGAAAATGTCAACTCA
AGTGTGAAGCTCTGTCATATTGTAAATCCATTGAATATAACAGAAGAATA
CGACGGTGTCAATTATCCAGAGAGACATCCTTGACATCCAAAAAATCATA
CAAGGTTCCATGTCACTATGATCCGAAGAATTATTATTTTACTGAGATAA
AGCCGAAAGGTAAGAAGTTTTGATCTTCATTATACTCTGTACTGTAAGGT
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CCCTGTTCTTATTAGGAGCCCCTAATAAGGGGTACAATTTCGGACCCCTT
CTTTTATCAGATTTTGAAGAAATTTCGAACCCTCTCCTTTTATTTGGATA
CTATTACCCACAACCAAAAGAAGCATCCGGGAATTTATATTATGAAATGA
CTGTGTTGAACAAAATATTTTGTCGTCAGCGGAAATCAGCTAAATTTGAA
ATTATGCAATAAAATTCTTACCGCAGTAAATTTTGAAAGTTTTTTTTCTA
AATATTCCTTTTATACCCTGAGTATCAGAGGTTGAGATAAATGATTTCGA
CCTGTGCTTTTCACGGTATTCCTTTTAATGTTATTTCTTTCTTTAGCTTT
AACTAAGGAATGGACGAAAAGAATATTCGCGTGCATTTACCATCATAATG
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GAAGCTGCTAAATATTGTAATTCCATTGAATACAACAAGAAAACTCGTAA
ATGTCTTTTGACAAGAGAAACTTCTTCAACTGTAGCAAAGGGCGATTACC
ACAAACCTTGTTATCACGACTCAAAGAATTATTTATACGCTGAAATAAAG
CCAAAAGGTAAGTACAATCTTTTGCTGATCCCATTTATTCTAAAAGCGAG
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CAAGGATGATCTTTAACCCATTTACCACATATTTATCTCAAGTCAACGGT
TCGAACTCTCTTTATATTGGTATTGTAAACAAAAAGAATTTGGCTCAAAA
AATTGGGGAAGCAGATTTCGCAAAACTGTTTGGATTGGTTATTCAAAATT
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GGGCAATTTGGGAATAATTACGAATTTATTTCTGACAAAATCGTGAATAA
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TTCAATAAACTTTAAGTTCGGCAAAGCAGATACGTGATTCATTTAATTTT
CAACAAAAAATGTTCTTTATGATTGCTGTTCCTTTTATTCACTCAAATGC
GTCCATAATAATCATCGCGAATACACCACTTTCTTGTAATTGAATTCAAA
ATTGTTGGTCGAGCATCGGGACTTTCATTAGCATGTCACTGTCCATGTGT
CCGTGGTGCTACATGACCGTTTTTGAAAGAGTAGTGATCTCTCAATTCAA
GTTTATTTCAAAGAAACGGCGGCTTTTAACAGGGAAGGGGCTTCCGAAAG
ACCGGTATTGAACCATTTTCCTTCTGTTATGCCAGTATCTTATTCCCAGG
CCTGTTAGACAACTAGCATGGTCCTTCCAAATTCGAGATATCATATTCGT
CAGATTGTTTTTTTTCACCCACCCCTTTAGAGCTTCAGCGTGGTGGACAG
AAAATAATCACGATCTGATCTCATGTTAAGAACACGTTGCTATTTCATCG
GGTCTTCAAGTCACTTCGGCTTTTTGTTTGTTTTTTTAGCTCTAACGAGG
CCATGGACGAAACAGATATTGGCGTGTATTGGCGGAGCAGTCAAAACATT
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AACCATCTTGCAAATCTGTCGAATATAAAAAAAGAATGCTTGTTTGTCTA
CTGTCCAAAGAAACAACTTCGAGTGCTTCAGAGTATTATGAAGAACCTTG
TGATAAACATTCTGAGAATACTTTCTTTGCCGAAATAAAAGGTATGATAT
GGATTATCTTTCATCATCAAAGTCATCATCGAGGTCAAAATTCAGAAGCG
TAGACAGGAGGGGCGCAAACTTTGTGAAGGAGAACATATTTTATGACACT
TTAAATATATATTCATAATATAAAAAGATAATTACCGTGTCATAAAAATC
TGCTCTCCTACACAAATTTTGCGTCCCTCCTGTCTACGCTACTGAAATCT
TCTTCGTGTAACTATCTTTAAAAAAGGCACATTGCATTTTCGAAGTGTGG
TCTAAGGCTCTCCGAGCATCATTCTATTTCTTTATTTCAGGAGCCTAAAT
ACTCCCCCTCCTCACATCACAAGATAGGGAAAAACTTTAAGCTTGAGTTT
GTTACCCGTGATGGATATCGACAAAGATTTTCTTTTTATCTTAGTCAATA
GAGGTAAAATATAATTCTGTTTTGCATCGCGTTTAAATTTTTCTCTTAGC
TTCAACTATAAGATGGGCTCCTCCTAAATTGGCATGTATCCGAGGACACA
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TGTGAAGACGAACCCTATTGTAATTCTGTTGAATATAACGAGATGAATCG
TCGTTGCCAATTGACAAGAGAAACATCTTCAAGTGTGCCGAACGATTTCA
AGGAACCTTGTCATGTCAATCCGATGACTTATCGTCATTCTGAGATAGTT
CCAAAAGGTTAGATCTTTGTATTGACCTTATTATGGAATTTGTAGCAAGT
TTGTAGGGAATCTCGCTAAATCGAATATCTATATAATTCGAACCAATACT
CATTTTCTTTCAAGGAAAAGCCCTTGTAAAATAATCTCTATTAATCGAAT
CTCTTTTGATTTACCAAATTAGACTTCTCGATTTCGAAATAGCCAAAGTA
GATTGTATCTAAGTTCAATCATGCTCTGATTCAAATATGATAAGTGGGGA
TAAGATTAAGATTCGCACTTTATAAAGATCTGATCTCGAACATGTCAAAC
TGAATAGTTAATGAGTATACCAAGCTTGCGAATGTGTTGTGTTAGCCAAT
TAGAATATCAGGTGGTTGCATTGTTTATACCTGGTTCGTTTTACTTTTAC
TGTCTACTGATGATTTTTGGAGAATTCTTTCTCTTTAACATTTTTTTATT
TCTAGTCTTGACAATGCCCTGGACTCGGCAAAAATCAGCGTGTTACCACG
GAGTAATTCCTCCTAACAATATCAATAATATTCGAAATTTTAACGAATGC
CAACGAAAGTGCGAACAAGAGACATATTGTAATTCTATTGTATATAACAA
GAAAACTCTCCGATGTCTGATGACAAGAGAAACATCTTCGACTATTCCAA
ATAATTATCAAGAACCTTGTAAGAGCCCTGATCTTTCCTATGCTGAAATA
GAACAAAAACGTAAGTCTACTTATTATTATGCTTACACTTGTCATTATAT
TCTTTGCCAACCTCGATTCCAGGGGCGAAAATCATTAAAAAAAGTGATGG
GGATGAGGTTGATTTCGTTTTATTTTATTATTTAGTTTCAAGGGTGTGAA
AATAGCTTGTTTTACAACCAACAATTTTGAGGACTTTTTCATGCGTTATA
GTGCCTTTGTAATTTTCTTTTAATTTGCCGTTAACAGAATCCGGTGATTT
TCGTTATCATCCTGGTTAAGGGGTGTGCATAGCACTACTTCGTCACATAT
CCTTACTTCGTCTCCTTTTGTTATTTTCTTTTCTACGTCATAATTTATGC
TAAAAAATTAAGCAGCTGAATACACATGGTTTCTACTAGATTATTGTTAA
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TGACAGATATCTTTGAATGGGAAAATATGGAAAATTGATTGACGGATATA
TTTTTCTAGAATACATAAATTAATTACCGTTAGGTGTGAAAATGATGGGC
GCAGAGGTAAATAAAAGACATATTTTGACATTATACATTTTTTTAACTGA
CCAATCAAATCACTACTATACATGTAACATTTTGAAGAGTGAGTGCACGA
TGAACAATCGTGATTGAAATTCTAAAGAAATATCTCGAAGAAACCATAAT
ACGCATGCACGGATGCTCTACACATGGTCACAAGAGTTGAAAGTTAGATT
TTGCAGATCAGTCAAAAAAATTTATCCTTACTTGGTCACGATGCATTGCG
TAAGAGTTCTTTAAAAATTTCACAAAAATTTATATTCTCACTACAGGGTC
ACGTGATTTAAAAGTTAGATTTTACAGATTAGTCAAAAAAACTTATCCTT
ACTTGGTGACATAACTTGAAAGTTCGATTTTGCAGATCAATCAAAAAAAT
TTATCCTTACTTGGTCACATGACTTGAAAGTTAGATTTCGCAGGTCAGGC
AAAAAAATTTATCCTTACTTGGTCACGATGCAATGCATAAGAGTTCTTTA
AGAATTTCGCAAAAATTTATATTCCCACTACGCGGTCACACGACTTGAAA
GTTAGATTTTGCAGATCAGTCAAAATAATTTATCCTTACTTGGTCACATG
ACTTGACAGTTAGATTTTGCAGATCAGTCAAAAAAATTTATCCTTGCGTG
GTCACATGACTTGAAAGTTCGATTTCGCAGATCAGGCAAAAAAAATTATC
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GGTCACGTGATTTAAAAGTTAGATTTCACAGATTAGTCAAAAAATTTATC
CTTACTTGGTCACCATTCATTGCGTAAGAGTTCTTTAAAACTTTCACAAA
AATTTATATTCCCACTACACGGTCACGTGATTTAAAAATTCGATTTTGAA
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ATTTTGCAGATCAGTCAAAATAATTTATCCTTACTTGGTCACATGACTTG
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ACTTGGTCACATGATTTGAAAGTTAGATTTTGCAGATAAGTCAAAAAAAT
TTATCCTTACTTGGTCACATGACTTGAAAGTAAGATTTTACAGATTAGTC
AAAAAAATTTATCCTTACTTGGTCACATGACTTGAAAGTTAGATTTTGCA
GATAAGTCAACAAAATTTATCCTTAATTGGTCACATGACTTGAAAGTAAG
ATTTTGCAGATTAGTCAAAAAAAATTATCCTTACTTGGTCACATGACTTG
AAAGTTAGATTTTGCAGATAAGTCAACAAAATTTATCCTTACTTGGTCAC
ATGACTTGAAAGTAAGATTTTGCAGATTAGTCAAAAAAATTTATCCTTAC
TTGGTCACATGACTTGAAAGTTAGATTTTGCAGATAAGTCAACAAAATTT
ATCTTTACTTGGTCACATGACTTGAAAGTTAGATTTTGCAGATTAGTCAA
AAAAATTTATCCTTAATTGGTCATGTTTACATCAAACACTACTTGGTCAC
GCCTTTTCACTCATAAGAAATGTTCATTATTTGGATCATAAACCACGCCT
TTTTACTTATAAAAAATGTTCATAGTTTGGTCCAAAGACATCAAACACTA
CTTGGTTGCGCCTTTTTACTCATAAGAAATATTCCAAATTTGGACCGAAA
ACACAAAATACTACTTGGTCACGCCTTTTTATTCATTAGAAATCTTTATA
TTTTGGACCAAAAACATCAAACACTACTTCGTCATGCCTTTTCACTCATA
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GTTTTTCCTCATCAGAAATGTTCATAGGCTACGTCATATCTTCCTTCGTT
TCGAGCGTAAAACTCCTACTCTTCGGGCTATGAGCACTGCTCTTGTTTTG
AATATTGAAATTCTCCAGATAAATCGCATGCGCACTGAGGTTTTAATGAA
ACAATAGAAAGTTTCGAAACCTAAGCCAATCAGTTGTGTTCTAAACATTC
TTTTATTCAATATCTCTATTGATAAACATCTTTTGTGAATGTTGTCTATT
ATGTTTAAACCTATTAATAAGTAATTCCCGGTGGGGGTCACTAGTGGCCG
CCTATAGCAGTGCCTATAGACCAAGAGTAAGGCCTAAAAGCCTGGATCTG
TCTATTGTGTAGACTAAAATGTTCATAGTTTGGATAAAAAACACCAAACA
CTACTTGGTCGCGACTCTTTACTCCTTAAACATTCAGATATTTTTCACAC
AAAACCCCACCAAATGTTACTTAATCATATCTTTCATTAAAAGCTCTCGT
CACTTCCATTATTCGTCCAAAAATGTCTTCGATATTTAAAGAGTTTTACG
TTATATTGAAAGTTCAGGTGAAGAGGAGTTGCTAACTTGCACTTTTAGTA
CATTTGTGGCCGAAACGCCCGACGAGACAGAATGAGATACACGTTTTTTT
TTTTATAAGAACGTCAAAAATTTTCGAAGCCTTCGGATGTTCTTAGTTTT
TTGGATTTGAAGCCTAAAAATGTTCTTAAAATGTTCTTATTTTCAGCATT
TTTTGAGCATTTTGATGTAATTTCTTAAGAAATTGCATGTTTTTAAGTCT
ACAAAGCCTTAGTATGTTCTTAGAATGTTCTTAAATTTTTGGGCTCAAAG
CCTTATGTTCTTATATAGTTTGTTCTTATAAAAAAAAAAACGTGTATACC
TTTTTCTATTGAGATTTGTTAAGAATATTCAATTTTTTTTAAGCTTTAGG
GTGTTCTTTCTTTTGAATCTTAACCTTAAAAATATTATTGAAATTTTTAC
GGCGATCTTTAACCGGTATGACCGATTTTAAGGGAACCCAACCGTGATCA
GGATAGGATAGAGTGATCTGTCGAAGACGAAAGTGTCCCAGAAATTGTGA
CCTGGTTGATGTATGTATCAAAAAACTTCTTTCTTCTACATTTTGACTTG
TTATAAGGAGACTTTATCATTACCTTTAGAGATACTAAAGAAATTAGCTG
AAAAAAATTCGATTTTTTAAACTTCCACAGATAGTGATCTGTGAAAACTA
ATTTATTTAAAATTATTTAAAAAATAATATCAAATTCGATTCTATTATTT
TATTAGTTTTCTTGTATGCCGCTTCTTAGAAGCCGTATACAGTATGTTCT
TTATAAAGTTTTTGATCAAAAAAGGGTTCAGACATTGAGATTTCAACCTT
TACTTTTTGCTAGACGGAACAAGAAAGCGATCATCCATTCACTTTATTAA
GTTTGTTTGTTAACACCTTTAAAAAAAAGAGAGATCAACCATAGACTATT
TCTTGTTTCATTTGTTTATTAACACCTTCACATGAAAGAGCAAATTTTTT
TGTTTAATTTCAACTGCTATAAAGGTGTTACAGAACAATACAATAAATAA
AAGCAAGTAGAGACCACCTCTAATCTCAAGATCAATCAGAAATAATTTAT
GCAATTATTCATGCATATATTATGACGTAAAAGAGAAAATAACAATAGGA
GACGAAGTAAGGATATGTGACTAAGTAGTGCTATGCACAAGGGGTTTGTT
GGTATTGTCGTTTTTGACTTTTAAAGTGTCTTCATTTCATCTGCATCGCT
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GATTTAATAGATAAATTTTTCGTCTTTGAACTTTTTTTCTAGTTTTAACT
GATGAATGGACCGATGAAATATTGGCATGCATCACACTAAAGCACAGTAC
CGAAATAAACATTGCCCGAAATTTCAAGGAATGTCAATATAAATGTGAAG
CTAAATCATTTTGCAAATCTATTGTATACAACAAGAAAGATCAGGGTTGC
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CCCCTGTTACCCTCCGTATAGTCTGAGAATCCATTTGGAAGAAATTCGTC
CTTGATTCTAAACGGAACAGGGACCAAAGTTTTTCATTCCGACATGAACG
GTTTTCGTTGCCCATATGATGAAGTTATCAATAACACGGCTTTTTTTCTT
ATAGAGCAATGTGGTATCAGCAAAGTTATACAGAAAAGAATTATTGGGGG
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TTTCGAAGTCGAAGCATAAAAAATCTCGTAAAAAATCATCACTCTGCATA
ATGTTTCATCCTATTAATAAGAATTCCTGGTGGGGGTCAACAGTGGCCAC
CTGTCGGAGAGTCTACAGACCCAAAATGAGGCCTAAAAAGAGCAAAAGCT
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CGACGGGCGACCACGACGGGCGACCACGACCAGCGACCAGATAAATTTGG
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ATACTTAGCGGCATAAAATTGTTTGAAACTGGTGAGAAGCTTTGTATTTC
ATCATCAAATTGTTATTTCTGTCGAAATTAGTCATTTTGTCAGTCTAAAG
ACAATTGAGTAATTGATTAGATTCATATCTCTAAAACTGGCTTTCCAAAT
TTTTTTCTACTGACAAGTTCTATCTATTCATACTAAAGACATCTCATTCA
GCATAATTAAAATATTCGATGTAACAAAACTTACAAACATCATACTTAAT
GGCCCTGTCAATATTTTTGTCAAATAGTGTCACTTTGTCAAGAATATGAC
TGGTTACTTCAAAGGTCACTTTTTAGTATTCTGAGGACTTGATTTAGACA
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GTATTAAGGATGAGATTGTACATAACCGAGTTGAATTAGGTGAGTACACA
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GGACATAAATGTTTTTTTTTTTACTTTTGATAGAAACATCCTTTTCAGTT
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ACAATTCAAAAGCATAAAAAATAGGAAGAATGACTTTATCGTAAGGGTTT
AATTTAGTCCTTTTTAAACCATGGATTGTTACCGATTGCTAAAGATTAAA
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GTATGTATTTAATGAAGAAATTGTAGGAAAAAGAATAATTACATAATGGG
CTGTTCCATAAAAATTTCCATACAGGAGGGGTGGTGAAAACAAGTTTCTT
GGAAAAGTGTAGATACCCCCTGGAAAATGGCAAAATTTGCAAAAGAACCC
TTGGAAAAAAATTATTTTCATGTCATAAAATGATGGTGGACGAACTAAAA
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AATGGAAAAAACACTTCTTTAGACCCCCTCGAAATGTTCGTCCATCAAAA
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TCTCCCAACCCTACTACCCCCCTCATATCTAAATTAACCAAATTTTTTAT
TGCGCAGACTTTGCAAGAAGCAACTGTTAGAGTGTACACAAAAGAAGAGT
GTTTAAACGATCGGGGAAATAACAGAATCGATGACAGTATATTTTGTGCC
GGATATCGTCGAGGTGGAAAAGACACGTGTAAAGGAGACAGTGGTGGTCC
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A Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000125_pilon:173797..185497- >XLOC_040492 ID=XLOC_040492|Name=XLOC_040492|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=4776bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000125_pilon:173797..185497- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ATGAAAAGTTTAATTTTATCACTTGTGCTGTTCAATATATTCACCAAAGT CGTTAGTCAAGATGAAAAGTTTAATTTTATCACTTGTGCTGTTCAATATA TTCACCAAAGTCGTTAGTCAAGCTTTGACTAAAGAATGGGCTACTCCGAA ATTGGCATGTATATATGGACACAATGCTAAAATATATTTCAATGTTCAAA ATTTGAGAAAATGTCAACTCAAGTGTGAAGCTCTGTCATATTGTAAATCC ATTGAATATAACAGAAGAATACGACGGTGTCAATTATCCAGAGAGACATC CTTGACATCCAAAAAATCATACAAGGTTCCATGTCACTATGATCCGAAGA ATTATTATTTTACTGAGATAAAGCCGAAAGCTTTGACTAAAGAATGGGCT ACTCCGAAATTGGCATGTATATATGGACACAATGCTAAAATATATTTCAA TGTTCAAAATTTGAGAAAATGTCAACTCAAGTGTGAAGCTCTGTCATATT GTAAATCCATTGAATATAACAGAAGAATACGACGGTGTCAATTATCCAGA GAGACATCCTTGACATCCAAAAAATCATACAAGGTTCCATGTCACTATGA TCCGAAGAATTATTATTTTACTGAGATAAAGCCGAAAGCTTTAACTAAGG 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Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
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Properties
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| Aaloc | 1-60:11702 |
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