XLOC_040491 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_040491
Unique NameXLOC_040491
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000125_pilon:157559..170797-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_040491 ID=XLOC_040491|Name=XLOC_040491|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=13239bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000125_pilon:157559..170797- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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GGGTCTTAACATGTTTAAATGCTCCATTCTTCTTTAACGAATGTGTCTAG TTCACGAATTGACTTTGTTTTTACAAATAACAAGCGAACTTCCGACTGTA CTGTAGCAAACAGTAATTTCAACTTCTTCTTCAGTTGAGTATTTTAACCA GTAATAAACTTCAAGAATTCAAAGAAATAGTATTTTCTCTCTATTAATAG CAACTTACTTGCGATTGGCTGCATCCAAAGGAAGTTTGGTGTCAGCAGCT GTTACCCGCTCAGCCGTAACCACAGCATTGTCATGTACATGTGATATTAA CTGGGGCAATGGAGATTATCATGCCAGATGTAACAGACAGAATTATTGCG TCAGGTAGGTCTTTCAACGAGTCTAAGTTTCTAAGGAATTCGTCAATAGT AAACTGCATACTGATACAGTCTGCTTGACATTAATATGGTAATATTTGCT CTTCATCTTTGATTCTTTCTATAGTGATTAGATTGACACATGCACGATAA AATTTCTATACCTGGTCGTCAGAGGTTGATACTTTCTTTAAAAACTTAGC CTCTGATACTCAGAGTACATCCTACGGGCTTTTAATGCGCAAGCTAAACC AGCGTTTGCGACAACTTGAACCATCTAGTAATCCCTATAAAGAAACGTTA TTTAAAAGGATAAGCAGAAGCCTATTTTTCGCTATATACAGCTGACTTGA CACTCTTTAAAGGGCTCTGACCATAGTGAATTCTGAATTCAAAGAACCAA GAATTAATTTCTGGATTTAATAAATCATTCCAAAACCACTGAGTACAATC GCTGAGTTTTTGTGAGAAATTTGTCACCGTAATAATGGCACTCCTCAACA CGGGTTTTATGTTTCTTCTAGAGAATGCCCTGTGTTTGGTGTACCTGCAA TTTGAGGGCTTCCCTTTTCGATGTATATAACTTAGCCAAGAATTCAAAAA 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000125_pilon:157559..170797-

>XLOC_040491 ID=XLOC_040491|Name=XLOC_040491|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=4836bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000125_pilon:157559..170797- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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AATCCAAACACGGGAACGACTATTCACGAAATCCTTCACGCTTTGGGATT
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ACAACAACAACCATTCCTACCACTATAACGACCACCACTCCTACTACTAC
AACAACGACCACAACTCCAACGACAACGACAACGACTACGACTACAAGGA
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GCGTGATGCACTATTCAGGTTCTGCTTTCGCGCGAGCCTCTGGGTTGATA
ACTATCCAGGCTAAAGATCCTGAAAACCAGAATCTCATGGGATCAGATAT
TCTTAGTTCTTGGGATCAAACTCAATTAAAGCGGATGTACGGTTGTGAAC
CAACTCCTGATTGCAATACACCGACAACGACCACAACGACAACGGCTACA
CCCACTACCACAACTACAACGACCACCCCAACGACTACAACAACTACCAC
CCCAACTACAACAACAACAACCATTCCTACCACTATAACGACCACCACTC
CTACTACTACAACAACGACCACAACTCCAACGACAACGACAACGACTACG
ACTACAAGGACCACCCCTGCTCCACCCCCACTCCCGCCAGTCACACCCTC
TCCTCTCACTTCAGTTACTCTTATTAACAACTGTGCCATTCTTTTATACG
ATCATTATACAGCTACATCATCGTCAACGTACGCATCAATTAATTTGATC
CTAATCGATGTTCCTGCTGGAGATGAGCCAATCAGAATGCATTCTGTTAG
AGATGGACCAATGGCAGAGCGTTTTGCTGAAGATCAACAAATCAGAATGC
CACCCCGAAGAAAAAGACGATCTGCTGCTTTCCTTTCTTTCATCAAAAAT
AAACGTGTTCTTGAAGCCAGACAAAGAATGAAACGAATATACGATCATTA
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ATGTTCCTGCTGGAGATGAGCCAATCAGAATGCATTCTGTTAGAGATGGA
CCAATGGCAGAGCGTTTTGCTGAAGATCAACAAATCAGAATGCCACCCCG
AAGAAAAAGACGATCTGCTGCTTTCCTTTCTTTCATCAAAAATAAACGTG
TTCTTGAAGCCAGACAAAGAATGAAACGAAATACTTGTTCAGATGTGGGT
ACAAATTGCTTCATTTTCCAAAGCAATCCATCTTATTGTACCACTCTGTC
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CCTTTGTGCAACGACAACGACTACTACTACGACCACCACAACGACCGCAA
CAACGACCGCAGCTCCAGGAGTTACGACAACAACGACCACCATTGCACCG
ACAGCATCTTGTCAAGATACCGGCACAAACTGCTTTTTGGTTGATTCCAC
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GTAATACATGCTCAACGACAACGACTACTACTACGACCACCACAACGACC
GCAACAACGACCGCAGCTCCAGGAGTTACGACAACAACGACCACCATTGC
ACCGACAGCATCTTGTCAAGATACCGGCACAAACTGCTTTTTGGTTGATT
CCACTCCTAACTTTTGTACTTTCACTTTCGCCAAAACTCGATGTGCATCC
ACTTGTAATACATGCTCATCATTGACAACGACACCCACAACTCCAGGACC
AACGACTGCCCCTACTTCGGCTCCTCTCGGTTTTTCATCATTGACAACGA
CACCCACAACTCCAGGACCAACGACTGCCCCTACTTCGGCTCCTCTCGGT
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AGCTGTTACCCGCTCAGCCGTAACCACAGCATTGTCATGTACATGTGATA
TTAACTGGGGCAATGGAGATTATCATGCCAGATGTAACAGACAGAATTAT
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GATATTAACTGGGGCAATGGAGATTATCATGCCAGATGTAACAGACAGAA
TTATTGCGTCAGGGCTTTGGTTCGACGTCAATCCGCTCCACTAACTAAAG
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TTTCCAACATAACTTTGGTACATACTCTGTTAATTGGGCAGACGACAGTT
TACCTGACGCACAATGGGTCGAAATCAAAATGGATGTTCCTGGCTATTGC
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GGATATTGCAGGTGTTGTTGTTGAAACTAAAATGTGTTCAGAAACGTGTT
CTACATCAGCTGGTGATGCACCATTTAGATGTCCAGCATTATTTGCATGC
AGACAGTTCCGATACATTGGATATTGCAGGTGTTGTTGTTGAAACTAAAA
TGTGTTCAGAAACGTGTTCTACATCAGCTGGTGATGCACCATTTAGATTT
ATGAATAGATACAATCGGTTTTATCGAGAACTTGATGCCATCGAAAGAGA
TTTGAAAAATGCGGAAGATCGTATCAGACAAGGCAAATTTAGTTATGAAT
AGATACAATCGGTTTTATCGAGAACTTGATGCCATCGAAAGAGATTTGAA
AAATGCGGAAGATCGTATCAGACAAGGCAAATTTAGACCACAAGAAATGA
AGATGAACTAAACCACAAGAAATGAAGATGAACTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_040491XLOC_040491-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
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Properties
Property NameValue
Aaloc2398-2421:25
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