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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000125_pilon:95395..103311- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_040490 ID=XLOC_040490|Name=XLOC_040490|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=7917bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000125_pilon:95395..103311- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ATGAAGAAAGTTAATTTATATATTTACGATATCTCCAAAGGGATGGCCAG
ACAGCTCTCCTTACCACTTATAGGTAGGCTCCTTATATTGACATACAGTT
GGAGATCTCCAAATTCGATTTTCAAGAGGAATTTGATTAGTATCGAATAA
GGGAGCGTATCGAATGGTAGAGCGTCGTTTATGAGCGTTTGTTGTTGACG
GTGACATTCGATATTATCGAATAATATATGTTATGGAATAGTTCAAAGAA
CATCGAATTAAATAGGGCATGGAATATCGAATTAGAGAGCGTCAACTGTA
AGTAAAACATGTAAAGAACCTTTACAAGTCTCAACCATATTTTTATATAG
TCTGGAGCGGACTTCAGCCTCAGGTTCGAATGCAGACGATCTAGATAGAT
CAGACCGTAAGCCGTTAATGGGAAAAAATATAAAAAACAAGACTATTGAA
TAGTTTACTGTCAAGATATGAAGGGAGTTTAGTCATTTTATTGTAGTAAC
ATATATTTACACTGGTCTTTTCTTCTCTTATAGGAAAACAAATTGATGGA
ATATGGTACGGACTTTGTCGTGTATAAAACTAACTACAGTAAAACCCTAA
AAGTTCTGTTTCATTGAGTGGCTGACTGAAATGTGATACCGTTTTTATTC
CTGGGCAGAAAAAGTTTATTTATTAGTTGACCTTGCGATGATTAGTAGTC
GCTAGTTGTTGTTGTCCAGTGTAAACATACTCGATATTCTCCAACCCTTT
TACCCCCGAAAACTTTGTTTCAATTAGATAATGGGATGATTCCGAGCACT
GACATTCATATACCACGAAACATTTTCAGTCTCGACTAAGCAAATAAGTT
TTTTAAAGTTGTATTCTAATGGTACCACTACTCATATTGAATTATAGATT
GACCCACGTCGAGTAGTGCTACCATTAGGGTACCACTTTCAAGAAACCCC
GACCATAGATGGTGGTTATAGCTTGGCCCAGGGTTTATAAACGTCAGTGT
CTCCGTTAACTACTTATCTGAATTTATCTCCTTCTCACATAGGCACACGG
CAATTGTATGTTTCGGTAAAGAATATTACTTCGGTTCTGATGGGATCACT
AATTGTGCGCCGGTAAGTTAACAATATTGAAAAATTCCCTACCTTGAACT
TCGAGGGAAACTTATGAAATACGCATGTGGAGATACACAGTTTATTATGA
AATACATTATTTAAAATACGAAATTTTTTTATAAAATACACATGTGAATT
ACGCAGTTTTTATAAGGCATAATTCGAAATGAGCCTAATGATTTTTTAAA
GTTTTTGATTTCAAGCCCAAATATTCTTATATGATTCTTAAAATTTTTAA
AAGAACAACAATTATTTTTAATTAATGGTCGTTTTATATTAAAATTTTAC
AAAAGATTTTAACAACACAAGATTGTCTGTACTCGACAAGCTTCTTAATC
TGCAACACATACGGAATGAATGTGATGAGAGAAGTCAGACATCACCCCTT
TAAAATGCCAAGAATCAACCCTACGTTTTTTGCAATGTTTGACAAACTTT
CTCATTCTCCTAGACAGTTATTTTTCAAAGCCTCTCAGTATCATAGAGGT
TTTGCATTGTTCTAAATTTTAAACAGTTTAGTTTAACTTTAAATTTTTTC
TTTTCTATTTCACAAGTGTGGTACTATACTTGGTCAACCAGACGAAACAG
TTTGTCTTGGTGAGACGTCTGTCACCAAAAGAATCTTCCATGAATACTTA
GCTGGATTATCGAGAGAAGCTTTCAGGTATGCAAGACTCCAAGGATTTTG
GTTGTTTGTTTTTTAGACACAGTTGACTATAATTCAGTCGTTAATTCAAA
TTCTTCAAATTTGTTCGAATGACAAAGAGATTCGAATTAGAGAGTATTAG
TAGAGAGTATTTCAAGACAGTCTCCTCCTGACAGGGACTTAGAATTAGTG
CGAATAATAAAAGTTCGAATGACTTAGTGAGAGTCGACACTTTATAAACC
ATTGTAAATCATGCATCTGTTTCGTTCAAAGAGAATCTTCCAATCTCAAG
AGCGGATTCCACAAGTTATTAAATGACAATTTAAAAAGATGAATTTCTTG
CAGTTCTTCATTTTACTTTCTTTTGATGTTAGTTGTCTCTGTGTTGATGC
GTTTTTCAAATTAGAACATCCAAAAGTCTTCGGTTGTTCTGAACCTAAGT
TTTAAGCTTAGAAATGTTCTTAATGTCAGTGTTTTGTGAGTTTTCAGCTG
ATTTAGAGTCCTTTAGTTTAAAATGTTCTTGTTCTTGTTCTTAATATTTA
TATTGTTCTCATAATAGTTTGTTCTCACAAAAAACGTGTTAACACGGATA
TATATTTTTCTTTCTAGACCTGAGCGCTACGATTTATTCCTTCACAATTG
TAACACTTTCTCGAACGAAGTTTCGCAATTCTTAACGGGAAAGAAAATCC
CATCACACATCACAGACCTCCCACAAGATGTGATGAGCACGCCTTTTGGT
GCAATGATCTCACAGTTTATACAAAATGTGCGCGTGCACCCGAGCGCCCT
ACAGAATGGCGGAGGTCCGCCCACCAACAATGATGCGCCAACTTTACATT
TAGAAGACGATGAAGATGAAGAAGCGCCGTACGAAGGAAATCCTGATTAG
TGAGTTGTGAAATATTTTAGTCTCAATAACTCGAAATCGCAAAGGGGGGT
ACTATCTTTGCCGCCCGACGGGGATGTTCCGCTGAGGTCCGAAAAATGGA
CTCTACGTGGGACTTTTTTTCAAAAAATGTTGCAAAAATTTGCGAAAATT
GGACCCTGAATGGGACTAAAATTTGCAGCGGCACCTCCCCGTACCCCCTT
TTACCCGAGTACTTCTCCCCGGGCCCATTTAAAAAGGCAACTAAATCCGT
GGAATCTGCGAAATCCCCGTGAAATTTTATCCCATGAAAATTACTTCCTT
TGTTTCTCCATTACAGTCACCCAATGGAGCCACCACACAAAGACCATTCG
GCTTCCGTAACAAGTTACGATGATAAAAACCGCAAGACCAGCCTCAAACC
TCACATCTACCCAGTGAACCTCGAAGAAGTATGTATTGTACTTATTTGTT
TGATCCTTTAGATCTGTCCAATTTAACTCCGGATGACTCGAAAAAAACTG
AACGGCATCCTAAAGTCTTAAAGTCTCAGTTTGGTCTAACTAAAATTTTA
AGCTATAATTTTTTTGTTGTTGTAAATATATACGCAAACCCAAGTGAAAA
AAATTATCTGTCTCAGAAGGTTGTGAAGAAGATAAACAAACATAACTTTA
GTAGCTGCAACCAGCAAATCTTCTCCGCTTGGTCTGCATCCCGGCCAACC
TTTACTGATCTTTGCCGAATCCGCTGAGACCCCTATGTAGATCCATTTTA
ATTTATAATGTTTCAAATAATGTTTAAATTCTTAAATTGTTTTTACTATT
TGGAAAGCTCATAACTTTAAGAATCGTATTTCCATCCCATAGCTCGATGA
CAGTATATCATACTTAAAGAAATGCTTCGATAAATACTCGAAAGATCTCG
ATAAACTCCGATCGATACTCGAAGAAATCGAATTCGATTTTGGAAGCGAA
GAAGATGTTAGATACGATATAACTGATACGCTAAGTGAGTATTTTGATTT
TTTTTGGGTATGATACTTTCGATATTTCGTTTGCTTAATTTTAGTCAACT
ACTTTTCTGCTACAGTTTCAATGGAATATACTAGAGTTTATTTTGAAAAG
TCACCAAGGTGACACAGTTCACTAGCCTGCCTTTGGTGTCATATATATTT
AGCCATACCGTGATAATTTTCTGTTCATTAAAAAATATTATCTGATATTT
CACCCTCCCCCTCCGATCAGGTTCATGGCTTCCTTTAAAGTTTCATTACC
CGCAACTAACGTTTTGATTTTAACAAATACTCTTACTTTTTCAGGTTGTC
TATGTAAAGAACTACAAACTCGGAACCCAGACCCCAAAGCATTCAAAGCT
GTTCTAGTCACATTAAAAGCATCTGCATTAAATTTATCAAAAATATTCAA
ATACGCAGAAGGTTTGTAAAACTTTTACTGTGCCCTTTCGAAAGAGTTTT
TAAGATAAACAATATTACAGGACATTGTCTGTTTTCGAGAAATGCCTTAA
AATGGGTTGTTCCATTAAAAAAACATATAGGGGGGGGGGTCAAAACTTTT
CAAGTCAAAAAAGATTATTGAGAATGTGTCGATACCTCCATGGAAAATGA
CGAAATTTGAAAAAGTACCCTTCGAAAGATTATTTTCATACCTTTTAGTG
AGGGTGGATGAACTGAAATCAGTCTTTTACCCCGTGGAAATTTTAGAATT
ACTTTTTACCCCTTGGAAAAATGAAAAAAGACCCCTTAGAAATTTTTCTC
GGATTACCTTTGGAAATGTTCGTCCACCCCCTGTATGGATATAAAATGGA
ATGGCCCAATTTGCACTGTATTTCGAATGACAGTCTGAACCTAGCATTTT
TTTTGTGTTCCGGTTTTACATTTCTCGTCATTTCTGGTCGTGAATGTTAC
TTACAATACAACTTTTGTAAAACTTTTAAAAATCACGTGGACCGCGCAAC
TTAAGTAAGAAATAAGTGGCTTTATTGAATCTTACATACATAGGGGCCAT
CCATTTACGTACGCAATGACGGGGAAAACGGGGGGTTAGTGAAAGCGTAC
GTCTATTGGGCTTTTCCAGAAAAAAACCGTATACCCCCTGTTGAGGAGGT
CCATCCCTCTGTGGCTGGAAAGGCTGTAACCCCCTGGAATTCCAGGCAAT
TTCAGGTTTAAACCCCCCTCTGGAATTCTGAATTTTAGTAGGATTTAAAA
AGCTACCCCCATGGAATTCCAGTTATTTTTGACCGATTTTTGTATCTCCC
ACTTATCAAACCTTACCTCCTTGGAACGGAAATGGACCTCCTCAACAGGG
GGTATACGGTTTTTTTCTGGAAAAGCCCATTGTTTGAATGACGTCTCTGC
GTACATGGGGGAAATGGTGTAAAATATTTTGAAAATTTTGCGTGTACGTT
CTTTATGAATGACCCAATAATAGAATCGACTCCAGTCCTCGGCTATACCT
TATTGGTTTAAAATATAGTTTTACCTTCTTCTCTTAGGCGACGAAATAGT
ACTAATGGTGATAAATAAATTACAACATGGACCAGCAAACGATGTCAAAC
TACTTAGGATACAATTTGTAAGTATCATATGTACAGGTGTCCTAGCGGGT
TGGCCCCCCTCTTGAAATAGCAAAAAAAACTCCACAAAGTGTTTAAAAGG
TTATTCCTCTGAAAAATTAAGATTTTCTTTGTCCCCTCCCCCTATTTATT
GGACATATTAAAACCTAAATATTTAACCCCCCCCCATTATTAATCTACCC
TCTCAAATTTCGAAAATTATTTTCTGGCTCCCCCTCTCTCCCTTTTGAAA
GGGGGGAGTAGGATACTATGTATCTGTTCATACATTATTAAGAAGATATA
TCTTGACGTTTTTAGGACCCATATAGAGATTTCTTCCCATCTTTTTGCTC
TAATCCTTTGGGATGAAGGGTTTTCGAATTTAGTAATTTTTGAACCCTTT
TTAAGAGAGTGGATTGGTTTTTGTAGGCCTTATAGTTTTTTTTAGAACTT
TACGCTTATCTTTTACCTAAATGATTCACATCTGACATGTGATTAACAAT
TAATTGTTACATTACATTTTCACTTTTTACTTTCAGTTAGCAAACCTACT
CAGTGTATACGAACTACGTAATCATCTACTGGCTATCGATTCTATGCTTC
GGATACTGGTCAATCTCACTGTTTCAAGTATTCTCGATGGACCAGGTCCC
TTTGTCAGAGAAGCTGGATGTTGTCTCGCCTATTCACTCTCAATTGTAAA
GGTAACTGTTGTCTACACTTAGAATATATATAGGTCGGTCTGGCGATAAA
AGAAGCATGCCAAAGAGAGGTATCAATTCAACGTCTACACTAGTTTAAGC
TAAGTTCTAACCATAAACATGAGCATTAACGCGAATTCATATTAAAAAGG
ACACGGTTAGTTACCAAACCCCTATATTTTTTCGTGGAGCACCCACTATC
TACAAAAAAAACAAGAACCTTTCGAAGGGTTCGAATGTTTATGAGCACCA
TTTGAGCTATCTTTTTTCCCTTGTTGTTACCACTGACCACTAAAAGCCCA
AGACAAAGATACATTAACCAATTTTGATCTGAGATCTTTAGAAAGTGGTA
TACGCAAAGAAGCCATTGTATTTTTAAAGATATTCAATGTCAAACGGCAA
AACATCATCAAAAGTCTTCAAGAATAAAAACAGATCTAGCGTTCTCGATG
CCTTTACCCTACTATTGAGTAGTGCTACCATTAGGCTACCACTTACAAAA
AAACTCCGATCAAAGATTAGCTTATGCGGGATGGAGAAACTTTACCCAGG
GTATATATGAAGCTCAGTGCGTGTTAGGCGTTTAAACTTTCCCATCTCTT
CCACCAGATCAACGATGATCACGCCTTCGAATTATCGTCAGCTCTCCTAC
ACGTTGTCGCTGAACTCTCCTATAACTCCAAAGCTCGTAAGTCACTGGTT
TTTCGAATTGTTATTGTTTGTTCTTTTTGTAAGTCGATTGGATTTGAGGT
GCGTGTTCAGTCATTTTACCAACAATGTATCATAACTGACTCGATCAATT
TATGCACAATTTTGAATTTCAACCCGTTGGTGCATTAAAACCCTTTTTAC
TGAAAAGTGTTCGGAAAACTTTATAATATAAATAACAGCAAATCTGCGAG
GAAAAAAATACGGTATTTATAAAAGCTTTCACACACAAATGATGCTTATC
CTTGTTTTTCATTTGATTTGGCAGGTGAATACAGTATCGCTGCACTACAA
AATTTCACCAAAAAGTTTGACCAGGTAAAAGCTCTATATCTTTACAATTT
GTTGAATATTTCACAAAAAGAATGAAAAAGGCCAGGGGGGGTCCATGTAC
AAAACAACGGCATGTATCAGTACTTTGTGGCAAATTTCGATTTTAGACAC
CACTCCACCCCTATAGTAAAAAAACTGCAAAATACTATCCAGCAAACTCC
CAAATATACTCCAATACACCCTGTTTAGTACAGAATACTATCCAGCAAAC
TCAACACTCAAACCCCAAAAAACCTCATGTATATTACACAGATGCTAAGC
AGATAATACGAATTTATACCAAACAGCAAAAAAAAATTCAAAACACCCAC
CCACCCCATGATACATGCCGCTTTCTTGTACATAGACCCCCCCGCCCTGA
AAAGGCTCCAGTTTTATGGTACGGAATTTACGGAGCTCTACAGGTCACCC
AAAATCTAAGACCAGCCTAGTCTGTCTTGTTCTTTTCTGTTTTATATCAG
ATTTTTGAACAAAATATCCGAATTCCCACAAAATTGCAACAACAGGGTCG
GCTAGTAAGCCTGTTAGACGAAAACCGCTTTCTAATTGCGCCTATCAACC
CTTAAAGCGTAAGGTAACTTGGTAAGAGTTTACCAGGAAGAAATGAATTT
TGGCATCATTTTCCTGATAAACTCCAACCCATTCTCCTCGCACTTTTAGG
GTTTACAGGTGAATATAGAGAACTATGAAGTTCTCATTGCTCTAATTTTA
ATCATACAATGGATTCTCCATAACTCGAACACTTAGTTTATTTGTTCGAC
TTAAGTTTGAGTTAAATTTCGAGTTATAGAGGGACCATAAAAGCATTGTT
GACTGAAGGGACCATAAAAATTGTTCGAGTTATAGAGGTTCGAGTTAAAG
AGAATCAACTGTACCTTCATTGTAATGACCGATTTTGGTTCACAGGTAGC
AGAATTGGCACAGATGATCGTCCCAGATGTTTACGCCAGTGAACTTGAAT
CACCCATTTCTGTCTGA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000125_pilon:95395..103311- >XLOC_040490 ID=XLOC_040490|Name=XLOC_040490|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2748bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000125_pilon:95395..103311- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ATGAAGAAAGTTAATTTATATATTTACGATATCTCCAAAGGGATGGCCAG ACAGCTCTCCTTACCACTTATAGATGAAGAAAGTTAATTTATATATTTAC GATATCTCCAAAGGGATGGCCAGACAGCTCTCCTTACCACTTATAGGAAA ACAAATTGATGGAATATGGAAAACAAATTGATGGAATATGGCACACGGCA ATTGTATGTTTCGGTAAAGAATATTACTTCGGTTCTGATGGGATCACTAA TTGTGCGCCGGCACACGGCAATTGTATGTTTCGGTAAAGAATATTACTTC GGTTCTGATGGGATCACTAATTGTGCGCCGTGTGGTACTATACTTGGTCA ACCAGACGAAACAGTTTGTCTTGGTGAGACGTCTGTCACCAAAAGAATCT TCCATGAATACTTAGCTGGATTATCGAGAGAAGCTTTCAGTGTGGTACTA TACTTGGTCAACCAGACGAAACAGTTTGTCTTGGTGAGACGTCTGTCACC AAAAGAATCTTCCATGAATACTTAGCTGGATTATCGAGAGAAGCTTTCAG ACCTGAGCGCTACGATTTATTCCTTCACAATTGTAACACTTTCTCGAACG AAGTTTCGCAATTCTTAACGGGAAAGAAAATCCCATCACACATCACAGAC CTCCCACAAGATGTGATGAGCACGCCTTTTGGTGCAATGATCTCACAGTT TATACAAAATGTGCGCGTGCACCCGAGCGCCCTACAGAATGGCGGAGGTC CGCCCACCAACAATGATGCGCCAACTTTACATTTAGAAGACGATGAAGAT GAAGAAGCGCCGTACGAAGGAAATCCTGATTAACCTGAGCGCTACGATTT ATTCCTTCACAATTGTAACACTTTCTCGAACGAAGTTTCGCAATTCTTAA CGGGAAAGAAAATCCCATCACACATCACAGACCTCCCACAAGATGTGATG AGCACGCCTTTTGGTGCAATGATCTCACAGTTTATACAAAATGTGCGCGT GCACCCGAGCGCCCTACAGAATGGCGGAGGTCCGCCCACCAACAATGATG CGCCAACTTTACATTTAGAAGACGATGAAGATGAAGAAGCGCCGTACGAA GGAAATCCTGATTATCACCCAATGGAGCCACCACACAAAGACCATTCGGC TTCCGTAACAAGTTACGATGATAAAAACCGCAAGACCAGCCTCAAACCTC ACATCTACCCAGTGAACCTCGAAGAATCACCCAATGGAGCCACCACACAA AGACCATTCGGCTTCCGTAACAAGTTACGATGATAAAAACCGCAAGACCA GCCTCAAACCTCACATCTACCCAGTGAACCTCGAAGAACTCGATGACAGT ATATCATACTTAAAGAAATGCTTCGATAAATACTCGAAAGATCTCGATAA ACTCCGATCGATACTCGAAGAAATCGAATTCGATTTTGGAAGCGAAGAAG ATGTTAGATACGATATAACTGATACGCTAACTCGATGACAGTATATCATA CTTAAAGAAATGCTTCGATAAATACTCGAAAGATCTCGATAAACTCCGAT CGATACTCGAAGAAATCGAATTCGATTTTGGAAGCGAAGAAGATGTTAGA TACGATATAACTGATACGCTAAGTTGTCTATGTAAAGAACTACAAACTCG GAACCCAGACCCCAAAGCATTCAAAGCTGTTCTAGTCACATTAAAAGCAT CTGCATTAAATTTATCAAAAATATTCAAATACGCAGAAGGTTGTCTATGT AAAGAACTACAAACTCGGAACCCAGACCCCAAAGCATTCAAAGCTGTTCT AGTCACATTAAAAGCATCTGCATTAAATTTATCAAAAATATTCAAATACG CAGAAGGCGACGAAATAGTACTAATGGTGATAAATAAATTACAACATGGA CCAGCAAACGATGTCAAACTACTTAGGATACAATTTGCGACGAAATAGTA CTAATGGTGATAAATAAATTACAACATGGACCAGCAAACGATGTCAAACT ACTTAGGATACAATTTTTAGCAAACCTACTCAGTGTATACGAACTACGTA ATCATCTACTGGCTATCGATTCTATGCTTCGGATACTGGTCAATCTCACT GTTTCAAGTATTCTCGATGGACCAGGTCCCTTTGTCAGAGAAGCTGGATG TTGTCTCGCCTATTCACTCTCAATTGTAAAGTTAGCAAACCTACTCAGTG TATACGAACTACGTAATCATCTACTGGCTATCGATTCTATGCTTCGGATA CTGGTCAATCTCACTGTTTCAAGTATTCTCGATGGACCAGGTCCCTTTGT CAGAGAAGCTGGATGTTGTCTCGCCTATTCACTCTCAATTGTAAAGATCA ACGATGATCACGCCTTCGAATTATCGTCAGCTCTCCTACACGTTGTCGCT GAACTCTCCTATAACTCCAAAGCTCATCAACGATGATCACGCCTTCGAAT TATCGTCAGCTCTCCTACACGTTGTCGCTGAACTCTCCTATAACTCCAAA GCTCGTGAATACAGTATCGCTGCACTACAAAATTTCACCAAAAAGTTTGA CCAGGTGAATACAGTATCGCTGCACTACAAAATTTCACCAAAAAGTTTGA CCAGGTAGCAGAATTGGCACAGATGATCGTCCCAGATGTTTACGCCAGTG AACTTGAATCACCCATTTCTGTCTGAGTAGCAGAATTGGCACAGATGATC GTCCCAGATGTTTACGCCAGTGAACTTGAATCACCCATTTCTGTCTGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| sc0000125_pilon | genome | sc0000125_pilon:95395..103311 - |
Properties
| Property Name | Value |
| Aaloc | 1303-1374:73 |
| Aaloc | 1255-1302:1042 |
| Aaloc | 1174-1251:1411 |
| Aaloc | 1009-1173:2182 |
| Aaloc | 931-1008:2779 |
| Aaloc | 814-927:3972 |
| Aaloc | 670-810:4426 |
| Aaloc | 559-669:4951 |
| Aaloc | 277-555:5550 |
| Aaloc | 166-273:6252 |
| Aaloc | 97-165:6875 |
| Aaloc | 76-93:7383 |
| Aaloc | 1-72:7918 |
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