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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000028_pilon:620760..627562+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_040461 ID=XLOC_040461|Name=XLOC_040461|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=6803bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000028_pilon:620760..627562+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTTCAATATGGTTAAATCAACTGACTCcaatgaagaaaagaaaggtTT
GTTTTACAGCACATTTAAATGTTTTGTATAAATTTCTATCAGTCTATCTG
TCTATGGCAGGACCCTGCCGGTTGTTatagcaaacgatatcatactccag
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ATTAATTCAAATGAGTTGAACACCTATTTTTTACTCTCTTCGTCGTTATG
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caatatcttactttatatTTGCTCCTTACGCCAATACTCTAAAAGTAATT
ACTGCctcacgccgaatatattcggaGTCCTGTGCACTAATTCCAGGCTG
GCAAAATTCCGAATGCAGGATCAGATGTGAGCGAAAAGTGAGAGCAAAAT
TGAGCTGGTGATTTTAGGGGGCAGGGCCCCCTGGAAGAAAAGTTTTAATA
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GTATACATAATGTTTATTAGGATGAAATCTTATAATCAATTATTCTCCTT
TAGAACCAACAATGCGAGTTGGAGATGAATTTCAAGCTGAGGTACCTGAC
GTCTTACATGGTGGGTTGCTTGCTTACTTTATTCTGGTAACATTAAAGGT
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AATGATTTGTGGTTTGATGAACTTGAAGATCTTATTTaatattcatgttt
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TGTTTGGGCACCCTGTGAAAATGTATCTGATGAAAAAAGTAAGAGTACAT
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ATAAAGATTatgaaaaggaccaaaaaaaatatttcctggCCGCCTGTATT
GCTTTTTTGTTCGTCACTGGTTTTACTGTAGGGCAGGCCTTATTTCAGAC
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CGAGTTGCCAAAGATAAACATGGCTACAATATGGAGCAGGTTGggagaaa
atattcttttgtaaACAGCTTGCAAGAAGTACTAATTAGGAATACTCACA
ATACACAAAATTGGAATCTTTCTTCCACTTTATTAGTCGTCGAGACCGTa
attatttgttattttgaataAGAAGAGACAATGATTATCCATATTTATCT
TGTTTACAGGCTTTAGGACTGCTTTATTGGCATAAATATGACATTGACAA
AACATCTGAAGACTTAAGAAATTTCACACCATTACCTGGTAAGTTGGGTT
TGAACTTTCAAACCTGGGTATCCACTGAAAGAAAATAAGTCCGTTGCAAG
TACCtgttgacaaaaaataaatccCGACAACATCCAAACAGAtttttttt
GCAACAAATAATTCATgataaacttatttttttcCGTGGACACCCAGCTT
AATCATTTTATGAGattaaaatatcaataaaaagaTTTGGCTCAGCCCTA
TCATGCGCACCTTTCAAGCCCTACAGCACTGTCAGTTGTGATTGGTTAGG
AGTTTACAcggaaaattatttcaaaatgggaaattttatcgaaaacacAA
GCATATAAGGGCCCCAGAAAAGTGGGGTAAAGTAATGTCACTTAAGTCAA
GCTTGCTGGAATACAAAAAGTAGTGTGCAATCTGTTGTTGTAGAGAAATC
atggggggggcagtcaggcaaattgaccgactggtatgtgcggcggttaa
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TGCAAGCGCGcgagaaattgcaaaatgtagcacgtcaattttttctgcaa
ttgctctgcaacgcaataaaaatattgcagaacAAATTGCAAGtgtctgc
aacaaaatcagtttgaactgattttgttgcagaagAATCTGCAAtttttt
tGACGATGTATCTGACATTCCAATCTTATTGCGTCATTCGAACGTTTGAC
Cttcgaaaatcgaatgtttttgataaaatcgaatgtttttcaaaatatca
gaaatgcactgtatgggtggacttttgataaatgcactgtatgggtggaa
atttcagcaaatctaagaaaaattgcaaatttttgctcaaaaatcttgat
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TAtaaatttcaccgatttttttctggactgtaagggtgtgattctaaaag
ccaattttttcgccgcacatactgtcagttggtaaacccacggCCTGTTT
GGAGGTCTCAGAAATGTTCTCGTGGCTATCACAGTTTAAAGAGTCTGAAC
TAAAATAAATCAAAGTTAATGTTGTTATCATTTAGATTCATGGAGCATGG
AAGATCAAGTTATATTTGAGCAATCCTTTAGTTCCTATGGAAAACATTTT
CCT Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000028_pilon:620760..627562+ >XLOC_040461 ID=XLOC_040461|Name=XLOC_040461|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=762bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000028_pilon:620760..627562+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTTCAATATGGTTAAATCAACTGACTCcaatgaagaaaagaaagATGT
TCAATATGGTTAAATCAACTGACTCcaatgaagaaaagaaagAACCAACA
ATGCGAGTTGGAGATGAATTTCAAGCTGAGGTACCTGACGTCTTACATGA
ACCAACAATGCGAGTTGGAGATGAATTTCAAGCTGAGGTACCTGACGTCT
TACATGATTCCTCATTGGATAAAGATCATCGTCCTGAACCACTTCTTGTT
TGGGCACCCTGTGAAAATGTATCTGATGAAAAAAATTCCTCATTGGATAA
AGATCATCGTCCTGAACCACTTCTTGTTTGGGCACCCTGTGAAAATGTAT
CTGATGAAAAAAtggatGAATATTTACGAGTTGCCAAAGATAAACATGGC
TACAATATGGAGCAGtggatGAATATTTACGAGTTGCCAAAGATAAACAT
GGCTACAATATGGAGCAGGCTTTAGGACTGCTTTATTGGCATAAATATGA
CATTGACAAAACATCTGAAGACTTAAGAAATTTCACACCATTACCTGGCT
TTAGGACTGCTTTATTGGCATAAATATGACATTGACAAAACATCTGAAGA
CTTAAGAAATTTCACACCATTACCTGATTCATGGAGCATGGAAGATCAAG
TTATATTTGAGCAATCCTTTAGTTCCTATGGAAAACATTTTCCTATTCAT
GGAGCATGGAAGATCAAGTTATATTTGAGCAATCCTTTAGTTCCTATGGA
AAACATTTTCCT
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000028_pilon | genome | sc0000028_pilon:620760..627562 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 316-381:6738 |
| Aaloc | 235-312:5560 |
| Aaloc | 184-234:5339 |
| Aaloc | 106-180:5013 |
| Aaloc | 49-102:4756 |
| Aaloc | 1-45:1 |
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