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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000028_pilon:592416..599447- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_040452 ID=XLOC_040452|Name=XLOC_040452|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=7032bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000028_pilon:592416..599447- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
AGGTTAACATACAAATTGGTTTGTTGGCACAAGACGGATCATCCAATGTT
ACGCATCAAGCCCGCTCGCTTAGAACGTATTTACCCCAAGCCAGAATTGA
TCTTCTACCGTCAAGCCATGTCTGACAGAGAAATCGAAAGAGTAAAAACA
CTGGCTATCGATATGGTAAGGACAGTTCTCTCTCTATAGAGCTTATCGGA
GTTTTTGATTTTTCTAAAAAAACGATGCATTGTGGGATTGTTTCGAGTGT
ATTACAATAGAATTCCCTTGAGGAATTCCTAAGAGATTTCTATTGTAATG
CGCTTGAAATAATCTCACAATGCATCGCTTTTTTAGAAAAATCAAAAACT
CCGATAAGGTCTACTTACATCCTAACGTTTTACAAAATATGGAAGTTTGC
TTCAACGTCATTTCAGACCACAAGGGCAACATGAAAAATCTTGCAAATAC
ATTAAAAGTACAGAACGGAACAGAAATAATCATATTACTTGTATCAACGA
CCAACCAAAATAAATTTTTCATGCGACACGTGCGGTCTTTTTCCTACATA
ACGTGACTCCTTGATAAGAACTATCCGAGATTCTTGGACACTAGGGCTAA
ATTCTTTATCAGAGATGCTCGCTTAGATAAACTTAGATCTTGATTGGGAT
TCCGTTTTCAGCCTCTTGCTTCTTTTATTCGATTTTAGCTTCCCGCCTCT
TATTTTCGTTTTCAGCCTCCCGCCTCCCACTTTCGATTTAAGCCTTCCGC
CTCCCACTTTCGATTTAAGCCTCCCGCCTCCCACTTTCGATTTCAGCCTC
CCGCCTCCCACTTTTCCAGTATACCGGTTAAAGACCTTATAAATTGTTAT
CTGAAAAGCTTGAGTGGAAATAGAAATGGTACACAACATGATTTTATGTA
TACGGAGTTATATTTACATTGAATGTAAAATAATTACAGGAGTTTGAATG
TTTTTTATTTTTTGGTTTTTATTTGATGTTTTTGACGATGTAGCGAAGAG
TTCACCATTGACCGTCATCTTCGGGCAAAGGAGCCTCTTGTGCTTCCTTG
ATTAGTTGTTGTGCAAAAGCTAGACGCTCTTTTGATATGCCAAGGCTTTG
TTCATCTTCGCTCTTGTCTTCTGCTTCCTTGATTTTAAGTCCGAAGTTCT
TCTTAGCGGATGATTCACACTCACTTTTCAATAATGGTTGACCAGCTATG
GCTGGAAGCAAGCCGCGTTGCTTTAATTGTTCGAACTTGGAGGCAGAGAC
GGTCAATTCCACGCCATTTTGATCCGCAAAAGTGACCATCTTGGGTGCTA
ACTTTTCGTTAACTTTATTCCGATGGCTGTTTTTTTGGTGAGTTGAGGAC
TCGATATTTGATGGTTGACCAGCTATGGCCGGAAGCAAGCCGCGTTGCTT
TAATTGTTCGAACTTGGAGGCAGAGACGGTCAATTCCACGCCATTTTGAT
CCGCAAAAGTGACCATCTTGGGTGCTAACTTTTCGTTAACTTTATTCCGA
TGGCTGTTTTTTGGTGAGTTGGACTCGATATTTGATGGTTGACCAGCTAT
GGCCGGAAGCAAGCCGCGTTGCTTTAATTGTTCGAACTTAGAGGCAGAGA
CGGTCAATTCCACGCCATTTCGATCCGCAAAAGTGACCATCTTGGGTGCT
AACTTTTCGTTAACTTTATTCCGATGGCTGTTTTTTGGTGAATTGGACTC
GATATTTGATGGTTGACCAGCTATGGCCGGAAGCAAGCCGCGTTGCTTTA
ATTGTTCGAACTTGGAGGCAGAGACGGTCAATTCCACGCCACTTCGATCC
GCAAAAGTGACCATCTTGGGTGCTAACTTTTTGTTAACTTTATTCCGATG
GCTGTTTTTTGGTGAGTTGGACTCGATATTTGATGGTTGACCAGCTATGG
CCGGAAGCAAGCCGCGTTGCTTTAATTGTTCGAACTTGGAGGCAGAGACG
GTCAATTCCACGCCACTTCGATCCGCAAAAGTGACCATCTTGGGTGCTAA
CTTTTTGTTAACTTTATTCCGATGGCTGTTTTTTGGTGAGTTGGACTCGA
TATTTGATGGTTGACCAGCTATGGCCGGAAGCAAGCCGCGTTGCTTTAAT
TGTTCGAACTTGGAGGCAGAGACGGTCAATTCCACGCCATTTCGATCCAC
AAAAGTAACCATCTTGGTTGCTTATTTTTCACTTTTCACTTTATTACAAT
AACTGACAGTTTTAACAAATTCAGGATGAGAATTACTTCTGCATGCGCTG
AGAGGTTTTTTTCAAAACTAAAGTTGTTTAGAATTATGAAAACTTTTCAT
ATGTGAGATTTTTTATTTGACGTCAAATATTCAGTTTTATCCTGCGTCAC
ATTACGTCACGTTTGCAACGTAATTTTCACTTTCAAATTTAAATGGACAA
AAGAACAAGTGATATTCCTGAGAAGGATATTGTTTGATATCCTCGACCAT
TCAAAATTTTGTGGTAGCCTAGAGGCCTCAAAAATTGTTGATATAGGCCT
ACTTTGTTATTCCTACTCGATAAATTTATTTTAATTAATTAATTAATTTT
TTTACTAGCTTCAACGAGCAACAGTACATAACCCGAGCACCGGAAAGTTA
GAATCAGCTGATTACAGAATAAGTAAAAGGTATAAATCTTTCATTTTCTA
TTCATGATGTGTCAACCAGTATTATTATTATTGCAGTGGCGGATCTAATA
GGAGTTCAAAAAGAGTGTTTCTTCTAGCCATACTGCTTATAAGGAAATGA
AGACTATACGTCATAGATCTCGAACCATCCCTGCAGATCCGCCATTGAAT
ACACGGATTGCAAAATTATATCAGTGCAGTCAAAACATGTGATTACTCGA
AAAAGTTTCCATGTACTTGCTTTACAACTTACAGCTGATAACTTTATTAG
TGTCAATAAATTCGAACCAATCAGAAATAAATGTCATGTAACAAGCACAT
AAAAATGTCGAGTAAAAGCGTGATTTGTCTTCAGACTTTAGTTTTGCAAC
CTGTGTATTAGCAATTGAATTATGCAATTTAAAAGGGCTGTAAGTTCCAT
TAAGGCTCAACCGATTGGTGGAGGTCAATCATCAGGAGAACTTTTTAAAG
TTGGTTAAAACCATGTGGAACTTTCAGTTTAGTGTTTTTAGAGATGTGAA
AAAAAACGAACTAAGGGAACTAGGTACGGGTTTCAGAATTTAATAATACG
CGTTTTAATTTTTATAAGAGCATCCAAAATTTTTAAAATGTTCTTAACTT
TTTGGGTTTTAAGCCTGAAAATCTACTTAAAATGTTCTCAATTTCACCAT
TTTGTGACCATTTTTACCTATTTTCCCAAGAAATTAGCTGTTTTAGACCC
CACGAAGCCTTATTTTGACCATCGAACCTTATACAGTTTGTTCCTATAAA
AAAAACGTGTACCATAATTGTTATTTTTCTTAAAGCGCTTGGTTGGACGA
GAGTCATGATGGTATTGTTGACATAATGAATCGAAGGATAGAAGCTTACA
CTGGACTAAGTATGGAAACGGCTGAAAAATTACAGGTCTGTTATTCAATA
GTTGTATGCCCTCGTGTGAGTCAGGGCGAGCTTAAACTTTTTAAAATCAC
AAATTGAAAATTAGATCATTGGCACCGATTCCCGGATCCCGGATTTTTAG
TTGACCTTTGAGTAAGTTTGGAACAGCTCAGATGGCAATGGATATATTTA
CCGATTTATTTTCAGCTCCTTGAAGGGCACCATTTATCGAATAACTTCTC
ATTTCGGAAGGGATTTTTTCAAAGGTGCTTCTGAAAAGAACTATCGTAGC
CATGCATTCTGTATTCTAATCCTAACTATCTTCTTCAGGTTGCAAATTAC
GGTATGGGTGGACATTATGAAACTCACTTTGACTTCGGAAGGGTAAGTTT
ATAGATTGGGCTCTTCCAGAAAAAAATTGTTCATGGGGGTTGGATTGGAA
GATATATTATTTTGTCAATGATCTACCCCTGGACATTTGGATTTTTCACC
CCCTGGACACGCGTTTTACCCCTGGACACGCGTTTTACCCCTGGACACGC
GTTTTACCCCTGGACATGCGTTTTACCCCTGGACATTACAAATTCAATCT
ATGGACATGGCAGTTATTCAGGATTTTTTCGATACCCCTGGACAATATAC
CTTCCACCCCCTATGAACGGTTTTTTTCTAGAGGATATCAACGTTTTAAG
AAAAGTTTATTCTAAAATTTCAATATCTAGTATGGCCTTTTTTGGATTGT
TTGAGATAATGATAATGATAATTTATGACATTTGTATTTTCAGAGTGTTC
CGCTACGTCCACCGCCCGGAAAGAACCGAACCGATTATACTTACGTAAGC
TTTTGATTTTTTTGAGTCCTATTTTAGGCTTTTTGACATTCAAATTATTA
ACAGTCTTTCATCATTAAAAGTGGACTCATCCGAAAAAAAAAATATGAGG
TGTTGAGAGCATTAATTATTACGACCGATTTTAAGATACTTATAGTTTGG
CAGGTTTATTGTTGAAAATTGACTCTTTCTTATAACCTGATTGCTTCAAC
TTCTGAACTGGATACAACTTGAAAATATTCAATATTGTTATTTTCAATTT
TTACATATCCATGAGTTTTTGACAAATGACCCCTAGATTATCAACACAGA
AATGATCTCATTTTTCACCAACCCCCAATGTCCAGCTTTTTCTATCCTTT
TACTCTCCTGATTTTCCAATTTCCCCAACAATCCCTGTTACAATTCTTTT
CTTTGAATTAAAGGACCCCTAATGTTTTTTATTACTTTCTCTCGTATAGA
GAACGCATAAAGGAGAAGATTTCAAGAAGGACGGACATCGAATTGCCACC
TTCTTAGCATATGTAAGTCTTTTGATTTTTAAGTTCTTCCATTGATGGAT
GTATTTGACTTACAGATACCAGAAAAGATTACGTCATTAAAAAAACGAAA
AAACGAAAATTTGAAAGAAGTTCAACTTTTTTAAACCGTTACGTCAAATT
TGCCCAAAGGGATTGCTTCATTTTTCAACCGACCAATGACCTTACAAAAA
CGTTAAAAGTTTTTGCTCATTTCGCAGAAAAGTGGAGACCAGCTTTTATA
CTGTTTGATGAGTGTTTGTCATCGCAGTGACTTGCTTTTTGCCACCCGTT
TACCAAAACTAAATATAAGCAAATTCTTTATGCCAGTGAGGGGAGGGGAT
TCAAAAATTATAATAGAGAGTCTTCATTCTCTCATAAGGATGAGTATGGC
CGAAAAAAACTCTCCGCCATAAATTTTGAACCATTTTAGATCCGCCACTG
TATGTTATTCTCAACTCAGCTGGCATATCACGTTGTTTCAACGTTCATTT
AAAGTTATATGGACGTTGTGAAAATTAGATAAACGTTAAAAAAAACGTAT
TGTGCCGGCTGGGAAGAATCAACTTTCCCCTAAACATCTTTAGTGAAACA
CGTTGAAAATATATTTCTTTCATTTAGATGTCGAATGTCGAAGCTGGAGG
AGCAACAGTATTCACCAATATCGGACAAGCTGTCCAACCAGCTAAGGTGT
CGTTGTGTTTATTAAATTTCAAAGATATTCTCCATCTTACTGTCCCGTTT
GTAATCTCTGAAGAGGCTCTTGTCTTATTTTTAAGTAATAGACCTTATCG
GAGTTTTTGATTTTTCTAAAAAAGCGATGTATTGTGGGATTGTTTCGGGA
GTATTACAATAGAAATCTCTTAGGAATTCCTCGAGGGAATTCTATTGTAA
TACTTCCGAAACAATTCCAAAATGCTTCACTTTTTTAGAAAAATCAAAAA
CTCCGATAAGGTCTATTGAATAGACGGTGATCTGAAAAAAACTAATTTAA
ATTTAATTGATGATCACAAAATCATCCCAAAGGTTAGAACAAGGGTGTTG
ATTGAGGTATATGGTTGAAATCATGTTTCTGAAACAGGGTGAAAATTTCT
TGCGGCAGAATGAACTAAAGGAATGCGATCAAAATATATATGGAGTTGAA
TATCGCTTGTCTTGAAATTGGTGGGGATCTGTCAGAACTATAGGATAAAA
ATTCATGTTTTTTTTAACCTCCAAAGACGTTTCGGATTTTTTAGCTTGCG
TTCATTATTTGTTTGCAGGGTGATGCAGTATTTTGGTTCAATCTCCATCA
CGATGGCTCTGGTGATTTCGATACAAGACATGCAGCTTGTCCTGTACTCA
TCGGTGAAAAATGGGGTGAGTAGGTCCTAGGCTTCTTCGTATCCAACAGC
GAAATGGTTTTTTCAAAAGAAAGTATAGAGCTCTGCGAATCAAACTAAGT
CATAGGCGTAGCGAGATACCCTGCAAAATTTATGCGGTTTTTACGACACT
GAAATTATTGTCTTTGTTTTATCATAAGCTAATGAAATATGTCATAAACT
ATTGCACTCCCTCATAAATTTTGCAGGTTATCTCGCTTCGCCTATGTAAA
GTACACTGGAGTGTTTATAACTCGAACAAGTTTCCTGGTTCCTTCAGTTA
ACAATACCTTATAAACCAATCTCCATTGTTATTAGAAATTTCCATAATTC
GAGCATATTTGTGATCGCCATGCGTGTTGAATAATGGAGACTCTAGTGTA
GATGAGAGTTAGATAAACGATTTAGTTATGTTGAAAACCTTTAAAGCGGC
CAAGATTTACGGCCAAAATTTTTAAAATCATAATTACAGCCTATAGTCCA
TTTTTATAGTGAAATGAAACATGAATAATCAGGATCAATGATCTTATCCT
TTATTTCTGAGATTTATTGTTGTCTGACCGATGTCTTTATTAGAGCGCAA
TCAATCCTGATTACCCATGATTCATTGCCTGTGACTCGTGAAATGACCTA
TTCATAATGATAACGAATGCTCTCGTTTGGATTGCAAAGGGGTTTTTCAA
TCTGCAAAGTAAGAACACATTTGAAGTTGAATTCTATTCTCATGTTCATT
GCTTTTAGTTTCAAATCGTTGGATTCACGAACGAGGTCAAGAATTCCGAA
GACGTTGTAATTTACGACCAGAAGACGATTAG Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000028_pilon:592416..599447- >XLOC_040452 ID=XLOC_040452|Name=XLOC_040452|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1488bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000028_pilon:592416..599447- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
AGGTTAACATACAAATTGGTTTGTTGGCACAAGACGGATCATCCAATGTT
ACGCATCAAGCCCGCTCGCTTAGAACGTATTTACCCCAAGCCAGAATTGA
TCTTCTACCGTCAAGCCATGTCTGACAGAGAAATCGAAAGAGTAAAAACA
CTGGCTATCGATATGAGGTTAACATACAAATTGGTTTGTTGGCACAAGAC
GGATCATCCAATGTTACGCATCAAGCCCGCTCGCTTAGAACGTATTTACC
CCAAGCCAGAATTGATCTTCTACCGTCAAGCCATGTCTGACAGAGAAATC
GAAAGAGTAAAAACACTGGCTATCGATATGCTTCAACGAGCAACAGTACA
TAACCCGAGCACCGGAAAGTTAGAATCAGCTGATTACAGAATAAGTAAAA
GCTTCAACGAGCAACAGTACATAACCCGAGCACCGGAAAGTTAGAATCAG
CTGATTACAGAATAAGTAAAAGCGCTTGGTTGGACGAGAGTCATGATGGT
ATTGTTGACATAATGAATCGAAGGATAGAAGCTTACACTGGACTAAGTAT
GGAAACGGCTGAAAAATTACAGCGCTTGGTTGGACGAGAGTCATGATGGT
ATTGTTGACATAATGAATCGAAGGATAGAAGCTTACACTGGACTAAGTAT
GGAAACGGCTGAAAAATTACAGGTTGCAAATTACGGTATGGGTGGACATT
ATGAAACTCACTTTGACTTCGGAAGGGTTGCAAATTACGGTATGGGTGGA
CATTATGAAACTCACTTTGACTTCGGAAGGAGTGTTCCGCTACGTCCACC
GCCCGGAAAGAACCGAACCGATTATACTTACAGTGTTCCGCTACGTCCAC
CGCCCGGAAAGAACCGAACCGATTATACTTACAGAACGCATAAAGGAGAA
GATTTCAAGAAGGACGGACATCGAATTGCCACCTTCTTAGCATATAGAAC
GCATAAAGGAGAAGATTTCAAGAAGGACGGACATCGAATTGCCACCTTCT
TAGCATATATGTCGAATGTCGAAGCTGGAGGAGCAACAGTATTCACCAAT
ATCGGACAAGCTGTCCAACCAGCTAAGATGTCGAATGTCGAAGCTGGAGG
AGCAACAGTATTCACCAATATCGGACAAGCTGTCCAACCAGCTAAGGGTG
ATGCAGTATTTTGGTTCAATCTCCATCACGATGGCTCTGGTGATTTCGAT
ACAAGACATGCAGCTTGTCCTGTACTCATCGGTGAAAAATGGGGGTGATG
CAGTATTTTGGTTCAATCTCCATCACGATGGCTCTGGTGATTTCGATACA
AGACATGCAGCTTGTCCTGTACTCATCGGTGAAAAATGGGTTTCAAATCG
TTGGATTCACGAACGAGGTCAAGAATTCCGAAGACGTTGTAATTTACGAC
CAGAAGACGATTAGTTTCAAATCGTTGGATTCACGAACGAGGTCAAGAAT
TCCGAAGACGTTGTAATTTACGACCAGAAGACGATTAG
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000028_pilon | genome | sc0000028_pilon:592416..599447 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 673-744:73 |
| Aaloc | 574-669:915 |
| Aaloc | 505-573:1556 |
| Aaloc | 442-504:2234 |
| Aaloc | 391-441:2740 |
| Aaloc | 337-390:3195 |
| Aaloc | 238-336:3597 |
| Aaloc | 166-234:4475 |
| Aaloc | 1-165:7033 |
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