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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000304_pilon:289890..295647+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_040261 ID=XLOC_040261|Name=XLOC_040261|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=5758bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000304_pilon:289890..295647+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ATGTCTGGAATTACAAGACTTGCAAGACCGTTACTTCGCTCTACCAAGAC
CCCTACAAGATTTGCACAGGCCTGTTTTAGTACCACTTACTCTCAAAATG
CaccaaaagaaattaaaacagGTACCGAAGCAAGAGCTTTGATGTTGAAA
GGTGTTGATCTTCTTGCTGATACTGTCGCTGTCACATTGGGCCCTAAGGT
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CTgggggaaaacctggaaaagttatatttttcattatgtTTTCAAGTTGg
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agaccaagagtaaggcctaaaagcctggagctgtctattgtgtagactaa
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GTTTGTAGGTTTGAAGTATTGTCTTCCAGTAAAACCAAGCTCTCAACTGT
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TATTGTTAAAGAATTTTCAGATGGAACAGCCAGAAACCTAGACAAAATTG
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tgagcactgctcttgttttgaatattaaagaaagaaattttggcggaaag
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gtattgaaattctccggataaatcAATCGCATGCgtactgaggttttaat
gaaacaatagagtttTAAacttaagccaatcagctgtgtttaaacattct
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TAtgatgaatgttttaatttctgaGGCATTTACAGTTTTCTAATTTTGTC
ATTTCTATTTTGATGCACTTTACAGCCTTTCTGTATTCTtgagttgaaaa
taagaaccaaaattattttttaaggtGTCATGACTGCAGTCGAAACTGTC
ACACAAGGATTAAAGGACATGTCAAAGCAAGTTACTACCTCAGAAGAAAT
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TCATTTCCAGTGCCATGGAACGTGTTGGAAAAGATGGAGTTATCACTGTC
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ATTTGATCGCGGATACATTTCTCCTTATTTCATCAACAGTGCCAAaggac
aaaaagttgaatatgaaAATGCCTTAGTTTTAATCTCTCAAGCCAAAATC
TCAAATGTTCAAGAGATTGTTCCTGCTTTGGAGCTTGCAAATCAACAGAA
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GCACCAGGATTTGGCGATAACAGAAAGAATACTCTTCGTGATATTGCCAT
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GGTTTAAAATTAGATGAGATTCAACTAAACGATCTTGGTCAAGTTGGAGA
ATTGGTCGTCACAAAGGATGATTGTCTTATGATGAAAGGACGTGGTGATA
GCAATGCTATTGATGCACGAGTTTCACAAATCAAAGACGAAATCCACGAA
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AGTCGGTGGAGTTGCTGTTATCAAAGTAAGTAAACATAACTTCATAAAAT
CTTTTCCATTTTTATGTCCTTTCTAGTGACGTTGCACAATAAGAAATTTA
GTTTTGTGTAATTCTAAACAAATAAGTTGGTAGTGAACAGTGTAAAAGCC
TGAAAGCCTCTgatgaaaaacaaaacttaaatacGTTAGtgatgaatgtt
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TTAATTTGTTAAtgatgaatgttttaatttctgaGGCTAATTTTTGCCCT
CCGTCCATGTCTTAAAAACCCATGATGAAAAAACTAGCTTAATTATGAtg
atgaatgttttaatttctgaggtttgaattttttttggtttcatgTCTTG
AGTTTCCTTCTTTCTGACCAGTTCTGACACATTGATGATAGAGCGACAGA
CAACATATCTACTGAATTCGAGTATGATCCAATCTGAAATACTCTCTACA
GGTTGGCGGAGGTAGTGAAGTTGAGGTTAACGAACGAAAAGACCGTGTTA
CGGATGCTTTGAACGCCACACGTGCTGCTGCCGAAGAAGGTATCGTTCCA
GGTGGTGGTACCGCTCTCATCCGTTGCGCTTCATTGTTAGATGGTCTCAC
CCCAAAGAATGACGACCAGAAAATTGGAATTGAGATCGTCCGATCAGCGC
TTTACACACCTTGTACAAACATTGTCTCCAACACTGGAATTGAGCCTGCT
GTAATTGTTCAAAAGGTAACAGTGAAATGCCTATTTCAGGCTTTCTCATT
TGAAAAATTCAGACGCGTGGTCAATTGAACTCATAAAATCTGAGTTTTGC
TTATTTAGACGGTGTGATTAAGGTGTTCTGACACCACTATTAATAGTAAA
TTTTTGAATTATCTGTGGTCCACTCTCACTCCTCAAATGATTCAGCCTGT
ATTTGATAGCAATAATAAATAATTTTGTTGAATAGGTCATGAAAATAATT
TCAGGCCTACCTTATTACACTTACATAACTACTCAAGTTATTAACGTGAA
TCGGTCACCCTCGCTTTAGTTACAACCGTTGAGCAAAGTTTGATCCGTGG
TAATCTTTGGAAACCCTGCCTTTCGCGTTAATAAATTGTCGCATTCAATT
TCCCGCGTTAAGTACTCGATTAGTTATATAAGTGTAGTAAGGTATGCTCG
ACAGACTCTTTTAGATTTTCACTTCAAGGCTGTTTTCATGGGAAGGAAAA
AATAGACAAATCCTTCAATTTTTCCACTACTTCTTTTCTGAACTTCGTAG
GTTGCTTCAGCTGAAGATCCAGAGTTTGGTTACAACGCAGCCAACGGAGA
ATTCATGAATCTTGTCGATGCTGGAGTTATCGATCCTTCAAAAGTTGTCC
GTATTGCTTTGAACGACGCTGCTGGAGTCGCTTCTCTTCTTACAACTGCT
GAGGCTGTCATTACTGAAATTCCAAAGGAAGAACCACCAATGCCACCTAT
GGGTGGAGGCATGGGTGGTATGGGAGGAATGGGTGGTATGGGCGGAGGCA
TGTTTTAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000304_pilon:289890..295647+ >XLOC_040261 ID=XLOC_040261|Name=XLOC_040261|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3516bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000304_pilon:289890..295647+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ATGTCTGGAATTACAAGACTTGCAAGACCGTTACTTCGCTCTACCAAGAC CCCTACAAGATTTGCACAGGCCTGTTTTAGTACCACTTACTCTCAAAATG CaccaaaagaaattaaaacagGTACCGAAGCAAGAGCTTTGATGTTGAAA GGTGTTGATCTTCTTGCTGATACTGTCGCTGTCACATTGGGCCCTAAGAT GTCTGGAATTACAAGACTTGCAAGACCGTTACTTCGCTCTACCAAGACCC CTACAAGATTTGCACAGGCCTGTTTTAGTACCACTTACTCTCAAAATGCa ccaaaagaaattaaaacagGTACCGAAGCAAGAGCTTTGATGTTGAAAGG TGTTGATCTTCTTGCTGATACTGTCGCTGTCACATTGGGCCCTAAGgGAA AGAATGTTTTAATTGAACAGAGCTTTGGTGGACCAAAAATCACAAAGGAT GGTGTCACAGTTGCAAAAGCTATTGATCTTCCTGATAAATACATGAACAT GGGAGCACGTTTAGTACAAGATGTTGCCAACAACACAAATGAAGAAGCTG GCGATGGTACCACAACTGCAACTGTTCTTGCAAGAGCCATTGCTAAATCT GGTTTTGAGGCTGTTTCTAAGGGAGCAAACCCTAATGAAGTTAGAAGAGg GAAAGAATGTTTTAATTGAACAGAGCTTTGGTGGACCAAAAATCACAAAG GATGGTGTCACAGTTGCAAAAGCTATTGATCTTCCTGATAAATACATGAA CATGGGAGCACGTTTAGTACAAGATGTTGCCAACAACACAAATGAAGAAG CTGGCGATGGTACCACAACTGCAACTGTTCTTGCAAGAGCCATTGCTAAA TCTGGTTTTGAGGCTGTTTCTAAGGGAGCAAACCCTAATGAAGTTAGAAG AGgtGTCATGACTGCAGTCGAAACTGTCACACAAGGATTAAAGGACATGT CAAAGCAAGTTACTACCTCAGAAGAAATTGCTCAAGTTGCCTCAATCTCT GCTAACAATGACACTACTGTTGGAAGCCTCATTTCCAGTGCCATGGAACG TGTTGGAAAAGATGGAGTTATCACTGTCAAAGATGGCAAGACTGTTGCTG ATGAACTTGAAGTTATTGAAGGAATGAAATTTGATCGCGGATACATTTCT CCTTATTTCATCAACAGTGCCAAaggacaaaaagttgaatatgaaAATGC CTTAGTTTTAATCTCTCAAGCCAAAATCTCAAATGTTCAAGAGATTGTTC CTGCTTTGGAGCTTGCAAATCAACAGAAACGTGCTTTATTGATCCTTGCT GAAGATGTTGATAGTGAAGCCCTTACAGCCCTTGTTATCAACCGATTGAA AATTGGATTACAAGTCGTTGCTGTCAAGGCACCAGGATTTGGCGATAACA GAAAGAATACTCTTCGTGATATTGCCATCTCAACTGGAGCTGAGgtGTCA TGACTGCAGTCGAAACTGTCACACAAGGATTAAAGGACATGTCAAAGCAA GTTACTACCTCAGAAGAAATTGCTCAAGTTGCCTCAATCTCTGCTAACAA TGACACTACTGTTGGAAGCCTCATTTCCAGTGCCATGGAACGTGTTGGAA AAGATGGAGTTATCACTGTCAAAGATGGCAAGACTGTTGCTGATGAACTT GAAGTTATTGAAGGAATGAAATTTGATCGCGGATACATTTCTCCTTATTT CATCAACAGTGCCAAaggacaaaaagttgaatatgaaAATGCCTTAGTTT TAATCTCTCAAGCCAAAATCTCAAATGTTCAAGAGATTGTTCCTGCTTTG GAGCTTGCAAATCAACAGAAACGTGCTTTATTGATCCTTGCTGAAGATGT TGATAGTGAAGCCCTTACAGCCCTTGTTATCAACCGATTGAAAATTGGAT TACAAGTCGTTGCTGTCAAGGCACCAGGATTTGGCGATAACAGAAAGAAT ACTCTTCGTGATATTGCCATCTCAACTGGAGCTGAGCTGTTTGGAGATGA CATGGGTTTAAAATTAGATGAGATTCAACTAAACGATCTTGGTCAAGTTG GAGAATTGGTCGTCACAAAGGATGATTGTCTTATGATGAAAGGACGTGGT GATAGCAATGCTATTGATGCACGAGTTTCACAAATCAAAGACGAAATCCA CGAAACCAATTCTGACTACGAACGAGAGAAATTTCAAGAACGTTTAGCTA AATTAGTCGGTGGAGTTGCTGTTATCAAACTGTTTGGAGATGACATGGGT TTAAAATTAGATGAGATTCAACTAAACGATCTTGGTCAAGTTGGAGAATT GGTCGTCACAAAGGATGATTGTCTTATGATGAAAGGACGTGGTGATAGCA ATGCTATTGATGCACGAGTTTCACAAATCAAAGACGAAATCCACGAAACC AATTCTGACTACGAACGAGAGAAATTTCAAGAACGTTTAGCTAAATTAGT CGGTGGAGTTGCTGTTATCAAAGTTGGCGGAGGTAGTGAAGTTGAGGTTA ACGAACGAAAAGACCGTGTTACGGATGCTTTGAACGCCACACGTGCTGCT GCCGAAGAAGGTATCGTTCCAGGTGGTGGTACCGCTCTCATCCGTTGCGC TTCATTGTTAGATGGTCTCACCCCAAAGAATGACGACCAGAAAATTGGAA TTGAGATCGTCCGATCAGCGCTTTACACACCTTGTACAAACATTGTCTCC AACACTGGAATTGAGCCTGCTGTAATTGTTCAAAAGGTTGGCGGAGGTAG TGAAGTTGAGGTTAACGAACGAAAAGACCGTGTTACGGATGCTTTGAACG CCACACGTGCTGCTGCCGAAGAAGGTATCGTTCCAGGTGGTGGTACCGCT CTCATCCGTTGCGCTTCATTGTTAGATGGTCTCACCCCAAAGAATGACGA CCAGAAAATTGGAATTGAGATCGTCCGATCAGCGCTTTACACACCTTGTA CAAACATTGTCTCCAACACTGGAATTGAGCCTGCTGTAATTGTTCAAAAG GTTGCTTCAGCTGAAGATCCAGAGTTTGGTTACAACGCAGCCAACGGAGA ATTCATGAATCTTGTCGATGCTGGAGTTATCGATCCTTCAAAAGTTGTCC GTATTGCTTTGAACGACGCTGCTGGAGTCGCTTCTCTTCTTACAACTGCT GAGGCTGTCATTACTGAAATTCCAAAGGAAGAACCACCAATGCCACCTAT GGGTGGAGGCATGGGTGGTATGGGAGGAATGGGTGGTATGGGCGGAGGCA TGTTTTAAGTTGCTTCAGCTGAAGATCCAGAGTTTGGTTACAACGCAGCC AACGGAGAATTCATGAATCTTGTCGATGCTGGAGTTATCGATCCTTCAAA AGTTGTCCGTATTGCTTTGAACGACGCTGCTGGAGTCGCTTCTCTTCTTA CAACTGCTGAGGCTGTCATTACTGAAATTCCAAAGGAAGAACCACCAATG CCACCTATGGGTGGAGGCATGGGTGGTATGGGAGGAATGGGTGGTATGGG CGGAGGCATGTTTTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| sc0000304_pilon | genome | sc0000304_pilon:289890..295647 + |
Properties
| Property Name | Value |
| Aaloc | 1501-1758:5501 |
| Aaloc | 1237-1500:4702 |
| Aaloc | 994-1236:3933 |
| Aaloc | 454-993:3177 |
| Aaloc | 199-450:1993 |
| Aaloc | 1-198:1 |
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