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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000727_pilon:23477..32835- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_040214 ID=XLOC_040214|Name=XLOC_040214|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=9359bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000727_pilon:23477..32835- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ATGGCAGAAGTAAGACCTACAAGAAAAGTAGCTTTGATCACTGGAATAAC
AGGACAGGTAAGTGTGGAACATTTTGTTTTTTTTCTACATTTTTAGTTTC
CGATATCTAAATTAGAAAATAGAATACTTTAACTGAAAAATTGAAAAATT
CAAAGATTTGGCCAACAAAGATGACAATGTAGCAAAGAGCCTTATCTGGT
ATGCTGAAAATTGCTATGTTTTTTATAGGATGGCTCCTACTTGGCTGAAC
TATTACTAAATAAAGGATATGAGGTGCATGGTATAATCAGGCGATCAAGT
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TGTCACTGGAGGTAACCTCTTTGGAAGGTTTTTTCATTCTGTCCCTTCTC
TTTATATTTATACTTCAGTTTCTTTTTTTCTTTTTTTTTTCTTTTTTTTT
CTCACTGAAGATTGGTGCCTGTGCACCATAAAACTCTGAGTTTGAAACAA
AGATATTGAGTCAACTCTTTATTATACTTCAGTTTCTAAAAACATTATGT
TTAGTTTTCACTCCTCTATGTTTTTAAAATGAAGATTTTGAAGATAAACA
AATAGGTTATTTAAAAATTCTTCCTTGGTATATACCTTCCAAAGAAAATA
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ATTTCATTACAATTATTATTCCAACCTCTCACTTATTGAACTTTTATATT
TTTCCCATTTCCTTCAATTCCATGGCTAGGCAGACCATTTTTCATGCCTT
TTTAGCTTATGGTTATTGGACGGTGCAGCGTTTGTATGGTAAAAACTGCC
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ACACTTGGTTTTTATTCACTTGATGTTTTCTTTTGCTTTAGATTTGCACT
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ACAAATTGTTGAATGTAATGATTCCATTACAATTCATAGTGCTTGCATAA
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AATTGACCACTGTGATGTGGAATTCCTGGCAAGATTCTTCTTCTATTTTA
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ACACAAACAAAATAAACAATCAACACATTCAACTTTGATTCCACTTTTCT
AGAAACATTTCTAGAAATACTTTAGATGTACAAACTTTCGCAAGCAGAAA
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GCAAATTTTCGACCTTGCGAAAGTTTCTGCTCGCAAACGTTTGTACGCCT
AAAGTATAGTCTAAAATGTTGCAAAATGTTTTTAAAAACCTTGGAAAGAT
CATCAACCGCATAGACAAATTTTTCGCTCCCTTTCTATTCATTGTAACCA
GGTGTCGTTTGACTTGGCTGAATATACTGCAGATACTGATGCAATGGGTA
CTTTGAGGTTACTGGAAGCCATCAAAACGTGTAATCTTATTGGCAAAGTC
AAGTTCTACCAAGTAAGCTGGTAGATTTCGATATTTTACAGGGGGTTGTC
ACGTAAATCTAAAAGTAATATAGAACTTGTTATCAGCCTTTCGTTTTGCT
TTTACTGGGTCCACATCTGGTTGGCTTTGAACAGAAGGGAACGTGGAAGC
ATTCGAACTAGGAACCCCAGGTTTGTGGCATGCACGCTTAAACCGAAGGT
ACTCCAGGGAAAGGAGGGATCTTTAGTATTTATGTAACCCAGAGTCAAGC
TCATTTAATTCTGAAGGTGCATAGCACGCAAAGATACCAATCACTTTGAA
GAAGCTTTCACCTAAACCGTAATGGATAATTTTTATCTTATTAAATTGTA
TGATTGCTCTATTTTGTTCATTAAAGGCTTCAACGAGTGAAATGTATGGA
AAGGTTCGTGAAATTCCACAAACTGAACTTACACCTTTTCACCCTCGATC
GCCCTATGGTAAGATAATCTGAATAACCTTTCGATCTTTGTGAATTCTGC
CAAGCAAGTCAGTAACAATAAAGTAACAATAATAATGCGTTCTAAGATTT
AGTTATTTATAGAAAGGCAGGGGACGCGACTTCTGTGTTGACAAAACAGA
ATCAAAAAATAATTTTTATGATAAAATAATGTCCGTTGATAACGCAAATT
ACTTTGAATTATATTGGATTAAAACAAAAATTTAAAAATTCATGTAACAA
TTTTTATTTCTTTCGTAGCTTTTCGGTGTTCATACCATCATCAGGTTCAT
AAAAATGATCTAGTTTACTTTGAATTATATGATTTGATATTTCTTAAAGC
CGACCCATACATACATGAGTATGGAGCTGTTTTATTATCTTGTAAAAACA
ATAGAAAAATTTACTTGATCTATCAAAAATGACCCTCCATTGGTTTCAAT
TCTTATTCAACATTTTTTTAGCGTGCTTTCACTGAAAGGTTCTAAAATGA
TGGTCTGCGTTATGTAATTATTTTGTCAAGAAAGATATTCAGTAGCGAGT
ACCTACCTCACCAAAAACTGGAATTTTTCATCCCGTTTCCACTTTGATGA
TTTTCGAAAAATAGAAGCCTTTCAAGTGTTCTGACGCAAATTCGATTTTT
TTTGATTCCGCAGGAGCTTCAAACGCTTAAAGTGACGTCAAAAAATCGAA
AACCTGGGCTCAAAATATTCGAAAAAGTCGCAAAGTGGAATAGACGTTAC
AGCGTAAAAAAAAAGCCGTGGCTAGACATTCAGTTGTCAAAGAGAACAAT
ACACGTATTTCCTATTAGCGGATTCATGTAAAAAAGTTACGAAAAACGTC
GAGAAAGTCTCTGATTGGCTGAAATATTGCATATACAAGCATATTTTTCA
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AATAGGTGTATTGACTATCATAACGTGCCGAGTGCTTCTTTTTTTATGAT
TCGTTTTAACGCTGCAATGTCTTTGCAATCTCAGCATATTTCCTTATAGC
TTCAAGTATAGTTAACTTTGCTTCAATGCGGTTTCTATTATAAAGGTTTT
ATTTTTACATTTTACTTATAAGTGTTCCCGTTTCATATTAGACACATGTT
TCATATCAGAAAAGTATCTCCCTATTGTTTGTTCTGTTATTCTGCTGAAT
AAACAAAAATTGGTTTTAATTCTTCTCCGCTTTTTGACGAATCTTGTCCA
CACATTTGTGTCAATTCAATGTGAAAAAGCTTGTAAATTAAAAATTGATG
GGTAAGCAAACGATATCATTCTTATTTAAAAACAAAACCCTTAAAAGTTG
TAAAAGTGTAAAATGTAATATCTACCGGGTGACCCACGAAAAAGTTCAGA
CGTTTCTCGACGTCTTGAGGCCGAACAAATGTCCCAAAGTGCTTAGAGTT
TAGATATTTAGAAAGTAGATATCCTAACTTAAAATTTGAGCTATCACTTT
TTTTAAATTTGACCAATTTGTTCTCTACTTATGAGCTTTTAAAGTCAAAA
GTCACTTTTCGGAAAGTGTAAAAAACACGTACAAAGGGGTATCAAATTTG
GTATTTTTAGACGTTTTTGATATACAGTTTTTGAAAAAAATCTGAAAAAT
CTACAAAAGCGCCAATTTTTATAAAAACTAGTCTTGTTTTAGACAAAAAT
TACTTTTAAAGGTGTTTTTATTAATCATTAATGTCATAAAACTCGTTAAG
TAAGTCAATTTGTAAGTGATTTTCTGATTGATTGCATGAATTTAATACCT
CTTTTTTACGTGTTTTTTTACACTTTCCGAAAAGTGAATTTTGAGTTTAA
AAGCTCATAAGTAGAGAACAAGTTGGTCAAATTTAAAAAGTGATAGCTCA
AATTTTAAGTTAGGATATCTACTTTCTAAATATCAAAACACCAAGCACTT
TGGGACATTTGTTCGGCCTCAAGATGTCGGGAAACGTCTGAACTTTTTCG
TGGGTCACCCGGTATATTTTTTTTGTGTTCAGGGGTTGCAAAATTATATG
CATACTGGATAGTTGTCAATTACAGAGAAGCTTATGGTCTGTTTGGTTGT
AATGGTATCTTGTTCAATCATGAATCTCCACGGAGAGGTAGGTGGCTCCG
AATTCCTGTTGAACCTGAAGAGCTAGATACAGTAGAGTAGACAAGAGGGG
TGCAAAATTTGTTGTTAAAATTCATTGGTCATTTGATTGTTGTTATATGA
TGTGGGAAAAGTTTTAGTGTTTTCTGAAATTTGATTAGCTTCTTCAGATA
TAGGAGAGCTGATTCTTATCTTATGACACTGTACTCATCAATGTGTCATG
AAAATCTGCTATTCTACGCAAATTTTGCGCCCCTCTTGTCTACGCTATTG
AAATTTTCGCTCCATTTTATTATCTACATATATAAAATAAGCTGCAAAAA
GATCTATTAAGCTTTTTGTAGACTTAAAAAAGATTGATCGAAAATTATCG
AAAATCCCCTTAATCTTTAAAAGGACATTTTGTATCTTGGTTAGTTGTAA
ATGTTTTTTCGTAGCTGTTTATTTCCAATTGTCAATAAATTAATTATTAT
TATCATACCTTGTCTTTTTATTTAGGGGAGACATTTGTGACTCGAAAGAT
CACAAGAGGTGTGGCAAAGATCAGCTTGGGTTTGCAAGATGAGGTACTAT
AGATTGCGACAGCAAATTTTCAAAGTTCTCAGCCTCTTTTACCATTTTAT
CATTCAATTCCGTACCTATACTATGCTATAGTCTAAGACGAATTCGAATA
ATAAAGAACAACCTCAAACATGCAAATAAGCAGTCGGGCGGAAATTTTGT
CCACGTGAGCGAAAAATATTGGAAGGGGCTCAATGTCTTAAACACAGACT
CTATTTTCCGCCGCGCAACATACTACGTTTTTGATATTACACAATTACGT
TACATCATAATATCATAATAATATATTACATGGACGAAAGCATTGTCTAA
TACCACGAATGAACATGACACCTGATGAAGTTCTGAGAGAGAACGAAGTA
TCGTCAACAGAGTTGATTTTACTATTTTGTTTGTGATTTTGTAAGCTTGC
ATATTTTTCCTTTTACCAATGCCAATTGTTATACATATTATGTCATTAAT
TCCATTCCCTTCTTCTGTTTTAGCTGGTCCTCGGCAATTTGGATTCTATA
CGTGATTGGGGACATGCTAAAGATTACGTAGAGGTATCTTTATTTGAAAG
TATTAGTCTTTAAATTCGAGGGTTACTTTTAACTTTTCGTTGACATTTCA
GAGATTTTTGAGGAAAACCCGAAAGGTCTACCTCCTCCAGCTGGAAATTT
CAGATTTGACCTCTTAGACACTGTTAAGATGTTTGTCTCGAATAGACCAT
TCTGCAGACCCTTTCATGTTTGCCTGGTGTATGCAAATCATCATGATGCA
AAGTATACGGTTCACTCTCTCTAATTCGACCTTCAAGAGACCAAATTTAT
CTTCGAATTACAGAGAGTAATTAAAATCACTCTCTAGCAAGAGAATCAAT
CGATTTACAAAAAGACTTGCATAATAGAGTTCGAATTAGAGATATTTAAC
TGTACTATATAAATCTTAGAAATATTCCTCCTTTTCTCGCTCCTCATCAA
CAGGCCATGTGGTTGATGTTACAACAAGAGGGAGCAGACGATTACGTTGT
AGCGACCAATGAAACTCATTCTGTTCGAGAGTTCGTTGAGAAGTCTTTCG
GTCACGTTGGTGTCAAAATAAGGTATGTAGGTATACAGTAGAGGCTAAAT
AAAGTTACATAACTTCGACCATATAATGACTGAAATGAATGGGCCCTTTT
AAAATCAACTGTTTTCTGCCATATATTCTGTTGGCCTCCGGTAATTACGC
ACGGAGCGAGCGTTAGCGAGCGGAGTGCGACTCTTTTGGCAAACGCATGC
GCGTAAGCAAAATTTACAAAATTTCAATGATATGCGGGCACAAAAAATGA
AATTCAGTTTTTTTTCACGATTTTTTTCGTCTAGCCGCTATTCCGCCGTG
TTTAGCCTGTGGAATGTTTCAACTTTGAAAATTCCGTGAAAATTAGCGTT
TTTTAAGAAGAAGTCGTTGCAGTGGCAATCTTTCGCAAATTTATAAACCC
ACTTTCCCTTGGAAAAAATTGACGTTTTTTGTTTTTTTGGGACCCTTGGG
GCATTAGGCACCTGTTGACCGCAAAAATTCCTAAATTCGCGAATTGACCG
TTGATAACATTAGGGGTAAAGGGACCCAATGACGTCACGGATTTGGGAAA
AACTTCAAAATGCGATATCTCGAGTTAGAAGAGGAGTTGGGAGGTCGTTG
ACCCCTCAATCTATCGGGAACTTTATGGGGAATGAAATGGGAGGGTTTAT
AAGGCTTGAGTAGCACTTTCAAATTTGGCTGAATTTTCAGCCATTTTCAG
TTGATGACGTCATCAAAACAGAAAACATGCGATATCTCGAGTTTGAAGAA
GAGTTGGGAGGTCGTTGACCCCTCATTAGATCGAGAACTTTATGGGGAAT
AAGATGGGAGGGTTTATAAGGCTTGAGTACGATTTTCAAATTTGGCTGAA
TCTTTAGCCATTTTCAGTTGATGACGTCATCAAAACAAAAAAAAAGCGAT
AACTCGAGATTGGAAAGGAATGGGGAGATCGTTGACCCCTCATTCTATCG
GGAATTTTATGGGGAATAAGATGGGATTGGAAACGAGTTTGGAAATGGCT
AACCCCTCTTTGGATCGGAAGATTTATCGAGAATGCAATGGGAGAGGGGT
GTTATGAGGCCTTAGGATGACTTTAAATAAAAATTGGTTAACATTTGGGT
AAGCAGCGTGAGAAAAACAAAACAAAACAGCCGAAAAGAACTGAACTCTA
GGAATAAATAATGGAAAAACGTAAAAAAACTATTTTTTGATGAGCTCTTA
CTCCATTCTTTCCAAAAAGTCAGTGAAATCAAAACTGATGAAATATATAG
AAATGATTACAAAACTACTCGACGCACACGTGACACGACCCAAAGTAAAT
AAATTCAGCTTTCGGCACTTTCGTTCGTTTCGTGAAAACCAAACAGTTCT
TTTTATCAATGTATTATGCCATAAAAGCTTAAAATTCTTTAATACTTGTC
AAGAATATTTTCCATAACAAAACGAGGGAAATTCAATGTCTTTGATTAAA
CCATAAATCAGGTAACGAGGGATTTTTGTAAAAAGTCTCTTGTGTCTCTC
CCAATCCTCCACAAAACTGTGACTTTGACTTTTCAACATCAATTCTTCAA
CAATCAACACTTCTTACTTCGAAAATTCGACCCAATTAGTTTTTGTTGCA
AAAATGTTGTTTCAGACCATTCATAGCTTAAACCAGTATGCATTTTCTTA
TCTATGCATCGAAACAAAAACATCGAAAAGTGTTATCTGATAGAGAAACG
CAATAATGAAGAATTTCTTCTCAATCGAAAAAATACAATACATCTTCTTC
GGTCGAATGTTTTTGTTCGAATCTAAAATTCGAATCTAACAAGATTTTCG
AACAAAATCATTCGAAGTTATAGAGACCCGTAAGTTATTTTTCATTTTTT
AACTTTTGAATTTTTGCTTTCTTTAGCTTTTCGAGTTATTTTTGATTTTC
TAACTCGGGAAATTGTGCTTCCTTTAACCATCCGAGTTATTTTTCTTTTT
TTAACTCAGGAATTTTTGCCTCCTTTAACTTTCTGTAAATAGATTAAATC
TATTACATTTTACGTTTAATAAAAAGGCTCGCCTCGCTCGTAAAATATTT
CTCGTATTGCACTCAAAGTCATGCGATAACTATTACTTATTGAAGTCTTC
ATTGGATTGGTAATCATCGATAGAATCTATCGGATCAATTAGAAATCGAT
TTCATTTCAGTAAAGTTAAAAATTTATTACCCTTTCGGTGATGACATTTA
GGGCCAAAATGACGTCCTCATCACAAGATTCACAGTATTTTGAGTTTTGA
TCCGTTTTAAGTTGTAATTTTTAGATTTATGGAATTTTGGATTTTCGGAA
TTTCTTTGGGGTTTGGGATTTTCGGAAAAAGAGTACGATATAACCTTCAC
TTCTTCTTACATAACTAGTGTTGGCTTGGGGCTTATATAAAATCCTTTCG
CTTTGCGAACACGAGACTCGTTCTCCGTGCGTAACCCCTTTTACGATTGA
TTTGAGGCAAAATGTTTCTATCATTTTTATGGTTTAAATACTCATAAAAT
GGTAAGAGTAAGACAAATATAGGAACATTATTAGACATAAAGCTCAAAAA
AGTTAAGAACATCCGGAGGTATCAAACATTTTTGATGTTCTTATGAAGAA
AAAAACGTGTATCGAGAATACCCCTCTAAACGTTCGATTGATAATGTTAT
TAATTTGTTCTATCTTTAGATGGGAAGGCGAAAGTGAAAACGAGGTTGGA
TATGATGATGCCACAAACACACCACGTGTCAGAGTTAGCTCTAAATTTTA
CAGACCCGCCGAAGTTGATTACTTGCAAGGAGACCCGGCTAAAGCTGAAG
CAAAACTAGGCTGGAAAAGGAAAGTTCCTTTTGAGGTAAGTAACACTTTT
GGAGCCAAGTGAATAAGGTTTACGATTAGTATTGTCATCCAAGGTAAATT
AGGACACTTCTCTCATTGTCTCCCCTCTTTCACCAACACTCCATCGCAGC
GGTCGGTTTGAAAAATCTTAAATTAGAAAAGGTAATGACAACAGAGCCTC
TACGACAATGAATTTTGAAATCAGCCGAAGATATAGGGTCTGTGTACAGA
CAACATCCCTCCCTACATAACTCTTTTATTCACTTTTTGTTCGCAGGAGC
TAGTCAAAGAAATGGTCGAGTCGGATATTGATTTAATGAAAGCAAACCCG
AGCGCTTAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000727_pilon:23477..32835- >XLOC_040214 ID=XLOC_040214|Name=XLOC_040214|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2148bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000727_pilon:23477..32835- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ATGGCAGAAGTAAGACCTACAAGAAAAGTAGCTTTGATCACTGGAATAAC AGGACAGATGGCAGAAGTAAGACCTACAAGAAAAGTAGCTTTGATCACTG GAATAACAGGACAGGATGGCTCCTACTTGGCTGAACTATTACTAAATAAA GGATATGAGGTGCATGGTATAATCAGGCGATCAAGTTCCTTTAATACTGG TCGTATTCAGAATTTATATGAAAATAAAACAGCTCATGTCACTGGAGGAT GGCTCCTACTTGGCTGAACTATTACTAAATAAAGGATATGAGGTGCATGG TATAATCAGGCGATCAAGTTCCTTTAATACTGGTCGTATTCAGAATTTAT ATGAAAATAAAACAGCTCATGTCACTGGAGATTTGCACTTACATTATGGT GACATGACTGATTCATCTTGCCTTCTCAAAGTTGTCAGTAAGATTTGCAC TTACATTATGGTGACATGACTGATTCATCTTGCCTTCTCAAAGTTGTCAG TAAGAGTCAACCATGTGAAATCTATAATTTGGCTGCTCAAAGTCATGTCA AGAGTCAACCATGTGAAATCTATAATTTGGCTGCTCAAAGTCATGTCAAG GTGTCGTTTGACTTGGCTGAATATACTGCAGATACTGATGCAATGGGTAC TTTGAGGTTACTGGAAGCCATCAAAACGTGTAATCTTATTGGCAAAGTCA AGTTCTACCAAGTGTCGTTTGACTTGGCTGAATATACTGCAGATACTGAT GCAATGGGTACTTTGAGGTTACTGGAAGCCATCAAAACGTGTAATCTTAT TGGCAAAGTCAAGTTCTACCAAGCTTCAACGAGTGAAATGTATGGAAAGG TTCGTGAAATTCCACAAACTGAACTTACACCTTTTCACCCTCGATCGCCC TATGGCTTCAACGAGTGAAATGTATGGAAAGGTTCGTGAAATTCCACAAA CTGAACTTACACCTTTTCACCCTCGATCGCCCTATGGGGTTGCAAAATTA TATGCATACTGGATAGTTGTCAATTACAGAGAAGCTTATGGTCTGTTTGG TTGTAATGGTATCTTGTTCAATCATGAATCTCCACGGAGAGGGGTTGCAA AATTATATGCATACTGGATAGTTGTCAATTACAGAGAAGCTTATGGTCTG TTTGGTTGTAATGGTATCTTGTTCAATCATGAATCTCCACGGAGAGGGGA GACATTTGTGACTCGAAAGATCACAAGAGGTGTGGCAAAGATCAGCTTGG GTTTGCAAGATGAGGGGAGACATTTGTGACTCGAAAGATCACAAGAGGTG TGGCAAAGATCAGCTTGGGTTTGCAAGATGAGCTGGTCCTCGGCAATTTG GATTCTATACGTGATTGGGGACATGCTAAAGATTACGTAGAGCTGGTCCT CGGCAATTTGGATTCTATACGTGATTGGGGACATGCTAAAGATTACGTAG AGGCCATGTGGTTGATGTTACAACAAGAGGGAGCAGACGATTACGTTGTA GCGACCAATGAAACTCATTCTGTTCGAGAGTTCGTTGAGAAGTCTTTCGG TCACGTTGGTGTCAAAATAAGGCCATGTGGTTGATGTTACAACAAGAGGG AGCAGACGATTACGTTGTAGCGACCAATGAAACTCATTCTGTTCGAGAGT TCGTTGAGAAGTCTTTCGGTCACGTTGGTGTCAAAATAAGATGGGAAGGC GAAAGTGAAAACGAGGTTGGATATGATGATGCCACAAACACACCACGTGT CAGAGTTAGCTCTAAATTTTACAGACCCGCCGAAGTTGATTACTTGCAAG GAGACCCGGCTAAAGCTGAAGCAAAACTAGGCTGGAAAAGGAAAGTTCCT TTTGAGATGGGAAGGCGAAAGTGAAAACGAGGTTGGATATGATGATGCCA CAAACACACCACGTGTCAGAGTTAGCTCTAAATTTTACAGACCCGCCGAA GTTGATTACTTGCAAGGAGACCCGGCTAAAGCTGAAGCAAAACTAGGCTG GAAAAGGAAAGTTCCTTTTGAGGAGCTAGTCAAAGAAATGGTCGAGTCGG ATATTGATTTAATGAAAGCAAACCCGAGCGCTTAAGAGCTAGTCAAAGAA ATGGTCGAGTCGGATATTGATTTAATGAAAGCAAACCCGAGCGCTTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| sc0000727_pilon | genome | sc0000727_pilon:23477..32835 - |
Properties
| Property Name | Value |
| Aaloc | 1012-1074:64 |
| Aaloc | 847-1011:490 |
| Aaloc | 727-843:3257 |
| Aaloc | 667-726:3737 |
| Aaloc | 601-666:4283 |
| Aaloc | 496-597:4876 |
| Aaloc | 412-492:7034 |
| Aaloc | 301-411:7509 |
| Aaloc | 253-300:7970 |
| Aaloc | 193-252:8317 |
| Aaloc | 58-189:9132 |
| Aaloc | 1-57:9360 |
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