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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000058_pilon:609528..616556- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_040193 ID=XLOC_040193|Name=XLOC_040193|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=7029bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000058_pilon:609528..616556- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAGTGAGAATTCAATTGGACGTTCAGCAAAAATATTTTTTGTTGTTTG
TGCTTACTGGTGAGAGATTTCCTACTTTTTCTATAAAAGTCTCCAATTAA
AAATGAACCATGACCTTTTTGATCATTGAGAATTGTATTTTAAATAGACT
GAAAAACCTTTTTCCTAATACTTTATATATTTTATAATACCGTTTATCAA
AAGTATGATACTGCTCTGTCAATTAGTATTGAGCACTCAGATTAAATTTA
AAGTCATTTGTATATACAATATATTATTGTCATAAATTGGCATGTTCAGA
AAAATGAAATGAGATGATATTTCTCTTCCTCCAAGTTTTTTAAACATTAT
TTTAGTTTGGACTATTATCCTTTTAGAATGATTTGTTTTTTATCAATTTC
AGGTTTGTTTCAATCTCACTTGTATTTTTGAATAAATTTTTATTGAGTGG
TAAAGATTTTAAGGCAAGTACATCATTTTATACATTAAAAAACTTTGCTT
CCCTTAATTCTCCCCCTCTTTACTAGGGGAGGGGGCTAGTAACTTTCCAT
GCATTTTGGTAAAAAGCATAGCTTTTTTTTTTAATTTCAATGAGGGGTGG
CTGAGGTAAAGAGGGGTGACCAGGGGGGGAGGGTTTCTGTATAAAGCTGA
AACCAGAGATCAAATAAATTAACATGATCTACTGATCATAATTTTATTTA
AATTTATTCCATTATTATAAAACAAGCAATTAGAAAGGTTTGCCAATGAC
ATTTCAGAACATTTAAATTGAAACGAACTTTACCATCCATAGGCCAAATT
AACTTTGATACATCAGTGTAGACTGTCCCCCTTTTTCTTTCAGCTTGATG
CACCTATCTTTATCACTTGGTATCAGTGTGTATTTTCCCTCCTTATTCTA
TTCTTATTGAGTTTTCTTGGCGATAAATATCCATCTATCGATAAGTTCCC
AGAATTTCAACTGAACCCAGAAATATGCAAACAAGTAAGTAGTCATCACC
ACAGATCTGTAAAGCCCAAAGGGCTAGATCCGCGGCCTTTTTTGAAAGGT
GAAGTAAGTTTTGGGCCAAATTGAAAAGTCCCGTTTCTGTCACGGAAGGA
AATCAGAGCCTTTTTTGGTCTATTTTTGAAAAATTGTAAACTTAATGAAA
ATAATATTAGTCCTGAATTAAAGCCTTTATAGTACTACTACTTCCAAACC
AAAATAAATTTCATAAAAGTTTTTCCTCGTTGAATAATTGAACTTTGAAG
GTTCTGTCACGGAAGGAACGCAGCAAAGACATTAAAAAAGACAAAAGTAT
GCTGATTCAGATTCCTGTGAATTTAAAGAGAATTTTAAAACCAAAATACC
ACCAGAAGAAACTTTGTCTATCTGCTTGTCATTGAAAAAAGAACTGAGTC
AAAAAAATTAATTTCAATGGCTACAGGCCTTTGCAACTGAGAAAGGTCAG
TGTCACGGAAGGACACCGTCACGGAAGGAAAAAATTCCTATTTTTCAAAA
TCAGCAATAGCGTAAGAAATGTTGACTGAAACTAGTGGAGTGACATATCA
GATCATGAATCATATAGCCATTTTCAGTTCATTTCAAAACCTTGGAACTG
TATTTTTATTGTTCAACCATAATGGTGATAATAATTAGGAAATTTTACGG
GAAAGATTATATAAGCGTTTTTAAGCAAAAAACGTAAAAACGCGACCTTA
CAAGCGAGTGAGCTACTTCCAAAGGCTCTAATTAGCACATTTCCATGGTG
CTGAAGCGATTTAGAGGGTTTAGAACCGGCTGGGAACAGTAGTTTTGCCA
GAAAACCGGTTTTTAGGCCTCCAGAGCCGCCTGGGCTTACGCTGTAAGCT
TACAGCGCTTTACTGGAGCTTTAGTTAAGCTTATTCTGAGCTACATACAG
GGCTGAGCTGGTTCCCAATGGTCCTAAACCTCGTGGGACACTCTATTGCA
AAGGATTAGACCCATTGAAGTCCAGCGAAGGGGGTAGAACCGACGAATTT
TCACTAAAATAGCTTAAAACGCTTAAAAAGCTCTATTTAAGCGTTTTTAA
GCAAAAAACGTAAAAACGTGGGGCGTCAAATGTCAAAGTCAGAAAATTCA
AGATGTAGTGTTTTTTTATGAAAATTTAACCTATTGTGAGGCATTCTGCG
CAATTTTTAAGGTCAGAAGTTCAAAATTGGCCGAACCCCCCTGGGGGTAC
TGATTCGCACTACAGGCAAAAATTGGAAAAAATGGCATTTTCTGGCCTTT
TCAGGCCTGTAAATATGTCAAAACTATTGCAAATCTTATTTTTTTCACTT
GCTGTACTAAATTTTATGAAGAAAAACAACAAAAATAATCATAATTGGAT
TGAAAAATTGTGCCCATTAGAGCCCTAAACGAGCCGTTTTAAGCCAATTT
TGGTAGCAAAATGCTTTTTAAGGCCAATTTTGCAAGCTCATAAACTTTAA
ACTGATTGATTCACATGTCTGAAATTTTCAGAGATGGAAGTCTTCAATAA
AGTCTTTAAGCAAAATGAATTTCAAGTTTTTCACTTTTTTCAAAAAATCA
TAATGGCGTCTTCAAAAATCGCTTTTTAGCAAAAAAAAAATCATATTTCT
CAAAAAATAGCATTTTTTAAGGCAAGCTTCTACAAACTGAGTTTAAATGC
TGACTGAAATTTTTTTTGCAGTGATAGTATACTGGAGATACTCCAGGGAA
ATCAAAATCATTTGGGCCTGGGATGCGTCTATGTCCGCCATTATGGAAAT
AAAATTCCTGCTAAGAGCCATTTTTCAGGCCAAAAACCCAAATTTGGACT
GAAAAAATCTCTAAAATGTCAATAGACATGGGTCCAAATTCTCTTGCAGT
GATAGTATTCTGGAAATACTACAGGAAAATCAAAGTCATCTGGGCTTGGG
ATTTGGGTATATCCACCATTTTGGAATTGAAATTCCTGCTAAAACGCAAT
ATTTCAATCAAAAATCCAATTATTGACTCAAAAAATCTTAAAAATGGCAA
TAGACATGAAGCTAAAATCTTTTTGCAGTGATAGTCTTCTGGAAATACTC
CAAGGAAATCAAAATCGTTTGGGTTTAGGATTCGGGTATATCCGCCATTA
TGGAATTGAAATATGTGTTAAAACTGGCTAAAATACAACGTTTCAAGCAA
AAACCCTGTTTTTGAATAAAAATTGCTCTAAAATGACAATAGACATGGAC
CTAAAATTTTTTGAAGTGATAGTATTATGTGAATATTCCTGGGAAAACAA
AATCATTTCAGTCTGAGATTTGTTTACATCCACCCTTATGGAAATGAAAT
CTCTGTTAAAATGCTACATATTTCCATCCGATACATCATTATTGACTAAA
TATTTTGTATGTTACATTAAACAAAGAATGTGAATTTACAATCCTTTAAT
TTAGAAATACTAGTTGAAATAAATTATTTAAAAAATCCCATTTCACTCAA
CAATTCTTTATAGCCCACTTACATTTCCATTTTCAAGACTTGTTCTGTCA
AAAAAAGATTGAATTGTAGCTTGAAATATTATATACATTTTAAAACTGGC
TTCAGTTTAAAAATTGCGGTCCCAGAAGCATCTTATACCTGAATAGTTTT
TACCCCTAGAGTATTTACAGAACACTATCACTGCAAAAAGATTTTAGGTT
CATGTCTATTGCCATATTAGAGCAGTTTTTTAGTCAATATGGGATTTTTG
CTTGAAATGTTGCAATTTAGCCAGTTTTAGCACAGATTTCAATTCCATAA
TGGCGGATATACCCAAATCCTAAACCCAAATGATTTTGATTTTCCTGGAG
TACTTCCAGAAGACTATCACTGCAAAAAGATTTTAGCCTCATGTCTATTG
CCATTTTTAAGATTTTTTGAGTCAAAATTTGGATTTTTGATTGAAATATT
GCGTTTTAGCAGGAATTTCAATTCCAAAATGGTGGATATACCCAAATCCC
AAGCCCATATGACTTTGATTTTCCTGCAGTATTTCCAGAATACTATCACT
GCAAAAAAATTTGGACCCATGTCTATTGACATTTAAGAGATTTTTTCAGT
CCAAATTTCGGTTTTTGCCTGAAAAATGGCTCTTAGCAGGGATTTTATTT
CCATAATGGCGGACATAGACGCATCCCAGACGCAAATGATTTTGATTTCC
CTTGAGTATCTCCAGTATACTATCACTGCAAAAAAAATTTCAGTCAGCAT
TTCAACTTTGTAGAAGCTTGCCTTATAAAAAATGCTACTTTTTGAAAAAT
ATGATTTTTTTTGCTAAAAAGCGATTTTTGAAGACGCCATTATGATTTTT
TGAAAAAAGTGAAAAACTTGAAATTCATTTTGCTTAAAGACTTTATTGAA
GACTTCCATCTCCGAAAATTTCAGACATGTGAATCAATCAGTTTAAAGTT
TATGAGCTTGCAAAATTGGCCTTAAAAAGCATTTTGCTACCCAAAATTGG
CTTAAAACGGCTCGTTTAGGGCTCTAATGGGCACAATTTTCAATCCAATA
TGATTATTTTGTTGTTTCTTCATAAAATTTAGTACAGCAAGTGAAAAAAA
TAAGATTTACAATAGTTTTGACATATTTACAGGCCTGAAAAGGCCAGAAA
ATGCCATTTTTTCCAATTTTTGCCTGTAGTGCGAATCAGTACCCCCAGGG
GGGTTCGGCCAATTTTGAACTTCTGACCTTAAAAATTGCGCAGAATGCCT
CACAATAGGTTAAATTTTCATAAAAAAACACTACATCTTGAATTTTCTGA
CTTTGCCCCAAAAATGACTGTTGACGGCCTACCCTATTTTTAAGACTTTT
TTTAGGCAAAAAACGTAAAAATGCGACCTTGCAAGCAAGTGAGCTACTTC
CAAAGGCTCTAATTAGCATATTTCCATGGTGCTGAAGCGATTTTGAGGGT
TTAGAACCGGCTGGGAACAGTAGTTTTGCCAGAAAACCAGTTCTTAGGCC
TCCAGAGCCACCTGGGCTTACGCTGTAAGCTTACAGCGCTGTACTGGAGC
TTTAGTTAAGCTTATCCTAAACCTCGTAGGACACTCCCTTGCAATTGATT
AGACCCATTGATGTCCAAGATTTCTAAAAATACCAAGATATTTTTAATCC
GTCACGGAAGGACAAGGTAAAAGTGTCACGGAAGGACAATAATTTCAGAC
CTTGTAAGTGAATATGAAGGAGGTTGCTTTGGAATGTAATTTCATTTTTT
GCTAGAGGGTACCAATAGTTAGAACTTGCAATAATATCAAGAATAGTGCA
CTTGCACAAAACTGGTGAAAAAACTTTTTGTCTTGAAATTGTCACGGAAG
GAATTCCATATTTGAAAAAAGTTTCTGCTTGCAGTACTTTTTTGTTGTTT
GACTTATTTCAAAATGAATAAACCTATTAAACTAACTAGGGTATGTACTT
GTTTTAAAACAACATTTCATTTTTGATAATCATTTTATTTTTCAAAAGAA
GGTCCATTATATTTTAACACTTGTCCTTCCGTGACAAACCTCACTAGTTG
TGCTTCGATATAATCACCTGATTACAGAGTCTAAAAGTGCGACTCGGTTG
ATTTAAAAGTTGAAATTGGAAAATTTAAGGGTTAAATTTAAAAAAAAAAT
CAGTTACTTATTTTGTTTGTAAGGTTTTTGATTTTGTGTTTTGGTTGACC
ACTTTTCAATTTGGCCCTTTTGTAGGATTGCTTACCAAAGAAATGACATG
ACAACAAGCAATTTCACTTGTTTGAGCTAGATGCGAAATAGCGTGTGCCG
CCTACTTTTTTTGATCTTGCACTCTGAAAACTTTCACTCTTTTTTGATGG
AGAAAGCTTAAAGTTGCTTATCTAGCCCTTCTGGCTTTCCAGATATTCTG
TGGTCATCACTATCATTAAAAATGATGTTTTTTCTTGTATTTATCAATTT
TCTAGAAGTTGTTGAAGATGCAAACTTTACTTCTTGACAGTAGTATATAA
TACGCAAGTTCATTCAAAATTTATGTTCTGTTGTTAATTTGAATCAAAAT
TAGAATCAAAAATCAAGTTTTTATTTTAATATACTTTAGGTTTCTTTACT
TTTAAAAAGCTTTTAAATCTGAGGCTCAGATTATAGTCATTTAAATTATA
TTCTATTAAATAAATTACAGCCAGAGTATTTTTGGCTAAATCTTTGTTTA
ATATTGTTCTTATAAAAAATAATTATTTCGTTTTAGATCATGCCACTCTC
GATTGTTTTTGTTGGGATGATAACTGCAAATAATTTGTGTTTGAAATATC
TCGACGTTGCATTCTATAACGTTGCAAGAGCACTGACAACATTCTTTAAC
ATAGTAAGTACCTACAACATACTGATTGGATCATTGACAATTTTATATGA
ATTTTGAAATCCCTGATTCCAAATAAACCAGTGCTTCATTTTCATTTAAA
AAAAATTGTTTTTTCCCTTCTAGGTTTTCTCCTACTTTATTCTTGGTCAA
AAGACATCAGTTCGTGCAATCGCTTGCTGCAGTTTAATCATCTTGGGGTT
CTCTCTTGGAGTAAAAGAAGAAGGCCAGCTAGTTGATCTATCATACAAAG
GTGTCTTTTTTGGAGTTTTGGGTTCTTTCTTTGTCTGCATGAATGCCATC
TTCACCAAACGTTGCATGCCAGCTGTTGATGGTAATATTTGGCGTTTGCA
AATGTACAACAACTTCAATGCTGTGTTTTTGTTTGTTCCTTTGATTATCA
TCAATGGAGATCCATCAGTGGTAGCAGCCTTCCCACATCTATATAATCCA
AGATTTTGGCTCATGATGTCCCTTAGTGGAGTCTTTGGTATTGCAATTGG
TTATGTTACTGGCTTACAAATCAAGGTCACCTCACCACTCACCCACAATA
TAAGTGGCACAGCTAAAGCATGTGCTCAAACCATCATTGCTGTTGTGTAT
TTTGTAACATTCAAATCAAGTCTATGGTGGTTCTGTAATTTCCTTGTCCT
TGGTGGTTCTGGTTTATACACCTATGTCAAAGCTGCAGATATGAAAAGGT
TGACTGCGTCTATTAGTAATAAAATTTGA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000058_pilon:609528..616556- >XLOC_040193 ID=XLOC_040193|Name=XLOC_040193|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1968bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000058_pilon:609528..616556- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAGTGAGAATTCAATTGGACGTTCAGCAAAAATATTTTTTGTTGTTTG
TGCTTACTGATGAGTGAGAATTCAATTGGACGTTCAGCAAAAATATTTTT
TGTTGTTTGTGCTTACTGGTTTGTTTCAATCTCACTTGTATTTTTGAATA
AATTTTTATTGAGTGGTAAAGATTTTAAGGTTTGTTTCAATCTCACTTGT
ATTTTTGAATAAATTTTTATTGAGTGGTAAAGATTTTAAGCTTGATGCAC
CTATCTTTATCACTTGGTATCAGTGTGTATTTTCCCTCCTTATTCTATTC
TTATTGAGTTTTCTTGGCGATAAATATCCATCTATCGATAAGTTCCCAGA
ATTTCAACTGAACCCAGAAATATGCAAACAACTTGATGCACCTATCTTTA
TCACTTGGTATCAGTGTGTATTTTCCCTCCTTATTCTATTCTTATTGAGT
TTTCTTGGCGATAAATATCCATCTATCGATAAGTTCCCAGAATTTCAACT
GAACCCAGAAATATGCAAACAAATCATGCCACTCTCGATTGTTTTTGTTG
GGATGATAACTGCAAATAATTTGTGTTTGAAATATCTCGACGTTGCATTC
TATAACGTTGCAAGAGCACTGACAACATTCTTTAACATAATCATGCCACT
CTCGATTGTTTTTGTTGGGATGATAACTGCAAATAATTTGTGTTTGAAAT
ATCTCGACGTTGCATTCTATAACGTTGCAAGAGCACTGACAACATTCTTT
AACATAGTTTTCTCCTACTTTATTCTTGGTCAAAAGACATCAGTTCGTGC
AATCGCTTGCTGCAGTTTAATCATCTTGGGGTTCTCTCTTGGAGTAAAAG
AAGAAGGCCAGCTAGTTGATCTATCATACAAAGGTGTCTTTTTTGGAGTT
TTGGGTTCTTTCTTTGTCTGCATGAATGCCATCTTCACCAAACGTTGCAT
GCCAGCTGTTGATGGTAATATTTGGCGTTTGCAAATGTACAACAACTTCA
ATGCTGTGTTTTTGTTTGTTCCTTTGATTATCATCAATGGAGATCCATCA
GTGGTAGCAGCCTTCCCACATCTATATAATCCAAGATTTTGGCTCATGAT
GTCCCTTAGTGGAGTCTTTGGTATTGCAATTGGTTATGTTACTGGCTTAC
AAATCAAGGTCACCTCACCACTCACCCACAATATAAGTGGCACAGCTAAA
GCATGTGCTCAAACCATCATTGCTGTTGTGTATTTTGTAACATTCAAATC
AAGTCTATGGTGGTTCTGTAATTTCCTTGTCCTTGGTGGTTCTGGTTTAT
ACACCTATGTCAAAGCTGCAGATATGAAAAGGTTGACTGCGTCTATTAGT
AATAAAATTTGAGTTTTCTCCTACTTTATTCTTGGTCAAAAGACATCAGT
TCGTGCAATCGCTTGCTGCAGTTTAATCATCTTGGGGTTCTCTCTTGGAG
TAAAAGAAGAAGGCCAGCTAGTTGATCTATCATACAAAGGTGTCTTTTTT
GGAGTTTTGGGTTCTTTCTTTGTCTGCATGAATGCCATCTTCACCAAACG
TTGCATGCCAGCTGTTGATGGTAATATTTGGCGTTTGCAAATGTACAACA
ACTTCAATGCTGTGTTTTTGTTTGTTCCTTTGATTATCATCAATGGAGAT
CCATCAGTGGTAGCAGCCTTCCCACATCTATATAATCCAAGATTTTGGCT
CATGATGTCCCTTAGTGGAGTCTTTGGTATTGCAATTGGTTATGTTACTG
GCTTACAAATCAAGGTCACCTCACCACTCACCCACAATATAAGTGGCACA
GCTAAAGCATGTGCTCAAACCATCATTGCTGTTGTGTATTTTGTAACATT
CAAATCAAGTCTATGGTGGTTCTGTAATTTCCTTGTCCTTGGTGGTTCTG
GTTTATACACCTATGTCAAAGCTGCAGATATGAAAAGGTTGACTGCGTCT
ATTAGTAATAAAATTTGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000058_pilon | genome | sc0000058_pilon:609528..616556 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 379-984:607 |
| Aaloc | 262-378:844 |
| Aaloc | 121-261:6187 |
| Aaloc | 61-120:6627 |
| Aaloc | 1-57:7030 |
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