XLOC_040164 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_040164
Unique NameXLOC_040164
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000006_pilon:991238..1003362-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_040164 ID=XLOC_040164|Name=XLOC_040164|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=12125bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000006_pilon:991238..1003362- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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AACTTAAGTTATATCAACTTTCATTTCCTAATATCTATTGAAAATGAAAA AAAAAAAACAATGAAAATTTTTTCTACTCCACCAAAAAGTTTGAATTTAT ACTTTTCTGAAAATTGGAACTTCTAACTATCATAAAGATCTTGAAAAAGA TGCATGTTACTGCTGTACAGGGTGTCCGTAAAAAAAGTATCGAGTCTTAC CACTTCTACTCTTCTACAAAAAGAAAGTTCTTTATGTATTCTTGAGTGAG GGTCGTCGTGTTGTGGTAGCGAATTTTAACAGTGAGTATTTTATTTCCAT ATGATTTTCGTGTATATTCCTAGCCAGTCAGAACCTGTATTTCTTCCAGT GTTAAGGTTTCCTTTCTGGCATACATACAGTTTCTGGTGGCACATTACCT TTAATTTTTGACGTGTCCTTGTTGAGGTATTTGTCACTTTGGGTAGTCTT TGTGCCACCCACGTTTGTTATCTTATCGAGAGTCTCTCTATTCATCTCAG CCTTTTTCGAGACCATTTTCAGGCAGCAGGCCTTTCATATTTTCGACACA GATTTGCAGCATTTTGTAGAATTTCTTGCCTTTTTCTAATTCATAGCTAT TTGTGATTATTTAGCCTGATCTCTAATGTCAAGAATCGTGTTCTGAAATC CTATCGTTATTCGTCAGCGCCCCTCCGAAGTAAGGCCGCTATAATGCATG TCTGTTGCGAGGAGTTCTCTTAGTGCCGATAGGAATTCTTTTTAAAGTGA TTGTATCCTTTTGATTTGATCGTGTTTCAATTAAAGTCTGCCTCAACATA ATCTGCAGCTAGAATTAAAAAAAAGCTAGAATTCTAAGTTGATAGTAGTT TTATGCTCGTTAAACAGATACTCCGGAATATTATCAAAAAGAAGAATTTC ACTTAAATGGAAAAATGCAAAAGAAGAAAATCGGCTTCTTGTAGAATAGT 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GAATGTCTAAGACAGGAGACAGATTGCATAATTTGACTGTCAACAAATTC ATTAGTTTATGTATAAATTTTTATAAAAAGTAATGCAATGTGACTGCTAG AAGAGACCTTGGTAATTACAGAACCAAACCAAGAGCTTTTGACAAATCCA ATATGTCTGCTGCCAAAACGAAAAACGTGATTAATCACGTTTAGCGCTAC AGTACAATTCAATTTTCGCTACTTTAAAAAGAGCCAATCAGATTGCATTG CGATTATTCAAACATGGTGGCGTTTAGCGCAATTCGATTTGTCGAGGAAA TCTTAATAGACCTATCAATTCACGCCATTTTCCAAGAAAAGTAGAGATCT GTTACTTCTACAAAAAGTTCTGCTTAAAAACGTCGTCCATCACGCACGCT AAAAGAGAACAGCATTATTGTTAGACAATCTATCCAGGCAGCAAACATAA CGGAGCATTTATATTTATAGCCGGAACAAACACACAAAAATTTGAGATCC CTGTCCATGGCGTTCTAAATCTACGCCATGTTTCTGTCCCATATCTTTCG TGAAGCTATGAATGCCTCCTCACTCACTGTGCGCTCGCTACGGGGGCAAA AAAGATTTATAACAAATTTTCACAATTCATTTTTTCCAGGTCTTCGGCCG TTAAAAAAATATTCGACATCAAGTCTTCGGTTTTTTAATTCAGGTCTTCG GCCGCTAAATCAGGTCTACGCGTCCGCTGACGGAAAATGAAATATGCGTC GCAAATGCAGAATTTTATAATTTTTAACTGCCCTCTGAAGAATTGCGAGC AGGGTGGGGTACTGGGTTGCCAAGTTTGTCGCCCAAAATAAGGGTAATTT TTGTCGAAAATGGTAGCTACTTTCATTTTCGATAAACAAACAACCTCAGC GTAAAATGGAAAAAAGGGAGGGAGAAGCATAAACACGTTTCAAGTTTCAA 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GAAATTGACTTTGATTTTATTCCCATTCAAAATTCCAAGCTTCAAAATTT CCATCTCCACTGGGTTTTTAACCTTGAAAAAATAAAATTTCTATCCCCAT TGCGATCACAAAAAGAATTTTTGTCCCCACTGAAGAAAAAAGTTCCACCG GGGCTGTGAGACAGGGGTGTTCCAGGCTCGGATACAGAGGGAGGCTATAA CCAATGGAGGAGAGTGCACTTTATTATCGTATTACCTTATATAGAAACTA ATTACTCTCCATGAATAAGATAGCCTACCTCCTGTATCCGACCCTGTGTT CTACCTAATAAATGTCCCCCTGCTAATTAATTTTTTTTCGGAAGATACTT TTGAATGTCCCTCTTTTACCCTAATTCTGCTGTACAGCCTCCTTTTCAAA AGTTTTCCACTCAGTACATTTTTATTGCAACCCTCCTACTTATTAAGTTT TGAGAATTTTTCCATCCACCCACCTATTCTAGTTTGTTTGGTACCAGAGA ATAGATTAACTTTCATTAAATTTCTGCAAATTAGGCTATATGGTTCAAAG CAAGCGCTTCTTTTAAGACTACCTGAGACAATGACTTCTTATGGTTTACA GGTTTGCTGACATTTTTTGATAATAAGATAAAGATTCACAAAATTGAAAT TCACAAGAATTTGATTTTGTTTTGTTCTTCTGACCTAATCTTATCTGCTT TTAGAAATCTTTAAAAGACTTTATTTTATAAGAGCGAGGGGGAAGATAAA AGGGTACAACAAGCTCATTTTCCCAATACCCTTCCTTCAATGGCATTTAA CATAATTTCCCTACTTTGTATGCATGTAAGTTTCCTCAAAGCACATCTTC TTTTATTTTTTCTGATATTGCCTTGATAACCTGGAGTTGCCAACTGGAAA TATTTTTTATCCTATAACAGATAATAAAATTTAGTTTTCTGGAAAATATC 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000006_pilon:991238..1003362-

>XLOC_040164 ID=XLOC_040164|Name=XLOC_040164|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=900bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000006_pilon:991238..1003362- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTTATCCTTTCTACTTGGTTCATCAATACTATCCCTATGTCTTTTAGG
GATAGAAGGAGATGTTATCCTTTCTACTTGGTTCATCAATACTATCCCTA
TGTCTTTTAGGGATAGAAGGAGCATGCGACGCAAAAACGTTGACAAACGG
GACAGGAACTTTTACATCTCCTGGATATCCACAAAACTACCCATTCGGTG
ACACGTGTCAATGGAAAATCAAAGTCGCACCCAACTTGAAAATCAAATTA
CAATTCCCAGATATGGCTATCTTAAGTTCTGACAGCAGTGAAAGTGCATG
TGGTACGAACCGTATCGCTGTTGCTCATTCGTCTAACCCACGAGATCCAC
CATTACTGTATTGTAACTCACATCCTCCACCAATCGAAGCACAGGAGTAT
GGGAACGAATTAACAGTCACTTTCACTTCTACAAAGACTGAAGCAAAACA
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CACCGACCACCCATGCGACGCAAAAACGTTGACAAACGGGACAGGAACTT
TTACATCTCCTGGATATCCACAAAACTACCCATTCGGTGACACGTGTCAA
TGGAAAATCAAAGTCGCACCCAACTTGAAAATCAAATTACAATTCCCAGA
TATGGCTATCTTAAGTTCTGACAGCAGTGAAAGTGCATGTGGTACGAACC
GTATCGCTGTTGCTCATTCGTCTAACCCACGAGATCCACCATTACTGTAT
TGTAACTCACATCCTCCACCAATCGAAGCACAGGAGTATGGGAACGAATT
AACAGTCACTTTCACTTCTACAAAGACTGAAGCAAAACAAAGCAAAGGTT
TCAGTGCAAATTATACAGCTTATGACCCAAACCCACCTCCACCGACCACC
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_040164XLOC_040164-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000006_pilongenomesc0000006_pilon:991238..1003362 -
Properties
Property NameValue
Aaloc64-450:388
Aaloc1-60:12126