XLOC_040152 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_040152
Unique NameXLOC_040152
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000006_pilon:1033443..1052382+

Legend: CDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_040152 ID=XLOC_040152|Name=XLOC_040152|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=18940bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000006_pilon:1033443..1052382+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGAAGGTTTTGAGCTTATTTCATCAGCAATTGTATCAGACATCATCCC CATCAAGAAATATCGTTCCAAAGCAACTGGTATCACTGTTTGTATTGCTA ATGTTGAAGGGCCCCTTGTCAATGGCTACTTTTGCTTAGGTGTGTACTGC AATTCATATAGGAggatttttaaatgatttttaaattttctatttttaat ctAGTAATAAGCATTGATCCAGATTATTCCTTAAGTAAAAATATGGCAAG TGGCGTTACACTATTTTAAATGAACAGCTCATCGAGTTTACAATTAGATA TAAAAGAATCTAATACAGTAAACTCTTgcttattcaaacttttttttatt cagatatttcaattattcgaacttgtttccagtcctTATCAAGTAGAAAC CCTCTTAagatctttctataattcaaatctctgtaattcgaacaaataag attcctcgTTTGAGTCAACTGtatcttgttttatttttcattcagcTACT GAAGCTCATGATGATGATGGTCTGCCGCATACTCTTGAACACATTGTGTT CATGGGAAGTGAAAAGTATCCTTATAAGGTGAGTTGTTGTATTTCAAAAT ATACAATCTACATAGGATATCTAATCTATATAGGATTTCCTTAcccatta aaaaatattaagtcaAAGTAGAtgttaattgatttttttctctagGGACT TCTTGACTTGTATGCTAATAGATGTTTGGCACAAGGTACCAATGCTTGGA CAGATGTTGATCACACTTGTTACACCATGACTACTGCTGGCAGTGAAGGC TTTTTGAATCTCATCCCAATTTATTTGGACCATCTACTATATCCCACAAT CAAGGTACTACTTACTAAAAATAACTTCTAAACAATAATCTAGCAGGTAA AATAGTGAACTCCATTGGaaaacaaaatcgaaatattcaatgaaggAAAG TGTAAGTGATAAAATAgtaattctcgcccgaactttaaatgctaaaaaac attaaaatctcaatatatttcgaccttGATTGTAGCAGTTAACATAGTGA ACTACATTGAACAACATTGTAGAATTTCAACTGCTGTAGAGTCAACAATC CTCACCTTCTAATAGCCAAGCAACAAAAGTCTGAGAGCACTAATTATTGA CacaaaaaattgttgaaatcagCATAAATTTGGTGCTCACCTTGAATAGC AGCAATGCTTTGATATTACTCCTAGGAAGCTCATTATACAACAGAAGTGC ATCATATCAATGGAGAGGGAGAGGATGCTGGTATTGTCTATTGTGAAATG CAAGCTCGAGAAAATTCTGGTAGTAGTTTGACACATCGTGCATTTGTTAC AGAGATGTACCCTGGTCATTGTGGTTATAAGGTATTATTAGTTGTTCTAA AGAAATAAATCTGCCAAActtaaatctcgtgatccaagccacgataaact tccaatataaaTAAATACTGAAGATGTTTTCAGTGTATAACTTGATGTTA CAAAATTCATTTATAGGTTCCTTTCTTCTTTTGTTCCTGCCTATCTATTC TCCAGAATGATATGATGACTATTTTCTCTTGTAGAGTGAAACTGGAGGCA TAATGAAGAATCTTAGAGAGACATGTAGTCacaaaaaggtaaattttcta tgaaaatgtattataatattaaaaataacaaaagggaAGTTTCAAAACTA TAATGTCTAAACTTTTTATATTCAAACATTATAGGTCAAAGATTACCATA CAGATTTCTATCGTGCAGATAATTTGTGTTTAATTATTACTGGTAATGTA AAACCCGAGGAAGTCTTTGAAGCCATCAAACCTTTTGAAGAGAAAATCAA GAGCAAGGTCAGCCACAGTAAAACCTCCCTGAAGAAAGTTCAATTCTTCG CCAAATTGCTCATTAttttaataattctttttttaatattcaacaaacaa attttgttaCTGAAATCTCATGAAAGTagctaaaaaaattatatttataa tCTTCCAGTTATTATTCTTTTTTAATAAGGTTTATTTATGTCTGACTACT TAATAACAAATAAGACAAAATTTAAACCAAATATGTAGCTCATATTCATG ATTTTGACATTCaagatacaatttttttttccaattttatagAAAACCCT ACCACCGCTAACACGACCCTGGATGAGTGAAGTACCTCCATTGACGGAGA AACTTGTGGAAAAGCGCGTCTTGTTCCCTACTGAAGATGAATCTGTCGGT ACAGTCACACTGGGATGGAGAGGTCCTAGTGTTAATGTAAGTCAATTCTC CTTACGATCGTGAATACATAATGCATGTTTATAAAATTTACACATACAAG CCTGATACAGCTCTCCCAGTAgcattataattattttttaatcaatctTC AATCAAGCTTCAATCAATGCAATGCTAATTtgatcaaaaatacaaatagg taccgggtgacccacgaaaaagtataagagtttggagggtaactgtgtcc gaaaaaaattgaattttaattaaattcttttttcatggtaaagaggaaag gcaaacttaaattttgatgtatcattttttaattttggaaaagtagttat tgagatatggaggtataaagtcaaaagtcattataaaaaacggtcaaaaa agacagtatcaAATTTGTATCAGAACAAACAACTTTCCTTTGATCATTTG CTATTTCTTTGTCTTAAaagtttcgttaagaaaaaaataagtaaTATCTA ATTTTAGACGATTCCCAAATCGTCCTTTTGGGAATAAATGAAAAGTACCA AAAGTAGcataaagaattttcaaaatgccTAACCATCAATCAGTTGAAAG CAGCAATCGTCAGAGCTTGTAACAACTGAGATCAGCAAATGATCAGAGAC GCTTTCGATGGAATTATTTCTAGGGCTCGTCGCTGTATTAATGCTAGGGG TCGTACTTTTCCAAATGGATGaatatgattaaaaaagaattgtcaACCTT TGTTATTCTTTTCTGAATCCTTCCGGTAAAAGAAATGTAAATATGCTTCT CACTCGAtgtctctttttatttgttaatcaattaatttgaaactgtcttt tttgacgttttttaactgttttttataatgacttttgactttatacctcc atatctcAATAAccacttttccaaaattaaaaaatgatacatcaaaattt aagtttgcctttcctctttaccacaaaaagagaataatttagttaaaatt caatttttttcggacacagttaccctccaaattcttatactttttcgtgg gtcacccggtatttcgacagaaatgaattttagtaggatatCATAAGTAT CAGCATCATAACCGTTTTTAGGAAATCTACTGTCATTTCACAGCCGAACT ACATAAGTTTTATTCTTTTTAGGAGTATTACGAGATTCAAGGTATCAAAA TGCTGTTCAATTATTTAACCGATACACCTGTTGCTCCTTTGCAAAGAGAT TTAGTGGAAATCGAAGAACCATTGTGTAGCGATGTAAGacatttattatt tttctcattGTATTTAATTTCTATTTGCATATTAATTAGTACAAAATTGT ATCCAGAAATTATTCTGCCTTTGATCTCTTGATAATTAATTCAATTTGCT TAGGTTCATATCTGCTTTCCGACAAGGACAATCAGGCAAATTATACAATC GAACCAAATTGAACTAATTGACCATTTGATATTGGACTAACAAACACTCC CACAACAACTGccccccccTGAAAGCTCTATTTTGTTTACTCATTTCAGA TCGATTTTTCGTtcttcgaaaacaaagaaactgcAATTAGTCTTGCAGCT GATAATGTACCAAAGGAAAACTTGGATGACATAAAAACTAAGTATGTATA AGAGCGTTATTTAACAAAAATGCTTTTTGGGTGATGATACTTTCATCGAA TCTAAACCTAAAACTTTTCTTATTCCACTGAAGAATCTATTGTCCATGTT ACGTTATGCGTGAGATACAGGTACAGGTACAGGTACATAGTAAGGGTCAA TTGttttggaaagcttgtaatGTAATATAAAAAGGTTGTGTAGAAAACca tcctgaattttattatcaaTCTCCTTCTATCGACAGTGTTCTTGAGATCC TTGGAAACATTGCATCAGGGAAAGAGGAGTTCGACATGGAAAGGATGAAA GCGCAGATTCACCGATCTGTTCTTGAAGAAATGAATGCTGTAAGTCACCT TCCACTGAACAATGTCAAACTGTAACAACTCCCTTACATTTGAACTCCCT TCAATCAATGAGTACCAACATCTTTACACTCAGTTCCATCTATTTGACCC CCACACAATGTATTGACAAATTATGCTTGAAGCATTGTGAAATGTAACCG CCAAACTCCCctaattttctttgtatttttctttgcattttctcagtgtt aaaagttcttctgTCCCAGACAGATTTCCGTTTCAGTGAAATGTATAAAT aggcttttccgtctcaaaattcttaataatttaccaaaatttcaagagaa CATGCTAgtaatttgctgtgtaaaattaATTTCCCGTCTCAGACGACTGA TTGATCTTCTCTCCCGTTGGACAGGTGGAAGATTCACCTCACGACACGCT AGCTTTCTTATCAATCGGCGATTTCTTATACTCCACCAAAAGTGATACCA TGCAAGAGTATGTGGACAAAATCAAACATTTAcaaaagttgaaagaagaa CCGGTGTCTTATTGGACTGATTTGATGAAGAAATATCTGATGGATCAAAA GATGGTGGTCATCATTGGTGACCCGAGTGAAGAAAAAATGGAGAAGTCTG GTGAGGAGGAGAAAGCACGTGTTAAAAGACAACGTGAGGAGCTAGGTGAA GAAGGATTAGCCAAGAAAAAGAAGATCGCTGATGATGCGATCGCTGAAAA TTCGGTTTGTATTGTATGCCATTCTTTCCCATCTATGTGTTGGAATTTTT GTCGTTGCTcatttgtttcttttatatcTTATGATCTTATGACTTGAATT TACTTCAAAAGAAATGAATTTCTAATGcggtattttttaattttcatggc ttttcttcaaaaaaaagaatCTTAACACTGCtttttttCTACCTTAGGTT GAACATCCGACAGAATTAATCACACAATTGAAAGTCCCCTCAACAGACAG TGTCACTTTCCACAATGTCAACTCTTATCGAAACTACTCACCTGCACAAC CAGCAAACTTCGAAGCTGCCAAGAAGTTCCCTTTGGATGGGTTCCCTGCT GCATTCAACGTCTGCCATGTGCAATCTCTCTTTACACAGGTTTGTCACCT GTTACCtttttttCGCTCTTTCTACAGTCGATCCGTTATCTATAATACAA CGGATACCCCCATAACTCAAACacctataactcgaatgtctccttaactc gaacctaattcataactcgaaaattaataattcgaacaaatttgcattAC CCTTGCGCTTTCAAGTTATGGCGAAGCGACTGTAAATCGTTGGGAAGGAA CTTGTCTGCGTCATAATAAATGGAAAATGCccataaaaaagataaaaaac taaaacaacaGGCACTCCTtagtactctgtaccagagtgtatctcacgtt tatcgcttcatagtacactctgtgcgcgtTGTCTGTTTGATATAAGAAAA ATTCTCGTACGgtgacctctgcgatgaagtatgactTATAAATAGCAGCA CTTCTCTCATCGCCttccctctctcaccaacactccatcgcagcggtcgg tttgaaaagccaataaatgacaacagaccctctacacCAATAAATTGAAT AAGGTTTTGAAAAGTcccccccTCCCCATTCAGGCGAGTAGTCTAACCAC ACAAAGCATGGCAGTTGTTTATGATTATCGCAAATCTTATTTTCTAGATT TACATCGTTATTGACTCAGCCAAATTGTCCAACGAGCAAAGGATGCTGTT ACCTCTTTATACCGAACTCTTATATGAATCTCCCATTCTCAGAAATGGaa gtaagtgtttatttttttatattgtgTTGCCAGGAGACATAACATGAATC ATGTAATTGCCAAATCTCTCCTGGACGAGATGCTATAAACTGTATATCCG AGCGAAAAATTACAATTTGAGATCTTTGGAGGctttttctttactttctt ttttccaATTCATCAATTTCTAGGCGAAACTTTGAACTTTTACGAGGAAT ATTTTTGATGTCGCATTTTAGGACTCTATTTgtactaccgggtgcgccac aaaaaagtttctctctttgaaactgattttctcgaaatcgaaaaatttca aaagaatcattcctattcctttggaaagaagaaagataaacttaaatttt gaggggtcatttaataaattcggttcattagatcaaaagttatgctcaat tgaaaaacaaagttactttcagaaagtgcccgaaaacgttaaaaatcgac ctatcaaagttttattttaaaactagcaatcgcaataggctttacatgat taagaacatttttcagtaatcaaaaacataaattttgaaactgatgggtC AAAAGGGTTTAGAGTcctcatcaaaatcattttaatttacttttaccgag attttcttcagatttttggttgtagactggataaagtctaggctggatgt acctcgaaaccaatatttgatgtatttgtaCTGGAGCCTTATCCGCGTGC TGGCCTAGCAGACGAATAAGACGCAGTGGGTGAGTGAGTCTAGACTACGA AAGGGGCGGGCTAGAGGAACCTAGGGGAGTAGAACCTAATCCTATTTGCA GACAGGAACGGGAGACTATGCAGTTACAATAAACTAATATTTAATAATGA CAACGCTCTACAATCGTGCTATAAATAAGAAATGGATACTTACAAACCTA TGTCCTGAGCAGGTCCGCCGCCGATCGCTGCCGAAACAACACTAAAGTTT AGGAGGGCTGGACAGCAATTGCTAAGTTGCTGCCCAGTGGAGCGTGGAAG GCGTAGTTGGGCGTTAGAAGGGCGCTAGATACGATCAGTAAAGGTATAGC CGAAGGAACTTTAGTACATTCCTCCGACCTTAAATGGCTACGTGGGGTCG CGTTTTCTTTGGAGGCGTTCCCTGCTCAGGGCTgactaataaaataataa aaataataaaaatttcctAAACTTGACACTTCTTCCATCTTTGCTTGGGG GGATCGGAGATTGGTCGGGGGGTAGCCACTCTTCAGGACAGGTCTTGTGC TTCTCAGCTGTTGGTGGATGGATCATCTTCTGCTGACCTTGGGATACTTT CTGGGGTGATTATGGTGGTAGCGGAAATAGCAGGTTCCACTAATACTGGT GGCTTGATGATAGTGGATGACTGGTAGTGGTGTCATCCCCAGCTGCCTGT GGTGGTGGTTTAGCAGGCGTTAAAAGttcatttgtttgttttgagGTTGT TTGGTGTGTCTTCTCAGCCACCAGTCTCTTTGTTTCTCCTTTGGTGGTCA TATTTAGTAGGCCAGCAGATTCAGGTTTCCCTTGGCGTTGGTGGTGTTGG TTGCCATTTTGGGTAGTCAGTTGTTTGTAGAAGTGTTGGTTGGATGGGTG AAGATGAGTAGCTACCGCAGGGAGGGGCATAGGTCTTTTGGGTTCTGGTT TTAGGGGTTTTAGGTTTGGTTTCAGGGAGACTAAGGATTGGTTTGTGGCG TTTCTTGTGTTGTCTTCTTCAATCCCTATGCAAATActataaatatatat aaaaaatcgTTAATTCAACCAGATTCAACctagaaattaaaataaaaatt taatacgGAGTGCAGTCCCAACTTCGAATTTCtcgtttcctttttttttc tctctctctcctttaaaaatgaaatacggTGTGCGGTCACAATTTCGAAT TTCTCGTTTCctttctctctctctccttTAAAAATGAAACGATTTTTTAT AGAACTTTCTACACCTTTAAATTCCGACCCGATAAGAAGAGAACTCGAAT TTCAGACCTCATTCAGATGAAAGTttaacaagaaaaaattttaagaaaga aagcaagttgacctTTGTTACAGTGGAatctgtttctaaaaaaaactgaa aattgattGTGATTTTAGGGATaaaaaaaaCAGGCAAGACAGGCAAGGCG GAACGATGCCTGCGGTACTTTTAGAATACTTACGGAGTTTGCGTAATTTA CCTTGTACGTCATTgcttcttttttcataaaaaaattcctgAAAGATACT GAGaaaaggtcaaatttaaaaatctcttcTCTCGAAAAACTTGAAAGCAT ATGTTTAATTTCAGGTAGAGTGCCTGGACCCCTTAGTCGACAGATCTCTC CACTCGGCATACGACACTCAAAATTAGCCACTGCATGAGCGAATTCCTAT CGAATTTCGCAACCCACGCGATTAGATCAGCAGCGTCTAATTAGAATTAA ACTCTGATCTAATATACAAACATCGTTCGTTTTGTTTAATCAGGTGTTTG TTTTGTTCGTTTACAAACACCTGTAGTCTAGCGGCTTCAATTTTCGTTTA TCAAACAATCTCTACACACTTGCTGCattaactgaaaaaaatttctaatt ttctatttttgcgaccaaaagttcaaaaaaaacaaaaaaaattgaaaaaa actaaaaagagaaaaaaaaatatctgaaacTTTTGGCCCATACTTCGGGT TTAAAACCTGGACGCTTGGGTCCCGAAGTACATTGTCCACTACCCATAGT ggaatgaaaatctcaatattCTCAAATCACATCTCCGTGAAATCATTTAC TCTAGATGTCTCAATACATCAGTTACTACAGGATCTCAATATCCTCAAAT TATATCTCAATAAAACCGTAAACTCTGAAAGATGTCTCAATACATCAATT TCTCATAATATCTCTATCGAACACAAAGGCAAATGAAAAACAACCACTGG CGGCTCACCGCGCGCTGGGACTCCGGCACTAGCTAATTCTCATCCACATT GTGTGGGCCTAGGCAACTTGTCCTTAATTTCTTCCCATTCATGAAAAAGA TTCGAGGCAGCCCAAGCTCGAAACAAAAACGCGAGAAGAGTGACAGTCGT TACACGACTACAGCGTCACTCTGATATTTCTAACTTTCTACGTCAACTCT CAACACTCCTCTCATCACACACACTCCTACATCTTGCTTAACAGCGTTCG CACCTTATAGAGGACAGTGCACCCTGGTCTTGTGGATTCCGTTATTGAAC TGGGGATGCGTCCTATCGCCCACCCGATGGTTTAGAATCCCGAACCTTAT TTTGTTTGCTGGTATAGCTTGAAACCGCTTTTGATTAGGGATATGCAGTA AAAGATAACCTTCCTTACAGGTCCATGCGATGGAATTCTACAGAGTATCT GGAACCCCACCCCAAGAAAGGAAGAAATCCTATAGAACCCTTTCCCTAGA CTCGGGAGTGATTTCTTAATTCTTTAGCTTCGGGTGAAAAGAAAAGTAAT CATTAGCCAGTAAGGctttaagaaacaaaagaaagaccaCTGTTTAATTT CGTTGGGCGCCAATGTACTGGAGCCTTATCCGCGTGCTGGCCTAGCAGAC GAATAAGACGCAGTGGGTGAGTGAGTCTAGACTACGAAAGGGGCGGGCTA GAGGAACCTAGGGGAGTAGAACCTAATCCTATTTGCAGACAGGAACGGGA GACTATGCAGTTACAATAAACTAATATTTAATAATGACAACGCTCTACAA TCGTGCTATAAATAAGAAATGGATACTTACAAACCTATGTCCTGAGCAGG TCCGCCGCCGATCGCTGCCGAAACAACACTAAAGTTTAGGAGGGCTGGAC AGCAATTGCTAAGTTGCTGCCCAGTGGAGCGTGGAAGGCGTAGTTGGGCG TTAGAAGGGCGCTAGATACGATCAGTAAAGGTATAGCCGAAGGAACTTTA GTacatatttttctgaattttacaagatcttttggcttttttcgacaaat tttcttccttttaatgtaCTTCAACcatcctttatataacaaaaggtcat tttagacaactaattataatttttgatgactaaAACGAAATTACTGATGC ATCATTATGCTGTAATTATGcttctttttgatttgataggtcaattttta acgtttttgagcacattcagaaagtaaattttttattcgattgagcataa ctttcaatctaatgaaccaaatttaataaatgacccatcaaaatttaagt ttatctttcttctttccaatgggataggaatggttcttttagaattttta gatttcgagaaaattagttttaaagagagaaacttttttgtggcgcaccc ggtagtaatctcatggttatgagggaaattcgggataaatctcccgaggt caattttgaaattttttgagatttaaaacatttcgaaatttgaccgaggg taatttatccagaatttcacgaaaacaagcgtGTGATTTCTGGTTAATCT CAAGGTTTGGATTTTAActctaacaattctgaaagacgtcaatttaacac ttgaaatcaatttgaaactttaaaaagaggtctcaaaaaagtcatagaaa cgcgaatcCATTTAAGCCttcgaagttagtaagaaattcgaaaaaaggtg acgaatttccaaacgatggaaatttcacttttgcggggaattacaaaatc taggagagaaattacaaaagcttggagggaaattacaagttcgcgggaaa tttcaaaatcttcgAAGGCCGTAatgggaaatttgaattttatgagCTTA AAATCAGACGAATTCATTATGCCGAGCGGACGCAGTCTAGAGTGAGTGGA ACGAAGGCTAAGAAAAAACATCGTAGATGCGTCCTATAAGTGATGCAAAT GGAATATAATAAGTAAATGTCAATTTTGTAAACGCCACCTGTGACGtaga ttgttttcttttttcgaaatatAAACATGAAGTAAACTATGATATGAACA TCaataaaatcctaagtaaataaaaatgtaaataaaatgttattttcctC TTCTTCCTCTACCTCTGTAGTAACCTCGTCTTGGTGGTCCGTTCAGGTTG CCTAAACGAGAAagtgtttttgagttttgtcgCATTAAACTTGTTTAACA CTGTAAAGTAGGGAGGTGGGATGGGAATGAATTCGTCTGATTTTAAGctc ataaaattcaaatttcccatTACGGCCTTCGGCCTAGGAAAATATCGCTT AAAATCAGACGAATTCATTATGCCGAGCGGGCGCAGTCTAGAGTGAGTGT TCACTTAGGCTTGCGGAACGCCGGCTAAGTCCTTGTTTAAAGCTTCATTG TCCTTTAGGAGCAAGTTTTGGTACTTTTCTGCTGTACTAAAGTTTTTGTT GTAGAATTTCTGCCATACTGACGTGTTAGACCAATTACCCATTTTTAGAA TGTCTGTTATTTTTGCTCCCTTTTGGTGTGCTTTGGAGGTTGAGGCTGAT CTCTTAGAATGGGCTTGGAAAATGGCAGTGTCTATGCCTGCCATCTTTAG CATTTCTTTGACCCATCTGGCTGTCTTTCCCAATGGGCTTGTGTGGTTCA ACATAACTTAAGAACAACTTCGATGTTTTATATCTGTCTCTGAATCTTTT TGTGATATAACTTGTTAAAGTATTGTAAGGGCATAGTTTAATCAAATTTC CTGAACTCAATGGGTTCTGCTTTCTTCCCTTGTTTGAAGTGTTTTGGAGG ATTGTTTAAGTGGAAAATAATAGTGGAGTCCGACCTTCCCATTAGCTTTA TGTCCAAGTTTGTTAGCTCGGAGCCCCTGTCAGGTGCTAGTATTCCTAAA AAAGTGTTATTGTTTTTAGTATtatctgaccactcccttatatAATTGAG CACAGTGTCGATATCCCTTATTTCAGTGTATTTGGGGAGCTGGGGTCTTT GTCTTGAGACTCCTTTTAATAGAGAGGTGACCATGGGGTGTTGTCCTGCA GAGGCAAGCCCTCAACTAGTTGGTGATAGAACGAGATGGCTGACCTATGT ACATTTATGGTGCTATACTCTTTCCCTTCTTCAAATAGGGTACCTAAGTA ATTGGCCACTTTCTCTATAGGGGCTGAAATGGGATCAGTTTCCTCCCTAT CACACCAGCTGCTGAAGCTTTTCCAGGCTGACAGGTAATGTTTTCTAGTT CCCTCTGCCTTGGACTGTTGGATAAGGGAGAAGCTGCTTGTGATAGTTTG CCTGAAAGCTTTTGTTTCCTGAGATTTCCCATACCGCTAGGTGGAGGGTT TAATTCAGTATTAGAGGGTGGATCTCCCCTGATGGATGTGTTAAAATGTC TTCCCTCATTACTATCTTTCTTGGGTTTGATATTAGCATTCCCAATAAGA CTGGGTACCAAGTTTGAGTCGTCCAAATTGGGGCCACTAGGATCACTGTT GCTTTGGATCTCCTTACTTTTTCCAGACACCTCCCTATTAGAGGGAATGG GGGAAAAGCATACACTAGGTTTTGGTCCCAGGGTTGGTTCAGTGCATCTA CTGCTAGACAGTGTTGGTCTGGTTTCCAACTGTAGTAAGTCTGTTGTTGG TGAGAGGTTCTTGAGGCAAAAAGATCGATTTCTGGGGGTCCCCACACATT CATTATGTGTTTGAACGTTTGCCTTGCTAGTTTCCAGTCCCCACAGTCTT TTGCATTCCTGGACTCGAAGTCGGCCTCCTTGTTTAGGGTCGAAGGAATA TATTCTGCAGTGAGGCTGATGTTCTTTTGGTTCAAAAATGAGCAGATCTC TTAGGCTTATTAGGGTAGAGTTTGTCGGCCGACCCATTTTCACAATGTGT ACCAGGGCTACTTGGCTGTCTATCAGTAGATGTACTGACCTTAGGTGATT CCCCTTTATAAAGGTTTTCATTGCTATCAGGGTTGCTTTCATTTCTAGGA TATTTATGTGTTCCCTTTTCTCTGACTCTGTCCATAGCCCTCCTGTGGAG CTTTGACCACAATGAGCTCCCCATCCCCCCATTTTTCCCTTTGCCGCATC TGAGCTTATAATTAAATCTGGGGGACGAATGTTTATGTCCTTGCCGTTTT CTGAGGAGAAGTTTCCTATCCACCACTTTAACTCTTCTTTTGCAGTGTTG TCTAGTTTCATCATTGAGCCGTAGTGTTGTTTGTTTTTCGCTAGCTGTTT GTTCATGCATTTTTGCAAGAGTCTTATTTGAAGAGGAGCTAGAGTAAAGG CTGGAGCTATTGCCATTAGATTCCCTATTAGGCTTGCAAGTTTCCTTATA GGGAAGCTCTTCAGATTTAGCATTTGGAcacaaagttttttcaattttag cattttctccTGAGGGACTTTGAATATCATGCTGGAGCTGTCTATCAGTA CCTCCAGGTATTCCATTTGTTGACATGGTGTCAGTACAGACTTCTCTATG TTGATTGTGAATCCTAGGTTCTCCAGTAAGAAGATCGTTGTGTCTCTGGA GAAGATGGCCTCCTTCTTTGACCTTGCTACAATCAGGATGTCGTCTATGT AGATTATCAGTTTTATCTGTTATCTTCTCAATAGAGAAATGGGCACCTTG AGAAGTTTCGTGAATATTTTGAGAGCTGGCCCTAGTCCAAACATTAGGCA TTGAAACTCGTATAGGTTTCCCTCCCAGCTGAATCTCACATACTTCATGG ACTGTGGGTGTATTGGGACAGAAAAATATGCATCTTTCAGATCCACTTTG ACCATGAAGTCCCCCTTCTAAAGAATGTTCTTTACATCGCTTAGGGtctc catcttgaatttttggtATGGGATATGAGAGTTGAGTTCCCCTTAAGTTT ATCACAGGTCTGAATTTCCCTggttcttttttctctttcaaaaaCGGAAT GGACAGGACCTGGCCTTGCTTGTAAAGAACTCTCTTTACAGCCCCTTTTT CCAGTAAAGTTCTTATCTCTGCCCGTATTAGAGCTTTCATATTTAAGTCG AAATTTATTTGCCTTGGTGGTGTCTTTTGAATTGGTTTTCCCATTACTGG GATTGACAAGCCTGAGATGGTCTCCAGGATGCATGGGTCTTGGGTTATTT TGGcccaattcttttgaaataattttgttttgccAGCAATCAATGTTGAC TGGGGTACTATTATCTCTTCTAGGAGATTTTCTATCCCTTGGTGTATTTT CCCAGGGTAGTGTGTTTGAAACTCTTACCTCTCCATTTTACAGCTCGTCT GGGAAGAGCCCCATGAAAAGGGTTTCCTCTTTTGGTCCTGTAGTCGTCTG GAAAATATGTATTGTTTAAGAGAAGTGTAGTCTGCTGCTTTGGATTGTTT TGTTagagttttccacattttctcTAAGGCAAGTGGAGCAAAAATGTCTC GTATCTTGGATGATATCCGAGAAATAGATTTGTCTACGGCTAGGGTTTTA GTTCCCATGTAGCCTTTCTCTTTCAGTAGGGTGTCAGTTAAAGTGCCCAT TTTTAATGTATTCGACACATTAGAGGGAACTGGTATTTCTTCCAGCACCA TTGAAGAAATATCTTTATCTGATATATACTTTGTGATGTGACCGTTCAAA TATTGGGCTAGTCTTTGTTCTAGCATCCAGTCACTACCATCCTCTTTCAT TTGAAATAAGAGAGGTTGTTCACGTTCTGGTGACTTTGTAGGGGAtttac ttctccttctacgtttgttcttggattttttcttcctttttcgacgtctt ctttcttctGATGATGACGAACTGTTTGTACGATGCTGTTTGTATCCGAC GAGGAACTCTCTGAAGATGAACCGGAAGGAGATCTTTGTCTCTTTTTGTG TTTACTGTAAGTTCTTCTTCCTTCCTCTCCAACTTTGGGATCAGTTTCTG CTACGATGCccttgattttactcgattcAGTTGCATCATTCACTTTCGGT GCAGCGGATTTATCCGCCATCTTGTTCTTTGAGCAGCGAAAGTGAAAGAA GGACTTAGTCGGCGTTCCGCAAGCCTAAGTGAACACTCACTCTAGACTGC GTCCGCTCGGCATAATGAATTCGTCTGATTTTAAGCGAtataaaattaca aattaacgcaAGCAAAAACGTcattcgaatttcaatcaaccacgAGATTA TAAAGAGTAACTTgggtttttaaacttttggagaAAGAATTTCCAGGagt aaaaaagtatagtatagtatagtaaaaaatatagtTCCACTTGATTAGAG TTTTCACAAGTCAGATTTGCAATAAAACTCCCTATCAAATAATTTTGTTA TAGAGGTTATTCCATACGAAGAAGTAGTGAAAGAGTTGGCAGCAGACACT TTGTACACTGATGCTGGTATTGGGATTGGTGGTGGACGCTTCTCCCCAGG CTCCTTTTCCTCAACTGTTGTACTATCTTTCAAGGTGAGTGAAATTTTTT GTAGCTTCGACCAATCGCTGGCACCTCTCCTGGTATTTTTCTCATTGATG ACTGTGATTAACATTTTCGAACTTATTGGCTTTGATCCAAAAGAATGGCA TACTCATTTGCTATGTGATTTGACTTAACAATGAAAGGATTTCATCATTT TATTGCTTAGTTAAGTTACTATTAAAAGTCCAGTTTTTAGGGAAATTATT GAAACAAGATGCCCCAAGTTGCTcctaaaactttttttctattgtaGGTT GAAAACGATAAATACGAGAAAGGCGTTCGTTGGGCAAGAGACGTTCTTTA TAATTTACAGTTCTCTACTGATCGAATCAAAACGTGTGCTAATAAGATTG TCAAAGATGTGCCTAAGTAAGTACCCACCCACCTCTTTTGCTGAGGTATG TTTCAAGTATCTGGCATCGagcaaaaagaattttgtgCACTGACTCGTTT CTACTTATTATAACCTTGGGACAAGAAATATGAGTTCATAAAGTTATCTT TGAGGGCAGCTGATTCAGGCTGATTCGCTTAAGttaattttcgagaaaaa aatatttttaacttggAGTAATTTAGGGGTAtttttttGGCTGGCATAAT GAAAAGTAATTCAGGTTGTACCTCCTTTATGTTCATTTAACGTGATACAA AGATTCAAATTTCGTCGAATcgcaaaagatttttattgcGAATAAGATAA GCTCGATTCGGGAAATTGATTCTCAATAAATTAAAAGTTTGGCGAATTTG CTTAATCACGATAATCTTTCCCCTAAAGTAGTTAGTTCTCTTGCTCTTTC TCCTGAAAGGCGAGTAATAAGCACCTTTTCTTATAATGTCTCACTTGGGC ATGTGGAGAAGGAATTAAATTTCGTAAAAACATTAACATTTCAGTCACAA ACGAAACGGGCGAAGGGTTGTCAAAAGTTTATTGGACGATATCACTTACA ATAAAGGTAAAGTTGACTTTTCATTTCATGATTTTAAAAGCATAATTAAA TTGATAATCAAGAATTATGTTTTATTACAATATATAGCCTGAACTCGACT AtcttacaaaatgaaaaagattgtaACGAGAGTCAACATAGTTTTGTGAA AAGAGACTCTAATATGTCAAATAAAGcaaaatagtttttcttaaGTTCGG TGCTAGGTTTTTTCAAGGCCAAGCTCGTCCATATTTCCTTTCAATCTTCT GTGTTGGTTGTTCTGGTGAATTTTCTTCGCGTTTTCCGGTAATCCAATAT CTTGGACGTGATTCCGCCGTACTtctgttttgttgttgtttacgCACGAT CCTTTCTGTATTTCCATAACATTCTTTACTGAAAAACCAACAACGAAATG GGGACGATTCCTTTCGAACATTCGAGCCTTTATCAGTCGCAACTTTATCT GCCATTTTGAAAGggaggaaaatttttcttttttcgatgtttttcgttct tttGGTGCAAATCGAAGGCAATAGTAAAAGGTATATGAATAGAAGAATGA AAGATTTTCTCATCAACCTGTCCATTGCTCTCTCCAAACTCGTTTGAATT CTGATTTTGGTTTAACCCTTAATTATCTTAACTTTAtatgaatacacgct ttttcttttataagaatatcttctataggaatatcagggtgaaaattggc caaatcgtaagaataccctaagaataccctaagaataccctctagggtga gtttcacagaatttgattaGAATACAgtgattttgtatttggttaacata aaaaagctgcttcctttgttagacttgaatttaaactttgaggcagaaat gtaaCTTTAGCAccaaatgttcattcaaaagtccaaaactctcaaattga tcatttctcgtGTTTgtaaaaagtcaagtctaaaaaagtaagaatacgtt aagaatatttcaccctcaattttggcaatttattaagaatacttgaccct catccaaagtacactatccttataaaaaatagcgtgtatgaagaaaagtt attttgcaaaaaattgagtaaaaaggtgctaaaaTATTTTCGCTCCTGCT ATATCCTCTCGCTAATTCATCGgttttttttgtcgaaaatagTTTTTCTG TTTTGATTGAACTCAAGCATTATTTTGAGTTCTTATTAACGTCCAAAGTT CTATTTTCGCAAGCTAAATTTCGTAATTTTCACCAGTTACAGTGACAAAC AAAGTTATATAAATATAGATCAAAACTagaaatatgaattaaaaaacTTG GtgttgggaatttttttttcatttcaaataaaaCTATATTACATTTCAAA CGCTTCCTGCCCTCTTCATTTCTTCTTGTCGCATTTTCCGCCATTTTTGA CGTCACACAAAGACTGCTCTTGGTCTCCGATTTCATTCCATTCCCTGAAA GAGAGCATATCATCGATATCACGTAGATCGGACACTTTCTGTAACAAATC TTTGACCGCCTGTTCGCGCAATTTCATCAGGCCGCTTAACATTTGATCTC GATCCGCCTTTTCTTGGACATGTCTCTTCCGCCCGATTTTTAAGAAGCCT TCAGCGGGCGGTAGAAACAAATTGATCGATAGTGTTACCAAAAGAGCTGA CGTTAGCAATTTCTCGCACGTTTGACGACCTGAAATAAGAATATCGAAGA TTATTTCggtaaaataactttttaaacgTATTAGAAAAGccccccccAGT CTCCCTAGACCATGTTTTTGAAATCTGAGCACTACGGAACCTTGGGGAAA GGCTtgtcaaaaaaactttctaaaagACAAGAAGAAGCCTAAGAAGGGTA AACAATAAACAGAGATTCACATAGAAAAGAATCGATTTTTAAAACTTCGA TTGTTTAGATACCTTTCTTTCGTTGAAACATGATGATCTGTAGGACACCA GCCACCTCAAACTTTCCTTCTCTTGAATTGTCTACTGCTCCCTGTTGTTT TCACTGCATCTCTACTGCCTTCCTGTCGCTTACTTATGATGATGGTAATT CACAACAACTGTTTCTTTCCCAGTGTCAAAATCTCTATTAGTGATCAATT CTTTATGaagaaatatatattttacactaatttttcactgtttcaatttt tcaatgtaAAGATTGCGAATTGTTCAATTATTGTGAGAgaaaaattgttg attttttctGTTTGATGCTCTAAAGGAACgaatgattgattgaatgaatg aatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaa tgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgaatgatagaatggattagtg actgagggaatgaatgaatgaatgaatgaatatacTTTTTTCCTACAGAA TCGAATGTCTATGCAGGAAACATGGTTCGACAACACGATTTTTTGAGCAA ACTCATCAAAGATTTGGATCAAAACTCCTCACAGGTACTA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000006_pilon:1033443..1052382+

>XLOC_040152 ID=XLOC_040152|Name=XLOC_040152|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=4386bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000006_pilon:1033443..1052382+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGAAGGTTTTGAGCTTATTTCATCAGCAATTGTATCAGACATCATCCC
CATCAAGAAATATCGTTCCAAAGCAACTGGTATCACTGTTTGTATTGCTA
ATGTTGAAGGGCCCCTTGTCAATGGCTACTTTTGCTTAGATGGAAGGTTT
TGAGCTTATTTCATCAGCAATTGTATCAGACATCATCCCCATCAAGAAAT
ATCGTTCCAAAGCAACTGGTATCACTGTTTGTATTGCTAATGTTGAAGGG
CCCCTTGTCAATGGCTACTTTTGCTTAGcTACTGAAGCTCATGATGATGA
TGGTCTGCCGCATACTCTTGAACACATTGTGTTCATGGGAAGTGAAAAGT
ATCCTTATAAGcTACTGAAGCTCATGATGATGATGGTCTGCCGCATACTC
TTGAACACATTGTGTTCATGGGAAGTGAAAAGTATCCTTATAAGGGACTT
CTTGACTTGTATGCTAATAGATGTTTGGCACAAGGTACCAATGCTTGGAC
AGATGTTGATCACACTTGTTACACCATGACTACTGCTGGCAGTGAAGGCT
TTTTGAATCTCATCCCAATTTATTTGGACCATCTACTATATCCCACAATC
AAGGGACTTCTTGACTTGTATGCTAATAGATGTTTGGCACAAGGTACCAA
TGCTTGGACAGATGTTGATCACACTTGTTACACCATGACTACTGCTGGCA
GTGAAGGCTTTTTGAATCTCATCCCAATTTATTTGGACCATCTACTATAT
CCCACAATCAAGGAAGCTCATTATACAACAGAAGTGCATCATATCAATGG
AGAGGGAGAGGATGCTGGTATTGTCTATTGTGAAATGCAAGCTCGAGAAA
ATTCTGGTAGTAGTTTGACACATCGTGCATTTGTTACAGAGATGTACCCT
GGTCATTGTGGTTATAAGGAAGCTCATTATACAACAGAAGTGCATCATAT
CAATGGAGAGGGAGAGGATGCTGGTATTGTCTATTGTGAAATGCAAGCTC
GAGAAAATTCTGGTAGTAGTTTGACACATCGTGCATTTGTTACAGAGATG
TACCCTGGTCATTGTGGTTATAAGAGTGAAACTGGAGGCATAATGAAGAA
TCTTAGAGAGACATGTAGTCacaaaaagAGTGAAACTGGAGGCATAATGA
AGAATCTTAGAGAGACATGTAGTCacaaaaagGTCAAAGATTACCATACA
GATTTCTATCGTGCAGATAATTTGTGTTTAATTATTACTGGTAATGTAAA
ACCCGAGGAAGTCTTTGAAGCCATCAAACCTTTTGAAGAGAAAATCAAGA
GCAAGGTCAAAGATTACCATACAGATTTCTATCGTGCAGATAATTTGTGT
TTAATTATTACTGGTAATGTAAAACCCGAGGAAGTCTTTGAAGCCATCAA
ACCTTTTGAAGAGAAAATCAAGAGCAAGAAAACCCTACCACCGCTAACAC
GACCCTGGATGAGTGAAGTACCTCCATTGACGGAGAAACTTGTGGAAAAG
CGCGTCTTGTTCCCTACTGAAGATGAATCTGTCGGTACAGTCACACTGGG
ATGGAGAGGTCCTAGTGTTAATAAAACCCTACCACCGCTAACACGACCCT
GGATGAGTGAAGTACCTCCATTGACGGAGAAACTTGTGGAAAAGCGCGTC
TTGTTCCCTACTGAAGATGAATCTGTCGGTACAGTCACACTGGGATGGAG
AGGTCCTAGTGTTAATGAGTATTACGAGATTCAAGGTATCAAAATGCTGT
TCAATTATTTAACCGATACACCTGTTGCTCCTTTGCAAAGAGATTTAGTG
GAAATCGAAGAACCATTGTGTAGCGATGAGTATTACGAGATTCAAGGTAT
CAAAATGCTGTTCAATTATTTAACCGATACACCTGTTGCTCCTTTGCAAA
GAGATTTAGTGGAAATCGAAGAACCATTGTGTAGCGATATCGATTTTTCG
TtcttcgaaaacaaagaaactgcAATTAGTCTTGCAGCTGATAATGTACC
AAAGGAAAACTTGGATGACATAAAAACTAAATCGATTTTTCGTtcttcga
aaacaaagaaactgcAATTAGTCTTGCAGCTGATAATGTACCAAAGGAAA
ACTTGGATGACATAAAAACTAATGTTCTTGAGATCCTTGGAAACATTGCA
TCAGGGAAAGAGGAGTTCGACATGGAAAGGATGAAAGCGCAGATTCACCG
ATCTGTTCTTGAAGAAATGAATGCTTGTTCTTGAGATCCTTGGAAACATT
GCATCAGGGAAAGAGGAGTTCGACATGGAAAGGATGAAAGCGCAGATTCA
CCGATCTGTTCTTGAAGAAATGAATGCTGTGGAAGATTCACCTCACGACA
CGCTAGCTTTCTTATCAATCGGCGATTTCTTATACTCCACCAAAAGTGAT
ACCATGCAAGAGTATGTGGACAAAATCAAACATTTAcaaaagttgaaaga
agaaCCGGTGTCTTATTGGACTGATTTGATGAAGAAATATCTGATGGATC
AAAAGATGGTGGTCATCATTGGTGACCCGAGTGAAGAAAAAATGGAGAAG
TCTGGTGAGGAGGAGAAAGCACGTGTTAAAAGACAACGTGAGGAGCTAGG
TGAAGAAGGATTAGCCAAGAAAAAGAAGATCGCTGATGATGCGATCGCTG
AAAATTCGGTGGAAGATTCACCTCACGACACGCTAGCTTTCTTATCAATC
GGCGATTTCTTATACTCCACCAAAAGTGATACCATGCAAGAGTATGTGGA
CAAAATCAAACATTTAcaaaagttgaaagaagaaCCGGTGTCTTATTGGA
CTGATTTGATGAAGAAATATCTGATGGATCAAAAGATGGTGGTCATCATT
GGTGACCCGAGTGAAGAAAAAATGGAGAAGTCTGGTGAGGAGGAGAAAGC
ACGTGTTAAAAGACAACGTGAGGAGCTAGGTGAAGAAGGATTAGCCAAGA
AAAAGAAGATCGCTGATGATGCGATCGCTGAAAATTCGGTTGAACATCCG
ACAGAATTAATCACACAATTGAAAGTCCCCTCAACAGACAGTGTCACTTT
CCACAATGTCAACTCTTATCGAAACTACTCACCTGCACAACCAGCAAACT
TCGAAGCTGCCAAGAAGTTCCCTTTGGATGGGTTCCCTGCTGCATTCAAC
GTCTGCCATGTGCAATCTCTCTTTACACAGGTTGAACATCCGACAGAATT
AATCACACAATTGAAAGTCCCCTCAACAGACAGTGTCACTTTCCACAATG
TCAACTCTTATCGAAACTACTCACCTGCACAACCAGCAAACTTCGAAGCT
GCCAAGAAGTTCCCTTTGGATGGGTTCCCTGCTGCATTCAACGTCTGCCA
TGTGCAATCTCTCTTTACACAGATTTACATCGTTATTGACTCAGCCAAAT
TGTCCAACGAGCAAAGGATGCTGTTACCTCTTTATACCGAACTCTTATAT
GAATCTCCCATTCTCAGAAATGGaaATTTACATCGTTATTGACTCAGCCA
AATTGTCCAACGAGCAAAGGATGCTGTTACCTCTTTATACCGAACTCTTA
TATGAATCTCCCATTCTCAGAAATGGaaAGGTTATTCCATACGAAGAAGT
AGTGAAAGAGTTGGCAGCAGACACTTTGTACACTGATGCTGGTATTGGGA
TTGGTGGTGGACGCTTCTCCCCAGGCTCCTTTTCCTCAACTGTTGTACTA
TCTTTCAAGAGGTTATTCCATACGAAGAAGTAGTGAAAGAGTTGGCAGCA
GACACTTTGTACACTGATGCTGGTATTGGGATTGGTGGTGGACGCTTCTC
CCCAGGCTCCTTTTCCTCAACTGTTGTACTATCTTTCAAGGTTGAAAACG
ATAAATACGAGAAAGGCGTTCGTTGGGCAAGAGACGTTCTTTATAATTTA
CAGTTCTCTACTGATCGAATCAAAACGTGTGCTAATAAGATTGTCAAAGA
TGTGCCTAAGTTGAAAACGATAAATACGAGAAAGGCGTTCGTTGGGCAAG
AGACGTTCTTTATAATTTACAGTTCTCTACTGATCGAATCAAAACGTGTG
CTAATAAGATTGTCAAAGATGTGCCTAATCACAAACGAAACGGGCGAAGG
GTTGTCAAAAGTTTATTGGACGATATCACTTACAATAAAGTCACAAACGA
AACGGGCGAAGGGTTGTCAAAAGTTTATTGGACGATATCACTTACAATAA
AGAATCGAATGTCTATGCAGGAAACATGGTTCGACAACACGATTTTTTGA
GCAAACTCATCAAAGATTTGGATCAAAACTCCTCACAGGTACTAAATCGA
ATGTCTATGCAGGAAACATGGTTCGACAACACGATTTTTTGAGCAAACTC
ATCAAAGATTTGGATCAAAACTCCTCACAGGTACTA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_040152XLOC_040152-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000006_pilongenomesc0000006_pilon:1033443..1052382 +
Properties
Property NameValue
Aaloc2104-2193:18851
Aaloc2041-2100:16396
Aaloc1921-2037:15748
Aaloc1792-1920:15356
Aaloc1687-1788:5948
Aaloc1495-1686:5148
Aaloc1165-1494:4625
Aaloc1063-1164:4138
Aaloc970-1059:3800
Aaloc859-969:3423
Aaloc715-858:2143
Aaloc592-714:1735
Aaloc538-591:1585
Aaloc382-537:1226
Aaloc223-381:696
Aaloc142-222:498
Aaloc1-138:1