XLOC_040038 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_040038
Unique NameXLOC_040038
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000130_pilon:490751..505781+

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_040038 ID=XLOC_040038|Name=XLOC_040038|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=15031bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000130_pilon:490751..505781+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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GTATgctttaaattctttttattcAGCGGAAGAGTTTGCTTCATTATCAT CAGTTTGCAAGGGCGGTCTCCGATTTTAATCTAAgatttaaaaatgaata aaacttCTCAAATTCCGCAGCACCTCTACAGTAGTGGTTTGTAACTGCAC TCTCTAATTTGAGGTTCTTCTATTTGATACGTCCCAATCCCGCTAtgcga taatattgaaagtcatcgtcaacaagaaactctcataaacgacttTCTAC TTTCGTTCGTGACTTTTAACCAGTTTTTCTGTCTTTTAGATACAACACGT TTGCAACGGGAGGATCTGACGGATTTGTTAACGTTTGGGATGGTTTCAAT AAAAAGAGATTGTGTCAAGTAAGTCGGTCTGATGGccaaattatgttttt aaattaCACCTGTATCTTAATCTTACTACAAAAGgattatttttcgtttt ttagagAGAAAAACGTCACAcgcaaaataactcggaaaaataactcgaaa aaataaCTTAAGAATTCCAGGCTTAAAAGCCACTTACTTTTAAAATGATC TGCAAAAGATGAATGATTTTAGTACATTACACGATGGATCAGAAAACTTT AATCAGAGATTTGTTCTGTCAACGAACAAAAGAAGAGGGTACTCGACTAC ATAGACCAGAAAACCTGATctatatcttttcaaaaactaATATCATTTTA ATACTTGAAACTGATTGACTCAAGACCCCTTAAAAAATGTCAATCTCGAT ATTATTCAATAGTTGAAAAAGGTTTAACTAATATCGTGATAAACATTGGG TATAACAGTTCTGATAAATGCCTTAAAATGGAAAGATCTTCTCAGTAAAT GGTTCAAAAACATCCATAGTGTGGGAAAGAACAAGTATTAGATTTCAAGA TAGTGAGTGATATTTTATTTACATTATAAAAGCTGGTAAAAATAATGTTA 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000130_pilon:490751..505781+

>XLOC_040038 ID=XLOC_040038|Name=XLOC_040038|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1896bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000130_pilon:490751..505781+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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TTGGGATAGTCGCCATCCAGAATCATGGCATGTTCCGCTTATAGCGCTCA
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aagatgGCGATCGAGAAGGCAAACGAAACGTGCTTGAAAAATTCACCAAC
AGATACAATTTCTTCGATCAAATTTAGTCCTGCTACATCAAACTTCTTAC
TTGCAGCATCTTGGGATAGTACGCTCCGTTTGTACGATGTGACAAATAAC
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TTCTGATACCACACACGGCTTCTGTGGTGGCCTTGAAAAAGCTGTCAAAT
GACGCTCCGTTTGTACGATGTGACAAATAACCTTCAACGTCATTGCTTCA
ATGAGGGTGGTGCTGTATTGGATTGTTGTTTTTCTGATACCACACACGGC
TTCTGTGGTGGCCTTGAAAAAGCTGTCAAATGCTACGACTTCAACACATC
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GGTGTTGTCGAACAACGACGCGAATcgagtttgaaatttcaaacGAGATG
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CCACCGCGTCAAAACTGAAGGTGTCGAGTATATCTATCCTGTAAATGCCA
TCAGCTTTCATAAAGGATACAACACGTTTGCAACGGGAGGATCTGACGGA
TTTGTTAACGTTTGGGATGGTTTCAATACAACACGTTTGCAACGGGAGGA
TCTGACGGATTTGTTAACGTTTGGGATGGTTTCAAAGAAAACGCCAGATT
TGATACTGTCTTCAACGTCAGATTCGATGTCAGCGACTGAAAGAAAACGC
CAGATTTGATACTGTCTTCAACGTCAGATTCGATGTCAGCGACTGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_040038XLOC_040038-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000130_pilongenomesc0000130_pilon:490751..505781 +
Properties
Property NameValue
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