XLOC_039976 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_039976
Unique NameXLOC_039976
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000011_pilon:1031860..1045204-

Legend: polypeptideCDS
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>XLOC_039976 ID=XLOC_039976|Name=XLOC_039976|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=13345bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000011_pilon:1031860..1045204- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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TGCGCAAGGAAAATTCGCGTAAGTAACTTGATGTTCAAATCAAAACCAGT GTCTTGTATTATTTAGATTTACATGTTAAAAGTTTTGCTTGCTAGCTGCG GACGAATGTTTGCTGTAAAGTTGGACTATTTTACACTGAAGTGACTTTTT GTCTATGCGTTTTTTTGCATGCGATGTGAAGTATCGGAAGTTAGTGATGA TGAATGAACTTTAATAAAACAGCCGTAATGACGGCTGCAAACTCTGGTAA TTGTCATGGGTCACCCTTTCTTAATATATCTAACATAAAATTTAAAAGAG TATATCCTAGTAAGTACGAGCGCAAACGCAAACCAAATCGGGAAATCAAA CCCGACTATTGTGATTGATCGGATTTACGCGCATAAAACACTGATTTTAA GAAACTCCTTAACCGGAGTTTAATAACCAATGTTGAGTACTTCCATATTG AAGCATAAGCTTAAGTTTCTTCAATGTTGATTTCCCGGTGAAAGATAGAA CTACAGTTTCTTTGGCGTCATGTTTACACTGTGTTTATCTGGAAAAAAAG CGGTAAAAAAATTGTATATTATGAAATATGCTGAATATCCTTATTTCAGT TCGCCCAAAGACTTGTACTATGATCAAGAAAATGCGGATAAGGAGAAAAA ACAAGAAGAAAATAAAAAACAAATACAAGCCAAACGAACAAGTAAGCAAA CAACATTCATAGTGTAACATTTTAATTGTTTTCGGGGCGCTAGATAAAAA AAACCAGTGAAATTGCTTGTTGTCACGTGATTTCTTTGGTAGGAAATCCC ACCAAAACTTGCTTCACTTTTCGATAAAGGCCGTGGATCTAGTCTTACTT TAGAATTCGGTTGAACATTTTTCTTTCAGCCTACCTGAAGCGAGTTATCG CTCATCCGTCATTCAAAAACGTCACGTTCAAAGACGCAGAGAAACTGCTT 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000011_pilon:1031860..1045204-

>XLOC_039976 ID=XLOC_039976|Name=XLOC_039976|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=4602bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000011_pilon:1031860..1045204- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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CGATGCCGATCTACCCAACGGGAAATCGACGACTTCCATGCAGCGGCGCC
CTTCAAATACTTGAGAAACAAACCGGTGCGTGACTTGTCCGGCGAACAAT
TCTTCAAGATGTGTCATGCGGAACAAGAGAAATTGGTCAAAATCAAAATC
GCCATCGATGCCGATCTACCCAACGGTGCCCAATCTTACTTGGATGAGAT
CAAGCAACTCTTCTACAGGTGCCCAATCTTACTTGGATGAGATCAAGCAA
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TCTCCAAAGAATTGAAATCGAAATTATTGAACGAATCTGTGGACTTTACT
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AAGAATTGAAATCGAAATTATTGAACGAATCTGTGGACTTTACTCTGATG
ACTTGTGGATTGAAATTACGTAATTGGATCTCAGTGCGACCATACCAAGC
AGATTCCAGTTATAAGGAGGGTGGGCACGAGAACGTGGAAAGTGAACACA
CCTGTTGTCCAGTCCTCTCCTGTTCATTCACAGTGGATAAAGAATCTGCT
TCTTATTTCGCTATGATCGATGCTGATGGACAAATGGTGGATTTCTTGAG
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TACCAAGCAGATTCCAGTTATAAGGAGGGTGGGCACGAGAACGTGGAAAG
TGAACACACCTGTTGTCCAGTCCTCTCCTGTTCATTCACAGTGGATAAAG
AATCTGCTTCTTATTTCGCTATGATCGATGCTGATGGACAAATGGTGGAT
TTCTTGAGGTTGAAGCATTTGTTGTGGCGAAGAAACAGTCGGAAAGAAAA
TGAACGGAAAGCAAAGGAAAAAGATATGGAAATTCTCAAAAACTTTATTT
TACGTCATCAACCGCGTGCGGTCGCCATTTCCGCTGAAACGCGCGAGAGC
ACAAGCGTGATGGAAGATATCTCACGCGCAATCACCGAACTCGAACAAGA
ACAAAGCATGTCTACCATTTACGTCGAATTAGTGGACGCCGAAGTCGCGC
GTTTGTATCAAGATTCACCGCGCGGGCGCGCAGAATTTCCAGACTACCCA
CCGTTGCTGAGACACGCTATCTCGATCGCGCGACGACTTCAAGACCCGCT
GGAGGAATTTGCCAACCTTTGTGAAACAGAAGATGAGTTGCTCTGCTTAC
GATTTCATCAGTTACAGGAAAAAGATATGGAAATTCTCAAAAACTTTATT
TTACGTCATCAACCGCGTGCGGTCGCCATTTCCGCTGAAACGCGCGAGAG
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CGTTTGTATCAAGATTCACCGCGCGGGCGCGCAGAATTTCCAGACTACCC
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TGGAGGAATTTGCCAACCTTTGTGAAACAGAAGATGAGTTGCTCTGCTTA
CGATTTCATCAGTTACAGGAATACTTACCACGTGACCGGTTAGCGAAACG
AATGCAGATCGAGTTCATCAACGTTGTGAACGAAGTTGGCGTTGACATCA
ACCGCGCCTTGGAATTCACACATTCAACCATCCTCACGCATTTCCTTTGT
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TGACCGGTTAGCGAAACGAATGCAGATCGAGTTCATCAACGTTGTGAACG
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CTCACGCATTTCCTTTGTGGACTGGGACCAAGAAAAGCTAACCACCTGAT
GAAGACTATCAGGCAAAATGGTGGTCGCCTTGACAACCGGTCACAATTAG
TCACCGTATGCGAGATGGGTTTACAGGTCTTTTTGAATTGTGCCGGCTTC
ATCCGTATTGAGCCGAGTGAAGCCAACGATGACCGGTATGAAGTGTTGGA
CGGGACACGTATTCATCCGGAAACGTACGACTGGCCGCGTAAAATGGCTG
TCGACTCTGCGGACGATAATGACACTATCAGGCAAAATGGTGGTCGCCTT
GACAACCGGTCACAATTAGTCACCGTATGCGAGATGGGTTTACAGGTCTT
TTTGAATTGTGCCGGCTTCATCCGTATTGAGCCGAGTGAAGCCAACGATG
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TGGCCGCGTAAAATGGCTGTCGACTCTGCGGACGATAATGACGTTCCAGA
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GGTTCCAGAAAATCCAACAATGGCAGTAGAAGAGGTCATGACAGATCCTG
GACGTCTTAAAGATTTAGATCTTGATGCCTTTGCTGAAGAATTGGCTCGA
CAAGGATACGGTAACAAGCAAATCACATTATATGATATTCGTGACGAATT
AAGTTACCGTTTCAAAGACCATCGACCGCCGTTCAGAGGTCTTGGTTTCC
AAGAGAAATTCGAACTGTTGACGGGCGAAACACAACAAACTTTGTATTAC
GGTAAACTGATCACGTGTCTGGCCACAGGGTTCGCTTTCAAGAAGGCGAC
CAGAGATGAATTGGATTCGGCAAACCCTACCAGGAATGATGAGACGAATC
TATGGAAATGTCCCTTCTGTTTGAAAGACACTTTCCTGGACCTCAGTGAA
GTAACAAGCAAATCACATTATATGATATTCGTGACGAATTAAGTTACCGT
TTCAAAGACCATCGACCGCCGTTCAGAGGTCTTGGTTTCCAAGAGAAATT
CGAACTGTTGACGGGCGAAACACAACAAACTTTGTATTACGGTAAACTGA
TCACGTGTCTGGCCACAGGGTTCGCTTTCAAGAAGGCGACCAGAGATGAA
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TCCCTTCTGTTTGAAAGACACTTTCCTGGACCTCAGTGAAGTTTGGACTC
ACTTCGATAACGGAAGTTGTCCGGGTCAAGCAGTCGGTGTACGGACACGT
CTAGATAACGGAATATCCGGGTTCATTTCCAATAAAAATATTAGCGATAA
AGGGGTACGAAGACCCGAAGAGCGAGTCAGAGTTTGGACTCACTTCGATA
ACGGAAGTTGTCCGGGTCAAGCAGTCGGTGTACGGACACGTCTAGATAAC
GGAATATCCGGGTTCATTTCCAATAAAAATATTAGCGATAAAGGGGTACG
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TCAAAATCAATTATGAACGATTCCAAGTTGATTTGACATGTAAATCATCC
GAGCTGGCCGATGCGCAAGGAAAATTCGCGTCGGTATGACACTTCATGCT
CGTGTTATCAAAATCAATTATGAACGATTCCAAGTTGATTTGACATGTAA
ATCATCCGAGCTGGCCGATGCGCAAGGAAAATTCGCTTCGCCCAAAGACT
TGTACTATGATCAAGAAAATGCGGATAAGGAGAAAAAACAAGAAGAAAAT
AAAAAACAAATACAAGCCAAACGAACAATTCGCCCAAAGACTTGTACTAT
GATCAAGAAAATGCGGATAAGGAGAAAAAACAAGAAGAAAATAAAAAACA
AATACAAGCCAAACGAACAACCTACCTGAAGCGAGTTATCGCTCATCCGT
CATTCAAAAACGTCACGTTCAAAGACGCAGAGAAACTGCTTGACACCATG
ACGCAAGGCGACTGCATCGTTCGACCTTCAAGTAAACCTACCTGAAGCGA
GTTATCGCTCATCCGTCATTCAAAAACGTCACGTTCAAAGACGCAGAGAA
ACTGCTTGACACCATGACGCAAGGCGACTGCATCGTTCGACCTTCAAGTA
AA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_039976XLOC_039976-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000011_pilongenomesc0000011_pilon:1031860..1045204 -
Properties
Property NameValue
Aaloc2188-2301:115
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