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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000011_pilon:1016056..1026732- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_039975 ID=XLOC_039975|Name=XLOC_039975|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=10677bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000011_pilon:1016056..1026732- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ATGGCAGAGCGAGCGCCGTTTGACGGAGAGCAGCGGGACGAGAAGGAAGA
GAAAGCCAGGCTTGAACAAAATGCTTTACGAACCAATAACCATATTCTAA
CTCAAGACTTTTCAGATGAATATGGAAATAAATATTGGGCTAAATTCAAA
ACAGAACACTTCGATTCCGGTGTATCCCGGTTTGCGTTTAAGGGGACATT
ACGAGGTTCTGGACCTAAAAAAGATCAACAATGTGTTGTTAAAGTGTTTA
AAGATGAGTTTGCAAAGGATATTGATTTATGGGTACCAGACCTTTACACC
AGCATACGTGCTAAAGAGTTATGCAAAGAATTTAACGATGAACATGTATC
GACATTGAGATTAGCCGAAGCTCCAGTCAAGATGGAATTTGTTTTACCAA
TGTTAGCCAGAGTTGATGAAACCACTATGAATAACTCTGCTACAGCTCTC
AGAAAGAATAAAAAAATAGCTAAACAAGAGTTTGTAGCTATTGAACAATT
TATTGAAGGGGAATATGTGAAATTCAATTCAAATGCAGGGTATGAGCAAC
AAGAGTTATCAGAGTTGATGCCAGCTTTTACACATTGGACCTGGGAAAGG
ACAGCTCGCAAGATGATGGTCTGTGATTTACAAGGTATGCTCATCTTTTT
TTTGATATGTTTAAATCCGTAATGTTTTTTTTTATAAGCACAACGCTTTA
AGCATACGAAGGCTCAGATTTGCAGAATTCCTACATAAGCATACACGTTT
TTTTCAGCCTCAGCATGTTTCTTAGTTCTTAGGTATTCTGAACCTCATGT
TTCTTAAAAGTTTGTTTCTTAAAAAAAATGTGTATATGTCCGGCTGGAAT
ATTTTTCAAGTTGTCATTTTTTATCTGCTTAAAAAGGTTTGGTGGAGGGC
AAGTAAAAAAAGACATTCCACGGCTAGCTACATTTCACTGCTCTCAAAAT
CTGTCCCAAAGTCTGAAAAAGTCTCGGGTGAATCATAAGAATGATTAATA
AGCATAAACATAAGCTATGCCTGAATGCTTTATGAACTTAAGCATACACG
AGCCTGACCAAGATGCATACACTTGCTTATAAAGAAAACATGTAGTCTTT
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CTTGATGTCGGGACAGTGTCTGCCTATTGTTATATTATGCTGGTATAAGC
AAAAAATGTTTTTCTTTTCCTCTTTCTGACCAATCTTTCTCCACCTATGT
GTCAATCCAATGTGAAAAATGTGAACTTAAATTGATGAGTAAGCAAACTC
ACTCTTATCCAAAAACAAAACCTTTAACTCATCAATGTTTAGAAAAAGGG
GTTACGCGCGCTCCAGAACGCTTAAGTACGTTCCTCCACTCTGTTTGCGT
TGCAAATACTACTGAGGTAATCCAGGATAATCATGACGATCGGCGAAAAA
TTTAGGGCTATTGAAATTACGTTATTTCATTGGTTGAAACTCACTAGCAT
GTTACATTTTGGTCGTTTTCGTGATTATGCCGATTTGCTAGTTAACCTCG
CAAATATTTAGAGTGTAGAGTCTTGAGAAGCACTAGTGAAAGGTGAAAAC
AACAGCTTTTTAATTGGATATTCTTTTTGCGGGTAATCTGTTAGGCAAAA
CTAGAGTGCCTTTTCTGGGTAAATATATTGGGGGAAAGTGACGAAAATTA
TAAGAATTAAGGCGACGACATTTTTCCCCCAGTTGAAAAAAATTTATTTA
CCTGGTCTTTTATCCCCGGCCGAAAATTTTGCAACAGCCTCAGGATCTAT
AAAGTCCAAAATATCTGAAAAACACATTGGCCAAAGGGAATGTAAAAAGA
AATTCCAAAATACCAAAATTCTAAAAATTTGAAAAAATCCCGAAAATAAA
TTTAAAAGAAATCCCTTTTACCAACCTCGTTCCCTCATGCGTATTATCAG
CTTTTTTATGCTTTACTAACTGATAGCGCCCTTTTACTTTTTTTAAACAG
GCAAAATATAATTTATTCTTTAATATATACTGTAGGATATACTGTTAAAT
TTCACAATGGTTTTGGAAAAATTTTAAAAATATTTGATATTTTATAGCTT
TGTTTTGCAGTGAGGGGTGTTGCAGATTTTTCAGAGATGTATTTGAAAGT
TTCTAGATTGATAATTGAAAATGCAGATGGTGTACAGTATTATTTCGATA
GAGAAGAAACCACCCTTCATCATTGGATTAATCAGATTGAAAGCACTTCG
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CGTATGCGTTGGTTGTAATAATGGTTAAAAAAGACAACATTTTTGAAACA
GTAAAACAATGTGAATAATTTCTTGATTATCGTCAGACGTACCTTTGTCG
CAAACGAGAGACTTGGGAGAGAACTTTTATAAATATCGCTCGTCATATGG
TTTTTAAATACATACAAGACATTACATTCAGTTACATTTCCCTTATTATG
TTATCAGAAATCTCGTATCATATTGGCAAACATTCAAGAATCTCGAATGT
TTTGTATGCAGTGAAGTGATGAAAAACTGTTTGGCATCACACGGACAATA
CAATACCTAAAGCTGGAAATATTTGGATCATGTCAAGTAGTTTTATAAAT
TTCTTAGTTCATCAGATTTGATTTTAGTGTATTTTATGGAAGAACTCCAA
ATTAAAAGTTCAACTGAAAATATTTTTGTTGCGTTTTCCCCCTTTCCCTT
GTCTTTAACAATTCCCTACTCCGAAAGTTATCTTTTCGACTGTTTTTGAT
TTGATTTTTCTCAGATAGGCCTGTCTGTTGTTGTTGAGTACTGTATGAAG
ATTTTAACTTGAATATGAAACTCTTTACCTTGAAATTTTGTCTTCACAAT
TAAACCACAGTAATGTCTATGGTTAAAACCAAGAACCAACAAACAAACTG
TATCTTACTCTTATTAAGTTCTTAGTAGGGGGAGGGCTAATTGTTGGAGG
GGTTGGAAATTTTAATTCTAAAAACCCAAAAATAAGCTAAAATCAGGCTT
TATAGAGCAAAATAAGGAGCCTTCCTTCCCTCTGTCAGCTGAAAATATTT
TTACAAATTAATAAACGATGGGGGGTCCTAATAAGGTCCGGGGGTTGAAA
GATTTTCGTTTTGGAGCAATCTCATTATTTAAAATATAAAGCACTGAGGA
TCCTTCACTTGCGATCGGAGTGATCTGAGGATTTAAAAATTGATACGAAA
ATTGATGTCATGTAGTCATACACGAACCTTGAATTTTGAAAGTGGTTGAG
CGATATATAGGAACTTAGTCGACCGCGCGCACATTATACCAAAGGAGACG
CGCTGCGCGCGTAAAAAGACCTGAATGCACTTTTCATGGTGTCAGCCCCC
CCCCCAGAAATCTGAAGGGCACCTAGGCCAGGTTAGTAGAGGGGGGCTAA
TGCCTTGCAATTCTTTGGGGTTACCTATTCATTAAGGGTACCTAGCTGTC
TTGATGGAGGCTCTGGGGGCTGGTTATATTTTCCAAATCGAATATTTCAA
AATATTTCAAATTATTGAGCACCTAGTTTCCCATCCAATTTTTCTTTCGT
TTCCCATCACACCATCTTTTGCTATATTTTTCTAATGATGTGATTGTTTT
TATTTATAGCCGCCATCTTTATAGCATAAAAACAAAGCTTTTCTCATGCG
AGTGCGCTTCTCGTGCTACCGTGAGATCGGGTAACTTGCATCAGTGGAGG
CTAACGTGCATAGACCTTAAATAAATGACCTGGCTGGTCATTTAAATACA
AAGTTAAATCAAAACAAAAATGGTAGAGTAGAGCTGCGAGCGGAGCTGCG
TAGTTGTATTTTAATGACCAGCCAGGTCATCCAGGGCTATGCATGTTAGC
CTCCACTGATGCAAGTTACCCGATCTCACGGCAGCATAGAGAAGCTAAAA
CCTCAGGATAAGAGTATGCAAACATGGATAGCTAGTTATGTTTTTGGCTC
TGTTTAACCGTTTAACACTCACACTCATAACTGATTAAAATCTTCTGGTA
TACAAAAGAACAAAAAGTGTCAATTCAAAAAAATTTCTTTTGGCTGAATG
GGGGTACCTAACTCAAAGCAATTTCTCAAGGGGACCTAAATTGCTGGGGG
CACCATGCTCAATGGGGGCACCTAAAAAGTGGGCTGAAACCATGCTTTTG
AACCGAGTCCCAAAGTTCGCTTTTTTCATGATTGTATCACTGCCATCAGT
AATATCAAAAAGTCGCGGAAGTGGCTTTAGGTACGAGATAGATACTATTT
AGCTTACTTATTTAGTATTGTCTAAATAATATGAACTTGTCTCATCTACA
GTATGATGCGTATGCCGTATGCGGTTTATAAATAAACCTAAGGTATTCCT
CTTCTAAAGCCTAAGGTTAGTGTTCCAGTCTTTAAAACATCCTTCGGATG
CTCTTATTTTCGTCTTTTTTGAGTATTTTTAACCACTTTCCGAAGAATTA
AAATTAAAATGTTCTTAACTTGTTCTCGATATTTTAGCCATCGAAGCCTT
ATGCTCTTATATAGTTTGTTCTTATAAAAAGACGTGTATTCGCATTTACA
AATAGACGCATGTCTTTGTATACTATTTATATATGTATAGTTTATTTGAT
TAGAGCATTTCAGGTCTCTTGCTGAGGTACTATAGGAGAATAGCGCACCG
CGCTGAATCTAAAAATAGCTTTTATTTTTGACATAATCATTACTCTCGAT
GTGTTTGTACGAGTTCCAATCCCATCAACCTTTGCGTTAATCTCTTTTAC
ACGTTAATTGCATCATTTGACAAAGGACATATAACAACTTGCACGTATCT
TTAATTGAGCCGCATTGAATTGTGGGATTGCAACTCGTACAAATGTCAAA
AAAGTGAAAAGTAATAATTATGACGGGAGTTTCTAAACATCGACCAGCGA
CCACGACCGGAATCAAGTCCTTAGAATACTAAAAAGTGACCTTTGAAGTA
ACCAGTCATTTTCTTGACAAAGTGACACTATTTGATAAAAATATTGACAG
GGTCATTAAGTATGATGTTTGTAAGCTTTGTTACACCAAATATTTTAATT
ATGCTGAATGAGATGCCTTTAGTATGAATAGAAGTCAGTAGGAAAAAGTT
GGAAAGGCCAGTTTATTCTATTGTCTTTATGGTGACAAAATGACTAATTT
CGACAGAAATAACAGTCTGATGAAGAAATGCAAAGCTTCTCGAACCATTT
TCAAAAAATTTTGTGCCATTAATTATTTTGATGCTGATAATACAAAAGGA
TAGAAATTGACACCATAATTGAGCTCCAAGAGCGTCGAAATGGTTGTTGC
CCCGCAGGGGCTTTTGTTGCTTCACGTAGCGGACCTGCTCGCCAGAAAAA
TATTCATATTCATGTTTCGTCCGATTCTGAGTGGGCCGCGCGCGGTTAAA
AAATGTTAGCGCGCGATATCTCTTTTGCTGCTACTTGTATTGATTTCCTT
ATCTGATATTCCGATGGCGGATTGGCGGCCGCCCACGCTAAAGCTCTAAA
GGGAGCGGGCCAATTTCCCATCGGAGAGGAATGATAGTCGGCCTTTGATG
TGCCGCACCCTCAGTCGGGTTCAACAGCCCTTGTGCGTAAACCTATAAAT
ATTTCGGCTGGACCCGCCAATCCCCGAAAACGAGGGCTGGGTTACCAGAC
CTCCCGCTGCAAAATTCTTGACGCGGTCTCGCAAAATTCTGTAATGTAAA
CCTTCAAGATGTTGAAAATTTTCCCGATCTTCAGAGCTTTAGCGTGTCGG
ATGAAAATTTCACCATCTGGGTGCCAGATAATTGATTTCCTAGCTATGCA
CGGACAGAGAAGGTAGCTTCCCGTCTGCACTGCCAGTCCACACAGCTAAA
AGCTTTCACAAACAACAAACAGCGCACAAGATTTTATTTTTGCTTGGTTA
ATATCTTTTTAACGTATTTGCTCAACTTGATTTACTTGAGGGACATTGTT
TGCTACTGAATGAATAACTATCAAACTACTGATATTAGATCAAACCTTAT
ACAATTGTCAGAATGGACGATGGACATCTTCAATGACAGTTTGTTACACA
CACACACAGACAGAGTGTTATACGCTGCTCTAACGAAACCCTGCTGATAT
TATAAAGGCATAGACAAAAGGGAAATTGACCGTTAATTCATATTGTTTAC
CTATATAGTGATTTCATTTTGAAGGAAATTAAATTGAAATTTTTGGTGGA
AAGACAAAACCCAGAGTACCCTATAATTATATGGATATTGCATGCGCCGA
AAGTAATTTTTCAAAGAGTAAGCCTTGCGCCAAAACGTGCCAAAAACTGG
TACCAACATCGAGTTTCTTACAAAAGGTTTAGTGAGTGAGACATGCCAAT
GAAAATATACTATGACTAACATGAACTGATTCATTCTCGTGGACATTTGA
AGCACAGTGTTACAGTAAAAAAAAATGGTTGTGCATGGGAAGCAGCGAGC
AGAAAAATGTAAACAGAAGCGGAAAAAAAGCCGAAAACGATGGATTATGA
AGTATTTGATGCTATTTTGCTCTTTACGCCAATATTGAAGCTTAAAAAGC
AAACTTTGAAAATGCTGTTTATGTCACTGTGTCAGAACGGTACTTCGATA
TGTAATGTACGCCGAAGATTTTCAGCCTCATATTATGAACAGACTCGAAC
ACTCTCTCTACTAATACCACCACGGCACATTGTACCGTATTGATGTTGAA
CGCAGGAGTATACTTTGCTCAAATCAAAACTGAACAAACTTTTTGACTTT
TTAGAACCAGACGTCCAATAAAATACAAACACAATGTTGTACCTACCTGT
GAAGTGAAAAGTTTTTAACCATGTTGACGGTGGTTACAACAGGACACGGT
ATCTGAAAATTCCCCTGGCAATTTTGAGAGCAACTATCAAATTCATATCT
TTAGTAACCATGAAGAAATTTTATTCTAACTGAAAACTTTTTGCAGAAAC
ACGTATAAAGATTGTTAAAGTTTTTCAGATAATTTTCAGTAACCTTTGAT
ACAAAATAAATTATATCTACAGTATGCCACCAGTCCAAAGTTACTTACTT
TTTAAATTTCAAATCAAATGACTGAAATTATATTCAATTTCATTTTCAAA
TTCACCTTTTAATCTGCATTATGTATATTCTTTATGAAAGGGAAGCACTT
TCAGTTTCACAGTACACATTCTTATGTTTGGGTTTTCAAAAGGGATTTTT
ATTAGATTTTTATCTGGTGATTGAAGAAAATCAACTTTGATATCATTCTA
GTTCTTAATATGTTGCGAAACCTGTAATGGTTTTAATTTAAGTCACTTTG
CATCAGAAAGGGTAGATTAAACATGTTTTTTTTGGATTGACACTTTCGTT
ATGTATGGATCTTACTGAGAAAATTTTAACCGCATCGGCTCGTGCTTCTT
AACTTTAAACAGCTCTAGTAAAATTGAGCACTTTTTATGAAGACTCATTT
CACCAATTTATAGTCTGATTATGATTCCCTTGCTCGCTTCATGACTAAGT
TCCTCTGGGCTAATATCTGCTATCGGCGGGGCATTTATAGCGACAGCTAC
TTGCTAGTTTTACGTATTTGGCTCGTGGCTTTAAATATATGAAATAGGGG
TGAGCTTAATCTTCATATGATACATATTCAAATGATTAGGAGAGACACTT
TACGTTGGAGAAAGAGAAAATACTCGATAACCCAAATTTATCTGGTCGAC
GTTTAGAAACTCCCAATTATGACGTATGTGTTGCGGAGCGCTATTCAAAA
AATCACAAAGGTTTTATTCAAACATTTTATTCTTTAAAACTTTTAAAATT
CTTTAGGCAAACCTGCCACGAGTTTTGAATGACAAGGGCTCTTTTTGAAC
CTTGACTAATTGACCGGTCATTTATTTGGCGTGATTAAGAAAATAAGTAG
TTAATCCCGGAAATTTATTCTGAAAAATAAACAGATATAATTTTGTTTGA
GGTCTAAATTGGCTTTAAAGTTTTTGTTTTTAAATAACAGTGATATCATT
TGCTTACTCATCAATTTTAATTCACAAGCTTTTTCACATTGGATTGACAC
GAATGTGGAGCAAGATTGGTCAGGAGGAGGAAAAGAAGAACATTATTTTG
CTTATATCAGCATAATATAACAATAGATAGACACTGTCCTGATATGAAAT
ATGTGTCTGATATGAAACGGGAACACTCAACGGTCAAACTTTTGGCTCAA
TTTTATAAAGGATTTTGGACATGTTTTTTTAGACTACCCGGTATATTAAA
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ATTTTTTATACTGTTCAGTTGTGTACACGGAATATATGCCTCGTTTAGAA
CACGAATTCCTGCTGGAAGACCAAGGGGTTCTAATGTGCAGAGCACGATA
TAACAATTTTCTCAACTTATATTGAGCTAGTGTCTGAGAATGTCTGTCCG
TCGGAATCTTTTCAGGCCTAGGCACGAGTTTCTCAATGAAATTGGAATTT
CAAATCGTCGGTGAAAATACTATAGTTGAGACCAGTGCTGCGCGCACGTT
TGACTATCTCCTATATACATCTTCCTTCCGAATCTCAATTCTTTATGATA
TACCCAACTAAGCAAACTATTTGATCAATCTTAGGTGTGAAGAGAAAAGA
AGGAAATGTCACTCATTACATCCTAACCGACCCAGCTATCCACTCAGTGG
AGGAGACGTTCGGCCTAACCGATTGTGGTGCAACAGGCATGTACAAAGTG
TTGACTGCTCACAGATGCAATGATATTTGCAAACAGTTACAACTAGAAGA
TACATCAGTGTGAGTTTTAGCTATTGACAAACCCAAAGGGCCAGAAGGGG
AAGAAAGGTCCTATTCCGAAGAGTATACAATTTCCCCCAGAAAGCCTCTT
CTACACTTTACAGATCATCTAACTAATGACGCAATGTTTCGAGCTCCAAC
CCTGACCCTAACTGATAAGATCGAAATAATCAAAAATCGAAAATATCGAA
AAGGTCAAAAAGGAAGAATAAAAAAAGTCCGCTAGTGACAACCACTCCTA
CCGATTCATTCCTAATTGTTTATCACGGGAATTAACTACATGTGGTCTAA
AAGAACGACAAATTACGCATGTGTGTTAATGCAGAAGTCTGATTTTTTAA
CTCTTCGGAATGGGACCTTTTTCTGACTGCTAGACTCGAGACTCCTGGAT
GGGAAATGACGCCACTTATTTGCCAACTAGAACGTCCGCGCGTGGTTTTT
GCACAAACGCCGGATTGAAAGTAAAATCTATCGCTAGATTTCAAAAAATA
GAGTCATCAAAAACAAAAGAACCGCTAGATACAATCCGTCGTCATGATTG
CGGCGCGTTCTAGGCGCGTTCTGGATGGGAAGTAAGTGGCTTCACTTTTT
CTTGCCTGGGAAAGGTTAAAGATTCTATTCTAGCCCTTCGGGCTTTAAAT
TCAATGGTTTTAGCCTCTGCTTAAATCTTTGTTTACATTAACTCTTATAA
GCGCTCCCTCAGTTTTAAAGGTCATGTGCAAGTCATTTTACTAATTATTC
ATGTAGTCAATACAGCTTTCATTTGTAATACGGTACGGCACACTTCAGTT
GTTTATGTTTTTCGTAATAAATAATTGCCCAAATGCATATACTTTACGTC
AACTGGACAGAATTTAAAGTTAGGTTGATTTCTAGGTCAAACTTAGGCTG
AAAAGCTCATCGATTTATAAACCCGAAGGGATAGATGTCGTGCTTTGGCT
GAAGTATGTGCAGAGGTTAGGTAGGAAATCCTACACGTGACATTACAATA
GAATTTCAGCGCTTGACCAATAAGAAGCTTTGCGCGGCTTTTTCGAAAAC
AAAAACAGTAATATTTTATATATTTTATATTCACTTTTTTATTCTTGCTT
GGAAGAACTTAAAGCATGACATCTAGCCCTTCGGACTTTACAGAATTCTG
TGGAAAAGCTGAAAACGAAAATTCAAGATTGCAGCTTTTCATTATAAAAT
CTTTTTGAATTTTTCCTGTCATCGAACTGAATCGACCTATGTTAATGTTA
ATATTAATGTATATATTCTTTAAAGTCGAAAAAAGTGTACAAATCTGTAC
TAAATAGAGTTCGACTAATCATGGTAATAATATTAACCTTTAGACCACGA
GGGACGCGTATTTACGTCCAACACAAGCGAAAATACTGAGTCTCAGACTT
AAGGCCATAGCTACTGACCACTTGATTTAAAGGGGCATAAACCGAATGCT
TTATTAAAAATAGCTTTCCAATGGTACCAATTCCATCTTCTAAATCAAAA
ACTACAATTCTTTATGGCACTTTAAAGTTTTGGGGGAAAAGTAGAAAATT
TGAGAAAGTTTTGGAATTTCAGTCCCATTCAGAGTCACTTTTTTCGCAAA
TTTCGAGTCCCACGTAGGGTTCATTTTTCGAACTTCAGCCCCGTCGGTCG
ACAAGGGTAGTACTCCCCCCCCACCCGGGGCAAAGGGTTAATTGATTCCA
TCTTCATCATCTTTTCAGGTTACGTTTAATGTTATTGGTAGAATTGCTGA
AGAACACTGGCACAACTTATAATTTCCAACTCACAGAAAATGAAAAGAAA
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Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| sc0000011_pilon | genome | sc0000011_pilon:1016056..1026732 - |
Properties
| Property Name | Value |
| Aaloc | 811-918:109 |
| Aaloc | 637-807:1992 |
| Aaloc | 1-633:10678 |
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