XLOC_039975 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_039975
Unique NameXLOC_039975
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000011_pilon:1016056..1026732-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_039975 ID=XLOC_039975|Name=XLOC_039975|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=10677bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000011_pilon:1016056..1026732- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCAGAGCGAGCGCCGTTTGACGGAGAGCAGCGGGACGAGAAGGAAGA GAAAGCCAGGCTTGAACAAAATGCTTTACGAACCAATAACCATATTCTAA CTCAAGACTTTTCAGATGAATATGGAAATAAATATTGGGCTAAATTCAAA ACAGAACACTTCGATTCCGGTGTATCCCGGTTTGCGTTTAAGGGGACATT ACGAGGTTCTGGACCTAAAAAAGATCAACAATGTGTTGTTAAAGTGTTTA AAGATGAGTTTGCAAAGGATATTGATTTATGGGTACCAGACCTTTACACC AGCATACGTGCTAAAGAGTTATGCAAAGAATTTAACGATGAACATGTATC GACATTGAGATTAGCCGAAGCTCCAGTCAAGATGGAATTTGTTTTACCAA TGTTAGCCAGAGTTGATGAAACCACTATGAATAACTCTGCTACAGCTCTC AGAAAGAATAAAAAAATAGCTAAACAAGAGTTTGTAGCTATTGAACAATT TATTGAAGGGGAATATGTGAAATTCAATTCAAATGCAGGGTATGAGCAAC AAGAGTTATCAGAGTTGATGCCAGCTTTTACACATTGGACCTGGGAAAGG ACAGCTCGCAAGATGATGGTCTGTGATTTACAAGGTATGCTCATCTTTTT TTTGATATGTTTAAATCCGTAATGTTTTTTTTTATAAGCACAACGCTTTA AGCATACGAAGGCTCAGATTTGCAGAATTCCTACATAAGCATACACGTTT TTTTCAGCCTCAGCATGTTTCTTAGTTCTTAGGTATTCTGAACCTCATGT TTCTTAAAAGTTTGTTTCTTAAAAAAAATGTGTATATGTCCGGCTGGAAT ATTTTTCAAGTTGTCATTTTTTATCTGCTTAAAAAGGTTTGGTGGAGGGC AAGTAAAAAAAGACATTCCACGGCTAGCTACATTTCACTGCTCTCAAAAT 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GTGTTTGTACGAGTTCCAATCCCATCAACCTTTGCGTTAATCTCTTTTAC ACGTTAATTGCATCATTTGACAAAGGACATATAACAACTTGCACGTATCT TTAATTGAGCCGCATTGAATTGTGGGATTGCAACTCGTACAAATGTCAAA AAAGTGAAAAGTAATAATTATGACGGGAGTTTCTAAACATCGACCAGCGA CCACGACCGGAATCAAGTCCTTAGAATACTAAAAAGTGACCTTTGAAGTA ACCAGTCATTTTCTTGACAAAGTGACACTATTTGATAAAAATATTGACAG GGTCATTAAGTATGATGTTTGTAAGCTTTGTTACACCAAATATTTTAATT ATGCTGAATGAGATGCCTTTAGTATGAATAGAAGTCAGTAGGAAAAAGTT GGAAAGGCCAGTTTATTCTATTGTCTTTATGGTGACAAAATGACTAATTT CGACAGAAATAACAGTCTGATGAAGAAATGCAAAGCTTCTCGAACCATTT TCAAAAAATTTTGTGCCATTAATTATTTTGATGCTGATAATACAAAAGGA TAGAAATTGACACCATAATTGAGCTCCAAGAGCGTCGAAATGGTTGTTGC CCCGCAGGGGCTTTTGTTGCTTCACGTAGCGGACCTGCTCGCCAGAAAAA TATTCATATTCATGTTTCGTCCGATTCTGAGTGGGCCGCGCGCGGTTAAA AAATGTTAGCGCGCGATATCTCTTTTGCTGCTACTTGTATTGATTTCCTT ATCTGATATTCCGATGGCGGATTGGCGGCCGCCCACGCTAAAGCTCTAAA GGGAGCGGGCCAATTTCCCATCGGAGAGGAATGATAGTCGGCCTTTGATG TGCCGCACCCTCAGTCGGGTTCAACAGCCCTTGTGCGTAAACCTATAAAT ATTTCGGCTGGACCCGCCAATCCCCGAAAACGAGGGCTGGGTTACCAGAC CTCCCGCTGCAAAATTCTTGACGCGGTCTCGCAAAATTCTGTAATGTAAA CCTTCAAGATGTTGAAAATTTTCCCGATCTTCAGAGCTTTAGCGTGTCGG ATGAAAATTTCACCATCTGGGTGCCAGATAATTGATTTCCTAGCTATGCA CGGACAGAGAAGGTAGCTTCCCGTCTGCACTGCCAGTCCACACAGCTAAA AGCTTTCACAAACAACAAACAGCGCACAAGATTTTATTTTTGCTTGGTTA ATATCTTTTTAACGTATTTGCTCAACTTGATTTACTTGAGGGACATTGTT TGCTACTGAATGAATAACTATCAAACTACTGATATTAGATCAAACCTTAT ACAATTGTCAGAATGGACGATGGACATCTTCAATGACAGTTTGTTACACA CACACACAGACAGAGTGTTATACGCTGCTCTAACGAAACCCTGCTGATAT TATAAAGGCATAGACAAAAGGGAAATTGACCGTTAATTCATATTGTTTAC CTATATAGTGATTTCATTTTGAAGGAAATTAAATTGAAATTTTTGGTGGA AAGACAAAACCCAGAGTACCCTATAATTATATGGATATTGCATGCGCCGA AAGTAATTTTTCAAAGAGTAAGCCTTGCGCCAAAACGTGCCAAAAACTGG TACCAACATCGAGTTTCTTACAAAAGGTTTAGTGAGTGAGACATGCCAAT GAAAATATACTATGACTAACATGAACTGATTCATTCTCGTGGACATTTGA AGCACAGTGTTACAGTAAAAAAAAATGGTTGTGCATGGGAAGCAGCGAGC AGAAAAATGTAAACAGAAGCGGAAAAAAAGCCGAAAACGATGGATTATGA AGTATTTGATGCTATTTTGCTCTTTACGCCAATATTGAAGCTTAAAAAGC AAACTTTGAAAATGCTGTTTATGTCACTGTGTCAGAACGGTACTTCGATA TGTAATGTACGCCGAAGATTTTCAGCCTCATATTATGAACAGACTCGAAC ACTCTCTCTACTAATACCACCACGGCACATTGTACCGTATTGATGTTGAA CGCAGGAGTATACTTTGCTCAAATCAAAACTGAACAAACTTTTTGACTTT TTAGAACCAGACGTCCAATAAAATACAAACACAATGTTGTACCTACCTGT GAAGTGAAAAGTTTTTAACCATGTTGACGGTGGTTACAACAGGACACGGT ATCTGAAAATTCCCCTGGCAATTTTGAGAGCAACTATCAAATTCATATCT TTAGTAACCATGAAGAAATTTTATTCTAACTGAAAACTTTTTGCAGAAAC ACGTATAAAGATTGTTAAAGTTTTTCAGATAATTTTCAGTAACCTTTGAT ACAAAATAAATTATATCTACAGTATGCCACCAGTCCAAAGTTACTTACTT TTTAAATTTCAAATCAAATGACTGAAATTATATTCAATTTCATTTTCAAA TTCACCTTTTAATCTGCATTATGTATATTCTTTATGAAAGGGAAGCACTT TCAGTTTCACAGTACACATTCTTATGTTTGGGTTTTCAAAAGGGATTTTT ATTAGATTTTTATCTGGTGATTGAAGAAAATCAACTTTGATATCATTCTA GTTCTTAATATGTTGCGAAACCTGTAATGGTTTTAATTTAAGTCACTTTG CATCAGAAAGGGTAGATTAAACATGTTTTTTTTGGATTGACACTTTCGTT ATGTATGGATCTTACTGAGAAAATTTTAACCGCATCGGCTCGTGCTTCTT AACTTTAAACAGCTCTAGTAAAATTGAGCACTTTTTATGAAGACTCATTT CACCAATTTATAGTCTGATTATGATTCCCTTGCTCGCTTCATGACTAAGT TCCTCTGGGCTAATATCTGCTATCGGCGGGGCATTTATAGCGACAGCTAC TTGCTAGTTTTACGTATTTGGCTCGTGGCTTTAAATATATGAAATAGGGG TGAGCTTAATCTTCATATGATACATATTCAAATGATTAGGAGAGACACTT TACGTTGGAGAAAGAGAAAATACTCGATAACCCAAATTTATCTGGTCGAC GTTTAGAAACTCCCAATTATGACGTATGTGTTGCGGAGCGCTATTCAAAA AATCACAAAGGTTTTATTCAAACATTTTATTCTTTAAAACTTTTAAAATT CTTTAGGCAAACCTGCCACGAGTTTTGAATGACAAGGGCTCTTTTTGAAC CTTGACTAATTGACCGGTCATTTATTTGGCGTGATTAAGAAAATAAGTAG TTAATCCCGGAAATTTATTCTGAAAAATAAACAGATATAATTTTGTTTGA GGTCTAAATTGGCTTTAAAGTTTTTGTTTTTAAATAACAGTGATATCATT TGCTTACTCATCAATTTTAATTCACAAGCTTTTTCACATTGGATTGACAC GAATGTGGAGCAAGATTGGTCAGGAGGAGGAAAAGAAGAACATTATTTTG CTTATATCAGCATAATATAACAATAGATAGACACTGTCCTGATATGAAAT ATGTGTCTGATATGAAACGGGAACACTCAACGGTCAAACTTTTGGCTCAA TTTTATAAAGGATTTTGGACATGTTTTTTTAGACTACCCGGTATATTAAA CGGGAACACTTATGTAAAAATAAAATCTTTAACCAACATAATGTACAAAC ATTTTTTATACTGTTCAGTTGTGTACACGGAATATATGCCTCGTTTAGAA CACGAATTCCTGCTGGAAGACCAAGGGGTTCTAATGTGCAGAGCACGATA TAACAATTTTCTCAACTTATATTGAGCTAGTGTCTGAGAATGTCTGTCCG TCGGAATCTTTTCAGGCCTAGGCACGAGTTTCTCAATGAAATTGGAATTT CAAATCGTCGGTGAAAATACTATAGTTGAGACCAGTGCTGCGCGCACGTT TGACTATCTCCTATATACATCTTCCTTCCGAATCTCAATTCTTTATGATA TACCCAACTAAGCAAACTATTTGATCAATCTTAGGTGTGAAGAGAAAAGA AGGAAATGTCACTCATTACATCCTAACCGACCCAGCTATCCACTCAGTGG AGGAGACGTTCGGCCTAACCGATTGTGGTGCAACAGGCATGTACAAAGTG TTGACTGCTCACAGATGCAATGATATTTGCAAACAGTTACAACTAGAAGA TACATCAGTGTGAGTTTTAGCTATTGACAAACCCAAAGGGCCAGAAGGGG AAGAAAGGTCCTATTCCGAAGAGTATACAATTTCCCCCAGAAAGCCTCTT CTACACTTTACAGATCATCTAACTAATGACGCAATGTTTCGAGCTCCAAC CCTGACCCTAACTGATAAGATCGAAATAATCAAAAATCGAAAATATCGAA AAGGTCAAAAAGGAAGAATAAAAAAAGTCCGCTAGTGACAACCACTCCTA CCGATTCATTCCTAATTGTTTATCACGGGAATTAACTACATGTGGTCTAA AAGAACGACAAATTACGCATGTGTGTTAATGCAGAAGTCTGATTTTTTAA CTCTTCGGAATGGGACCTTTTTCTGACTGCTAGACTCGAGACTCCTGGAT GGGAAATGACGCCACTTATTTGCCAACTAGAACGTCCGCGCGTGGTTTTT GCACAAACGCCGGATTGAAAGTAAAATCTATCGCTAGATTTCAAAAAATA GAGTCATCAAAAACAAAAGAACCGCTAGATACAATCCGTCGTCATGATTG CGGCGCGTTCTAGGCGCGTTCTGGATGGGAAGTAAGTGGCTTCACTTTTT CTTGCCTGGGAAAGGTTAAAGATTCTATTCTAGCCCTTCGGGCTTTAAAT TCAATGGTTTTAGCCTCTGCTTAAATCTTTGTTTACATTAACTCTTATAA GCGCTCCCTCAGTTTTAAAGGTCATGTGCAAGTCATTTTACTAATTATTC ATGTAGTCAATACAGCTTTCATTTGTAATACGGTACGGCACACTTCAGTT GTTTATGTTTTTCGTAATAAATAATTGCCCAAATGCATATACTTTACGTC AACTGGACAGAATTTAAAGTTAGGTTGATTTCTAGGTCAAACTTAGGCTG AAAAGCTCATCGATTTATAAACCCGAAGGGATAGATGTCGTGCTTTGGCT GAAGTATGTGCAGAGGTTAGGTAGGAAATCCTACACGTGACATTACAATA GAATTTCAGCGCTTGACCAATAAGAAGCTTTGCGCGGCTTTTTCGAAAAC AAAAACAGTAATATTTTATATATTTTATATTCACTTTTTTATTCTTGCTT GGAAGAACTTAAAGCATGACATCTAGCCCTTCGGACTTTACAGAATTCTG TGGAAAAGCTGAAAACGAAAATTCAAGATTGCAGCTTTTCATTATAAAAT CTTTTTGAATTTTTCCTGTCATCGAACTGAATCGACCTATGTTAATGTTA ATATTAATGTATATATTCTTTAAAGTCGAAAAAAGTGTACAAATCTGTAC TAAATAGAGTTCGACTAATCATGGTAATAATATTAACCTTTAGACCACGA GGGACGCGTATTTACGTCCAACACAAGCGAAAATACTGAGTCTCAGACTT AAGGCCATAGCTACTGACCACTTGATTTAAAGGGGCATAAACCGAATGCT TTATTAAAAATAGCTTTCCAATGGTACCAATTCCATCTTCTAAATCAAAA ACTACAATTCTTTATGGCACTTTAAAGTTTTGGGGGAAAAGTAGAAAATT TGAGAAAGTTTTGGAATTTCAGTCCCATTCAGAGTCACTTTTTTCGCAAA TTTCGAGTCCCACGTAGGGTTCATTTTTCGAACTTCAGCCCCGTCGGTCG ACAAGGGTAGTACTCCCCCCCCACCCGGGGCAAAGGGTTAATTGATTCCA TCTTCATCATCTTTTCAGGTTACGTTTAATGTTATTGGTAGAATTGCTGA AGAACACTGGCACAACTTATAATTTCCAACTCACAGAAAATGAAAAGAAA ATGAACGAACTTGAGAAACGAAAGTAA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000011_pilon:1016056..1026732-

>XLOC_039975 ID=XLOC_039975|Name=XLOC_039975|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1836bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000011_pilon:1016056..1026732- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCAGAGCGAGCGCCGTTTGACGGAGAGCAGCGGGACGAGAAGGAAGA
GAAAGCCAGGCTTGAACAAAATGCTTTACGAACCAATAACCATATTCTAA
CTCAAGACTTTTCAGATGAATATGGAAATAAATATTGGGCTAAATTCAAA
ACAGAACACTTCGATTCCGGTGTATCCCGGTTTGCGTTTAAGGGGACATT
ACGAGGTTCTGGACCTAAAAAAGATCAACAATGTGTTGTTAAAGTGTTTA
AAGATGAGTTTGCAAAGGATATTGATTTATGGGTACCAGACCTTTACACC
AGCATACGTGCTAAAGAGTTATGCAAAGAATTTAACGATGAACATGTATC
GACATTGAGATTAGCCGAAGCTCCAGTCAAGATGGAATTTGTTTTACCAA
TGTTAGCCAGAGTTGATGAAACCACTATGAATAACTCTGCTACAGCTCTC
AGAAAGAATAAAAAAATAGCTAAACAAGAGTTTGTAGCTATTGAACAATT
TATTGAAGGGGAATATGTGAAATTCAATTCAAATGCAGGGTATGAGCAAC
AAGAGTTATCAGAGTTGATGCCAGCTTTTACACATTGGACCTGGGAAAGG
ACAGCTCGCAAGATGATGGTCTGTGATTTACAAGATGGCAGAGCGAGCGC
CGTTTGACGGAGAGCAGCGGGACGAGAAGGAAGAGAAAGCCAGGCTTGAA
CAAAATGCTTTACGAACCAATAACCATATTCTAACTCAAGACTTTTCAGA
TGAATATGGAAATAAATATTGGGCTAAATTCAAAACAGAACACTTCGATT
CCGGTGTATCCCGGTTTGCGTTTAAGGGGACATTACGAGGTTCTGGACCT
AAAAAAGATCAACAATGTGTTGTTAAAGTGTTTAAAGATGAGTTTGCAAA
GGATATTGATTTATGGGTACCAGACCTTTACACCAGCATACGTGCTAAAG
AGTTATGCAAAGAATTTAACGATGAACATGTATCGACATTGAGATTAGCC
GAAGCTCCAGTCAAGATGGAATTTGTTTTACCAATGTTAGCCAGAGTTGA
TGAAACCACTATGAATAACTCTGCTACAGCTCTCAGAAAGAATAAAAAAA
TAGCTAAACAAGAGTTTGTAGCTATTGAACAATTTATTGAAGGGGAATAT
GTGAAATTCAATTCAAATGCAGGGTATGAGCAACAAGAGTTATCAGAGTT
GATGCCAGCTTTTACACATTGGACCTGGGAAAGGACAGCTCGCAAGATGA
TGGTCTGTGATTTACAAGGTGTGAAGAGAAAAGAAGGAAATGTCACTCAT
TACATCCTAACCGACCCAGCTATCCACTCAGTGGAGGAGACGTTCGGCCT
AACCGATTGTGGTGCAACAGGCATGTACAAAGTGTTGACTGCTCACAGAT
GCAATGATATTTGCAAACAGTTACAACTAGAAGATACATCAGTGTGTGAA
GAGAAAAGAAGGAAATGTCACTCATTACATCCTAACCGACCCAGCTATCC
ACTCAGTGGAGGAGACGTTCGGCCTAACCGATTGTGGTGCAACAGGCATG
TACAAAGTGTTGACTGCTCACAGATGCAATGATATTTGCAAACAGTTACA
ACTAGAAGATACATCAGTGTTACGTTTAATGTTATTGGTAGAATTGCTGA
AGAACACTGGCACAACTTATAATTTCCAACTCACAGAAAATGAAAAGAAA
ATGAACGAACTTGAGAAACGAAAGTAAGTTACGTTTAATGTTATTGGTAG
AATTGCTGAAGAACACTGGCACAACTTATAATTTCCAACTCACAGAAAAT
GAAAAGAAAATGAACGAACTTGAGAAACGAAAGTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_039975XLOC_039975-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000011_pilongenomesc0000011_pilon:1016056..1026732 -
Properties
Property NameValue
Aaloc811-918:109
Aaloc637-807:1992
Aaloc1-633:10678