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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000011_pilon:1002579..1009185+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_039972 ID=XLOC_039972|Name=XLOC_039972|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=6607bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000011_pilon:1002579..1009185+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGTTTCTCTACGAGTGCTCATCGCGTTCAGCGCTCTGATTGCTTTAGC
ATCTTCTCAAACCTTTGGTGACGGAACCGTTGGTGCAAGTAAGACCATCC
TTTCTAACATtcaaaacgtccatataacgttagacaaacgttgaaacaac
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ttccgttaaaagctatgacgtcatcttgatttacgcatatcaagaatcgg
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AAGATGGTACCAACAATAACCGAACATGGCAAATCTATTTCGAAGGTCAA
CGAGATGATGCCACCTGTACAACATACCATTGGGATACCAGTAAAAACAA
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AACTGCTGAAATCGGACGTGAAGAGTATGACAAATACAATGTCATGTGCT
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CAAACTGGAAATGACGCTAAGAGTAAGTTCAAATTCATTCTTTGTCACGA
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aattttgaaaacgaccgtaagTTCGGCCAAAactcaggtctctaaaatcg
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ACTTCTGGACTCTTTTAATTTGTATAAAAAGTTTAGACAACaattagcct
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GCAAGGTATGGTAGTATcggaaaaaaaatcagaaaacgaaagtactcgat
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CACACTCGCCATGTATAAATATTGTGGTCgtttttaaatcaagtcctcag
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gctttgttacaccgaatattttgattatgctgaatgagatgcctttagta
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taatttcgacagaaataacaatctgatgatgaaatacaaagccTCTCAAA
CCATCTTTAAATTTTGTGCcactaattattttgatgccgatAatacaaaa
ggatagaatttgccaccataatcaagctccaagaacttcgaaatggttgt
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GTTGGAGAAAgggaaaaaactcgataacccagattatttatctggtcgct
ggtcgcggtcgccggtcgtggtcgtcatttctgggcgacgtttagaaact
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attactcttaggtgccaaataaacGccccccccgttattaatttttcgaa
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ACCCCGCTTATGCGAAccccccaaccccccccccccgtttattttggcac
ctaagagtatgagTTTAAAATAAAGTGGATTTGGTTGAGTAGCGTAGTCA
CATGATATGgacaatatacctttcggttaATAGTTCCTACagagtaaaca
aaggatggtaTAAAATGCAGGAACATTTTACTtatcttataagcatctac
ctTATAAGAATCttatcaataactcttgatagacgggatatacctttcgg
taaagagttcttataaaataaagaaggtACGGTGCACagtatgagcatat
ttatctttattatacaaatcaaatcaataactcttgatagacggggATAT
ACTTTtgggtaattagttcttacaaGgtagaCAGGGGAGTGACTACTGGT
TGCAGCATTTTTAATATGGATCAGCTTCGCTTATTCATCATTAACAATGA
CCGCGTCCGAACCATTTCTCATGATTCGaccaaaacctttttttctattt
caccTTGTATTTTTCTTAACAGCTTTTTCAGGGCTGGCATTTTAGCAtac
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TATCATTGTCTCATTTTAGACACTCCAGCCCAAGGATCACAAGAATCAGA
AAACTTTATGAGTGGAACCAAAGGAGTTGTTGTCATCATTCTCTTGGCAA
CTTTGGTGTTTGTTATTGCTGCTGCCATTGTCAAGAAAGTTTTCTTCAGT
GCTCCAGCTGTTGTTGCATCACCAGTTGTTGCCTACAGTAATAAAGCTAT
GGCTTAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000011_pilon:1002579..1009185+ >XLOC_039972 ID=XLOC_039972|Name=XLOC_039972|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2376bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000011_pilon:1002579..1009185+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGTTTCTCTACGAGTGCTCATCGCGTTCAGCGCTCTGATTGCTTTAGC
ATCTTCTCAAACCTTTGGTGACGGAACCGTTGGTGCAAATGGTTTCTCTA
CGAGTGCTCATCGCGTTCAGCGCTCTGATTGCTTTAGCATCTTCTCAAAC
CTTTGGTGACGGAACCGTTGGTGCAAGTTTCGAAGTTAAGTGTGACGACA
CACACTTTGCTGTCTGGTTTAACAAAACCGCTTTGGATGAAAGACAAGAT
GGTACCAACAATAACCGAACATGGCAAATCTATTTCGAAGGTCAACGAGA
TGATGCCACCTGTACAACATACCATTGGGATACCAGTAAAAACAATGTCA
GCTATAATAGCCTTTCAAACCCTACAGGGCTTCCATTTAATGTCCAAATC
GGTGCACCAGTCAAAAACTGTGGAATCAACGTTTTTGCTGATGCAACACA
CATTATCTACAACACAACACTTATTGTTACATACGGTCAAAATCCAACTG
CTGAAATCGGACGTGAAGAGTATGACAAATACAATGTCATGTGCTTGAGA
AATCGAACGGTTAACGAAATGGTCGATTTTGATGTTGAATTTCGTCAAAC
TGGAAATGACGCTAAGAGTTTCGAAGTTAAGTGTGACGACACACACTTTG
CTGTCTGGTTTAACAAAACCGCTTTGGATGAAAGACAAGATGGTACCAAC
AATAACCGAACATGGCAAATCTATTTCGAAGGTCAACGAGATGATGCCAC
CTGTACAACATACCATTGGGATACCAGTAAAAACAATGTCAGCTATAATA
GCCTTTCAAACCCTACAGGGCTTCCATTTAATGTCCAAATCGGTGCACCA
GTCAAAAACTGTGGAATCAACGTTTTTGCTGATGCAACACACATTATCTA
CAACACAACACTTATTGTTACATACGGTCAAAATCCAACTGCTGAAATCG
GACGTGAAGAGTATGACAAATACAATGTCATGTGCTTGAGAAATCGAACG
GTTAACGAAATGGTCGATTTTGATGTTGAATTTCGTCAAACTGGAAATGA
CGCTAAGAATACTACCGAGGATTACAGTTTCACTTTCACCCACACTGATA
TGGCTGATGCAACTACATTAGTCTACAATCTTGGAGACTacatcaaattc
aaaatggtcTCAAACACAGCGCAAACTGAAGTAAAAGCTGTGATCCAAAG
ATGTTGGACTACCACTGACGGATCAGCCAACTCGTACACTTTGATCAGCG
ACAGATACTACCGAGGATTACAGTTTCACTTTCACCCACACTGATATGGC
TGATGCAACTACATTAGTCTACAATCTTGGAGACTacatcaaattcaaaa
tggtcTCAAACACAGCGCAAACTGAAGTAAAAGCTGTGATCCAAAGATGT
TGGACTACCACTGACGGATCAGCCAACTCGTACACTTTGATCAGCGACAG
atGTACCATGGAAACTGGAACTAGCTGGGTTAGTAATCCAAGTGACGCTG
AGTCTGTCTTCAAAACCGAAGCTTTCAGATACTTGGCTGCCTCTGAAAAC
AAAATCTATGCTCAATGCCTTGTCCGTGTTTGTCTGGATACTCAAACTAG
CGCTGAATGTACACTTTGCTCTCCTGGTCTCAAACGTAAGAGACGTAGTA
CCGAAGAAGAAGAAGAACCCAGTGTTGGACAAATGGCTTTAATAAAATCA
CCAGTCTTCTACATCattgaaaaagatGTACCATGGAAACTGGAACTAGC
TGGGTTAGTAATCCAAGTGACGCTGAGTCTGTCTTCAAAACCGAAGCTTT
CAGATACTTGGCTGCCTCTGAAAACAAAATCTATGCTCAATGCCTTGTCC
GTGTTTGTCTGGATACTCAAACTAGCGCTGAATGTACACTTTGCTCTCCT
GGTCTCAAACGTAAGAGACGTAGTACCGAAGAAGAAGAAGAACCCAGTGT
TGGACAAATGGCTTTAATAAAATCACCAGTCTTCTACATCattgaaaaag
ACACTCCAGCCCAAGGATCACAAGAATCAGAAAACTTTATGAGTGGAACC
AAAGGAGTTGTTGTCATCATTCTCTTGGCAACTTTGGTGTTTGTTATTGC
TGCTGCCATTGTCAAGAAAGTTTTCTTCAGTGCTCCAGCTGTTGTTGCAT
CACCAGTTGTTGCCTACAGTAATAAAGCTATGGCTTAAACACTCCAGCCC
AAGGATCACAAGAATCAGAAAACTTTATGAGTGGAACCAAAGGAGTTGTT
GTCATCATTCTCTTGGCAACTTTGGTGTTTGTTATTGCTGCTGCCATTGT
CAAGAAAGTTTTCTTCAGTGCTCCAGCTGTTGTTGCATCACCAGTTGTTG
CCTACAGTAATAAAGCTATGGCTTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000011_pilon | genome | sc0000011_pilon:1002579..1009185 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 1003-1188:6422 |
| Aaloc | 727-999:3506 |
| Aaloc | 532-723:2308 |
| Aaloc | 91-528:1434 |
| Aaloc | 1-87:1 |
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