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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000191_pilon:70019..71758- Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_039886 ID=XLOC_039886|Name=XLOC_039886|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=1740bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000191_pilon:70019..71758- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAATACAAATTCAGTATCACAAGTGACTATTTTACTTTTGCTTTGTTG
TGGAACATTGGTAGATTCGCTTGGTCGTGGACGAACGCGTCCAAAAGCTA
AGAAATGTGAGAAAATTACAATACCCTTGTGCAAAGACGTTGGATATAAC
GAAACATACATGCCCAATAATTTCGGACAGAGTTCTCAATTCGAGGCTGG
GCTAATCATTCATCAGTTTTGGCCGTTGGTTTTAATCAACTGTTCACCGT
TACTGAAACATTTCGTGTGCTCGTTATATGCACCTATGTGTGATCCAATA
TACTTCAAAGAGATTGTACCGTGTCGTTCATTTTGTGAAGACGTTCGCGA
TTCGTGTACGGCCATTATGAAAAACAACGGTTTTGATTGGCCTTCTCATC
TAAAATGCGAACAATTTCCAACACGTAAAGAGAACAGTATTTGCATGAAG
CCTAGTAATGCACACGTCAGCAAAAATAATAAAACGACCAACAAACCAAC
CAGCTCACCAAACTCAAAAACAGTTAAACCTAATACTAATAATCATGGAA
CGAGTGGTGGCGGAACGAAACAATCGGGCGGACCATACCGCCCACCCACC
CATATTAATACGAACGGAGGTGCTAGAGGATGTGGGTGCATGTGTAAAGC
ACCCTTTGTTTACCCGAACGCCTCAAGCAGAGGAGAACTTCCACCATGCG
TGTTACCATGTAAGCAATTCTACTTCAAAGAAGACGAGGCGAATTTCGTT
ACATTTTGGTTAGGCTTATGGTCTATCATCGCCTTTATTGGAACTCTCAT
AACAATCGCAACCTTCTTCATCGATCGCTCTCGATTCACACAAGCGGAAC
GACCCATTGTTTTCATGTCATTCTGTTACTTTCTAGTCGCTTTCGGCTAC
ATTGTACGGTTAATATACGGACATGACGCCATCGCTTGTGACAGTAAAAC
CGGACTGGCTCGATACGCAGCCACAGGTCCGGCACATTGCACAACTGTAT
TTTTCATGACTTACTTTTTCGCTAATGTAGCGTGGATCTGGTGGGTTGTA
CTATCTATGAATTGGTTTTTATCGAGTGGACTCAGATGGCCTAGTAAAGC
TATATCGAGTTATTCCCAGTATTTCCATTTTATCGCATGGATTGTACCAA
CTGTCCAGACAATGGCTATTTTGGCCATGTCCGCAATCGATGGTGACCCG
GTCAGTGGTTTATGTTCAGTTGGTAACCATAACAACAATAACTTAACAAT
TTTTATGATTGCACCACTATTGATCTACACTATGTTGTCGCTTTCGTTTT
TCGTAGCAGGAGTGATAGCAATTGTTCAACGTAAGAGACATAATAAGTCC
AATAACGGTCAAATAACACCTGAATATTTCGACGAAGAAAGACAAGCATG
TAGTTATGTCTCAAAAATTGGGGTATACACTTTTATGGTATTCTTCCCTG
CGTTCACACTTATTGGATGTTATTTTTATGAACACAACAATAAGGAAATA
TGGGAAAAATCAACGAACTGCCCGTGTGTCCGGGATAAAGTAAGCCCGAA
CTATTATGTGTATTTGTTGAAATATTTCATGTCTCTTGTTATTGGATTGA
TTTCTGGTTTTTGGGTTTTGGACTCAAGGACAGTCGATTCATGGAAAAGA
TTTCTGTTGAAATTTGTTAAAGACGATTGTAATGAGAATAATAATTTACT
GGCAGCTCAGAAATATAACGGAGCTCCAGTACAGTTATAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000191_pilon:70019..71758- >XLOC_039886 ID=XLOC_039886|Name=XLOC_039886|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3480bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000191_pilon:70019..71758- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAATACAAATTCAGTATCACAAGTGACTATTTTACTTTTGCTTTGTTG
TGGAACATTGGTAGATTCGCTTGGTCGTGGACGAACGCGTCCAAAAGCTA
AGAAATGTGAGAAAATTACAATACCCTTGTGCAAAGACGTTGGATATAAC
GAAACATACATGCCCAATAATTTCGGACAGAGTTCTCAATTCGAGGCTGG
GCTAATCATTCATCAGTTTTGGCCGTTGGTTTTAATCAACTGTTCACCGT
TACTGAAACATTTCGTGTGCTCGTTATATGCACCTATGTGTGATCCAATA
TACTTCAAAGAGATTGTACCGTGTCGTTCATTTTGTGAAGACGTTCGCGA
TTCGTGTACGGCCATTATGAAAAACAACGGTTTTGATTGGCCTTCTCATC
TAAAATGCGAACAATTTCCAACACGTAAAGAGAACAGTATTTGCATGAAG
CCTAGTAATGCACACGTCAGCAAAAATAATAAAACGACCAACAAACCAAC
CAGCTCACCAAACTCAAAAACAGTTAAACCTAATACTAATAATCATGGAA
CGAGTGGTGGCGGAACGAAACAATCGGGCGGACCATACCGCCCACCCACC
CATATTAATACGAACGGAGGTGCTAGAGGATGTGGGTGCATGTGTAAAGC
ACCCTTTGTTTACCCGAACGCCTCAAGCAGAGGAGAACTTCCACCATGCG
TGTTACCATGTAAGCAATTCTACTTCAAAGAAGACGAGGCGAATTTCGTT
ACATTTTGGTTAGGCTTATGGTCTATCATCGCCTTTATTGGAACTCTCAT
AACAATCGCAACCTTCTTCATCGATCGCTCTCGATTCACACAAGCGGAAC
GACCCATTGTTTTCATGTCATTCTGTTACTTTCTAGTCGCTTTCGGCTAC
ATTGTACGGTTAATATACGGACATGACGCCATCGCTTGTGACAGTAAAAC
CGGACTGGCTCGATACGCAGCCACAGGTCCGGCACATTGCACAACTGTAT
TTTTCATGACTTACTTTTTCGCTAATGTAGCGTGGATCTGGTGGGTTGTA
CTATCTATGAATTGGTTTTTATCGAGTGGACTCAGATGGCCTAGTAAAGC
TATATCGAGTTATTCCCAGTATTTCCATTTTATCGCATGGATTGTACCAA
CTGTCCAGACAATGGCTATTTTGGCCATGTCCGCAATCGATGGTGACCCG
GTCAGTGGTTTATGTTCAGTTGGTAACCATAACAACAATAACTTAACAAT
TTTTATGATTGCACCACTATTGATCTACACTATGTTGTCGCTTTCGTTTT
TCGTAGCAGGAGTGATAGCAATTGTTCAACGTAAGAGACATAATAAGTCC
AATAACGGTCAAATAACACCTGAATATTTCGACGAAGAAAGACAAGCATG
TAGTTATGTCTCAAAAATTGGGGTATACACTTTTATGGTATTCTTCCCTG
CGTTCACACTTATTGGATGTTATTTTTATGAACACAACAATAAGGAAATA
TGGGAAAAATCAACGAACTGCCCGTGTGTCCGGGATAAAGTAAGCCCGAA
CTATTATGTGTATTTGTTGAAATATTTCATGTCTCTTGTTATTGGATTGA
TTTCTGGTTTTTGGGTTTTGGACTCAAGGACAGTCGATTCATGGAAAAGA
TTTCTGTTGAAATTTGTTAAAGACGATTGTAATGAGAATAATAATTTACT
GGCAGCTCAGAAATATAACGGAGCTCCAGTACAGTTATAAATGAATACAA
ATTCAGTATCACAAGTGACTATTTTACTTTTGCTTTGTTGTGGAACATTG
GTAGATTCGCTTGGTCGTGGACGAACGCGTCCAAAAGCTAAGAAATGTGA
GAAAATTACAATACCCTTGTGCAAAGACGTTGGATATAACGAAACATACA
TGCCCAATAATTTCGGACAGAGTTCTCAATTCGAGGCTGGGCTAATCATT
CATCAGTTTTGGCCGTTGGTTTTAATCAACTGTTCACCGTTACTGAAACA
TTTCGTGTGCTCGTTATATGCACCTATGTGTGATCCAATATACTTCAAAG
AGATTGTACCGTGTCGTTCATTTTGTGAAGACGTTCGCGATTCGTGTACG
GCCATTATGAAAAACAACGGTTTTGATTGGCCTTCTCATCTAAAATGCGA
ACAATTTCCAACACGTAAAGAGAACAGTATTTGCATGAAGCCTAGTAATG
CACACGTCAGCAAAAATAATAAAACGACCAACAAACCAACCAGCTCACCA
AACTCAAAAACAGTTAAACCTAATACTAATAATCATGGAACGAGTGGTGG
CGGAACGAAACAATCGGGCGGACCATACCGCCCACCCACCCATATTAATA
CGAACGGAGGTGCTAGAGGATGTGGGTGCATGTGTAAAGCACCCTTTGTT
TACCCGAACGCCTCAAGCAGAGGAGAACTTCCACCATGCGTGTTACCATG
TAAGCAATTCTACTTCAAAGAAGACGAGGCGAATTTCGTTACATTTTGGT
TAGGCTTATGGTCTATCATCGCCTTTATTGGAACTCTCATAACAATCGCA
ACCTTCTTCATCGATCGCTCTCGATTCACACAAGCGGAACGACCCATTGT
TTTCATGTCATTCTGTTACTTTCTAGTCGCTTTCGGCTACATTGTACGGT
TAATATACGGACATGACGCCATCGCTTGTGACAGTAAAACCGGACTGGCT
CGATACGCAGCCACAGGTCCGGCACATTGCACAACTGTATTTTTCATGAC
TTACTTTTTCGCTAATGTAGCGTGGATCTGGTGGGTTGTACTATCTATGA
ATTGGTTTTTATCGAGTGGACTCAGATGGCCTAGTAAAGCTATATCGAGT
TATTCCCAGTATTTCCATTTTATCGCATGGATTGTACCAACTGTCCAGAC
AATGGCTATTTTGGCCATGTCCGCAATCGATGGTGACCCGGTCAGTGGTT
TATGTTCAGTTGGTAACCATAACAACAATAACTTAACAATTTTTATGATT
GCACCACTATTGATCTACACTATGTTGTCGCTTTCGTTTTTCGTAGCAGG
AGTGATAGCAATTGTTCAACGTAAGAGACATAATAAGTCCAATAACGGTC
AAATAACACCTGAATATTTCGACGAAGAAAGACAAGCATGTAGTTATGTC
TCAAAAATTGGGGTATACACTTTTATGGTATTCTTCCCTGCGTTCACACT
TATTGGATGTTATTTTTATGAACACAACAATAAGGAAATATGGGAAAAAT
CAACGAACTGCCCGTGTGTCCGGGATAAAGTAAGCCCGAACTATTATGTG
TATTTGTTGAAATATTTCATGTCTCTTGTTATTGGATTGATTTCTGGTTT
TTGGGTTTTGGACTCAAGGACAGTCGATTCATGGAAAAGATTTCTGTTGA
AATTTGTTAAAGACGATTGTAATGAGAATAATAATTTACTGGCAGCTCAG
AAATATAACGGAGCTCCAGTACAGTTATAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000191_pilon | genome | sc0000191_pilon:70019..71758 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 1-1740:1741 |
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