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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000130_pilon:201038..204944+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_039828 ID=XLOC_039828|Name=XLOC_039828|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=3907bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000130_pilon:201038..204944+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
atgGATAGTTTTGTGGACCATATTAAGCACagttttcttcaaaatgtaag
tatttttctcatcattgtcttttttttatttgttttataataaaaagcga
aagtattttttaaacattttctatatgtttttctttaaGTATACTGTTAT
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ATTGGACCATGAGAATTTTTCTGGacaaaaaacgggttttttggaccttT
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AAAACCATCAGCATTATTCGTGAATGATTCAATCATTTATTCTGATTTGG
AATTTAATGTTTTTGTTGGTTAACCATGGTAAGGTCCATAAAGGatcatt
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TTTGTGTTGCTCCTCAGAACTATGTGGTTGCTGGTTTGTCAAGCTTGGTT
CTCCTTGTCATTACATTGCTGGTTTTTTGTCGTAAAAAGAATGACTCAGG
TACGCTTATTACTTTCATGCATTTTAGCCCCTTAGCTCGTTTTATATTCA
TGCCTTTCTCTCTTTCGTTTTATACCTTATTGAGTTATTTTTGGAGAATT
TGACCTTTGGATTTTTGGCCAGTTCTATACTCCCTTTGATTTTCAGTTAC
ATTTGATTTGAAAGACCTCCCACAAtttttttCCCAAGAAATTTTACTGT
CCCGACCCCCGGATTTCAAGGTTTTTCGAGGGAATCATCATGGACAAAGA
ATATATGACCTCTTTGGTATTCGGGGATATACTTTTGGAATATCCCATAA
AAATACCTCAACAGTAACTTGAAGTGTGTAATAATTTAAATTATAATgca
taacaataaaaaaaattactttctaattttataatttgaagacaTGGTTA
CGTAcaagacacaaatttcattgtttcagtcataaaaacaataactaAGC
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TTCTTACAGGTTCTTAAACCAACATTTCAAGAGGAAACTTCAGATTTTAT
GGCATAGAAGGTGAATTAATGAAATGATTAAAATTAAAGCTGTGAAAagt
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atACTCATTATTACAGTGGGACCACTGGGGGAGACAATAGCTGAGCTGCC
TAAAAGCTCATTCGGTATTCCATGGCAAACCACTTAAAATACTAgctatt
attattagtattgttATTATATACGCGAATATAACAGAAATCTGATAATT
CGAGAATGATGCGTTTGTGACGACAGTGAAAAAGGTACGATTCTCTCAAA
ATTCAAAGAAGAAGTTGAGAAAGTTATTTCtggcaaatttcaaaatatga
agatgaaaaataaagaagaagtcattgattttaaaaaattcactaATTTT
CAGCATTGATTTTAGCAGTGGATCTTCATGGAAAAAACGGACCCagcaat
tttgttttttgttccTACAAGTGGAAATTTTATGTTAACGTcataaaatg
ttattttcttccTGGAATTTAGTCTTTTGATGAAGAACATTTTCTACCAA
TTTTCATGGCCACAGCTCtcctagatcaaaaataatcgtGGGTGGTATGC
TAATAAAATACTTCCTGGAGCTATAAAAATCATTTGGAGTTAAAAAAGGT
TGAATATGTTAGCCTTAAAACGCTAGCCGTTCAAAAGTGATCATTGGCCA
AAGTTTGCTAACTGTTGCCCTCCATACTCGTAAACTGTAAGATTTGATTT
GGTTTAATCTCTTTTAAGGTTTACGACTGATCGTaaaaaaaGCGTATtta
aaatttgggtattttgcATATCACAAATATTTTAAAGCCTCCTGATTTTA
tctaaatatgattatttcccTGAAAATATATATTGCATCCGAAGTTATAG
CCTCTAAAAGCTAGCACTTGGAGTTGAAAAAACTCTGTTTTGGTGTTTAT
CCACCTAAATGGGCCATTTTCTGGCACGTTTTTATTTCGATACAATAGTT
CTGTGTGAAAAGTAATTATATAAATAACTAAAATCCTTGTGTGAAAACGG
CTACagttcatcttcatttttcgaaaaaaatctgaactgtataatatatt
atttcagaattgaaacttttgttgaaaaatagcAATCAAATCATAAATTA
GTgaacacttaaagcgaatggacttgATTTAATATTAAGGTATATTTCGA
TTTTCGAATGACTTTCTAGCATCGAGTGGAAAATCCAATCCTGGCATGGT
GTTTCCGCCTACAgagtttttcagacaaaaacCAAGGTTTCGGAGAAGAG
ACAAAGTCAGATTTTACACTACCAAAATGCTTAGGAAGGTATGTTTCAAC
TTGTCTTTCTTGCTCAAATCAGAAGAAAGGAACAGAAAAAGATCGGGTTT
TTCTTGA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000130_pilon:201038..204944+ >XLOC_039828 ID=XLOC_039828|Name=XLOC_039828|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=630bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000130_pilon:201038..204944+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
atgGATAGTTTTGTGGACCATATTAAGCACagttttcttcaaaatatgGA
TAGTTTTGTGGACCATATTAAGCACagttttcttcaaaatAACTATGTGG
TTGCTGGTTTGTCAAGCTTGGTTCTCCTTGTCATTACATTGCTGGTTTTT
TGTCGTAAAAAGAATGACTCAGAACTATGTGGTTGCTGGTTTGTCAAGCT
TGGTTCTCCTTGTCATTACATTGCTGGTTTTTTGTCGTAAAAAGAATGAC
TCAGCATCGAGTGGAAAATCCAATCCTGGCATGGTGTTTCCGCCTACAga
gtttttcagacaaaaacCAAGGTTTCGGAGAAGAGACAAAGTCAGATTTT
ACACTACCAAAATGCTTAGGAAGGTATGTTTCAACTTGTCTTTCTTGCTC
AAATCAGAAGAAAGGAACAGAAAAAGATCGGGTTTTTCTTGACATCGAGT
GGAAAATCCAATCCTGGCATGGTGTTTCCGCCTACAgagtttttcagaca
aaaacCAAGGTTTCGGAGAAGAGACAAAGTCAGATTTTACACTACCAAAA
TGCTTAGGAAGGTATGTTTCAACTTGTCTTTCTTGCTCAAATCAGAAGAA
AGGAACAGAAAAAGATCGGGTTTTTCTTGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000130_pilon | genome | sc0000130_pilon:201038..204944 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 130-315:3722 |
| Aaloc | 46-126:1768 |
| Aaloc | 1-45:1 |
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