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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000130_pilon:228799..235196+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_039826 ID=XLOC_039826|Name=XLOC_039826|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=6398bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000130_pilon:228799..235196+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGACGACCATCCGTGCGCAGAAAGATCTTATTCTTTTGTACAACGACGA
AACATTCAAACAACCTACCGAAACAATCGATTGGTTAAATGCCAGACGTT
GGATTTCTGCGCATCATCACGTATTTGTTCTTCTCTCTTTTTACCCTCCA
TATAATTGAATGATAAGTCGCATTAACATCCTTTATTCGGGTAATGTCGT
ATTTgctacaatccgtgccataatatatttgcacttttggctaatctacc
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cttgatttcatcgattatttcgatctgggagggatttattggtttctagg
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cctaaggtcctaagtcttaagtctagcgttaaaactcagagttaaaagtc
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CGACCCAAACTATGAGGGACCAGATAGGTATAATTTTTATCGCACTTAGA
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GTCTTGGGTGGCGGAGGTGCCAGGTAGAGTTGAACCTTGTAATCAactga
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TCATGGTGTCGGCTTTTGAAactaaataaaccagctgcgctggaaggtcg
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GCATTAATGTCAAAATGACTGAAGTTGATTTTAAGTTAATGttagaaaag
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TttaacaaaagtaaaaaatttggagGGGATTTAATATGGCTGCgagcttg
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aattttcaagttaACCACCAAATTAAAAGGACCCTCCAGGCACACTGGAA
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TTTGCTCCGGACGTTTCTGGAGCGTCGGGAGGGtcctaaattaaattccc
tttgaaaaaactttttcggccatccgccaaattaaattcccaccaaaatt
tctccTTTTAATGTAGGTGCAATGTCACATTGTGTAATTAAAACTCCAGC
AAATATCTTGATAACTCCATGTTTCAATGGATGCAAGGAGAACAACAATA
ATAATCAAAAGGGCCATTCCAGAGAAAGGATACGTAACGTCACTCTCATT
TTTACTAGATGCCAGTGGGGAGACAGTTGTTCAGCCGGGCATAAACTCCA
ATAATTGCAGTTGACAACTGGACAATATCTTGAAATGGCCCAAAAAGGAg
cctgaaataaaagaaataaactgGCTGCCAAACAGCCGACAGTTGTATGT
ttgttcaagaaattttaagtCAATACTTGCAATGGTTACACAAAATTACT
CGTCTTGGAACGGTGAATCATCAATCAAATCTTGCTTAAGCGTTTAGGTG
ATATATAAATGTTCTTTTGCTTCACTTCAAATCTGCTAATTGTAGCTAAG
AAATTCATGGTATGCAATTGATACATTGGTTAGGTTGCCATATGCAGTGA
GTGATCTTGGTTGGGACATGCTATCAACTGTTATCATAGATTTCGAgtaa
ttgaaacaataataaACTTATTCTTATCTAATCTATCTTATTTTTCTTGT
CAACACAAACACATCCATCTTCCAAAACCAAATGTTTAAACCTCAAAAGT
GATTCTAGTGAAAGGAGGTTTGTTTTCAACAACATCACGAGTGTGGTAGT
TTGAATGGAATAATATCAATGAAGAActataaatttcaatttcaattttg
aagaatCATTATTGTAGTTGTAGATTTAAAATCTACATCAAGAATTATCT
GCTGCTTGCACTTGTAGTAGAAACTTTCGACAACTTTCACGAGGCTTtta
attatctccgttattTAGATTTCATAAAACAAGTGTGCTAACTACTACGG
AGCTAATTAGAATCTACACACTGCAAATACTGTCTGATAAGTTTGCGTGG
CGCAATATAACAGAGATAAAACGGCTTATGCAAGAATTTACGCGGGaaat
aatttcccgatttaccgAACATTTACCGAATCGGGCGAccaaactttcac
aaaagagtCGTATGGAGAAAACACCGAATTTAAAGGTCTCCTTCACTTGC
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CAAAGGTAACGAATTGCTCAATCGATTAATAATCaattttatcggcgatc
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TGCAGCAAAGGAAGGAATGAGCAAATGAAAGTGGATGCTTAAAGGGCATC
ATCTCCTAACATTGCTTACACAGCAacttttgttctcttttttccGCGCC
CATGcgagtgcaaaaaaaaattagaaattctaCTGTTAATTCCGCCGTGT
CACCATTAAGGCACGTTCTTTCTATATCACCAAAAGAAATATCTATTAAA
GGTCCTCTTTTACTCtaaaagctttaaatgtttttgTGGATGAGTACTTA
ATGTATTAATTAATCCCATCTCTGAATCCCAGTCAAGAAACTTTAAAGGT
TTCATTATTTGATTAAGTGGCCAGGGGATAGCTTAAGATATGAAAtgcat
ttaaaagttttttcagttACTTGATTTTGATTTAGCCCGCCCTTTTTGGC
TAGCTTCTCTGTTATGGGCTATTGtacaatttttggacctacctaaggta
gtcctttaaattaacccttgtccgttcgttcgttcgttcgttcgttcgtt
cgttcgttcgtctgttaccagcttttctcgggatcagctcattagttttt
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gcaaccacaACTTCCTATTTATcatttccctacaacccttccctctcccc
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ctatattttctgactgatttttttcatttttcttttcgcattgctttcta
actttcatcatcaggtaggtccattcagcgtGTTGCTTGTTAATCCTTCA
ATTGAAAATCCTTCAACTATTAAACCCTTTCAACATCGTAACTGACTTCC
CATTCTCGGTTAGGTTTACTTTTATTTCGATTGCGCTTAAAAATCTCAac
tgaattttttaatgataattggTCTTTCTACTTTGTGTTTAAGGTCCCAC
TATGATTGGCAGTAGAACGACAACAAgttgttattttttaataaagttTG
AATTAGAATCCGATTTTTTGAGTAGAGTcacaatcaaaaagaaaaattga
aaaaaatgggaAGATCAATTACTTTCAAGATTGTGCTATAATTTCCTTTT
TCTCTGTTCACGTTCAGGAATACCGATTGACCGTGTGGGAGGTACGAGCA
TGGGTGCCTTTATTGGTGCTATTTATGCAGAGCATGGATCTATTGTGAGG
ACTACTCAACGTGCCAGAGAGGGCTGTTTGGTAAGCtttttttATACCGT
TACTTTTAACCACCTGGGAAGCTAGCTTTCTCTTTCTTCTGATGTCACCT
TTTATCATTTTGcattttgttttcagaaaatggCATCAATGTGGAGGAAA
CTGCTCGATATGACTTACCCTTACACCTCGCTTTTTACCGgtaagtaa Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000130_pilon:228799..235196+ >XLOC_039826 ID=XLOC_039826|Name=XLOC_039826|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1020bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000130_pilon:228799..235196+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGACGACCATCCGTGCGCAGAAAGATCTTATTCTTTTGTACAACGACGA
AACATTCAAACAACCTACCGAAACAATCGATTGGTTAAATGCCAGACGTT
GGATTTCTGCGCATCATCACATGACGACCATCCGTGCGCAGAAAGATCTT
ATTCTTTTGTACAACGACGAAACATTCAAACAACCTACCGAAACAATCGA
TTGGTTAAATGCCAGACGTTGGATTTCTGCGCATCATCACGTTCGATGCC
CAAGAAGAGTCTTCAAAAGAAAACTATTGTCAGCCCGTGTTCGATGCCCA
AGAAGAGTCTTCAAAAGAAAACTATTGTCAGCCCGTTACCATGACGACCC
AAACTATGAGGGACCAGATAGTACCATGACGACCCAAACTATGAGGGACC
AGATAGGATGTCAGATTTTGCTCGATTGGCTCGTGTGTTGACTGGAACGG
CAGTTGGCCTTGTCTTGGGTGGCGGAGGTGCCAGGATGTCAGATTTTGCT
CGATTGGCTCGTGTGTTGACTGGAACGGCAGTTGGCCTTGTCTTGGGTGG
CGGAGGTGCCAGaGGTATTTCACATGTTGGTATCATCAAAAGAATGTTAG
AAGCAGaGGTATTTCACATGTTGGTATCATCAAAAGAATGTTAGAAGCAG
GAATACCGATTGACCGTGTGGGAGGTACGAGCATGGGTGCCTTTATTGGT
GCTATTTATGCAGAGCATGGATCTATTGTGAGGACTACTCAACGTGCCAG
AGAGGGCTGTTTGGAATACCGATTGACCGTGTGGGAGGTACGAGCATGGG
TGCCTTTATTGGTGCTATTTATGCAGAGCATGGATCTATTGTGAGGACTA
CTCAACGTGCCAGAGAGGGCTGTTTGaaaatggCATCAATGTGGAGGAAA
CTGCTCGATATGACTTACCCTTACACCTCGCTTTTTACCGgtaagtaaaa
aatggCATCAATGTGGAGGAAACTGCTCGATATGACTTACCCTTACACCT
CGCTTTTTACCGgtaagtaa
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000130_pilon | genome | sc0000130_pilon:228799..235196 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 439-510:6327 |
| Aaloc | 328-438:6120 |
| Aaloc | 283-324:1563 |
| Aaloc | 205-279:997 |
| Aaloc | 169-201:743 |
| Aaloc | 121-168:593 |
| Aaloc | 1-120:1 |
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