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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000130_pilon:246870..255271+ Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_039825 ID=XLOC_039825|Name=XLOC_039825|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=8402bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000130_pilon:246870..255271+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ACAGGATGTCTTTGGAGATATGTCCGGGCAAGCATGTCATTATCAGGTTA
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GATATGTCAACAATTTACCAGGTCATTATTTTAACTTTAAGTGACACCAT
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aacaacattttataACAGTTTTGATCCCAGAATGACTGAATCTTAAGCCA
AATTGAGGTTTAGTAGTAAAAGCAGGGGGTATAAACCTGAAATGCCTCAA
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AATAGTGTACCCCGGTGAAAATTTTCCTCCAGGTAAAATATTTTCTCGgg
gtaaaatattttcactttttattttgcCATGTTTTCCAAAGTTTAATTAT
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TAGCGTACGTTTCATGTGTACGTCAACTGGAAGAAGTCAAACATGCCGAT
TATGTCACCTACATTCGACCGCCTATCGACAGGTTGCTTGCATTTCTTTC
ACTATTGAAATGAGAATCCATGATATTCTACAGCTTCacgatttaaattt
tcaaaatcggtTTTAACTAATTTTGAAATCGAAATCAGTAAATATAAGAT
ATAGCACATTCTAAGGATTGACCTTCTTTTAGAAAAGACTTAAAATACTA
CCTCCCAACTCTGGTTTAGTGTCTGTATGATGGCCACCAATGGAGCATTT
GTTGCAAAATCCTTTTGATTCTCTTTCAGGTTCAAAACGCTTCAATTTGG
AAGTTTTGACGAAATTCTCGTAAGTTTTATTCACCTTTTGATTCCGTgta
acaaattccaaaaaaggaaaaaattaaaaatcggTTTAGACCTAGCGCTC
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tgcattcgaaattagttttgtgaaaaagaaaaacatttaaagagaagaga
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TTATCTGCCTATGGTTCTCCTTGAAGGATTTTCTGTAGAGAAGTGTTTTT
GTGGCTGCTATTCGGTTGAAGGAGTGTATATTTTGCACGCATATTCTGGT
GTCAAACAAATGGAATTATAAACCCTTAAATATTTATGTTGTTTAAATAC
TAGGATCGTAAAACAGCGCCATCGTTTACCGACCTGACGCAACTAGTGGC
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CAGGTAGATTACTACGCACGACAACGAGGTGGTTCGCTCACCGAACAGGA
CATGGGTCGGGAGAATGAAAGTCAAGATGAAGGTGGTTATGAGGTAAGGA
TGGTGGGGTAATTTTCTCCATAGGATTATGTGATTTTTGAAGAATGATTA
TGATTTTGTTACCTACTTTCAACTTGTTGGCTCTTTTCACGCCTGACCTT
ATTAGTGCTGTTTTCGGGCCAATGGTGGATTAAGAGCCAGTGAAAGAAGG
ACCTAGTTTTTGTCGGCGTAAAAGGATATTGTGTGCTTTAGCGCCGATAA
TCTAGAACTTTAACAGGATAAGGACGCAAATGAGAAAGGGGCTGACAAAA
AGGTCAATAATCAATGTACTTAGGCATCTCGACTAAAAATTGGTAATTTG
AAAAGTGTCCTTCTTCCACTAGTTTGTTTATTCCCTCTTTTACAGTCAGA
AGATACCACCAAGGTGCGGCATTCATACCATCGACAATTCAGTGCCACGT
AA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000130_pilon:246870..255271+ >XLOC_039825 ID=XLOC_039825|Name=XLOC_039825|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1668bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000130_pilon:246870..255271+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ACAGGATGTCTTTGGAGATATGTCCGGGCAAGCATGTCATTATCAGGTTA
TCTACCACCCATTTGCGATCCAGAAGATGGCCATTTATTGCTAGATGGTG
GATATGTCAACAATTTACCAGACAGGATGTCTTTGGAGATATGTCCGGGC
AAGCATGTCATTATCAGGTTATCTACCACCCATTTGCGATCCAGAAGATG
GCCATTTATTGCTAGATGGTGGATATGTCAACAATTTACCAGCTGACATC
ATGTTATCGATGGGAGCGAAAACCATAATTGCGGTTGATGTTGGGTCACG
TGATGAAACTGATCTGACCAATTACGGAGATTCTTTAAGTGGCTTCTGGA
TGCTGTGGAAGAAATTCAACCCATTTGCTTCACACGTTCGACTGACATCA
TGTTATCGATGGGAGCGAAAACCATAATTGCGGTTGATGTTGGGTCACGT
GATGAAACTGATCTGACCAATTACGGAGATTCTTTAAGTGGCTTCTGGAT
GCTGTGGAAGAAATTCAACCCATTTGCTTCACACGTTCGAATTCCAGACA
TGGCAGGGATTCAGAGTCGTTTAGCGTACGTTTCATGTGTACGTCAACTG
GAAGAAGTCAAACATGCCGATTATGTCACCTACATTCGACCGCCTATCGA
CAGATTCCAGACATGGCAGGGATTCAGAGTCGTTTAGCGTACGTTTCATG
TGTACGTCAACTGGAAGAAGTCAAACATGCCGATTATGTCACCTACATTC
GACCGCCTATCGACAGGTTCAAAACGCTTCAATTTGGAAGTTTTGACGAA
ATTCTCGTTCAAAACGCTTCAATTTGGAAGTTTTGACGAAATTCTCGAAG
TGGGATACACACATGGCCAAACAGTGTTCAACACCTATTTTACCGAAAGA
CTTTTTCCATCAACCAATAATGAAGAATCTCTCTCAAagcaaaaacaaca
aattaccATTGAAGTGGGATACACACATGGCCAAACAGTGTTCAACACCT
ATTTTACCGAAAGACTTTTTCCATCAACCAATAATGAAGAATCTCTCTCA
AagcaaaaacaacaaattaccATTGATCGTAAAACAGCGCCATCGTTTAC
CGACCTGACGCAACTAGTGGCTGTTGTAAAGACACCCAACGTGCCGCAAT
CTGTGTTGGAAAAGCGCGCACAATTATTCGAGTACAGATCGGCAGACGAG
GAGAGCGATCACAACGATGACCAGGTAGATTACTACGCACGACAACGAGG
TGGTTCGCTCACCGAACAGGACATGGGTCGGGAGAATGAAAGTCAAGATG
AAGGTGGTTATGAGGATCGTAAAACAGCGCCATCGTTTACCGACCTGACG
CAACTAGTGGCTGTTGTAAAGACACCCAACGTGCCGCAATCTGTGTTGGA
AAAGCGCGCACAATTATTCGAGTACAGATCGGCAGACGAGGAGAGCGATC
ACAACGATGACCAGGTAGATTACTACGCACGACAACGAGGTGGTTCGCTC
ACCGAACAGGACATGGGTCGGGAGAATGAAAGTCAAGATGAAGGTGGTTA
TGAGTCAGAAGATACCACCAAGGTGCGGCATTCATACCATCGACAATTCA
GTGCCACGTAATCAGAAGATACCACCAAGGTGCGGCATTCATACCATCGA
CAATTCAGTGCCACGTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000130_pilon | genome | sc0000130_pilon:246870..255271 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 841-897:8346 |
| Aaloc | 601-840:7754 |
| Aaloc | 487-600:5892 |
| Aaloc | 448-486:5481 |
| Aaloc | 334-444:5120 |
| Aaloc | 187-333:350 |
| Aaloc | 64-183:1 |
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