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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000233_pilon:545360..550653- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_039753 ID=XLOC_039753|Name=XLOC_039753|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=5294bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000233_pilon:545360..550653- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CTGGAACCTGATAATGAACATGACGTCGAAATGTTTGATTGTGAAAATGA
TAACGAGTCTGAAGGTGAAGTAGTTCCTGAATGTTGTGACAGTGATGATC
AATTCGATCAAAGTGCAGGTGATGAAATGGAAGGTATATATAGACTGGAT
AGACTGTTTTCCGGGGGGGGGTAAATTTCCTAAAGATGTTACATCCTAAA
CCCCCCCCCATATTTAATTTTTTTTTCTTTCTGGAAAGACCAATTTTGCT
GAGAGTACAGTTTTGGGATTTTTTTATGCTTATAAAAACATGTAGTCGAA
GAGCTACAGGTTTCCTTCTGATTGAGCTTTGGCTTCTTGATGATTATGAC
GGCGCTGGGTTCAGTACAGTGAAGTAGACAAGAGGACCATCTTGAACTTT
TTCAATTTCATTTTTAAAAATTATTTAAAACAATGAATTGTATTCTGAAA
ACCCTATTAAAGTTTATGAAACTCTAAATTGTAATAATTACTGTAATTAG
TTTCATGTTTCATTGCCCAATTTGCTTTAAAAACACGCCCTTTTACGACG
TTACAAAAAGTAATTTATATCTACTTTGACCATAGGTAGCTGTTCTTTTA
AACTATAACTTTCATTTGAAAAGTTCTAATCCTATCTGAGTTCTGTCTGA
TACATTTTGTTTATACACTTCCCCCTGGCAGATCTTTGTTTGTATGCTAG
GGGTGAATTTTAATTAAGTTAAGCTTTTTTTCATTTCATTGGAATAATTA
TTTGTTATTGCTTTTATTGATATCATGATAATGTCCATAATTGTGCGATG
AATTTGTTAAACTACCGGGTGGTCCAGAAATAACATGTCGAAAATTCGAA
CCTAAATATCTCGAAAAGTAAACATGGAAAAAGCTGCAAATTTCTTTGTT
TTTTTATTTAACATATTTTTTATCTAAGTTCGAAATATTTTTTTGCTAGC
ACGATTCTTCTTATTTTTATGAGTTTTTCCTCCCAATCTATTTTTAGGAA
TAGCATTACAAAGTCTTTCTTTTTAAGAAGATGGCATTCCATTGCAGTTT
ACCGTTTCACAGTTGCTCCATCGACCTCTACGCAATCAGTACCTCTTTTT
CTTAATGCTGAAATGGTTTTCTCTGACGACGAAAAGGCTGTCATAAAAAA
TGACTATCTTGAGAAACAATGGAGCGCTTATCGTATCTGTAAGGAACATC
CTACAAAGAAATGGCATAAAACGTCTGTACAGAAATTAATCAATCGTTTC
AAAGTGTTTGGATCTATGGACAGAAGACCTGGATCAGGCAGACCAAGAAC
CGTGACAACACCAGATAACGAAGCTTTGGTTAACGAGTTGATATGTTCAC
AGGAAGAAAAACCGGGTACGCATTTGTCACCTCGGGAAATAGAGAAACAC
ACGGGAATAAAGAGATCTTCGGTAATACGAATGGTAAAAAGGAATGGCTA
TAAGCAATACAAACGTTTAAAAACACCACGAGTAAATGCCGCGACAAAGC
AACGACGAACAGAGAGAGCTGCAGCGCTCGCAGGAAGATTTGGAAAGAGC
AAAAGGAGCATCGAACGTTGTGTGTGGCAAGATGAAAAGGACTTTACACT
GGAAGTGCCGTTCAATAGCCAAAATAGCCGCGTTTACAGCAAAGGCCAGA
AAGGTGATGTTCCTGATGCAAGCTTGTTTCATCAGAAGAACAAACAAAGC
AAAAAAGTCATGGTATCCGCCTGCATTTCATGGTACGGTGCAACAAAACC
TTTTTTCGTGAGTGGTGATGGAGTAAAGGTGAATGCCGTTTCGTATCACA
AGCATTTAGATAAACAACTGATACCGGAAATAAATAAATTGGTTAGTAGA
AAAGATTGGGTTTACATACAAGATAGCGCACCATCACACAGATCAAATCT
TGTCCAAGACTATCTGAAGGAAAAATTGAGAAAACGCTTTGTCAAGTCAG
GTGAGTGGCCCCCAGCCTCACCTGACTGCAATCCATTGGATTACCACTTC
TGGGACAAGGTGAAAGTCAAAGTGTACGAAGGTCGATTCAATCAACCATT
TGAAAACGAAGAACAGTTAAAAAGAAGGATAAGGAGAGTTTGGAATGAAA
AGGCTACTGATGTTGTTGAAATTCGGAAAGCATTAAAGCAATTTGTGCCT
AGGTTGAGACAGGTTGCCGAGAAAGAAGGAAATTATATCAAAATGACATT
TAAGGGCTCTGACCATAGTCCAAAAATTGATTTTGGTATTTGAACATAAA
AGTTATATTTCAGGTTCCTTAACACTTTTAACAAAGAATCGCCTTTATAA
ATTGCTTTTTAATCGAATCCCTTAAGAGTAATTAAGAATTTAATTGCAAA
AATGACGTTATGAACTTTAAAAATATGTTAATAATATGTTGCATCACCCT
CTTTTACAAAAAGTGCTTAGTTTTAATGGGTAATTAACTTTTTTGTTTCA
AAATTTCTTTACATTGTCCGCAAAAAATTGAACTATTTTAAATTTTGCGG
AAAATTTTTCTAAAAAGATGTGTCAAAAGTTATGACTGTTTTTTTAAGCA
AAATCCAGATGAAAAATTGATGAAAAACCACTATTTTGAAGATTTCGAGA
CAAAGAAGCATTTACAAAAATTTTCCGCAAATATTTTTATTGTTCGGTAA
AAGATACACCATCTACTGCGAAAATTTTTTCAAAATGTTTTTTCTTCGCC
GAAACTAAGCTCTTCAAAGTTGAAATACTCTTCCTCGCAAAAGTCTTCAT
TTTCTTCTTCATCAAATGTTTTCAATGCAATTTTTGAATTTTCAGATTCA
GGAATAGTTTGTCTAACAGAAAATGTATAACATGCCATAGTTTTGTTGGT
TACATCAGTCAGAAAACACATTTTAAACACGGCAATTATGAAAAATTCAC
TATGGTCAGAGCCCTTAAGTGAACACCTATCTTGCGAATGCTTTTCTGAA
CACTATTGCTAGTTTTTTTTTTTTATAGTTGTTATCCAGATTGTAGATAG
ATGATATAAATTTCATTTGTTAATTGACATTTCATGTCGGATCAAAATTC
GTCTTTTTGACGTCAATTTTTCCTCATTTTCTTGCAATTGAAAATGTATA
CTATTACCAAAAATATCTGCCGTTTCCCTGATTTTGTTTTTCTGAACCCG
ATTTTTTGTTTGAGAGTCCCAAGATGTCCAAATTATAACTATACAAATTT
TCCTGGCTCTAGTGGTCAAACTTTTGGCACAACTTTAAAAATAATTTTGG
ACATGTTTTTTTTAGACCACCCGGTAGAACTGAGGTGAGATTTTCTTTCA
TTTTTCAGCCTTTTTCGCAAGCCATGAGTATCATACTGCAACTGTCGAAC
ACTTGGAAGATGTATTTAGGGTTGAAGATGAATTTTCCAATGATTTATTC
AATGAAAATGATTATTGGGAAGATTTTACTGAAGAATTGCAAGGTAAATG
AGGTGGTATTACAAATTTTTGTCAGTGGGAAGGCCTGTTGATGATTGTTT
TAGCTAGAATCTTTGAATGCAATATCGCTCCACATCTCACATGTCATAAA
TATTTCAACTAGAAATTTGTACGAGTTCCAATTCCACAGTTTATTTTGAA
ACGATTGAAAAATCGTGAAAGTTATTACCTTTCTTTTGATATCGCAAGGC
TGTTGAAAAAGTGGGTCAGTTGGTTTAGCGGTCAGTGGTAAACAAATTCT
GTTGGAAAGCGCTGTTGTGTGGGTACTTCTATATACCCCCAAATCACTTT
CAAAAAATTCCAGAACTTTAGTAACAAACAGCGCTTACATCAAAATACCT
ATCAAAAATTGATGTCGTCCATTTAGGGGGTGATGATTTTTTTTTCTTGC
ATGGACCATCATGGTAAAAGTAGGGGGCGGGAATGTGACAGAATCTTTTT
CTCAGTGTTAAGGCTTGGGGACATGAGAAGTTTTTTTCGCATTGGTGCGT
GCCATGTTTTTTTTGTTTCATGGGACGAAAAGTGAGGAAAATACATGCTG
GATTTGTCCCTGGGACAATGGAACAGAATTGATTTGAATTGATGGGTGAA
TGGTGGGATGGAGTATGTTGCATTGCACCAATGGGAAAAAACTTCTTGTG
TCCCCAATGCTTTTATTTTCATGCTATTAATCAAATTAATTAAATTTCTT
TGCAGATGATTTATTTGATGAACCAGAGAAGGATGGATGTAACAGTGATA
TAACTGGGCACTTTTCCTCACCACTTTACCCTGAGGCCATTGTAACTTTG
GGAGCAGCCATAACAATGATAATTGCTTTTTCGCAGAAATACAAACTTCC
TAGTGTTGCACTTTCCTCCTTGATCATCCTCATTAATATTCTTTTACCAT
CAAACCATATCTTTCCGAGATCATTGTATATGCTTAAGAAGCTTTTTGGC
TCACTGAATCCTAATGTCAAAACACACTACTTTTGTAAGGAGTGTTTAAT
GAAATTGGATAAAGACAGTGTTGTTTGTCCAAATTCTACATGTTGCCAAT
CAAAAAAAACGGAAAAACCTATGACCAAGTCGTACTTCATGCAATTTGAC
ATAAAAAGCCAAATCAAAGCAATTTTTTCGCGTGCTGGTATGCTTCTCAA
ATTAAATCACCGCTTCAACTGTACTGCATCATCACCGTCTGACATATACG
ACTTTTCATTATATAAATCAAACTCTGCTTTTCTAAATAATCCGTTCAAT
ATATCTTTTATGTGGAACACTGATGGTGTTCCCCTTTTCAAGAGTATCAA
GTCATCTATCTGGCCAGTCTTCTACACAATAAATGAATTACCTTTTAAAG
ATCGCAGGAAAAAGGAAAACATTTTGATTAGTGGCCTGTGGTACGGGGAG
ACACATCCTAATATGCTGCTGTTCTTATCTCTGCAGTTTGAATCTTTTAG
AGAGCTGACCTATTTTGGAACACAAATAAATGAAGAAGTCACCGTTAAAT
CCATGTTGCTTTGTGGCACTTTTGACATGCCTGCTAAAGCCAGTGTGCTA
AATTTCCAACAGTTTAATGCATTTTATGGCTGTCCTAAGTGTCTTCAAGA
AGGGGAGACAGCAAAAACTGCAAAAAACGGAAATGTAAGGTGTTTTCCAT
TCAATAAATCCAATCCAACTGGTCCCCACAGGACACATACTGAAACAGTC
CAACATGCTAAGGAAGTAATGATTGCCAAAGATCATGTAAAAGGAATTAA
AGGACCCACACCATTAATGCTTGTACCTAGCTATGATGTAATTCGTGGCA
TCGGCATAGACTACATGCATGCTGTACTATTATTTGATGTTTGA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000233_pilon:545360..550653- >XLOC_039753 ID=XLOC_039753|Name=XLOC_039753|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2814bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000233_pilon:545360..550653- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CTGGAACCTGATAATGAACATGACGTCGAAATGTTTGATTGTGAAAATGA
TAACGAGTCTGAAGGTGAAGTAGTTCCTGAATGTTGTGACAGTGATGATC
AATTCGATCAAAGTGCAGGTGATGAAATGGAAGCTGGAACCTGATAATGA
ACATGACGTCGAAATGTTTGATTGTGAAAATGATAACGAGTCTGAAGGTG
AAGTAGTTCCTGAATGTTGTGACAGTGATGATCAATTCGATCAAAGTGCA
GGTGATGAAATGGAAGCCTTTTTCGCAAGCCATGAGTATCATACTGCAAC
TGTCGAACACTTGGAAGATGTATTTAGGGTTGAAGATGAATTTTCCAATG
ATTTATTCAATGAAAATGATTATTGGGAAGATTTTACTGAAGAATTGCAA
GCCTTTTTCGCAAGCCATGAGTATCATACTGCAACTGTCGAACACTTGGA
AGATGTATTTAGGGTTGAAGATGAATTTTCCAATGATTTATTCAATGAAA
ATGATTATTGGGAAGATTTTACTGAAGAATTGCAAGATGATTTATTTGAT
GAACCAGAGAAGGATGGATGTAACAGTGATATAACTGGGCACTTTTCCTC
ACCACTTTACCCTGAGGCCATTGTAACTTTGGGAGCAGCCATAACAATGA
TAATTGCTTTTTCGCAGAAATACAAACTTCCTAGTGTTGCACTTTCCTCC
TTGATCATCCTCATTAATATTCTTTTACCATCAAACCATATCTTTCCGAG
ATCATTGTATATGCTTAAGAAGCTTTTTGGCTCACTGAATCCTAATGTCA
AAACACACTACTTTTGTAAGGAGTGTTTAATGAAATTGGATAAAGACAGT
GTTGTTTGTCCAAATTCTACATGTTGCCAATCAAAAAAAACGGAAAAACC
TATGACCAAGTCGTACTTCATGCAATTTGACATAAAAAGCCAAATCAAAG
CAATTTTTTCGCGTGCTGGTATGCTTCTCAAATTAAATCACCGCTTCAAC
TGTACTGCATCATCACCGTCTGACATATACGACTTTTCATTATATAAATC
AAACTCTGCTTTTCTAAATAATCCGTTCAATATATCTTTTATGTGGAACA
CTGATGGTGTTCCCCTTTTCAAGAGTATCAAGTCATCTATCTGGCCAGTC
TTCTACACAATAAATGAATTACCTTTTAAAGATCGCAGGAAAAAGGAAAA
CATTTTGATTAGTGGCCTGTGGTACGGGGAGACACATCCTAATATGCTGC
TGTTCTTATCTCTGCAGTTTGAATCTTTTAGAGAGCTGACCTATTTTGGA
ACACAAATAAATGAAGAAGTCACCGTTAAATCCATGTTGCTTTGTGGCAC
TTTTGACATGCCTGCTAAAGCCAGTGTGCTAAATTTCCAACAGTTTAATG
CATTTTATGGCTGTCCTAAGTGTCTTCAAGAAGGGGAGACAGCAAAAACT
GCAAAAAACGGAAATGTAAGGTGTTTTCCATTCAATAAATCCAATCCAAC
TGGTCCCCACAGGACACATACTGAAACAGTCCAACATGCTAAGGAAGTAA
TGATTGCCAAAGATCATGTAAAAGGAATTAAAGGACCCACACCATTAATG
CTTGTACCTAGCTATGATGTAATTCGTGGCATCGGCATAGACTACATGCA
TGCTGTACTATTATTTGATGTTTGAATGATTTATTTGATGAACCAGAGAA
GGATGGATGTAACAGTGATATAACTGGGCACTTTTCCTCACCACTTTACC
CTGAGGCCATTGTAACTTTGGGAGCAGCCATAACAATGATAATTGCTTTT
TCGCAGAAATACAAACTTCCTAGTGTTGCACTTTCCTCCTTGATCATCCT
CATTAATATTCTTTTACCATCAAACCATATCTTTCCGAGATCATTGTATA
TGCTTAAGAAGCTTTTTGGCTCACTGAATCCTAATGTCAAAACACACTAC
TTTTGTAAGGAGTGTTTAATGAAATTGGATAAAGACAGTGTTGTTTGTCC
AAATTCTACATGTTGCCAATCAAAAAAAACGGAAAAACCTATGACCAAGT
CGTACTTCATGCAATTTGACATAAAAAGCCAAATCAAAGCAATTTTTTCG
CGTGCTGGTATGCTTCTCAAATTAAATCACCGCTTCAACTGTACTGCATC
ATCACCGTCTGACATATACGACTTTTCATTATATAAATCAAACTCTGCTT
TTCTAAATAATCCGTTCAATATATCTTTTATGTGGAACACTGATGGTGTT
CCCCTTTTCAAGAGTATCAAGTCATCTATCTGGCCAGTCTTCTACACAAT
AAATGAATTACCTTTTAAAGATCGCAGGAAAAAGGAAAACATTTTGATTA
GTGGCCTGTGGTACGGGGAGACACATCCTAATATGCTGCTGTTCTTATCT
CTGCAGTTTGAATCTTTTAGAGAGCTGACCTATTTTGGAACACAAATAAA
TGAAGAAGTCACCGTTAAATCCATGTTGCTTTGTGGCACTTTTGACATGC
CTGCTAAAGCCAGTGTGCTAAATTTCCAACAGTTTAATGCATTTTATGGC
TGTCCTAAGTGTCTTCAAGAAGGGGAGACAGCAAAAACTGCAAAAAACGG
AAATGTAAGGTGTTTTCCATTCAATAAATCCAATCCAACTGGTCCCCACA
GGACACATACTGAAACAGTCCAACATGCTAAGGAAGTAATGATTGCCAAA
GATCATGTAAAAGGAATTAAAGGACCCACACCATTAATGCTTGTACCTAG
CTATGATGTAATTCGTGGCATCGGCATAGACTACATGCATGCTGTACTAT
TATTTGATGTTTGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000233_pilon | genome | sc0000233_pilon:545360..550653 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 271-1407:1138 |
| Aaloc | 136-267:1985 |
| Aaloc | 1-132:5295 |
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