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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000233_pilon:568625..572926+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_039747 ID=XLOC_039747|Name=XLOC_039747|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=4302bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000233_pilon:568625..572926+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCAGAAAATAATGATGGTGAGCAGCAGTGTTCCTCACAGCCATCACA
GTCAAAGCGACCAAGAAAGACAAGTAAGTAGTTTCTTCTTTgtgttcaac
attttcatttgccacattttgtgaaaatgtcGGCGAGTGGTggaaaaaca
agtttttgtgATTGTTTTTTAACGCCCAGTCcagtcagcaccttgaactg
actacccaattcccctcacatggcatgggttgactcTGGCGAAGGTTCAt
ccacttgccaagtgaaccgctgcgagttgGAATCAAACCTCAGTCCACAG
GTCCACAGTCCACAGTGCCTAATTTTTATGCATATGCATTTACAAGCATT
TACCACATTTGCCACTGAAAGGCATGATATTAGATTGTGATCTGATatta
ccagacggtgtcaatcgaacaacttcgaacaaaaatcgcaatcgaaccaa
tcgaacgtaatcgaaccaatcgaacgtaatcgaaccaatcgaacgtaatc
gaacgtgatcgaatAATTTGCAATTCGATTATCgttgactatgttccatt
ggttcgattacCTTCgattacaatagaccttttttcaaagaggccaccct
gttgaataattatgtagtccagcagaaaaacatgataaaaccatgcataa
ttattacaatatgcattatacagtaattatgcatggctctatcattgttt
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TCTCTTTTAAGGTACACATCAATATTTGAATTACGATTATTTGATTAATG
TATGACCATTACTGCATATATATAAAACACCATACTGTGTCTTAAAGTTt
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TTAGTAACGTCGAAGAGTGATACATTGCGCTTCTCTGCCATCCTTTGCAC
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TTTTTGTAAGGTTTAGGTTGTAATTGATCACATGTTTCAATCTGTAAACA
AGAGATTTAATTTGATGACtggaattttgagtaaaacaaaggaaataaaG
TGAGTAAAAAGTATGGCAGAAAAGTGCAATATATCACCCTTCGATGGTAT
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ctgatatgaaacatgaaTACCGATATCTCAATCTAAAAAATGAGAGTTAT
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TCTTAAATTTAACCACAAAAGATATTTTGTCCAAGAAACCTTAACTTTTC
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gttggTCGATAAATTTCTATTAAGTTTTGTTGTCAAACTAATAGAACTaa
agaactaaagaaaaaatctgCATGGTGTGCCTGTTAAACTGATGGCCACT
ACTCAAAGCTCTAAAGTCTCTGCACACTAATTTACTGGTCGAACTTTGTG
GAACTATAATATTTGTCAGGTTTGCTGAACTTTCTCTGTTGTCATACTTT
GCAGAAGTTCCTTGAATTTTAATCAAACACTTGGATTTTTTAAGACAGTC
TGGATTACATGATATGACATGAGATTGATAATTGATGATTAAATAATTTG
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tttaAGTATCAAAAGGTCATAAGACCCATTATCCATACataaaaattata
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AACAGAGGACACAAAGAAATAGCTTGAGAAGGCTAAATTAGAGAAATGGC
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TAGGAAGGTGCACAACAAGAcgccaaacaaaaacaaaagagttATATATG
CAAAGATAAAGAAAAGCTGGTTGTAAAATAGTggctaaaatttgaaatgg
gGGAGTCCTCGATTCAAACAAttgctaaaaataaattttatttaataagT
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TTGTCTAATTTATTAGTTCATTTTATTGGGTGATCAATAGTGCTAATCTA
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aagaattttttaagTTGTAACATCTGAAAAGGTATTACATGTATAaacag
tgctgcaaatagggaaatatatattatttaaaacaaatttcaatcaatta
gaattgattattgatatattattattattgattaGTTGTCAATTGCTAAC
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GCATGTTTTCACCATTTCTTTTGCAACTAAACTTACTACTATTGACTTAT
CACCTTGGCTATACaagatatgaaattttgaaggtTTGATTTTGTTTAAT
TACTTTAAAGCAGTGTTCAGACAAGACAAGTTAAACCCTCTTAATAGCAA
GcagggggtagaatctaccacccttgataattttttatcaatatgatCAT
ATGTAGTTTATATCAAACTTacagaaagtaaaaaataatttacacaACAT
GcattatcataattttttctctattttttctatttctctattttcCTTCA
CACTGCAGATGACTGGATTGCATCATTTTAATCACTAAAACTATTCTTTT
AACATGAatggatttgaaaaattgttatttCTTTGTAAAGAGGATAATAT
TAATTCCATGGGAAATTTTGAAGGTTGCTAAAAacctaaaaattacaaaa
attcttTGTCTACACATCACTTTGTTTAGGTCTTGGTTTGATGAAACAAA
TTGTGGCAGTTAACAAATCACTTAAAGCTAAAGCAAAACCCAAGAAAAAA
TCAGAGATTTGCTTTGTTGAACTCAAGAGATCTGCTGAAACTGGTTAGTA
TATTTTGTTTGTGCGGGACAactgaaactctaaattttgtCATCAATACA
GACCAAAAAGATTTCTCCctgtttcaaacttttcaacctgaattttattg
cacaaaaacttttgaaagttttaatcttTAGCTAAGGTTTGTTGTCTTGT
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AAAGGATCTACAAGCTGAAGAGACCAAAACATAACAATGGAATGAAAAGA
AGAATATCAAATACTGGTAAATGTGCAGTTACATTACTTTATGCACTGGG
TAATATTGAGGTACCTAAATCTAAATAGAGTTGTGTATCTTGtatgtatt
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CAAGTTTTGGATATTgatgcaaaaaattcaaactggcAAATTGCAGAAAA
TCTGGACACCATCGATAATGAAGAATTAAATGACATAAATCCACAAAGTG
ATACAAAAAGTAGGTATCATATCATCCCTTCTTGAAGTCAATTAAGGAAA
AaacattgtttaaaattttcactgtTATAAGACTCTATGTAAGATCAAAT
CCACCCTCataaaaaaaggggaaaaactggcaaaaaaaacatttttggtg
tTATAATGTAACAGAGTAATAACGATCAactattttaatttatttcagtG
AATAGTTGGTTAGAAACGCTTCTTAActttgtcaaaacaaaaaaaagaag
aagtcaTGGTTCGAAAGATCAAGATCCTGCCAAGAAGATTGGGATTTGCT
GA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000233_pilon:568625..572926+ >XLOC_039747 ID=XLOC_039747|Name=XLOC_039747|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=744bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000233_pilon:568625..572926+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCAGAAAATAATGATGGTGAGCAGCAGTGTTCCTCACAGCCATCACA
GTCAAAGCGACCAAGAAAGACAAATGGCAGAAAATAATGATGGTGAGCAG
CAGTGTTCCTCACAGCCATCACAGTCAAAGCGACCAAGAAAGACAAGTCA
AAGGATCTACAAGCTGAAGAGACCAAAACATAACAATGGAATGAAAAGAA
GAATATCAAATACTGGTCAAAGGATCTACAAGCTGAAGAGACCAAAACAT
AACAATGGAATGAAAAGAAGAATATCAAATACTGTAATCACTGCAGATGA
GCAAGTTTTGGATATTgatgcaaaaaattcaaactggcAAATTGCAGAAA
ATCTGGACACCATCGATAATGAAGAATTAAATGACATAAATCCACAAAGT
GATACAAAAATAATCACTGCAGATGAGCAAGTTTTGGATATTgatgcaaa
aaattcaaactggcAAATTGCAGAAAATCTGGACACCATCGATAATGAAG
AATTAAATGACATAAATCCACAAAGTGATACAAAAAtGAATAGTTGGTTA
GAAACGCTTCTTAActttgtcaaaacaaaaaaaagaagaagtcaTGGTTC
GAAAGATCAAGATCCTGCCAAGAAGATTGGGATTTGCTGAtGAATAGTTG
GTTAGAAACGCTTCTTAActttgtcaaaacaaaaaaaagaagaagtcaTG
GTTCGAAAGATCAAGATCCTGCCAAGAAGATTGGGATTTGCTGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000233_pilon | genome | sc0000233_pilon:568625..572926 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 271-372:4201 |
| Aaloc | 145-267:3886 |
| Aaloc | 76-141:3700 |
| Aaloc | 1-72:1 |
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