XLOC_039668 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_039668
Unique NameXLOC_039668
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000023_pilon:1875158..1888715-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_039668 ID=XLOC_039668|Name=XLOC_039668|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=13558bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000023_pilon:1875158..1888715- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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TAGCTTTTGAATGCGAGGATTCTTTACTGAGCTGAGGTCCCGATTGTTGA AAATACCCAGCAATGGTTCATGGTCTGTTGTGATGATCAGGTTGTTGCAG CCGAGGACGAACATCTTGGCGTGATCAAGTGACCAGGCAACGGCAAGTGC TTCTCCTTCTGTTGGGCTGTATCGGCTCTCGGAGTCAGATGTGAATGTTG AGCCTGCATAGATGAGCTTTCATCCGTCTGGACAGCATACAGGTGCATTC TTTGTATCACATTTACAATGCTGTTGTAGTAGTAAATACTGTAGCAGGGC AGGACCGCTAGGGATGTTTGTAACACGTGATTGTTGTGATATGGAATATT GAAGTGTGAAGTGTGAAGTGTTCAAACTGAAATGAATACAAAGAAAATAA TTTAGAAAAATTGACAATTTGACTAAATAAATGAAAACTAGGAATGATGA TGCTAATTAGTGAAAATGACTAATTAGTGAAAAAATGACTAATTAATGAA AATGGCTAATTAGTGAAAAATTACTAATTAGTGAAAAAAATGTCTAATTA ATGAAAAAATGACTAATAATCAAACAAAAAATGCACGAAACGTGAACAAG GTAGAACCACAGCTGTGACCGCCAAGAAGCCTGAGCACGAACGTGCGAAT GAGAATGCGGGCGAAACGAGTGCACAGCTGAGAAGACCATGAAACCAGGG CACGAACGTGCAATGCAAATGAAAAATGAAGGCCAGAAAATGAACTGAAC TGAGCCAAAATGAAAACAAGGCAAGGCCAATGAAAAGGAAAAGGACTAAA CGAGCCAGAGAGCCTGAGCATGAACGTGCGTGAGTGCAAAGAAAGTCCAA TGAAAAGAAGAAAGTAAATGAAAATCTAAGTTTTGAATAAATATTTTTGT AAATTTTCTGAATTTATAAATGTCAAATAACTAGAATAAATGCTTACCAG ATTGCCCAAGTGTAGTCACTGTGTAAAAACTGCCATGAAAAATGTACTTG AATGTGAATTGAAATCAAAGTAAAACGATATCAAATGTCAAACTCAAAAA CATGTCTCAACACCATACGTCCTATCTCTCTAAAAGCTCTCGTGTAACTG AAGTGAGAGTGACAAAACAGAAAATGTGACTATGGGTGAAAAGAGTCTCA AGGGACGATGACGTAATGAAATAATTGTATTTTATTAATGATATACTAAT GACTTTGGAAGTCATTTGAGAGTCCTTTAACAAATACCCTTATCCATCCT TGCTCCAATCAGTTTGTAAACAAGTTGTGTGCTTATAGTCGAACGAACGA ATACCTTCACTAACAGTTGCGATTAACAATTGCTTTGATTCAATAAAAAG TTTGTTCAAAGTCTCATCCCAATAAAATTTCGATTTGTGCTTCACAAGTT CCCTGAATGGAAGCATTACTGGACCAATAGAGTAGGCCCAAGCGACTTGG TTGACTAACCCAAACCATGAGCGAGCGTCAGTAATGTTTTTAGGTGTGGG AAAGTTTTTAATTGCGTTCAGTTTTGACTCAGAGGGTGCAATTCCATTTG GTGTGATTCTAAGTCCGGCAAAATCAACTGTGTCTTGACAAAATTGAAAC TTTTCAGCATTGAGGACGATTCCTTTCTCCCCACAAAGTTGAGGGTAATC CCATGCATGGTAGAAGGATTCCGTGATTGACATGTCGTATAACAGAGTAT CATCCACACATTTCACCTTTTGTTGTACATCTTTAATAATATCATCATAA CGACTGGTGTAGGCATCACCAGATGTTATAAAACCCTGGGGCATACGAAG ATATCTGTATCGTCCCCATTCAGTTATAAAAGTCGTGAGATGTTGGCTCT CTTCATCAATTGGTACAGAATGATATCCGTCAACTGCATCCAAGACAGTC TTCTTGGTATTGGGAGGTACTTGACATGCGAGTTGGAACGGGGAGGGACA ATGGTGAGTTTCGCGTTAACACTGTATGTTGAGTTGTTGGAGGTCAACTG TCCGACTAATATCGCCGTTTTTCTTTCTGGCTGTGACCATGGTGGTGCAC CACTCGACTGGTGTTCCGATCGGTACAGGTGCTATAATGCCTCTCTTGAC GTTGTTGTCCAGACTCTTCTTGACTGCTTCCTTAAGGTGGAAGGGCACTG GGATGGGGTTATGACAAACATGCGGCTTCGCATTAGGTTGAATATGGATG TGGGCAGGTTTTGTATCCATGGACGGAAATGGTCTGTCTCTGTTGAACGT AGTTTTGGAAAATTGTTCTAATAGGTAATGTTTGAGTTTTGGAACATTTT CCTCTGTAGGTTCAAATGGTAATTTTTCTGAACGTTTAGGTAGATTACTT GGAAAGGGTGTCAACGGAGGAAACGGTTGCTGATATGGGATATGGAAATG TCTCTGGTAGAATGTTCAATTCTGTACACCCTGCCTTTACGGCTGGCGTA AATTCTGTCAACTTTTTCACAAATGTATAGCGGTTGAGTAGTAGTGTGAT TGTCTATTGTGAAAGTCATTGGTAGCCAGCCAGAACAATGTAATGTGGAT CCGCCAACGGCTCGAACTAGTTTATTACATGGGGTTAACGATTGTTTGTT TAGTTTGTTATTCATAGAATTATATTTCACTGGTCTATCGACCTCTACGA AATAATTTTAGATTTATAAATTGTCTAATTCTTCATCTGTCGTCCAGTCG TCAGAAGATATGGACAGAAGAGAAGACGTTGTTTTGGTCTTTGTCCTAGG TTTTCGAACTAGGCGAAGGTTTGTTCTAGGGCTTCCTCTTACATGCCAAA CGAAATCGTCATTTTTTGAATTCATTTTTTTCGCCTTTTGGCACATATCT TTAAAAATTTTTCTTTCGTTGATGGTGAAGTCGTCTGTGATGCTAAAGCC ACCAATTTCATTGAATCGTTTCAGCTTATGCAGATTTTGCATTATCCGTT CTTTTTCCTCTATACTTTTTAAGATCAACTTGATTGGACGCCAATGTAGC CCTTTTCGGTTTTGTCCAATGCGATGATGGTGGGACGGTTTGATATCTTG AACGCCAATGTTACCTAGTATACCTTCAATATCTATTTTGTCTTGTTCCT GTTGTTCCTCTTTGTTGTCTACCTCTAATTCCACCATTCCATGTATAATA ATATTTCGTTTTCTTGATTCGATGTCTCTTTCTTCATTCTTGTTTCTTGT TGGTGTTCTCTCACTGCTGATTTGAAATTATCCTTGTGTTTCTTAGTTAT TTCAGCGTATGTTTTTTCTGATGTTTTCTCTATGTAATTCGTCGTTTGCT TTATTTCTTCTTTTATAATCTGCTTGGTTTTTATTTCAAAGTCAGCCATC TTATTGGTTAAGATGTTTTCGATATCGTTCTTAAGGCTGCGGTTCTTGGC TAGCTGGTTTTTGAGCTTTTTAATGACGTCATCCTTCTTCTCAATCTCCC TCTGCATCATATGATACGAGTTCTCACCTATTTTACTCATTAGAGATCGT GTTATCCGCACGCAATTCTGACATAGATATTGTTCATTATAAGTGTTGGC AAAAATTTGCAGCTGATAAAGCGGTAATTGTGTGCACTCGTAGTGTACCA TGCGGTGGCATTTTCGGCATTTTAGACAGTTTTGGTCATCATCATCTGAG CAGGAGGTGGGAGTGCATGTTTGGTTTTGTTTAGCTTCTTCAAATAGTTG TTTTTCTTGCTTTTTGTCGGTTTTTTCGTTCATGTTATTGATTTTTTTTC TCATGTTTCTGAGTTTGAGTTTATTCAAATGTTGGGGTCCAGCTAAACAA ATGCTAGCTCCACTATCAGGAAAAATTTTCATTGGCGTTGGTGTCGGTTT GGTCGTATTGGAGGTTGGCATAAGTTTTGCATTTATTTCAGTGATCTCTG CAGTTGGGCGGAACGCTTTGCTTTTTTCGTCATAGGTGACATGGGCCAAT AGTGCTTCGGCTGTTTCTGATTTTGGTTTCCGACACATTTGAAAAATGAT TTGATAATTTGCAATTGTGGCATGTCTTCCCCCATGCTGGACACTTGGAT GACCGATCTTTTGATCCGTGGGTAAGGCTGCCACAACCGGAACACGGAGC TCGTCTGGTTGGAAGCTTTTGGCGTTGATATTGCAATGTTCGGACCGCCA TTGCAGCAAATGTGAACTTATAAGAAAGAAAAAGGAAAGAAAGAAACGAG AAGAAAATTAATTCCCGCTTTGAGGTTATTATCGAAACAAAAGGATCAGC CAAAATTTCTATCCACACGTCAGCAATCTACTTTTTATAAATAGAAAAAC TATATTGTAAGGAAGATTCTAAAAAAAAGGCTGTTTTCTTAGACAACTAC GTTATATGTAATTTAAATTTTTTTTTTTTAAATGTACATACATATGTATG TATTCAGGGATTGAAAATATTTTTAAATGATTCCAAATTATTGATTGTTT GTTCAATCATTCCCTGGTTTTATAAGGATGTAAGGGCTTAATAAGGTTCA TACCATATTTTTAAGCTGTACACGTCTTCTTTTTTTTAAGAAACTAGTTT TACCAAGCAGCCTCAATGTTTCTTAAGAAATCGGCCTTTTGAGCCTTAAA TGTTTCTTACATGTTTCTAACTTTTTGACATAAATTAGCCTTGATTGGAA GGTTCTTATAAAAAACCGAGTTAAAAAATGTTATTTTCTCATTCTCAGCC TCAGCATGTTTCTTAGATGTTTCTTAGTTTTTAGGCATTCTGAGCCTCAT GTTTCTTAAAAGTGTGTTTCTTAAAAAAAAAAGACGTGTAAACTGTCTTG TGAAAGATAAGAACAGAATTCAAACTGAAATCGAGGCTCTATGAAAGTTT CTAGCTCTCTATTAGTTGATTTTCACTAGATCTGCAAGACTCCTCGTTGA TTTGTTATTCTAAAAAAGCCTATAACCAATGTACCAGGGTTGCCCACCCT CCTATTAGCAAAATTTGTGCAGAAGTAGCGAGTTCACCTTAAACAAAACC TGTACGTTGTTGTTCTTTTAATTAGCCATAATATTTCAATTAAAATCATG TCCCTTAATAAATGTATATAACGTATACCTCTTTCAAGACTTAAACGCCT AATTACAGTAAGTTGGTCTAATGGTCAACATGTAATCCTGTCATTCATCT TGAGAGATGAGAATAATAAGAAGGACAGAATCACTGATTGATACTATATT TTTGCATGTTTTTTTCAATCAGCAATTCTGACCTTCCTTTTACTTTATTA TTCCTACCTCCAAAGAAAGGTGACAGAATTAAATGGGGGATGTCGACATT GGACCAACTAAGGGTATGAAACTACTGAAATTATAGAATTTAAAGGTATA ATTAATTACATGGTTATCACTTAGCAAAATTGATCTGAATGTGCAGTAAA AGTGTAAATACATCCATATTATCATTTCAGTTTATCAGTTGAATTTTTTA TGCCTATGACTACATATGCCTATGACTAGCTTACTTTGAATTTATCATAG AAAAAGATACAGTTAAAAAACGTGTCAATAGACTGTCTTTGTTTATAATC CTTGTATGTGTGTTATAGGACAATGCAAATTGTTTCTGAATAAGGTAGGG AATCAGCTGATTTTAAGAGATTTCAGAGGGGAGGGGTAACCCTGCGTAGG TAGGGATAACATTTTTCAGGTAGTAGTGTTTGAGCAGGGGGGGGCACGCA GTTACTACAAGACATGATGTGAAGTAAGTGCTTTTTTAACACTTTTTTTC AGGACCACCACCCTTTGCAGTTACTACACCTTGGTAGTAACTGTTTTCAG AAAAGATTTCCAGGTACCACCCCTGTTTTTGAGTGATATCATCAAAAACA TGCTCGAAATTACCCTAAATTGCGATTATTTTTCAACCTAAAGCCATTTT TGTGCTAGATTTTCTTTTAATTTACTTGGTTAACAGCTGTTGAGAACATT TTGATGATAATTAGGGAAAGCGTAATTTCAAAGTTGGGTCTGAGAAAAAT TTCAAATTTTTTTTCTTCCATTTATAACAAAAATATTTTTTTAACAAAGA ATTTTTTCACAAAAAAATTCATTTTTTGTGAAAAGTTTTGAAAGTTCTTT AAAAAGAATTAAAATATAAGCACTTACTACACCAAAAGTGCTAATTTTAG TGTTTGGCACCACCCCCAAGCAGCAGTTACTACACTGTGTAGTAACTGTT TTCATAACTTCTGAATACAGTACCACCACAGTAGTAAGTGTCATACTGTC TTGTAGTAACTGCGTGCCCCCCCCTGGTTTGAGGGGTTTTGAAAATTATG TCAAAACTGAAGGTTGGCAATAAAGGATACATGGCTCGCACCCCCCCCCC CCCCCCGCCTGGGCGGGGGGAGCTACACCTAAAATTTGCCATATAAGAGA TGGGAGCTGCTTGTTTTTCCTGACAGGCGGGGGGAGCTCCATCTTGGGGG GAGCTCCATCTTGGGGGGGGGACCTGCATTAGTTTATGTAACTTTGGGGG CTAAATAACACTGAATATTTTTCTTCACTGTTGGTTTTTAATTTCTCTAA ACCTTTATGTTTTCATGCAAAGTGTGAACCCTTTAAGTGCCAATGTCGTA TATATCAGACATGGGTTATGTAGGAGGGCGAAGTCAAATTTGGCCCTGAG AAACTTGATTCTGTCCTCCAGCGAATTAGTTTGAAGTTTTACCAGTCGGC ACTTCTCTGTCATTCAGTCAGGTCCGCGCCTAAATCGGGCGGGGTCGAAG GCGCCTAAAAGAAAGAGGAGACTCTAAGCTATCCAACGGACTATAAACGA GCTTCTAACTCCTTCTAGATCTGGAGATATAAGCCTTTAAAGTTTGAACT AGCGATTTTCTTTAAAAAACTTAGCAAAAAAAATAACCGTGGCACTTTTA AAGGGTTAAAATGCAAAAATGAATACATTCTATTGCATTCTCTAAAAGTG CACACACATGTAAATAGAGCTTTGCGAATGCCATAAAATTTTTCCCCTTT ACTGGGACCTAAAATTTTATCAGGCTGGGGGGACCTCATGGTGGACCTAA ATTTGGCGGGGGGACCTAGAACCCCAGTCGGAGCCATGGGATACAGTATC CAGAAATAAAGTACAAGTTAAGAATATTGGGATTAATGCATTTTAAGAAC ACACAAAGTTTCATTTCAAGAAGATCTATATTATGTTAGATTGATTATTA ATTTTCTTTTAATTATTTTTTCAGGAGGCTCACCAGCGGGGGCCAGTCAA GAAGGCACTACTAGTGATTCCTTTACCACCTTTGTTGGAGACGGGAACTC AATATCAAATAATGTGCGAGTGGTACATGTACAAGCTGTCGATGACAACC CAAATCCCAATAGCAGTGGCTCTGTGAATAGTTCTAATTCAGGTGAGTCG AGTCAAATTATATGACGAGTATACTAGACATGTGCTAATTTTGAGTTAGA AATTGTAATTTTTGGTCGAACTCGTTGGAATTAGATTGGGTTTCATGGTC AAGCAAAAAGAAAATCAAAAATGAGTCTTTCCAACGAGATTTTAAACCAA AAAGTCGAAAAATGCAAAAATTTGACAAAAATCCACTTTTTTAAGATTTT 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AGACACTTTCAACGTAATTTATATATTTTCTTTATTATCGTTTATTATGA CCAATCAGTTTTGTCATTGTTAGTTTTGGTTCAATTGCCCTTGCTTCAGT AAGTAAGTCTGCGACCGCAGACGGAGGCAACTCGAAGGCTCTTATTTCAA AGGTAGGGGACTCTTTCTCCCTGGATTGCTTCACTTACCCTTGATCCTTC TCTTAGCATCAAGCAGAGAGGCATCAAGTACCGTTTTGAGAATCTTTGGT ATGACCCAGCTTGGGGTTGAACCCACAACCTTGCAAACTGTAGCCGGATG CTCTACCACTGCACTAAAGTTGCTAAGTCCCTTTTATAATGTTTTAATTC CGTAATACATTAAAATGAGCCTAGCCAGCACATGGCATGGGGGGGGGGCT ACAACCAAAATTTTCCTAAAAAAGGCTGGGGGCTGGATTTTTTTTAATTT CAAGGGGCATGGCTATGCTGAGTGACTCAGAGCATAGCTCAATCATGAGC CCCATCATAAAGTAGATAATGTTTTTTTTCTCAATATAATCAACTGATAT ATCCTTCTTTGGAATTTTAGGAAATCTGAATCTAGTCGCTCCACAAGAGA TGAAAGACGGCGAGCCACACACAATGAAGGTAATCTTATATTTCCCTTCA CCAGTGAGCCAAAATTAACGTTCCTTTTTTGCCAGCAATAAAAATAGTAA TATGATTACATATATAGATTTTTTCTAAGAATTCACCTGTGCATTAAGTG AAACCCCTCCCTTACTGAGGTATATATTTTGGCTTACTATTTTGATTTAA CTAGGCTAGTTAGTAGGTTCGAGAAATAACATTCGAGACTTAAAAAAATT ATTTTTCATAACTTTTTATTTCATTTTAGTTGAGAGACGTCGACGTGATA AGATTAATACTTGGATAATGAAGATTGCTGCAGTTGTACCTGATTGTCAG ATGGACCAATCAAAACAAGGCACCAGCAAAGGTGGTGTCCTGTCTAAGGC ATTGGACCACATCGTCAAATTACGCCAAGAAAATGATAGGATGCGTGAAA ATATGAAAGAACAGGAACGTGTACTGGTTGAAAATCAAGTCTTGAGACAG CAAGTTGAGAAACTGAGGCAAGAGAACTCTATACTTCAAGCTAATTTGAA TTTGCACATGAGGCAAGGAGAACAGATGGAGGATGATGGGAAATTGGACG AGGATTGA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000023_pilon:1875158..1888715-

>XLOC_039668 ID=XLOC_039668|Name=XLOC_039668|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1914bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000023_pilon:1875158..1888715- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGACAACCTTATTTGAGGAAGCTGACAACACCGACCCTCCGTCACCCTC
TGAACTCCTGGATGCCCCCTCTATCAAGTCAGAGTTGGTTGGCCAAAGAA
AGGCATCTAATGGTGCCAGTCAGTCAGATGATGGGATAAATTCAGATGAC
AACCTTATTTGAGGAAGCTGACAACACCGACCCTCCGTCACCCTCTGAAC
TCCTGGATGCCCCCTCTATCAAGTCAGAGTTGGTTGGCCAAAGAAAGGCA
TCTAATGGTGCCAGTCAGTCAGATGATGGGATAAATTCAGGAGGCTCACC
AGCGGGGGCCAGTCAAGAAGGCACTACTAGTGATTCCTTTACCACCTTTG
TTGGAGACGGGAACTCAATATCAAATAATGTGCGAGTGGTACATGTACAA
GCTGTCGATGACAACCCAAATCCCAATAGCAGTGGCTCTGTGAATAGTTC
TAATTCAGGAGGCTCACCAGCGGGGGCCAGTCAAGAAGGCACTACTAGTG
ATTCCTTTACCACCTTTGTTGGAGACGGGAACTCAATATCAAATAATGTG
CGAGTGGTACATGTACAAGCTGTCGATGACAACCCAAATCCCAATAGCAG
TGGCTCTGTGAATAGTTCTAATTCAGGTGGACTTTATGCAGTAGGAGGTG
GTGGACAAATTCAACAAGTGATATCACCTGGTGACTCTGCCATTGGTTCA
GTGGGAGTTGACAGTGCATCACAAGATGGGGCTCGTTACACTTATTACCC
TGCTGTCCAAACCAATGAAAATAATCAAGGAGGTGGACTTTATGCAGTAG
GAGGTGGTGGACAAATTCAACAAGTGATATCACCTGGTGACTCTGCCATT
GGTTCAGTGGGAGTTGACAGTGCATCACAAGATGGGGCTCGTTACACTTA
TTACCCTGCTGTCCAAACCAATGAAAATAATCAAGGAGGGCAATTCTACG
TTATGATGTCACCACAAGAAGTAATTCCAGTCACTGGAGGGAACAGTGCA
CCAAGAATTATTGCTCCTCGTGCTCAGACACTTTCAACGGCAATTCTACG
TTATGATGTCACCACAAGAAGTAATTCCAGTCACTGGAGGGAACAGTGCA
CCAAGAATTATTGCTCCTCGTGCTCAGACACTTTCAACGAAATCTGAATC
TAGTCGCTCCACAAGAGATGAAAGACGGCGAGCCACACACAATGAAGGAA
ATCTGAATCTAGTCGCTCCACAAGAGATGAAAGACGGCGAGCCACACACA
ATGAAGTTGAGAGACGTCGACGTGATAAGATTAATACTTGGATAATGAAG
ATTGCTGCAGTTGTACCTGATTGTCAGATGGACCAATCAAAACAAGGCAC
CAGCAAAGGTGGTGTCCTGTCTAAGGCATTGGACCACATCGTCAAATTAC
GCCAAGAAAATGATAGGATGCGTGAAAATATGAAAGAACAGGAACGTGTA
CTGGTTGAAAATCAAGTCTTGAGACAGCAAGTTGAGAAACTGAGGCAAGA
GAACTCTATACTTCAAGCTAATTTGAATTTGCACATGAGGCAAGGAGAAC
AGATGGAGGATGATGGGAAATTGGACGAGGATTGATTGAGAGACGTCGAC
GTGATAAGATTAATACTTGGATAATGAAGATTGCTGCAGTTGTACCTGAT
TGTCAGATGGACCAATCAAAACAAGGCACCAGCAAAGGTGGTGTCCTGTC
TAAGGCATTGGACCACATCGTCAAATTACGCCAAGAAAATGATAGGATGC
GTGAAAATATGAAAGAACAGGAACGTGTACTGGTTGAAAATCAAGTCTTG
AGACAGCAAGTTGAGAAACTGAGGCAAGAGAACTCTATACTTCAAGCTAA
TTTGAATTTGCACATGAGGCAAGGAGAACAGATGGAGGATGATGGGAAAT
TGGACGAGGATTGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_039668XLOC_039668-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000023_pilongenomesc0000023_pilon:1875158..1888715 -
Properties
Property NameValue
Aaloc631-957:328
Aaloc571-627:638
Aaloc472-567:1294
Aaloc316-468:1713
Aaloc148-312:2533
Aaloc1-144:13559