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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000023_pilon:1731887..1734887- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_039660 ID=XLOC_039660|Name=XLOC_039660|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=3001bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000023_pilon:1731887..1734887- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
AATTTGCAAGTAGACAGTACAAAGAATATGCGGGCAAAAGTTGTTTGCGT
ATTTTCGGATACGATGAAAACATTCTGGTCAATTTTGGCCATTCTTGGTT
TTTTCATTGCCACGTGTTTTTCGCATATGCTAAAACTAAACGAATGCGGC
AATTATGATGGTATATTTTCCAAGATAAAGTACGATCAACGACTAATCGG
TGATATACTAAATGTTATCGGAGCAATCACATTAAGAGGGTGTTTAACAA
AATGTCTTTATCACCCCATATGCTTAAGTGTGAATTACAGAAGGGCAAAT
TCAACATGTGAGTTATTGGGCGTGGCAATTCAAGTATATAACCCAACAAA
GAATGATACCCTTATCTCAGATGCTGGGTGGAACCATTTTGAAACTGATT
ATACAATAAAACAGGTAAAAATACGAACTTTTTACTTTTCTTTAAACCAG
CCCTATCTCACCGACCAAGAGTGAAATATGGTGGGGGAGGGCATCCTTAT
TCTTTGCAATCCAAAGCCTTAAAGGTTTTTTTTGACATAAGTGTTTTCGT
TTTGATACTGAAATATAAATAGATAGGAGGGACAATGAGCTGACCAATCT
TAGTTTATTTGAGGAAGAATTTAGAATTAAAGAAAAAACTGTAAGCACCC
TTTTTTTATAAGAATGGTGTTTTTCCATTTCATCATGGAAGGAAAATCAT
CAAAAAATATTCATACGATATTGTTAGATTAGGCCATCCAAATTCAACTT
AGATTCAGCATGTTAGACATGTTATACATAAATGTAGGATAAATTTGAAT
TCTTGTGAAAGTTTTGTGCCTTACTGGGGGTTAGTTGATAATTTACAGTT
AAAATCTCAAAATTGCATTATAAAATTCAGTTGCCAAATTGGGCTTTTCC
AGAAAAAGATTTTACCCACACTGTTGAGGATATTGATTTTTCGAAGTATC
GAACCCCCTGGATCCTACTTTATTAGTATCGAACCCCCTGGATATCCACT
CTTTAAAATATGCTCAACCCCCTGGACATCCTCTATTATAAAAATGCTAA
CCCATGGATATTGTATTTTTTACTTGAAAAGATATTTTAATTATAACTTA
ATGTTTTAACTTTCATTTAGTTGGGACGTCGGTGTACTGCAAACAACCCT
TCATGTTCTGAATACGAAATATGTGAAGATATTTGTGGAGCACCAGGTTA
TCAATGTGTAAAACGTAAGTTACCTATTTTTCAAACACAAAGGTGGCCCC
GGACAAGGATTGTATCTATACTCTTAGGTGCCAAATAAACGGGGGGAGGG
GGGTTGGAGAATGTTTGAAATTTTAATAAACGGGGGAAACCTAATTGCCG
GTGGTGTTGGAAATTGTACTTCTAAAACCCCAAAAATAAGGTATAAATAG
GCTAAAATCAGGCTATTAAGAGCAAATTAAGGGGCCTTCTCTTTGACAGC
TGAAAATATTCTTACAAATTAATAAACGGGGGGGGGTCCTTATAAGGTCC
GGGGGATTGGAAGATTTTCGAAAAATTAACAAGCGGGGGGGGGCGTTTAT
TTGGCACCTAAGAGTAAGTGAAAAGGGCAAACCTCAAAATTTTGAAATAA
CAAAGTAATTTTCGCTAGAACAGCTTAAAAAAGCTTAAAAAAACTTAAAA
AGCTCTACTTCTATTTAAACCCTTTGTCTTCTCAGACAAACTTATATAAG
CTATGATATCACACACAGTTAAAAACTGCATCAAAAAATTTGACAGTACA
GTAGACAAATTTTGATACATTGTTGAAAAGGTAATCTTAAGTGGACGATT
TTACTAGTTGTTCTTTTGGGGAAATTTTAAGTTTCGCTGATTTCAAATAC
ATGTTTTTTATAAGCAACTGTATGTCTGTATCGGCGATCCAAAAAATATC
TGCAATCTGATTGGTTAAAAAGAGTACAATATATCTTGTATTTTACATGT
AAAAATATAAATTGACGAAAAGATGTTGTTGCATTGTAGCGGTAGCAGCA
ATCTAACGTCACTTTGCTACAAAAGTGCCCTGCGCTTTTTTCCAACACAA
AAAGTGCATTTTTTGGGTCACCGATAAACCAGTTATCAGATATTTGCTCG
TACAATATGGAAATATTTTACTCGTTCCGTATTTTCCGTATATTTTCCTC
GCCTAAAGGCTCGGAAAATATTGTACGGAAAAATCTCGGAACTCGTAAAA
GAGTAAAACATTTCTCATATTGTACACGCAACTGTCCGATAACTATTACG
TATCAACAACTGAGCCTTCACATGGTTATAAACGTTATGCTAATAGAAAA
AATAACATGTATGTATTCAGATATTTTATACCTTTCTTGGACGAAAAGTT
TTCAAGGTCCATTTTGATATTGAAACACTTCAAAGTATTAATAATATTCA
TGACGTAATGATTTCTACGGAAATACCCCGGTTTTAGCCAGTAGTGGCAA
AAAAAAAGTTGTATAAAAGTTGCCACTATTGTCAAAAGCCGGGGTCTTTC
TGTAGAAAACATTACGTCATGAATATCATGAATTACAGAAAAAAAGCTTT
CATTAAATTATAATTTCCAGGAACACTACGTCACACAATTGCAGAATATT
CAGCAGTATCAGAATTAGCTGGACATGAAGCAATATATGCATTTGATGGT
AACGAATATAGGATCTACCATTCTCAAGGCAGTACAGATGGTAATTTTTG
GATTAAAGCTACCTTTGGCAAACGTGTTTTTATAACTGCTGTTGAGGTCG
TTAACCGATTAATTCACTTGGGACAAGTATACGAGAATCGAAATGATAAT
ATTGACTTGAGAACAATTTTACATGAAGGAGATGAAACCATTGATAATGT
CTTTGGTAATACAGGAGATCTAGGGGAAAGAATAATTATCCCTTGCAATC
GATTGGCTGACGAGTTACTTGCTTACCAATCAAAAGAGGTTACGATTGGG
ATCATTCAAATTGGTGAGATCTGGGTCTATGGTAAAGTCCCTTTCGAATG
A Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000023_pilon:1731887..1734887- >XLOC_039660 ID=XLOC_039660|Name=XLOC_039660|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1878bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000023_pilon:1731887..1734887- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
AATTTGCAAGTAGACAGTACAAAGAATATGCGGGCAAAAGTTGTTTGCGT
ATTTTCGGATACGATGAAAACATTCTGGTCAATTTTGGCCATTCTTGGTT
TTTTCATTGCCACGTGTTTTTCGCATATGCTAAAACTAAACGAATGCGGC
AATTATGATGGTATATTTTCCAAGATAAAGTACGATCAACGACTAATCGG
TGATATACTAAATGTTATCGGAGCAATCACATTAAGAGGGTGTTTAACAA
AATGTCTTTATCACCCCATATGCTTAAGTGTGAATTACAGAAGGGCAAAT
TCAACATGTGAGTTATTGGGCGTGGCAATTCAAGTATATAACCCAACAAA
GAATGATACCCTTATCTCAGATGCTGGGTGGAACCATTTTGAAACTGATT
ATACAATAAAACAGAATTTGCAAGTAGACAGTACAAAGAATATGCGGGCA
AAAGTTGTTTGCGTATTTTCGGATACGATGAAAACATTCTGGTCAATTTT
GGCCATTCTTGGTTTTTTCATTGCCACGTGTTTTTCGCATATGCTAAAAC
TAAACGAATGCGGCAATTATGATGGTATATTTTCCAAGATAAAGTACGAT
CAACGACTAATCGGTGATATACTAAATGTTATCGGAGCAATCACATTAAG
AGGGTGTTTAACAAAATGTCTTTATCACCCCATATGCTTAAGTGTGAATT
ACAGAAGGGCAAATTCAACATGTGAGTTATTGGGCGTGGCAATTCAAGTA
TATAACCCAACAAAGAATGATACCCTTATCTCAGATGCTGGGTGGAACCA
TTTTGAAACTGATTATACAATAAAACAGTTGGGACGTCGGTGTACTGCAA
ACAACCCTTCATGTTCTGAATACGAAATATGTGAAGATATTTGTGGAGCA
CCAGGTTATCAATGTGTAAAACTTGGGACGTCGGTGTACTGCAAACAACC
CTTCATGTTCTGAATACGAAATATGTGAAGATATTTGTGGAGCACCAGGT
TATCAATGTGTAAAACGAACACTACGTCACACAATTGCAGAATATTCAGC
AGTATCAGAATTAGCTGGACATGAAGCAATATATGCATTTGATGGTAACG
AATATAGGATCTACCATTCTCAAGGCAGTACAGATGGTAATTTTTGGATT
AAAGCTACCTTTGGCAAACGTGTTTTTATAACTGCTGTTGAGGTCGTTAA
CCGATTAATTCACTTGGGACAAGTATACGAGAATCGAAATGATAATATTG
ACTTGAGAACAATTTTACATGAAGGAGATGAAACCATTGATAATGTCTTT
GGTAATACAGGAGATCTAGGGGAAAGAATAATTATCCCTTGCAATCGATT
GGCTGACGAGTTACTTGCTTACCAATCAAAAGAGGTTACGATTGGGATCA
TTCAAATTGGTGAGATCTGGGTCTATGGTAAAGTCCCTTTCGAATGAGAA
CACTACGTCACACAATTGCAGAATATTCAGCAGTATCAGAATTAGCTGGA
CATGAAGCAATATATGCATTTGATGGTAACGAATATAGGATCTACCATTC
TCAAGGCAGTACAGATGGTAATTTTTGGATTAAAGCTACCTTTGGCAAAC
GTGTTTTTATAACTGCTGTTGAGGTCGTTAACCGATTAATTCACTTGGGA
CAAGTATACGAGAATCGAAATGATAATATTGACTTGAGAACAATTTTACA
TGAAGGAGATGAAACCATTGATAATGTCTTTGGTAATACAGGAGATCTAG
GGGAAAGAATAATTATCCCTTGCAATCGATTGGCTGACGAGTTACTTGCT
TACCAATCAAAAGAGGTTACGATTGGGATCATTCAAATTGGTGAGATCTG
GGTCTATGGTAAAGTCCCTTTCGAATGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000023_pilon | genome | sc0000023_pilon:1731887..1734887 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 511-939:430 |
| Aaloc | 415-507:1882 |
| Aaloc | 1-414:3002 |
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