XLOC_039652 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_039652
Unique NameXLOC_039652
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000008_pilon:88515..103386-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_039652 ID=XLOC_039652|Name=XLOC_039652|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=14872bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000008_pilon:88515..103386- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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ACTCCAGTCAAAATTTGGTGTTGATTGCAGTTATCGCTGCTTTTCAATAA TGACGCTATTTGAATCTTACTTATGACGTGTTTTTTCGATGTATTTTATA ACGTCAAAATCAATTTTTGACCGATATCTTGAGATTGGCTTAATGCAAAT TTTTGACCCAGCACTTTTCGAAATCTGCTCGTTGATATGATTCTTTTGAG CTATATATGAACGTTAAGGAATAATTGGAAGCGGTGCGCGTCACGCAAAA TATATTTGGGACATGCCTTGTTTCACCCGAGGCTACCCCTAAAAGGAATC ACTTCGCTGTAACCTATAGCCTAAATTTGAAAGCTATATTGGTCTGAAGG CCGCTAGCTATGTGACTTTCATTTTTACAATTTAATTTACTTTTACCTGT TTCAGATATTTCTTCGCACACATTCTGCAATTCACTTTCCACAAATATGC TTGTGATGCAGCCAACGTTACTGTTCCTCTTCATCAATGTTCCATCTATC AATCCAAAGAAGCTGGAAAACTCTTAGGGTAAGTTTAAAGGGATACATCT AGTGTTATCGCAATACAATTCCAGTTTAATTCGATCGAATCTCACAAGGA TATTTTCCAGAAAAAATTAAATATGGGGATGGAGGATATAAACATTTTTT GGAAATTTACCCCCTCCCCCAACATTGTCACTTTTGACCCCCGGACAGTA AGTCTATATTCAAGATTTCTCCCGTTGTATCATTTTGGAGGGACGAGTAT ATAATCCTGTGTCAAAGACCCGCTGACACCCCGCCTCATGGAAAATTTAG CTAAAGTTTAAATACCGTAGAATTTCAGCCTCACTGAGAAATTGTCTTTA ATTTCAGCAATCAACAATATAGTAAAAAAATGCACTCTAAAATCATCCCC ACAGGATTTTTTGAGATGGAGCAATAAAATTTCGATTGAAATTTGTATCA 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000008_pilon:88515..103386-

>XLOC_039652 ID=XLOC_039652|Name=XLOC_039652|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3900bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000008_pilon:88515..103386- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGAGAGAGCGTTTGGAGTATTACTTTTGGTTATTGGTATTTTTGTTTA
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AATTATTTGAACCCTACATTAGCCAAATCCAGGGACCCTAAAGAACTATT
ATATATTTGGGAGGAATGGAGAAAAGCGACAGGACCAAAATTAAAATCAC
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TTTGCTGACGCAGGAGATTATAAACGTAAACGTTATGAAGTGGACGATCT
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ATTACTACACACAATTCAAAATTAAGTAATGCAGCCAGTAAGGCGTATTC
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ACGTCTTCTAATGCAAGTGTGGTTGATAGTATTCTTGAAATTGGAAGCAA
CATGGAAAATATCTATAGTGAAGGCTGTATTCCCTACGATGCTACCATTA
TGAAAAGCGTTGACCCTAAAGGCAAAACATGCCTTTCATTGGATAATTAT
TTGAACCCTACATTAGCCAAATCCAGGGACCCTAAAGAACTATTATATAT
TTGGGAGGAATGGAGAAAAGCGACAGGACCAAAATTAAAATCACTTTACA
AGGAGTATGTCCGATTGAACAATATTGGTGCCCATGAAAACAAATTTGCT
GACGCAGGAGATTATAAACGTAAACGTTATGAAGTGGACGATCTTAAAGA
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ACGCTTTTGTACGACATCGTCTGGCGGAATATTACGAAGGAGAGATCGAA
GTAGATGGTCCAATTCCTGCCCACTTACTTGGTAACATGTGGGGACAATC
TTGGGAGAATGTTTTTGATATTGTTTCACCGTATAAAAATGAACCAAAAT
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CATGCCATGCATCTGCTTGGGATTTTGGAGTTCGTAATGGACCTGATAAT
GAGCCAGATGTTCGATGAACCAAAATTGGACATTACACCAGCCTTACAAA
AAGATTATGACGTCGATAAAATGTTCAAAACTGCCGAAGAATTTTTCACC
TCTATTGGATGGCAAAAGCTACCAAAACAGTTCTGGACCAAATCAATGCT
GGTCAAACCTGAAGGACGTAATGTGACATGCCATGCATCTGCTTGGGATT
TTGGAGTTCGTAATGGACCTGATAATGAGCCAGATGTTCGAGTGAAGATG
TGTACCAAAATTGACCAAGATGATTTCATTACTGTTCATCACGAGCTTGG
TCATATTTACTATGATTTGTTATACTGGAACCAATCAAATGTTTATCGTG
ATGGAGCAAACCCAGGGTTCCATGAGGCTGTAGGTGATGTCCTTGCATTG
TCTGTTCAAACACCAACACATTTGAAGAAAATTGGACTCCTTCAGAATGT
CTCCACTACTAAAGAGTGAAGATGTGTACCAAAATTGACCAAGATGATTT
CATTACTGTTCATCACGAGCTTGGTCATATTTACTATGATTTGTTATACT
GGAACCAATCAAATGTTTATCGTGATGGAGCAAACCCAGGGTTCCATGAG
GCTGTAGGTGATGTCCTTGCATTGTCTGTTCAAACACCAACACATTTGAA
GAAAATTGGACTCCTTCAGAATGTCTCCACTACTAAAGAGGCTGACATCA
ATTTCTTGCTCAAAGTTGCTATGGAGCGTATTGCATTCTTACCGTTTGGT
TATCTGATGGACCAATGGATGTGGAATGTGTACAGTGGTCAAATCAAATA
TGAAGATTACAATAAAGCTTGGTGGGAAATGAGATTGAAATACCAAGGAT
TGAAACCGCCAACCAACAGAAGTGAAAATGATTTTGATCCAGGAGCAAAG
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TGCTCAAAGTTGCTATGGAGCGTATTGCATTCTTACCGTTTGGTTATCTG
ATGGACCAATGGATGTGGAATGTGTACAGTGGTCAAATCAAATATGAAGA
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CGCCAACCAACAGAAGTGAAAATGATTTTGATCCAGGAGCAAAGTATCAC
ATTCCAGCTGACACACCGTATATCAGATATTTCTTCGCACACATTCTGCA
ATTCACTTTCCACAAATATGCTTGTGATGCAGCCAACGTTACTGTTCCTC
TTCATCAATGTTCCATCTATCAATCCAAAGAAGCTGGAAAACTCTTAGGA
TATTTCTTCGCACACATTCTGCAATTCACTTTCCACAAATATGCTTGTGA
TGCAGCCAACGTTACTGTTCCTCTTCATCAATGTTCCATCTATCAATCCA
AAGAAGCTGGAAAACTCTTAGGTGACATGCTCACAATGGGCAAGAGCAAA
CCATGGCCCATCGCTCTTGAAAAAGTGACTGGTTCACAAAAAATCGATGC
TGTTGCTATCAAGGAATATTTCAAACCTTTATCTGATTGGTTGAAAGAAC
AAAGAAAAGAGCATGGATACCCAATCGGTTGGAATGGGGGACAAGCCACT
ACATCCAAACCGGCTACGACACCAAGTCATGCTGGAAAGATTCAAGGAAG
TTTTGTGGCGATTGGACTTTCATTTTTGTCTGTAGTCTTGTTTATGATGA
ATAGAAAATAATGACATGCTCACAATGGGCAAGAGCAAACCATGGCCCAT
CGCTCTTGAAAAAGTGACTGGTTCACAAAAAATCGATGCTGTTGCTATCA
AGGAATATTTCAAACCTTTATCTGATTGGTTGAAAGAACAAAGAAAAGAG
CATGGATACCCAATCGGTTGGAATGGGGGACAAGCCACTACATCCAAACC
GGCTACGACACCAAGTCATGCTGGAAAGATTCAAGGAAGTTTTGTGGCGA
TTGGACTTTCATTTTTGTCTGTAGTCTTGTTTATGATGAATAGAAAATAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_039652XLOC_039652-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000008_pilongenomesc0000008_pilon:88515..103386 -
Properties
Property NameValue
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