XLOC_039639 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_039639
Unique NameXLOC_039639
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000023_pilon:1585596..1595166+

Legend: CDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_039639 ID=XLOC_039639|Name=XLOC_039639|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=9571bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000023_pilon:1585596..1595166+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000023_pilon:1585596..1595166+

>XLOC_039639 ID=XLOC_039639|Name=XLOC_039639|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1482bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000023_pilon:1585596..1595166+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGATTATTTGGAGCAAGAGATGAGCAAACGAAGATGGCTTCGTCAACA
AAGATTCAAAGAAGAGATGGATTATTTGGAGCAAGAGATGAGCAAACGAA
GATGGCTTCGTCAACAAAGATTCAAAGAAGAGCAACAGTACAACGATCAG
TCGTGCAACATGGCGATCAACTACCGAGTAGGGACCATCATAATCGCAGC
AATTACAATCATAGGAGCTATTTTCGACAGTGTTCAATTATTTTTCCCGG
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CAAGCATTATCGATTATTGGGAATTTATTGTCGTTAATGACGAGCTCTTG
TTTGTATTTTGTTATTTCGATTGATATTAAAACGAATGTTCAAAGGAGAC
GTTTCCTTATACCGTATACCGTGTGGGGATTTATAGTATGTATATGGCGT
TTTACGGCTTTTACGATACTCGTGCTCCGGTTCGGGAACGAAATAGACAA
CGTGACGTATGCGATGTGGCTTGGTGGAGCTATTATAATGTTTTTATTCT
CACTAGTTGAATTTTCATATTACCGGTTGCTGAGTCATGATAACGGCTCA
CGTCTGGACTCTAAATCTTTAATGTTGAAAGAAAGACCGTTCCAGCTACG
GCGATATCGGCTTGGAGTGACGGGACGTATTTACTACAATGACGATGAAG
AGGACGTTGAagcaggaaaaaagaaaaagaaaaaagagaaaaaaggtGAT
AAAGATTTTTTGAGAAGCAAAATGAAAGATATGAATGCAAACTTGTTTAT
GCCATGACAACAGTACAACGATCAGTCGTGCAACATGGCGATCAACTACC
GAGTAGGGACCATCATAATCGCAGCAATTACAATCATAGGAGCTATTTTC
GACAGTGTTCAATTATTTTTCCCGGCTAAGGGCGTAACCAAACAATTTCA
ATATCTAAACAACGTTACATTACATCAAGCATTATCGATTATTGGGAATT
TATTGTCGTTAATGACGAGCTCTTGTTTGTATTTTGTTATTTCGATTGAT
ATTAAAACGAATGTTCAAAGGAGACGTTTCCTTATACCGTATACCGTGTG
GGGATTTATAGTATGTATATGGCGTTTTACGGCTTTTACGATACTCGTGC
TCCGGTTCGGGAACGAAATAGACAACGTGACGTATGCGATGTGGCTTGGT
GGAGCTATTATAATGTTTTTATTCTCACTAGTTGAATTTTCATATTACCG
GTTGCTGAGTCATGATAACGGCTCACGTCTGGACTCTAAATCTTTAATGT
TGAAAGAAAGACCGTTCCAGCTACGGCGATATCGGCTTGGAGTGACGGGA
CGTATTTACTACAATGACGATGAAGAGGACGTTGAagcaggaaaaaagaa
aaagaaaaaagagaaaaaaggtGATAAAGATTTTTTGAGAAGCAAAATGA
AAGATATGAATGCAAACTTGTTTATGCCATGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_039639XLOC_039639-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000023_pilongenomesc0000023_pilon:1585596..1595166 +
Properties
Property NameValue
Aaloc67-741:8897
Aaloc1-66:1