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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000032_pilon:173628..181414- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_039634 ID=XLOC_039634|Name=XLOC_039634|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=7787bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000032_pilon:173628..181414- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTCCTCGATAACTTTCTTTATCACTTATATTATCTCATCACTGGTTTT
GCTCAATAATAAAGGTAATTAAAAATAATTAAAAATTTTTTTGGCATGAC
ATTTTGGCTTATTAGATTAATACTCTCAGTATTCTGTCAGGGCGGCTCGC
AAATTTCACTTCATACCAAATGCAAGCAACCTTGGTTTACAAACCCAATG
CCTAACCGCTTGCTCTAACGAAACACGACAGAAAACAGTCATTCACAAAT
ACTTATAGCGTATAATTTACAGACCTTTATTAAGAAAACTCCCAACCCTA
CCGGTGCCCCTACAAAATATATTTTTAGTTCGATAAAAGAAACACCATCT
ACCGCAAAAAAAAATTCAAAATGTTTTTTTCTTGCCGAAAAGAAGCTCTT
CAAAGTTGAAATACTCTTCTTTGCAAAAGTCTTCTTTTTCTTCCTCATCG
AATTTTTTCATTGTAATTCTTAAATTTTCAGACTCAAGGATAGTTGGCCT
AACAGTCACAGTTTTGTGTGCTACATCAAATAGAAATTTATATTTTTTAC
GTGACAAATATTTCAAGTTCACTATGGTCAGAGCCCTTAAGAAATTGTTT
TCTAATCATCCGCTAAAATAAGCTCCCGTGAAATAATTGAACAGACGTCA
ACCACGTAGCGAGCACCTCACTAAAAACCGGGATTTTTCATCTCGTTTCT
TAGTGAATTCCACTTTGACGATTTTCGAAAAATAGAAGTCTTTCAAGTGT
TTTGACGCAAATTCGATTATTTTGCTACTGCAGAAGCTTTGAAAGTTAAA
AGTGACGTAAGAAAATCTTAGAAAAATTTTAGAGCCCGAAAACCTGGGCT
CAAAACATTCGAAAAAGTCGCAAAGTGGAATAGACGTTAATTGCGTAAAA
AACGCGGGTGACGTCTAGTATAGGCTATCAACCACGATGATAAGTCCCCA
CGAAATCTAAGAATTTCATAGAAACGCCCAAAAACGAAATTTAATGCCCC
CCAGCGGTTTGCGTGAATGCGTGAATGGGCTTTTTCACTTCCGTGAATGC
GTGAAAATTAAAGAAAAACTGCGTGAATGCGAGAATTGGAAGTAATTGAC
CTTTTTTGTACCAATAGCTTTCTCATTTGGAAATCTTAATTAATAATTCT
TTCAAAGAGGCTCAGCGCCATAGATTTGTAAAGCCCGAAGAACTAGATGG
AGTGCTTTAAGCCATTCCAAGCAAAAAAGTGATATCGCAAAAAATATTGC
TGCTTTTGTTTTCGAAAACCCGCGAAGCTTCTGATTGATCAAGCACTGAA
ATTCTATATTGTAATGTCATGTGACTTAGGTAGGATTTACTACCTAACCT
CTCTACCTACCTACCGTACGCAAAAGCACGGTATCTAGCCATTTGGGCTT
TACAAATCTATGCTCAGCGCCCCAAATTTAATTGAATTCAACTGTCTTTC
TATTCGTAGCAAACCTGGTGGATGCCGAATGTACAGGTCGCTGTAAGTTG
AAATATTCTTTTCAGTTCTTTCACATTTATCTTATGCTCACTGTTACGAA
CTTGATTGTGCTGTTATAGCAAATTAATGCGTAGTTGATCGACTGGAGAA
TTGAGAATGTTCTTTCGTATTTCCTTTTTGTATAATTTTTATGCCTTCTA
GGGAACTTCGTGTTTTAGATAAAAAGCAATGTAATAAACCACAAAGCAAA
CTTCTAACACAAGAAAATAGGGTCAAAATGACTGTATAGATGCCCGTTGA
ATTTGACACCGTGAATTTTGAAGTTCTTGACTCTTTCGATGTCTTGACCG
GCACTTTTTATTTCGGTGACCAAGTAAGCAAGCGAGTGGCGTTGTGCTAG
CTGTCTGGTTGAAAATACAGTCATTTCGGTCCGACCACTAGTTAATGTTA
TCGATTTCTATATGTACGGATTCGATGGTATTCTGTAACTCTTTGATTTT
TGCGTGACGTAGTAGTTTTGTATCATCAGCGAAGAATTTTCTCAGATTTT
CTACTTTTTCCCCAAATTTTACAATAAAACACCCTACAAGGGACTGACTT
TTCTATTTTGGTATTTTTGCTACCCTACCTGGGACTAGTGGGGGTTAAAA
ATGGTATACTGACTAGTAGCGTATCCCCGTAACCCATTTTGCCCTAGTAC
CCCCTGGACTATTCTTATAAAAGAAAGTGTAGCGTATATTGGTATCCTTA
TAAAAACGACTATTATATATTAATATTATAGTGGGACTCACCAGAGTAAG
TGAAGAGAAATTCGATGTTGTGGTTGGTGACGTAATAAAACTCAAAGCAC
AATCAACACAAGGCGGATTTAGGTATCATTGGTCTGTGAATGGGCAGACG
TTAACATATGGATTAATGCGATTCTCACCTCATTATGTGAATAGTAATAC
AGCAAGAGGATCTGGTAAGTAATATATTACTAAACTTGCCGCGTAGTCCG
AGGCAACTCTAGTGGAATTAGATTTTTTCTCGTTTCGTTCGCTTTAAATA
TGCGGTCCAGCATAATAAGGAGTGAAATTAAAGACACTACGCATGAGATT
CTTCCAAGAATGGGGGTGATGACACGTAGATGGTGGGGGTACTTAGGCAA
GTGTACGGGTATGTGCCGACCATAAGGATGTCTTTTTGGAACCCTGAAGT
CCCTGTAAAGGTTGGAAAAATCAGAAAATCAATCTTCAGTCCCTGTAAAT
ATTGGAAAAATAGCCCCCCGGACAAGCATTCAAAATTACCAAACAAACCA
AAATTACTCCTAAACAGAGCAAGTTTACCCCCCGGACAAGGCAAATTTTT
GTCCCCACAGCGAGTATGGCGCATAGATATTGGACTGGAATCTCGAAATT
TTGTTGTTTTGTCGCGCAAGCATCCCCGAAGTTAGTCTCTTCCGTAAATC
TAAATGTTCGGTTTTTTTCCGGGACGGTAATATACATTTTTTCATATTAC
GTTATATGCTATTACCATTATTACATATTACTGATTTAGCTTTGAAAAGC
TGAAGCGAGTGTTATGAATGCAGATTATAACAGTGTATGATATAACACGA
ATACAATATTAGTTGTGCAAATCTAGACTAGAGACTACTTCTGGCTGAAC
TTTGCATTTTGATAATTTTTGATGACACTGAGTCCAGTGAAGTAGACTAG
GAGCATTTCGCGAGGTTGCCATTTTGAAAAAAAAATGTTTAGAATCCAAA
TAACAAAAAAGCTACTTGAAGTTGAAAAATATAATTAAGAATGAGAAACA
AACATCAATAACAGATTTTGAATCCCTTATTTTAAAATAAAAACATTGCT
TCATACTGTTTTTACCTTCCAAAAAGAACGAAAAAAAAAAGCATATCACC
ATATACTACCGGGCCACTTAATTGCACCATTCAGTCTATGAAAAAGCTTT
ATGTGGACCCCGGGCTAGTGCAAATCAAAACAAACAAAATGGCAGACTGG
TTATGATTATACATTTTGATAAATAACGAGATTGCTCACGGGAATTTCTA
ACCCGCGCGAGCAAACCCACACCTGTCAATCATTTTTTAGGCCTGTCAAT
CATTTTTTAGCAGCATATTCAGTCACTTGTGGTTCTGAAAAAGGTGTTTG
TAAGATAGCAAAAAAGAGATGAAAGTCGATTTTCATGTATTTTTTTAGTT
GAAAGTTTTGGAATACTAGATTTTCAAGAGAAGGGAAAGTCATGACTCTT
GGCTCTCTACCCACTAACCAACCTGATCCATTTTGAAATACAGTACTTGA
TGACAAACTCAAACTGAATAGGTGACACTACTTAGAAAGAAAATTTTTGT
TTCTTAAAATTCTAACCGGAATTTTCAAAAATATCAATAAGAGCTCATAA
AACCAGAAAAAGGTTTGTCGTCAATGCTGACAAAATAACACATACTACAA
CACACCGTTTAGGATTCGAACTCTCAAAAATGTTTCCTTGTCAGATGGCA
GATTAGCGCCTTATCTAGTCTGAATCGCAGACCTCTACAAAACCCCATGT
AGTATAAGGAGCACGAATCCGTTAGTGGATGCCAGCAGCCTACGCCTTAT
CCACTCAGCCACGGACACGATAATCAATGGGCAACAATTCCATATCTTTA
TTTGCCATGACCTGTATAATTTTACGCTGTCAAGGTATTAATTTCTTAAA
GAAATAATTTTAGATTAAGATTATTTCTAATATACAAGAGCCGATCAATG
GGCGATCAATCATCGCGATTTTCATCCACTCTTTAGTTGAAGAGTGACTC
TTATTCCAATTCAGTAAGGGGACTCAGTAAGGGGACTCAGCAAAAGGGCT
GTAAACCCTGCTAGTGTCTATGCAATTAGAAATTTCCATCTGGGGGGTTA
GGACACTCTCCAATCTCCTTTAAAGTCTCAAAAGACTAAAAAGAGGAGCT
TTGTTCTTGCATACAGTACCCATACAGCAGACAGAGCGCACACGCGCGGA
CGATTAAATACGATCGCGCGGGATGCAGGTCAAAAAATTCCTGTGAGCAA
TCTCGTTATTTATCATAAAGTATGATTGTTAGCTGATTCATTGACTGGAA
AAAGTGTTTTGTACAACAGCTTAAAACAGATAGTTAGAAAGACAATAACA
ACAAGCAACATGCTGAATGGACCTACCTGATGAAGAGAATCAGATAAAAA
TAGGATAAATAGCATGAGAGTAAAAATATTTAGTGGGCAGCTTGAATAGA
TTACCGTAAGTGAAGTATAGTTAAAGATTGTTACTATAAATAACGAGGAA
CAAGAAGTAAAACAAGAAGTAACGAGAAGTAATGAGAAGTGACAAGAAGT
AACACGAAGTAACGAGTATGTAACGAGTAGATAACGAGAAGTAACGAGTC
CTTAAATGGAAGTAACGAGTGCCCAATCTAAGTAACGAGTACTTTAGTCA
AGAAAATGACGCTCCATACCAGTTAATTGTTTTAAGATTGATGACGTCAT
TTCTAGATTTTTTTCAGGCACCTATATCTCGTGATTGGCTTGTCTGTTTC
CTTTCAAATTTGGCATGTGACGCCTTGACAATAATGCCTTGAAATTAATC
TAATTAGATTTTGTCAATTTTGGCGATGACGTCATGATTTCGGCGTTACT
TCTCGTTACTTCTTGTTACTTCTCGTTACCTACTCGTTACCCACTCGTTA
CTTCTTGTTGCTTCTCGTTACTTCTCGTTACTTCTCGTTACTTCTCGTTA
CTTCTTGTTCCTTGTTATAGTAACAACCATAGTTACAGTCGTATGGCGTG
AATAAATATTTTAGCGTGATTCCAGAAAACCCCATTTTTAGGAACTTTTT
GGCTCAAATTTTTTTATGATTATCTGCTTAAACCAACTTTTAACCTATGA
TGGTACCCCACTTTCATGCATAAAAAGAGAAAATGATCCAATTAATGATC
CAATTTTTCACAAAGTCCACAAAAAACCTATTTTTAGCCATTTGGCTGAA
ATTTACTCATTAAATTTTTTTTTCGAAATTCGGACTCCGTAACATTTTGG
CCGCCACCATTTTGCACCTTTGTATCAAAAATCAAAAGATTCCTATGATT
CAATACTGAGAAAAGTTCGTTGGTAACAGACGAAAGGTTGATTTATAGGA
CCTCCAGGTGGTCCGACAAGTTAAGAAAATGGACAAAATTTATTTTATAA
TTTAATTTATTTTAAGGCTTAAAACTCAAAAAGTTAAGAACATGCCAAGA
TTTTTCAAATAAAAAACTTGTAACGCATACCACAAAAACCTTTTTTAATT
CATTTACATTTTAGCATTGGAAATTCGGGACATTCAACGGAGACATGGTG
GAATATACAAACTTAAATTTGTAGACTATTCAAACAATTGCCAAATCATT
GATTTCAAAGTTACAGTGTCAGGTAAAAAAAAGAATTTCTTTCTATTTTC
AAACGAACATTAGGATTCCTTTACGTTCCTTTAATTAAACACTGTTCTCT
CGCTACTCAACGCCTATAATCTTGAGCTAACGAAAATCTCAGAATGAGCT
TCAAAAGAATCATGATAAAATCAATTTTGCATCAAACGTTCTAACTAACA
CTCGAGGGCTCAAATCAGGCGAATGTTTTTCGGATTATAAAAAGATTCGA
ATAATAGAAATTCAAATAAAATCGAGAGTCTATAGACCTTTTCATAAATT
ACGACACGAACATCACTTGCCTCGTTTTCGAACAATTACTATGGTGATTA
TGTCCCTTGAGACATTAAATGGTTTTTTTATGAAAAAAATGTAGTTTCAA
TAAAATCCTGCTGGGAGTTGATCACCATGACAATATTTTCAAAACGAGGC
AAGTGATGTTCGTGACGTAATTTATGAAAAGGTATATTTTAGCATCTAAA
ATCTTAACAGTAAAATAAACTCTATTTGATGCTCTATCTAAAACAAGAAC
CAACGACAACCACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACT
ATACCTACTACAGAAAGAAGATATGAAAACGAGTTTACCCCGAAGCCCAA
TATCGAACCAGTGGTTGGTTTAAAAAAGGAAGAATCGGACCCGGTTACCG
CATTTATTACATTGATAGTCGGCTGTTTCTTAGCTAGTACATTGATATCA
TCGGCTGTTCTTGTGATTGCTTATAAAAGAGCACTAGCTCGCCGCACGAT
GCAGTAAGTGCTTTACTCTATCTTGTTATATCACCTCGTCAAAGGAATAA
AACGAATGTTCCTTAAAGGTCGGGTACCCCAAATGGGGTACTTATTGGGG
TACCCATTTAATTTACAGACCAAAATTAAATAACCAAAAATCGGCAACGG
CATTTAGTCAAATTAGTCCCAATAAGGGTCGTAAAATTCACAAAATTACC
CTTTTCTGTTCCTTTTTGATCCGACTAAGGGTCTGAGAGTCGAAAGTTGG
GCAGTACCCTCCCCCCCCGTCATCCTATAAATCTAGTACTAAAAAAAATT
GGAAAAAATCTCTTGGGAAATTTATTTTCATACCTTAAAGTGACGGTGGA
CTAACTAAAATCAGTCTTTTACCCCTTGGAAATTTGAAAATAATTTTTTA
CCCCCTGGAAAACAAAAAAATACTCTTTTAGACCCCCTGGAATTCATGCT
CAATTAACCACCTGGAAATGCTCGTTCACCCCCTGTATGGACATAAAATG
GAATGGCCCAATTTTAAGCATAATGGGGAGAAACATTTTTATAGCTGGTA
ATTTGATAGCTAGTAATTACCTTAAGTGGATTAGATTTTGCGGGGATTAA
ATTTGGCGAATTTGGTGAATTAAAATCCGACCATTCGCAAAATTAAATCT
CCGCCAAGTTTAACAAAAAGAACATTATAGTATGTGAAAAAATCACAACT
TTGTAGTATATTTCATAGTAAATGTCACTCATTTCAGTGTCTCGAAATTT
CCAATTCGCCAAATTTTAAAATCCCCGCCAAAAATCGTATTTTGGCCAAT
CACTAAATTAAATCCTCACCAAAATTAATCCACTTAAGGTATTTTCAAAG
AATTAATAAACTAGGGATTGGGGTCTTAACAAGGTCCGGGGGTCGGAAGA
AAAATGAAAAATTAACAAGCGGCGTGAGTGCTTATATTAGGCACCTGAGA
GCACACTGCAGACAATTCTTTTTAAAATTTCATTTCCAGGAGATTATCGA
CATCTTCAATACAAAAGGATTCTTACAAGGATGATGACGATGATGAAAGT
GACGTAGAAAGTCGCAAAACAGGATCTGACAAAGTGCGAAGACATAAAAA
AAGAAAAGAGGATAGACGATACTCCGATGATGAATGA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000032_pilon:173628..181414- >XLOC_039634 ID=XLOC_039634|Name=XLOC_039634|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1590bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000032_pilon:173628..181414- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTCCTCGATAACTTTCTTTATCACTTATATTATCTCATCACTGGTTTT
GCTCAATAATAAAGATGTCCTCGATAACTTTCTTTATCACTTATATTATC
TCATCACTGGTTTTGCTCAATAATAAAGCAAACCTGGTGGATGCCGAATG
TACAGGTCGCTCAAACCTGGTGGATGCCGAATGTACAGGTCGCTTGGGAC
TCACCAGAGTAAGTGAAGAGAAATTCGATGTTGTGGTTGGTGACGTAATA
AAACTCAAAGCACAATCAACACAAGGCGGATTTAGGTATCATTGGTCTGT
GAATGGGCAGACGTTAACATATGGATTAATGCGATTCTCACCTCATTATG
TGAATAGTAATACAGCAAGAGGATCTGTGGGACTCACCAGAGTAAGTGAA
GAGAAATTCGATGTTGTGGTTGGTGACGTAATAAAACTCAAAGCACAATC
AACACAAGGCGGATTTAGGTATCATTGGTCTGTGAATGGGCAGACGTTAA
CATATGGATTAATGCGATTCTCACCTCATTATGTGAATAGTAATACAGCA
AGAGGATCTGCATTGGAAATTCGGGACATTCAACGGAGACATGGTGGAAT
ATACAAACTTAAATTTGTAGACTATTCAAACAATTGCCAAATCATTGATT
TCAAAGTTACAGTGTCAGCATTGGAAATTCGGGACATTCAACGGAGACAT
GGTGGAATATACAAACTTAAATTTGTAGACTATTCAAACAATTGCCAAAT
CATTGATTTCAAAGTTACAGTGTCAGAAGAACCAACGACAACCACAACAA
CAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACTATACCTACTACAGAAAGA
AGATATGAAAACGAGTTTACCCCGAAGCCCAATATCGAACCAGTGGTTGG
TTTAAAAAAGGAAGAATCGGACCCGGTTACCGCATTTATTACATTGATAG
TCGGCTGTTTCTTAGCTAGTACATTGATATCATCGGCTGTTCTTGTGATT
GCTTATAAAAGAGCACTAGCTCGCCGCACGATGCAAAGAACCAACGACAA
CCACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACTATACCTACT
ACAGAAAGAAGATATGAAAACGAGTTTACCCCGAAGCCCAATATCGAACC
AGTGGTTGGTTTAAAAAAGGAAGAATCGGACCCGGTTACCGCATTTATTA
CATTGATAGTCGGCTGTTTCTTAGCTAGTACATTGATATCATCGGCTGTT
CTTGTGATTGCTTATAAAAGAGCACTAGCTCGCCGCACGATGCAGAGATT
ATCGACATCTTCAATACAAAAGGATTCTTACAAGGATGATGACGATGATG
AAAGTGACGTAGAAAGTCGCAAAACAGGATCTGACAAAGTGCGAAGACAT
AAAAAAAGAAAAGAGGATAGACGATACTCCGATGATGAATGAGAGATTAT
CGACATCTTCAATACAAAAGGATTCTTACAAGGATGATGACGATGATGAA
AGTGACGTAGAAAGTCGCAAAACAGGATCTGACAAAGTGCGAAGACATAA
AAAAAGAAAAGAGGATAGACGATACTCCGATGATGAATGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000032_pilon | genome | sc0000032_pilon:173628..181414 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 649-795:148 |
| Aaloc | 391-645:1392 |
| Aaloc | 283-387:2022 |
| Aaloc | 100-279:5555 |
| Aaloc | 67-96:6327 |
| Aaloc | 1-63:7788 |
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