XLOC_039598 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_039598
Unique NameXLOC_039598
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000001_pilon:1737027..1749772-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
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AATTTATTTCTAACTTTATTTCTCTAACTTTTTTTTTGCAGATATTACTG GGACTTGATCATCATGCTTGTATTGTTATTCAACATGCTTGTCCTACCTC TCAACGTTGCTTTTTTCTCAGAAAGTAACACCTCATTCGTTACTTGGATC GTGGTACATACTTTTTCGGACATTGTTTTCATGCTGGATATTGTATTCAA TTTTCGGACAGGCTATAGAAAAGATGAACCAGGACATTTTATTAGTTTTG TATTGCAACCGAAAAAAATTGCTAAAAAGTAAGTTTTTTTTTCATTTTCA CTTTAGTAACATTTTTATATTTTTGGGTACACGTTTTTTCTTTTAAGAAA CACACTTTTAAGAAACATGAGGCTCAAAATGCCAAAAAACTAAGAAACAT CTAAGAAACATGCTGAGGCTGAGAATGAGAAAATAATATTTTTTAACTCG GTTTTTTTAGAACCTTCTAATCTTTGCATGAAAAATAGGCTGATTATGTC AAAAAATTTAGAAACATGTAAGAAACATTTAAGGCTCAAAAGGCCGATTT CTTAAGAAACATTGAGGCTGCTTGGTAAAACTAGTTTCTTAAAAAAAAAA ACGTGTATTTTAGCGTTTAGCAGAAACAGGCAAGTATGATATTTTCAGGC TTTCAACTTTATTTAATTGGATTTCTCGATTCGGGAGGGGTATAATGGCT TCCAGGCTATATTCACAGTCTAGTCGGACAAATCACAAGCTTTTAGGATC TTCAAATCCTAAGTCCCTAAGCTAAATTCAATTAAAACTCTAATTTCCTA CCTTAGAGTTAACACACGGTCAACAACTACTTGCAGCTTGGAAAATTTTC CTGAAAAATTTACTTTGTCCCAAAAATTACGGCCAACATTGTAGGTCGAT AAGTGACGCAAAATCTTGTCGTGTTCCCTGTAATCTTATTCGATCCTATA 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TGGTCCTGATTTTATAACTCAAGTTACAAATAGTCTGACGTTTGATGTTT ACTTGGCGGGTGACATCATTATTAAGGAAGGAACTTTCGGTGACGAAATG TTCTTCATACGTAACGGAAGCGTTGACGTCATCGCGAGCGGACAATACGT CACCACGTTGGTAGAAGGAGATTACTTCGGAGGTAAAAAGTCTAATTATC TTTTTTTACGAGAACAATTTAGTCTCAAAATACCAAAAAATAAGAATAAT TTAAGAATAATTCTAAATCTGGAATTGCTAAATCTTGAAAAAATAAAGGG TCAAATCAGTGAGAAAGAATCTAAAATACCTGGATTCTACTACTTGAAGT TAATAAGAATACAATTTGAGGCTCAAAATACCAAACCAATTAAGAACAAA AGAACCTAAACAAAATTTTACTGGCTCTTAAAAACAACTACATTTCATCG TCTTCATGCTTAACATCGCGTTTGTTGAAAACTATCATATTCGTGACATT TTCCATTTTAGAAATTACAATGCTAACAAGTGCCCGTCGCGTAGCAACCA TTACAGCCGTTACCGTTTGCGATCTGTTCATTTTAACGGCCGATAATTTG AACAAGACACTTGAGGAGTTTCCTGAAATGCGAGCCGTTATGGAAAAAGT GGCACTCAATCGATTATTGCGATTGCGCGAAAAGGTATTTCTCAGTTTGC TTTATGTTACCTTCTTAAGCCAGTATTATCTATTGATTATAAATTCCCTG GTACAGTAGACTCTGGCTTAGTCGAACTTCTATTATTCGTATCTTTATAT AATTCGAACTAATTCACAGTCCCCGTCAAGGAGAAACCCTCTTGAAATAC CTTCTACAGTTCGAACCTCTCTGTATTTCGAACAAATATCATTCCCCGTT CCAGTTCGAATTAGTGATAGTCAACTGTATATATATAAATAAAGTTTATT 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000001_pilon:1737027..1749772-

>XLOC_039598 ID=XLOC_039598|Name=XLOC_039598|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=4308bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000001_pilon:1737027..1749772- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTCTAACGCTAACCGCTACAATGTAAACGACGCCAGCGAACCGCCAAC
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GTTGCTTTTTTCTCAGAAAGTAACACCTCATTCGTTACTTGGATCGTGGT
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TGTATTGTTATTCAACATGCTTGTCCTACCTCTCAACGTTGCTTTTTTCT
CAGAAAGTAACACCTCATTCGTTACTTGGATCGTGGTACATACTTTTTCG
GACATTGTTTTCATGCTGGATATTGTATTCAATTTTCGGACAGGCTATAG
AAAAGATGAACCAGGACATTTTATTAGTTTTGTATTGCAACCGAAAAAAA
TTGCTAAAAACTATTTTAAATCGTGGTTTTTGATTGATTTAATTAGTTCG
TTTCCCTTCGACAATATCATTCTCTTGATCTCTGGAGGAAATACGGATAG
TTATGGTCTAGGCGTTAAAAGTGCATTTCGTGGATTCAAATTTTTGCGCT
TAGTCAAACTTTTGAGTTTGTTGAAATTATTGAGATTGTCAAGAGTAATG
AGATACGTCTCAAAATATGAGGATCTATTTTAAATCGTGGTTTTTGATTG
ATTTAATTAGTTCGTTTCCCTTCGACAATATCATTCTCTTGATCTCTGGA
GGAAATACGGATAGTTATGGTCTAGGCGTTAAAAGTGCATTTCGTGGATT
CAAATTTTTGCGCTTAGTCAAACTTTTGAGTTTGTTGAAATTATTGAGAT
TGTCAAGAGTAATGAGATACGTCTCAAAATATGAGGATTTTTACAATTTG
ACAGCATCAGTAATTCGTTATATCAAGCTAGTATGTATGATGTTAATGGT
TGCCCACTGGAATGGTTGCCTTGGTTTCTTAGTACCCATGCTTCAAGATT
TTCCAGTTGATTCATGGGTAGCATTGAACAATTTACAGTTTTACAATTTG
ACAGCATCAGTAATTCGTTATATCAAGCTAGTATGTATGATGTTAATGGT
TGCCCACTGGAATGGTTGCCTTGGTTTCTTAGTACCCATGCTTCAAGATT
TTCCAGTTGATTCATGGGTAGCATTGAACAATTTACAGGAAGCACATTGG
ACTGAGCAATACGGATGGGCGCTATTTAAGGCGTTATCCCATATGCTTTG
TATTGGGTATGGGCGTTTTATACCACGCCTTTTATCCGAAGCATGTATTA
CAATATTCAGTATGGTGACAGGAGCAACCTTTTACGCCCTTTTTATCGCC
CATTCTATGGCTTATATTCAACAACGCGATTCAGCTCGAAGATTGTATTC
TGAAAAGGAAGCACATTGGACTGAGCAATACGGATGGGCGCTATTTAAGG
CGTTATCCCATATGCTTTGTATTGGGTATGGGCGTTTTATACCACGCCTT
TTATCCGAAGCATGTATTACAATATTCAGTATGGTGACAGGAGCAACCTT
TTACGCCCTTTTTATCGCCCATTCTATGGCTTATATTCAACAACGCGATT
CAGCTCGAAGATTGTATTCTGAAAAGTTTCAACAAATTGAAGAATATATG
CGATACCGTGATTTGCCGCAAAACGTGCGCGAAAAGATTACAGATTATTA
TGAACATAAATACAGTCAGAAGAGACTTTTTAACGAATTGGAAATCTTAA
GCGAAGTCTCCAAGCCTCTTCGTGACTTTCAACAAATTGAAGAATATATG
CGATACCGTGATTTGCCGCAAAACGTGCGCGAAAAGATTACAGATTATTA
TGAACATAAATACAGTCAGAAGAGACTTTTTAACGAATTGGAAATCTTAA
GCGAAGTCTCCAAGCCTCTTCGTGACGATATTGTTAACCATAATTGTCGA
GATCTGATCGAATGCGTTCCATTCTTACGGGAAGGTGGTCCTGATTTTAT
AACTCAAGTTACAAATAGTCTGACGTTTGATGTTTACTTGGCGGGTGACA
TCATTATTAAGGAAGGAACTTTCGGTGACGAAATGTTCTTCATACGTAAC
GGAAGCGTTGACGTCATCGCGAGCGGACAATACGTCACCACGTTGGTAGA
AGGAGATTACTTCGGAGGATATTGTTAACCATAATTGTCGAGATCTGATC
GAATGCGTTCCATTCTTACGGGAAGGTGGTCCTGATTTTATAACTCAAGT
TACAAATAGTCTGACGTTTGATGTTTACTTGGCGGGTGACATCATTATTA
AGGAAGGAACTTTCGGTGACGAAATGTTCTTCATACGTAACGGAAGCGTT
GACGTCATCGCGAGCGGACAATACGTCACCACGTTGGTAGAAGGAGATTA
CTTCGGAGAAATTACAATGCTAACAAGTGCCCGTCGCGTAGCAACCATTA
CAGCCGTTACCGTTTGCGATCTGTTCATTTTAACGGCCGATAATTTGAAC
AAGACACTTGAGGAGTTTCCTGAAATGCGAGCCGTTATGGAAAAAGTGGC
ACTCAATCGATTATTGCGATTGCGCGAAAAGAAATTACAATGCTAACAAG
TGCCCGTCGCGTAGCAACCATTACAGCCGTTACCGTTTGCGATCTGTTCA
TTTTAACGGCCGATAATTTGAACAAGACACTTGAGGAGTTTCCTGAAATG
CGAGCCGTTATGGAAAAAGTGGCACTCAATCGATTATTGCGATTGCGCGA
AAAGCTACCCGAGTGTACCAACACACATTCAGCGACTGTCGATTTAAAAA
AGAAGCCTCGGTTCGAGTCTGCTTCATCATGCACAACACGTAACATGTCT
ACCATTATTAACGAAGCAACAGACATTATCTCAAAATCAACAACAAACAT
TGCTAACCCAAAAAATAACCAAGTCTCTCCGGCGCCACATAACTTCCCGG
CCGTACCGACGATTAATGTATCCGGATCAAATGGGAATATTGCCGTAAAC
AAAGATACTCCGGATAAGCAGGAAACCGGAGAATTAAGTAATACGGAATC
GAGCAAGAAGGATCCGCACGTTGTTGTGTAACTACCCGAGTGTACCAACA
CACATTCAGCGACTGTCGATTTAAAAAAGAAGCCTCGGTTCGAGTCTGCT
TCATCATGCACAACACGTAACATGTCTACCATTATTAACGAAGCAACAGA
CATTATCTCAAAATCAACAACAAACATTGCTAACCCAAAAAATAACCAAG
TCTCTCCGGCGCCACATAACTTCCCGGCCGTACCGACGATTAATGTATCC
GGATCAAATGGGAATATTGCCGTAAACAAAGATACTCCGGATAAGCAGGA
AACCGGAGAATTAAGTAATACGGAATCGAGCAAGAAGGATCCGCACGTTG
TTGTGTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_039598XLOC_039598-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
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Properties
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