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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000112_pilon:456955..464852- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_039520 ID=XLOC_039520|Name=XLOC_039520|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=7898bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000112_pilon:456955..464852- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CGGGAATGCAAAGACCTTTTGAACGCATACCGATGTACATTGATGCAGAA
CCATGACGCGTGTACCAAAAGACGTTTCCTTGTCAGAATCTTCTGTAGAA
AGCACTGTGGAGTTTGTGGTAAATATGTTCGCTTTATTTTGTAAGCATGC
GGAAATTCAGTAGAAAATATCCAAAATATTCTTATAACCCTATGCCTGAA
ACTTGAACAATATAATTCCCTTGATTTATACCTCAAGTGAGGAAAACCAT
TGAAAATGGTAATTTCAAAGGAACACTGATTCTTTTCCGTCTGCCTGGTC
ATCAAAATAATTTATGCAGTCCTGCAGCCAAACAATTAACGTGTGGCAAA
AATTTGTTTTGGAACTACTAACAGAGAACTTAAAACAGGGCGTCTTAATT
ACATGTGAGCTCCAGTTCAGAAAAGCCCCGTCTGTGCATAGCACTACTTC
GTCACATATCCTTACTTCGTCTCCTATTGTTATTTTCTCTTTTACGTCAT
AATATATGCATGAATAATCGCATAAATTATTTCTGATTGATCTTGAGATT
AGAGGTGGTTTCTACTTGCTTTTTTTTATTGTATTGTTCTGTAACACCTT
TATAGCTGTTGAAATTGAACAAAAAAAATTGTTCTTTCATTCTTTCATGT
GAAGGTGTTAATAAACAAATGATACAAGAAATAGTCTATGGTTGATCTCT
CTTTTTTTTAAAGGTGTTAACAAGCAAACTAATAAAGTGAATGGATGATC
GCTTTCTTGTTCCGTCTAGCAAAAAGTAATACAAAAGGTTACAAAAGGTT
GAAATCTCAATGTCTGAACCCTTTTTTTATCAAAAACTTTGTAAAGAACA
TACTGTATACGGTTTCTAAGAAGCGGCACTAAAAAAACTAATAAAATAGG
AATCGAATTTGAAATTATTTTTCAAATAATTTTAGATAAATTAGTTTTCA
CATTGATCTATCTGTGGAAGTTTTAAAAATCGAAATTTTTTCAGCTTGTT
TCTTTCGTATCTCTAAAAGTAATGATAAAGTCTCCTTATAACAAGTCAAA
ATGTAGAAGAAAGAAGTTTTTTGATACATACATCAACCAGGTCACAAGTT
CTGGGACACTTTCGTTTTCGACAGATCACTCTATCCTATCCTGATCACGG
CTGGGATCCCTTAAATTCGGTCTTACCGGTTAAAGATCGCCGTAAAAATT
TTAATAATATTTTTAGGGTTAAGATTCAAAAGAAAGAACACCCTAAAGCT
TTAAAAAAATTGAATGTTTTTAAAAAATCTCAATAGAAACAGGTATATCT
TATTCTGTCTTGTCGGGCGTTTCGGCCGCAAAAGTGCAAGGTAGCAACTC
CTCTGCACCTGAACTTTCAATATATCGTAAAATTCTTTAAATATCGAAGA
AATTTTTGGACGAATAATGGAAGTGAGGAGAGCTTTTAATGAAAGATATG
ATTAAGTAACATTTGATGGGGTTTTATGCGAAAAATATCTGAATGTTTAA
GGAGTAAAGAGTTGCGACCAAGTAGTGTTTGGTGTTTTTGGTCCAAACTA
TGAACATTTCTAATGAGAAAAAAGGCGTAACGAAGTAGTATTAGGTGTTT
GAGGTCCAAATTAAGAAAAATTCTTTCGAGTAAAGCAGCGTGACCAAGTA
GTGTTTAGTGTTTATGATCCAAATATCCAAATTAGGAATATTTTTAATGA
GTAAAAAGTAGCGACCAAATTATGAACTTTTCTTATGAAGAAAAAAATGT
GACCAAGTAGTGTTTGGTGTTTTTGTGTGAAAGTATGATCATTTCTAATG
GGTAAAAAGGCGTGACCAAGTAGTGTTTGGTCTTTTGGTGCAAACTATGA
GCATTTTTAAGGATGAAAAAAATGTGATCAATTAGTGTTTGGAGTTTTCG
GTCCAAACTAGGAATATTTCTTATGAGTAAAATGGCGTGACCAAGTAGTG
TTTTGGTGTTTGGATGCAAGTATGATCATTTCTAATGGGTAAAAAGACGT
GACCAAGTAGTGTTTGGTGTTTTTGTTCCAAGTTATTAAAATTTCTAGTG
AATGGAAAAACGTGACCAAGTAGTGTTTGGTCTTTTGGTGCAAACTATGA
GCATTTTTAAGGATAAAAAAAATGTGATCAATTAGTGTTTGGAATTTTTG
GTCCAAATTAGGAATATTTCTTATGAGTAAAATGGCGTGACCAAGTACTG
TTTTGGTGTTTGGATGCAAGTATGATTAATTTCTAAGGGGTAAAAAGACG
TGACCAAGTAGTGTTTGGTGTTTTTGTTCCAAGTTATTAACATTTCTAGT
GAATGGAAAAACGTGACCAAGTAGTGTTTGGTCTTTTGGTGAAAACTATA
AGCATTTTTAAGGATAAAAAAAATGTGATCAATTAGTGTTTGGAGTTTTC
GGTCCAAATTAGGAATATTTCTTATGATTAAAATGGCGTGACCAAGTAGT
GTTTTGGTGTTTGGATGCAAGTATGATCATTTCTAATGAGTAAAAAGGCG
TGACCGAGTAGTGTTTGTTAGTTAAAACTATGAACATTCTTAATGGGTAA
AAAATTGACCGAAAACGTTTTTTATTTGTGCAATTTGTAAAGTTTCTTGA
GTTAAAATATGTGAAATACCTACCATATACCTAAATTACATTTCTTTAAC
TGACCAATCAAATCACTAATATATATGTAATATTTTGAAGAGTGAGTGCA
CGATGAACAATCGTGATTGAATATCTAAAGAAATGTCTCGAAGAAACCAT
AATACGCATGCGCAGGTGCTCTACACATTGTCAGAAAAAAACTTCTGAAG
CAAATGGCTTTTTTTCGTGACGAAATAAAACAAGAAAGTATGAGAAGAAA
AAGCAAAATTATTATTTTTTACGTTTTTATTCTGCTTTTTGGAAATGTAA
TCAAAACCGAGAACCGTCTTATAGAATACGGCTATAGAAGACGAAGATTA
TGAATTATTCGTCAATATAATTCAAAATGATGGTCAGAATATGGTGAAAG
GAAGGGAGCGCACAAACCAGGACAAAAAAGTGGCACGGTTATATTTATCA
GGGAATTTGGACATCGAGCTTACATATAATCCTATAAAAGAAGATGACGA
AGAGATGTTGGTAAGTATTTTTTTAAACTCCGTTGTAAAATTATTTTGAT
AATTATTCTGGTTTGACATTAATTAAAAGCAAAATGTTGATGTGTGGTCA
AAAAAATGTATCCTTACTTGGTCATGACGATGCATTGCGTAAGAGTTCTT
TAAAAATTTCGCAAAAATTTATATTCCCACTAAATGGTCACGTGATTTAA
AAGTTAGATTTTGCAGATCAGTCAAAAAGATTTATCCTTACTTGGTCACA
TGACTTGAAAGTTAGATTTTGCAGATCAGTCAAAAACAATTTATCCTTAC
TTGGTCACATGACTTGAAAATTAGATTTCGCAGATCAGGCAAAAAAATTT
ATCCTTAATTGGTCACATGACTTGAAAGTTAGATTTTAGATTTTTCAGAT
CAGTCAAAAAAAATGTATCCTTACTTGGTCACATGACTTGAAAGTTAGAT
TTCGCAGATCAGGCAAAAATAATTTATCCTTACTTGGTCACATGACTTGA
AAGTTAGATTTTGCAGATCAGTCAAAAAAAATTTATCCTTACTTGGTCAC
ATGACTTGAAAGTTAGATTTTGCAGATCAGTCAAAATAAATTATCCTTAC
TTGGTCACATGACTTGAAAGTTAGATTTTGCAGATCAGTCAAAAAAATTT
ATCCTTACTTGGTCACATGACTTGAAAGTTAGATTTGCAGATCAGTCAAA
AAATTTATCCTCACTTGGTCACATGACTTGAAAGTTAGATTTCGCAGATC
AGGCAAAAAAATTTATCCTTACTTGGTCACATGACTTGAAAGTTAGATTT
TGCAGATCAGTCAAAAAAATTTATCCTTACTTGGTCACATGACTTGAAAG
TTAGATTTTGCAGATCAGTCAAAAAAAATTTATCCTTACTTGGTCACATG
ACTTGAAAGTTAGATTTTGCAGATCAGTCAAAAAAATTTATCCTTACTTG
GCCACATGACTTGAAAGTTAGATTTTGCAGGTCAGTCAAAAAATTTATCC
TTACTTGGTCACATGACTTGAAAGTTAGATTTTGCAGATCAGTCAAAAAA
AAAATATCCTTACTTGGTCACATGACTTGAAAGTAAGATTTCGCAGATCA
GGCAAAAAAATTTATCCTTACTTGGTCACACGACTTGAAAGTTAGATTTT
GCAGATCAGTCAAAAAGATTTATCCTTACTTGGTCACATGACTTGAAAGT
TAGATTTTGCAGATCAGTCAAAAAAAAATTATCCTTACTTGGTCACATGA
CTTGAAAGTTAGATTTTGCAGATCAGTCAAAAACAATTTATCCTTACTTG
GTCACATGACTTGAAAGTTAGATTTCGCAGATCAGGCAAAAAAATTTATC
CTTAATTGGTCACATGACTTGAAAGTTAGATTTTTCAGATCAGTCAAAAA
AAATTTATCCTTACTTGGTCACATGACTTGAAAGTTAGATTTTGCAGATC
AGTCAAATAAATTTATCCTTACTTGGTCACATGACTTGAAAGTTAGATTT
TGCAGATCAGTCAAAAATAATTTATCTTCACTTGGTCACATGACTTGAAA
GTTAGATTTCGCAAATCAGGCAAAAAAATTTATCCTTACTTGGTCACATG
ACTTGAAAGTTAGATTTTGCAGATCAGTCAAAAAGATTTATCCTTACTTG
GTCACATGACTTGAAGTTAGATTTTGCAGATCAGTCAAAAAAATTTATCC
TTACTTGGCCACATGACTTGAAAGTTAGATTTTGCAGGTCAGTCAAAAAC
AATTTATCCTTACTTGGTCACATGACTTGAAAATTAGATTTCGCAGATCA
GGCAAAAAAATTTATCCTTAATTGGTCACATGACTTGAAAGTTAGATTTT
TCAGATCAGTCAAAAAAAATTTATCCTTACTTGGTCACATGACTTGAAAG
TTAGATTTTGCAGATCAGTCAAAAATGATTTATCCTTACTTGGTCACATG
ACTTGAAAGTTAGATTTCGCAGTTATATTCCCACTACAAGGTCACGTGAT
TTAAAAGTTAAATTTTACAGATCAGTCAAAAAGATAATCCTTACTTTTTC
ACATGACTTGAAAGTTAGATTTTGCAGATCAGGCAAAAAAATTTATCCTT
ACTTGGTCACATGGTCAAAATATGTTTTTCATTTACCTCTTCGCCTATCA
TTTTCACACCTAACGACGTAATTGCTTTATGTATTCTAGAAAAATATATC
TGTCAATCAATTTGCCATATTTTATTCAAAGATATCTGTCAATCAACTTA
TTAGCTTGCATAATAGCATATGTTACGTCATGTTGTTTAAATGATTAACA
ATAATCTAGTAGAAACCATGTATATTTAGCTGTTTAATTTTTAAGCATAC
ATTATGACGTAGAAAAGAAAATAACAATAGGAGACGAAGTAAGGATATGT
GACGAAGTAGTGCTATGCACACCCGTCCAATACACCTTTCCCGTAATTCG
TAAAACTAATGCGCGTGCATTATTTTGATGCTCTCCACCGTTTGGGCTCT
GGAGGTAATCAAACCCGTTTTTGCCTACGTTTCCTCAGGGATAGTTGGTT
TTTTGAGCTTTTCTTAAGTTCTGTCGAACAAAATCCCCTCAAATTTCATG
ATATTATACCACCCTTAAAATCTTTTGCCAAAAGAAGATCGCTATCAAAA
GTTAGAAACTGAAAACCCACTTTCCCTAACCCCTCGCTGGCAAAAACGCA
TTCGTTTACCTCCCAAACAATTTTATACACAACGGTGGAGCGCACATTTT
CCCGGGCCATTTCTGAGAAGTTTGAATTACGGGAAAGGTGTGTTAGCTTA
AAATAAACGCGTTGACCCGTTGACATAGGCATCTTTGGTGAGAAACATGT
TGGCCCCTATCGGGTAAATAAGAAATATTGACGACGCTGTATCCTGAATT
CTTTACTGTTCAGGTGATGTTAAATGCCGCTCAACACGGTACGGATGTTG
CCACGATGGGAAGACACCTGCTAAAGGACCTTACTTTCAAGGCTGTAAAG
GTAAGAAACTTTTCTATTCTCCTCAATGCTATTCTCAATGAGGAAGACAT
TTCCGTCATTGGTCCTTAAGAGTTAGAATATTGCTACTCAAAGCCATCTT
CAAATACCTAATTTTATAGCTAAAGACTATCGCTCCATTGGTATTCGAAT
GAAAATTTACAATAATACCGCTGAGGGCTAGAGCTCGATCAGAGCACTAG
ATGCAGGAGAAAGCTAAAAGTATTAAAAGAAGCATCGAGCTCCTTCCCAA
GTCCATTCACTTTACCCTTAGATTATATTTAGACTAACTATTCAATTCCT
TATTTTTCAGAGCCATGTCAGGATGAAAGAAGCTCATATTTTTGTCAATC
CATAGTGAGAGCAGGCTTCTGTGGGAAACCTCGATTCAAACAGTTTTCAA
ATCTGTGTCTCAACTCTTGCAGGATGTGTCGTAAGAAATTCCCATTTTTC
CTAATGTTCGGATGTGCTTTTTTTATCCCTCACCAACCTCGGTTTTTTTC
CAAATAAAATCATTCTCCTGAAAACTTATTTGCGTCTTTTTTCACCTGGT
CCTGAGTTTCCATTACATGTTATCTCACTCGAATTCATTACTAATCTTGT
TAGAACAAACCAATTGTCAGGTAGAACGGACTAGACGATGGTAAGGACGG
ACCAATATTTCCAGGGTAATCCGAGAAGAATTTCCGAGAGTGTAAAAAAG
TGTTTTATCTTTCCAGTGGGTAAAAAGATTTTCTAAAATTTCCATGGGTA
TCTACAAATTTCCTAGAAATATTTATTTTTGACTTGAAAGGGTTTGTCCA
TCCCCCCTTCCCACAATGTATAGATTTTTAGCGGAAAAGCCTGATCCTAG
ACCTAGGACAGTGGAGAGTCGTTGGACGATTGCCCAGTCTCAAAATTGCA
ACTTTGGGGACTGTGAGGGGAAGGGCATTTCCCTTTTCAAAGCCATTTCC
AGTGATTCTCAACCATTTACATCCAGGATAATAGTTTGTATATTCTTCAT
TTACAGGACCATGCGAAGATTCAGCCTCCACAGAATGTCCGTTCTTTGCA
CGTCGTGGACGTTGTGATACAGACAAATCAAAAACGTATAATCGATGTCG
CAAATCTTGTCATGTTTGTGGTAAAGTCAATGTTACGATTCATTATAATA
CCCCAGCTGGCACATAACGTTGTTTCAACGTTTATCTAACGTTCACAACG
TCCATATAACGTTATATGAACGTTGAAACAACATTGTGTGCCAGCTGGGA
CACAGTTTCTTACTTACTTAGAGATAAGATTTACACATATCCACTTTTCT
GATTTTTATAACTTATTGACTAAAATATATCCAGAAATGTGGTTGAAACT
ACCTTATTACACGAATATTACTAGTCATTTTACTAACACAAATTGAAAAG
GTTCGTGTTAATAAAAAGCCTCTTACTGTTATTAATATCAGCCGTGGTGT
CCTTGAAAAAGCAAATAAAATTTTCAACTCTATTTAACTCTAGGAGTCAA
AGACCCCTGTCAAGGCTTCATTTGCACGAAACCTAACACAAGATGTCGAG
TTGATCATTTAGGAGTACCGTATTGCGGGTGTCGAGTACATTGTGATCCG
GGCGATCATTTTACCGGAACAGTTTGTGGAAGGGATGGCAAGGAATATAA
AAACAAATGCCGATTGCTTCATTCGAACTGTGAAATACCAAATATTGCTA
AGATTCAGAACTATGGAAAATGTCCTAGCTTAAATATAAAAGGTAAAACG
TTTCATATTTTTCCTATAAATGAGATCCCAAAAAGTATCACAAACTGA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000112_pilon:456955..464852- >XLOC_039520 ID=XLOC_039520|Name=XLOC_039520|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1488bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000112_pilon:456955..464852- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
CGGGAATGCAAAGACCTTTTGAACGCATACCGATGTACATTGATGCAGAA
CCATGACGCGTGTACCAAAAGACGTTTCCTTGTCAGAATCTTCTGTAGAA
AGCACTGTGGAGTTTGTGCGGGAATGCAAAGACCTTTTGAACGCATACCG
ATGTACATTGATGCAGAACCATGACGCGTGTACCAAAAGACGTTTCCTTG
TCAGAATCTTCTGTAGAAAGCACTGTGGAGTTTGTGGTGATGTTAAATGC
CGCTCAACACGGTACGGATGTTGCCACGATGGGAAGACACCTGCTAAAGG
ACCTTACTTTCAAGGCTGTAAAGGTGATGTTAAATGCCGCTCAACACGGT
ACGGATGTTGCCACGATGGGAAGACACCTGCTAAAGGACCTTACTTTCAA
GGCTGTAAAGAGCCATGTCAGGATGAAAGAAGCTCATATTTTTGTCAATC
CATAGTGAGAGCAGGCTTCTGTGGGAAACCTCGATTCAAACAGTTTTCAA
ATCTGTGTCTCAACTCTTGCAGGATGTGTCAGCCATGTCAGGATGAAAGA
AGCTCATATTTTTGTCAATCCATAGTGAGAGCAGGCTTCTGTGGGAAACC
TCGATTCAAACAGTTTTCAAATCTGTGTCTCAACTCTTGCAGGATGTGTC
GACCATGCGAAGATTCAGCCTCCACAGAATGTCCGTTCTTTGCACGTCGT
GGACGTTGTGATACAGACAAATCAAAAACGTATAATCGATGTCGCAAATC
TTGTCATGTTTGTGGACCATGCGAAGATTCAGCCTCCACAGAATGTCCGT
TCTTTGCACGTCGTGGACGTTGTGATACAGACAAATCAAAAACGTATAAT
CGATGTCGCAAATCTTGTCATGTTTGTGGAGTCAAAGACCCCTGTCAAGG
CTTCATTTGCACGAAACCTAACACAAGATGTCGAGTTGATCATTTAGGAG
TACCGTATTGCGGGTGTCGAGTACATTGTGATCCGGGCGATCATTTTACC
GGAACAGTTTGTGGAAGGGATGGCAAGGAATATAAAAACAAATGCCGATT
GCTTCATTCGAACTGTGAAATACCAAATATTGCTAAGATTCAGAACTATG
GAAAATGTCCTAGCTTAAATATAAAAGGTAAAACGTTTCATATTTTTCCT
ATAAATGAGATCCCAAAAAGTATCACAAACTGAGAGTCAAAGACCCCTGT
CAAGGCTTCATTTGCACGAAACCTAACACAAGATGTCGAGTTGATCATTT
AGGAGTACCGTATTGCGGGTGTCGAGTACATTGTGATCCGGGCGATCATT
TTACCGGAACAGTTTGTGGAAGGGATGGCAAGGAATATAAAAACAAATGC
CGATTGCTTCATTCGAACTGTGAAATACCAAATATTGCTAAGATTCAGAA
CTATGGAAAATGTCCTAGCTTAAATATAAAAGGTAAAACGTTTCATATTT
TTCCTATAAATGAGATCCCAAAAAGTATCACAAACTGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000112_pilon | genome | sc0000112_pilon:456955..464852 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 442-744:304 |
| Aaloc | 328-438:791 |
| Aaloc | 208-324:1487 |
| Aaloc | 121-204:1884 |
| Aaloc | 1-117:7899 |
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