XLOC_039487 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_039487
Unique NameXLOC_039487
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000023_pilon:1939114..1952943+

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_039487 ID=XLOC_039487|Name=XLOC_039487|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=13830bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000023_pilon:1939114..1952943+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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aattgaatagatgaaatcttgaatttaaaagGACAAATTACAGATAATTA GCCTCttttttttACTGATAAACTCCGAAAATTAGTTtgtgaaaataact tttttcccACGCTTCTCttaaaaataagtaaataataaaaatattttgaa gaaaattatatCTAATTTTCTACAACTCTGTTCCTTTCAAGACtaagcaa atttcttttaaCTCTATCTAATATacttgcttgtttttcttccctTAGCG CAAAGAATTGATACCGAAGGTGTTCGACGAACTTCTACCTCGTTTCGCTG ACCATGATGGTAACTATACCACTGTTTATCGTGTCCAATCAGAAGCGTTG CCTAGATACCATTACAAAAACTTATTATATCGAAAAGATGGTAACCTAGT TGTTGAACTGAATGGAAATTCTCTTCCGCCCATGATGCCAAGTAAAGTTG AAATGGAAGAGCTGACTTTAAGATATTTCGAAAATAAGAAGAATGAAATG GATAATTTGGAACGTGGTTCATCTGTTtga

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000023_pilon:1939114..1952943+

>XLOC_039487 ID=XLOC_039487|Name=XLOC_039487|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1356bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000023_pilon:1939114..1952943+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
atggcgacgCTTTATCGGGGCATCGGGGCACGCTGCTCTTGCCTTGTGAA
ACTTCAACAAAATAACATCGTATCTACTACAGTCAGGTGCATTTCAGTTT
CTGCTCctgatcaaatcaaaagaaaatggaTTTCCAAATGGAAGAACAAC
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atggaTTTCCAAATGGAAGAACAACTTTCCAACGCAAGTTTACAGTGAAG
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GGTTAATCAAGAACGTGTCGTTGTCTCTTATCGCCGTGGGATTGGGCTAG
CGAGGCTCACTGAATTGcTGAGTGGTTAGAGGAAGCATGTTTCGATAAAA
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TTATATCGAAAAGATGGTAACCTAGTTGTTGAACTGAATGGAAATTCTCT
TCCGCCCATGATGCCAAGTAAAGTTGAAATGGAAGAGCTGACTTTAAGAT
ATTTCGAAAATAAGAAGAATGAAATGGATAATTTGGAACGTGGTTCATCT
GTTtga
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_039487XLOC_039487-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000023_pilongenomesc0000023_pilon:1939114..1952943 +
Properties
Property NameValue
Aaloc397-678:13549
Aaloc343-396:13065
Aaloc178-342:11242
Aaloc1-174:1