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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000130_pilon:176925..185528- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_039479 ID=XLOC_039479|Name=XLOC_039479|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=8604bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000130_pilon:176925..185528- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) TTTCAGGTTTGGGAAGGTTGTGGAAATGGATCAATTTCTTTTGATTCCAG
TGACATTGGTAGTCCTTATATCTCACACATAGTGGAAAATAATGCTATCA
TTGAAAGTTGTGGAGAACAAGCAAAAGAATGCAAATCTGTTGAAATGATG
TATCAAACAAGACTGACAAATTATGCTGCACCAGACTCTTCGGTAAGAAT
GAATTATTGTCACTGTATGAAAAATCTTGAATGAACTATACCTACATAAA
ATTTGGCTTTTTGGTCTCTTTTTGCCCTAATTCTAGAACTTTCGCATTTT
TTTAGAAAATTTACAGAATATATCATGATGTAAATTAATCCATTTTAAGG
CAGCAGATATTTGGGCAGAATACTGTTGGTTACAAACAGAGTTCAATAAA
TAACTGCAATATGAACATCAAAGGGTTTAACTTTTTTTCATTGCTTTTCA
ATATCGGTGGAATTAAGGCTCTTTGCTTACAACCACTCAATTTATTTGTT
AATTTATGACTGAAGGCCTTCTTGTGTTAGGTGAATTGTAGTCATTTTAA
AATTTAGAAAGGCAGTGTTAGCTAGAGCTGGGAAAGGGCATTTCTTTATG
TTGCTTATTCGTGAAAGACTGCTGATATAATTTTTCATATTTTAGGCAGG
GCACCATCTTATCACTGCTCTGAAGAACCTTAACCTTTACCACGCCGAGG
CCGTAAATTTACGTTCTAATATATAGCCGAGGCCGTAAATATATGTTTTT
CATGGGGTGTTAAGAAAACACCTACTTTCGATTTTAACTGTCAAAACAAA
CTGGAAAATCAGGCAAAATATTATTTTGGAAATTATGAGCTCATTGATTG
CTGTAACTAACTTTTTATGTTTATTTAGTAGAAAATGGTTTGTTTTATTG
GTTGGAAATGTTATGTATTGCTTGTTTGTAGTTTAGTCAGTGTTTGAGGT
AAGTTTCTGCCTCCTTATTCTTTAGTATGACGGTACATTAAGGGTGAGGA
CTGGAGGCTTGTCGGCCGTCATCGACCGTCACCGAAACCCAAGTTAAGGC
TTCTGATAAGGCTGCAAAGAGTTTCAAAGTGTATATACTATGTTATTTCT
ATTGCTTTCATGCTGGTTGATGATAGGAAAGTCATTTTTAGCTGTTTTTA
GTGATATTTCCCATAAAAATTACCTCAAGGGGCCTCTGCCTTACGTGCCT
CTGATTTACGTGGAAATTTTCTCGAAAACCAAGGTTTTCTAAAAATGAAT
TCTGCCTTTTCTAGTAAAGGTATGATTGTGATTTTTTGGCTAGCAGTTGT
AGTTATAATGGTGGAAACAATGAGCCAGAAAATTATGGTATCGCAAATGT
TCTCCCCACTTTTTTTTTAACCGGAACTTAAAATTTTGAAAAATATGACA
AATTGCGTTTTTAATTTTTTTCAACTCTAAGGCAGAAGACTACTGTGTCA
CCATTGATAGAGGAAAATCCTTTATTTTAACATATTTAGAAAGCAGGATA
GTTGGGCTTTCCAGAATGGGCTTATTTTTTTGAATCGGTTTAGTAGATCA
AAAGTTATGACGGAAAGCGTAAAACTGTCATTTTTCCCAAAAAGACAAGG
CGTGCACGGGGTGAAGTTCCCAAAGAGAAGGCGTGGTAAAGGTTAAAAAA
TATTGTCTAGTCAATGTGCTCAAAATTCTGCTATAGTCTATATAATAGTC
TCGTATTGGCTGTAGTTTGCAAAACATTTTGAACTAAAAAGGTTTTATTT
GTGATGTAAATGTTTTCCATCGGGTTAAAAGATTTCCCCAACATGAGTAT
AAAGCAGCTATTTGGGCAGAATACTATTGGTTACAAATAGGGAGTTCAAT
AAATAACTGCAATATTATTTTGTCAGATTTGGGCAATGCCAGTTTCAGTA
ATTGGTTCCTGTTCCCAAAGAAAACTTACACTTTTCTATTTCTCTAGCTC
TAAGGGGCCTTACAGGTCCAATATCTTATGATACTCTTTTTGACGATGTC
ACTCATTATGCCCAAAATGAGCATAAACCAAAAATTCCCTTTGTTCTTTT
AAAATATTATTTTATCCTAAATATTCAATAAATTACGGTTCAAACATATA
TTTAACACAAAAATAAATTTGTACTGGAAGAAATGTAATTTTATTGCCAT
CTTAGGCAAGACCAATTTAATTTGTTGTTCTACAGGCCCGACCGACCCTA
TTTTTGCTAAAATCAAAAAAATAATATCGAATTTCCACTACAATATATTT
TACACACTAGTTATTTGTAACAATCAAACTTGAATAAAGCTGAAAATTAA
TTCAAGAAATTTAAAAATCATAAAAAGCATTCCATACACTAAAATTTTAT
TATTATCTTCATCGAAGATAAAAAACAAAGTGAATTTTTGATCCAGATAC
TTTTTGGAAAACATTTTCTCAGTACCTTACAAACCCTGATAAATGAAAAA
TCTATTCTTATTTTGCCGACCGACCCATATTTTTCTAACGATTTGTCCGT
AGAACAACAAATTAAATTGGTCTCGCCTTACTGTCACAAATGTTATCGTG
CTGAATGTCTAAAAGGTGGTGTCAAAATTTCTTTTATTTTGAAGCTATGT
AATTGTAAGGAACTTTCAGAAAATTTATATCAAAAGCTTTATTATTTTAG
GAGCTATAACCATTAATTTCACCACCAAACAGAAAAAGCTCCCCCCCCCA
ACAGTTCAAATAGGGTTAAAACGGGTTTTCACCTGTAATAGAGGCTTTTG
TTTATAATTGAAACTTCTGTCACATTTCTTTCTTTAAAGGTTCAAAAACA
GTTATCATAGTTCCAGATAGTTCTAAACATGAATTACAAAGCAGCTATTT
GGGCAGAATACTATTGGTCACAAATAGGTAGTTCAATAAATAACTGCAAT
ATTATTTTGTTAGATTTGGGCAATGCCAGTTTCAGTAACTGGTTCTAATT
CCCAAAGAAAACTTACATATTTAAAAAAAATTGGTTTATTGAGCTCTTTC
TCCAAAGAGGCATTACCTTGTGAAATTATCCAAACTGTATTACAGCTGAA
ATCTTTCTTATTTCTGCTTGCAATTATATACATAGATATTATTGAAAATT
TAAAGTTATCTTGTAAGTTACAAAGCAAGTCAACACTCTGTGTCTGGGTC
TTGTAGTTCCCAGGTTCAATTTTTCATCTTGCTAGACTAAATCTCACATA
ACCAAGTACATTTGTTTTCTGTAGCAATATTGTACAAATAGTAGTGAAAA
CATCTGCTGTTCTGTAACATTAACTTTCTGCCTGTTTTACCTTTTAAAAC
CCTATTCATACTAGGCTTTTAGGGCAGTTCAAAACTGGGGGGGGGGCTCT
TCCTGTACTACCCCTTAACTTTTGATCTAATGGGTTTTTTGAATGAAATT
TGAAACACAAGATCCCTGTCATATAAGGTAACTCTTGACAAAAGTTTTTT
GATGACATCACTCATCATGCTCAAAGTGAACAAAAACAAAAGTTTCCTTT
GTTCTTATAAAAAGCTATTTTATTCTAAAAAAGGCTTTAGAAAAAAGTTG
CCTGAGTTTAAAATGCTTTTTTTATCCTAAATATTTAATAAATTACGGTT
TAAACAATATATTTGACATAAAAAATAAATTTGTATTGGAAATGTGTCAA
TTTTTGTGACACCTTACCGTCAAAAATGCTATCATGCTCAAGGTGTGAAA
ATTCTCAGGTGTCAAATTCTTCTTTTTTTTTGAAGCTAAATAAAAGTTTG
GAATTTACAGAAAATTTCATGGCAGTTATTATTTCAGGAGCTATCACCAA
TAATTTGACCTTGGAACAGAAAGATCCCCCCTCCCTAGGTCGAATAGGTA
GGGTTAAAGAAAATTTAGTGCATTTGGGTTGGCCGATTTACCTGAAATCT
GCTATATTAAAAGCTACTACCAAATTTTCATGTCCATCCGTCAAGTTTAA
TTTATTTTCAGTCTTTCTAATTCAGATTTATTTGCGTCGGCAAAAGCCAA
ATTTATGTAATAGCCAAATGCTGACGCAAATTAGAATGGCTGATTTTGTA
TATTTCCAATTTCTTGCTATTTCAGGCCCCAAAACAGGTTCAAAACATGA
GTTAAAAAGCAGCTATTTGGGCAGAATACTATTGGTTACAAATAGGTAGT
TCAATAAATAACTGCAATATTATTTTGTCAGATTTGGGTAAGACCAGTTT
CAGTAACTGGTTCTTGTTCCCAAAGAAAACTAACATTTTAATGCTCATTT
TTCTTTGTCTCCATGATAAGGCCTTGTATATGTCTGTAAAAGTTTCCCAA
AAAATAAGTTATTACATTTTACAATTTAGGCTTCTGAAAAATTGGTTACC
TTAGAAGCAAGCAATGGTGAGAAGATTGCAACTAAACTCCTTGTAAGTGA
CACCTCTCTTATTTTCATCCTACAATTAACTCCTGATTAGATTAACATAA
ATTTGAAGTGAACAAAGTTTGAGGTGGTTTTAAATTACTTTATGCAGGTG
GGGGGTCGGTAGTAAAATCTCAGACATATATGAGCAGTAATAGGATTTTT
ACGAATTTTTACATACCACCACCCAGACTCTGGGAAGAGGTGTTTTACTA
CCCTTGTAGCAGCTTGTAGTAAAATTTGTACAATTTGTCATTGAGCAGCG
TTGAGACCACCTATTTTTTGGTTGCTTGTCGGACTGATTTTAGAAATTTT
AAAATATTTTACTTTTTTATATTGACAAAAAATTTTAAGATTTTTTCAGA
AAAGTCATCCAAAAAATTAAAAGAATTGCAAAACAGTCAAAATTTGCTAA
TTTTACCAGTTTTAACCACAGATATCTGTAAAGCCCTTTAGGCAACTTTA
AGCTTTCTCCAGCAAAAAAAGTGAAGCAAAAATTTGACTTTTTAAATTTC
GTGCCGATGGATAGGATCTAGCATTTTAATTGTTTTCGGAGCGCGAGATA
AAAAAAGTAGGCGGCAAACGCTATTTCACATCTCTCAAACTGGTGAAATT
GCATATTTTATCAAATCTAGCCCTTCGGGCTTTACAGATCTGTGGTTTTA
ACTACCCAGGTAGTAAAAAAAATTTCAACATTTAACACATAGATACCACC
CATTTCAGTACCCTGGGTAGTAAAACTAGTCATAGCTTTCACTAAATGCC
CCCACATAAAGATCATTTCATGCACTTATAAAGCTTTAATGCTTTAAATA
TTAAACATTAAAAAATAATCAGGAATAATTGATTGATTTAATTATTGATT
GATTGGTTGATTGATTGATTGATTGATTTATTGATTGATTGAGGCGTTTG
CTTGAAAAAAAATTCAGACGTACAGTCGAGAAAAGTTAAAATGCGCCTAA
ATTTCTTTTCAAGTGCATAGTCCTTTTTCATAATGCAATCTTTTCTCCAA
GCTGATCGCAGCGCAGACAATGAAGAGACGTGCCTTTAGGAAGCTAGACT
TTTTGAGTTTATAGCTAGCGATATACTTTCCCTTTATGGTGTTTCTGTAT
GACTGTCTGTGTACCTAGTCTAACCACCGTTAAATGCCTTCGGGAAGGTC
TCCTAACTGGAGCGTAAGTTATTTAGGCTATCACAACTGCATGAAAAAGT
TTAACGTGCGCATGTAAAGTTTAACGAGTAAACAAACTTTTTTCAGGTTT
TTGAAAAAGATTTACCACACTGAAAAGACGTAAAAACACTCTAAGTGAGG
TAAATTATTTTGAAGACCCAAAAGAAAAAGTCAACCACGTTTGGATTCAA
CTTTATGCGTACATTCATCTTTTTTGTATTTTGCCGGTTGTTTTACTAAG
TTAAGAAGGACTTTCTCGAGTTACGACCATATGATAGTATTTAAAGCTCA
AGAAGCCCTATAAACACGTAAACAATAAAGGTAGTTATCAATAAAATGAC
AGACAAAAATAAATTAGAGTTTGAACAAAAATATCAAATGTACATTTGAA
AACTTAAGCAAATTTCTTTAAAGATTCTGGAAAAAGAATTGAAATCATTG
CTGAAGTGAACTTCTGACTAAATTACAGTAGTTAGTATTCAGTTTCAAAG
ACAAGAAACAAAATCTGACATACAAAACACTTTTTCTAGTCAATGAATCA
GCTCATCATCATCATAACCAGTCTGCCATTTTGTTTGTTTTGATTTGCAC
AAGTAATATTGTAATTCGTGTTATATCATACACTGTTTTGATTTGCATTT
ATAACACTCGCTTCAGCTTTTCAAAGCCAAATCAAAACTAAAATTGTAAT
ATGTAATAATGATAATACCATATAACGTAATATGAAAATATGTATACTAC
CGTCCCGAAAAAAAACCGAACATTTACGGAAGAGACTAACTACGGATATG
CTTACGCGACAACAAAACAATTTGCAAAATTTTGAGATTCCAGTCCAATA
TCTATGCGTGAAACTATGAGAGCCTCCTCGTCGCTACGCTCCTGCGGGGG
CAATTATTTTTCGATTTTTCGTCACACCACCACCGAGTAAACCTCTTATG
TCTGAGATTTTACTACCGAAACACCCCCCCCCTGCTTTATGTAAGCCCAA
CTTTTGCTATTCTCTTTGGCAATAACAGCTTGTAAAAGGTTGTACACCTT
AATTAACTGCATGGAATGATTCGAATATAAACCTTTCTTAACTTATCTTC
ATAGTGAACTTTTGTGCAATTACACTAATTTTATGAAATTTGTTTGCAAG
ATAACACTCTGTGCCTGGGTGTCTTGGTTTCCAGGTTCAATTTTTCGTCT
TGCTAGATAAAGTATCACAAAACCAAAAGCAATCGCCTTTTTATAGCAAT
TTGCTTAAATTATAGTGAAGCCATCCATGTTATAGTTATTAAGTTCTGAC
TGCTCGTTTGAGTGGTCTTTTTAGCATGCTTTACAAAACCATGTGTTCAT
AATGACAACTAGAAACTCGAAAAACATACATCCATTCATATCCATTCATC
ATGATCAGTCCTATTGTCTAAATAGATTTTTGAAGCAGCTGCCTCACTTT
AATCAGCTTAATTTTTATAGGGCTAATTTTTTTAAGTCATGAGATTCAGT
TTAACAATGTGGTGGTATGAAATGAGTACTATTTAGAGTTTTTTTTGCTG
TTGACAAGAAAAGTTTAATATTGCATCTCCCATCTTTATTTCTGAAAATT
TTTTAATTTTTTTTTCAGGTAGCAGCTGATGGTTTCAACTCTTTCATTAG
AACCAATTCTGGAATCAAAACAATTGATTATGATTATGGACAGTCAGCTG
TTGTAGCGACAATCAAAGTCAAGACGCTTCCTAATAAAACTGCTTGGCAA
CGATACTTGACAAATGGCCCTGTGGCCCTCTTGCCGGTAGGTATTTTTCG
ATCCTTCCTTAAAGGGGAATCCTAACCTGTGTATATCCGTCCGTCTGTCT
GTTATTAAATTTTTTAGAGTGATTTTTCACCACTATTTGCTTTAATCAGC
CAATGATTTTGAAATCAACTAAATCTTTATTTCTACAGCTATCTGATGAA
TGGAGTAGTTTAGTTTGGTCAACTTCAAAGGATAAAGCAAAAGAACTGAT
GCAGCTTTCTGATAGTGAATTTATCGAAAATCTCAATGAAGCTTTCACCA
AACCTAACAACTCCCTTATCCCTGTCAATGCACTTTCTGACTTTATGAAA
AATGTAATGTCAACAATACAGCCAGGTAAGCTCATTTCAAGACGCTAAAT
CTTTTTCAACCTGTCACTAAACAAAGTATCCTACGCTTGGTTGAACAACC
GAATAACAAGCAAGCGAATCTTTAAGAGAAGCCGCCTTACTCGGAATAAC
TGGAAGTTTTGAATATTTTGGTATTTAGTAATAAATAGCGTTAAAAGGGA
AGTCTTTCATAAAATCATGTGATTTATCTCTAACTTCTCTGATTCTCTGT
TACAGGGAAGTATGCTAGCAACGTATCACACAAAGTACCCATGCCAATTG
ATATTCTACCGCAAAGCAGGGGAATGTTTCCTCTAGGAATGAAGCACTCC
ACGTATTACGTCAAATCAAGAATAGCGCTAATAGGAGACTCAGCCCACAG
GATTCATCCAATGGCTGGCCAAGGTGTCAATTTGGGTTTTGGAGATGTAA
AATCTTTGGTTGAAAATATCGACAACTCGTGCAGACTTGGAAGAGATTTC
GGTATGTTGCTGTCCTTGAACTGTTACGTCAGTAGCTTGTCACGAATGTG
TTACTCCAAGCGGTTTCGTGATTACGTGATAGGGATTTTTTTTGCAGCGT
GATTGCGTGATGAGAGGTCAAATTGTGATTTGAAAGATTTTTGCTGATTA
ACGTGATCGTTATTGAAGAAAAAATCGTGTGATAACGTGATCAGAGTTAC
CGCTCGCGAATAATTTCATATACACCTTCTATTCATCAGGAGCACTTGAA
AACCTACTACCTTACGAAACGGAACGTCAACGCCATGTTCTTTCAATTAT
CGGAGCAATCAATGGATTGAATATGTTGTTTTCTACGGATGCTTTCCCTG
TCGTTTTCGCACGTACCCTTGGACTCACCATGACCGATTCTGTTTCAAAT
ATAAAGGTAAATATTTTCCTGTACTTGTGCAAATCTAAGGCGAAAGACAA
GTAG Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000130_pilon:176925..185528- >XLOC_039479 ID=XLOC_039479|Name=XLOC_039479|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2142bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000130_pilon:176925..185528- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) TTTCAGGTTTGGGAAGGTTGTGGAAATGGATCAATTTCTTTTGATTCCAG TGACATTGGTAGTCCTTATATCTCACACATAGTGGAAAATAATGCTATCA TTGAAAGTTGTGGAGAACAAGCAAAAGAATGCAAATCTGTTGAAATGATG TATCAAACAAGACTGACAAATTATGCTGCACCAGACTCTTCGTTTCAGGT TTGGGAAGGTTGTGGAAATGGATCAATTTCTTTTGATTCCAGTGACATTG GTAGTCCTTATATCTCACACATAGTGGAAAATAATGCTATCATTGAAAGT TGTGGAGAACAAGCAAAAGAATGCAAATCTGTTGAAATGATGTATCAAAC AAGACTGACAAATTATGCTGCACCAGACTCTTCGGCTTCTGAAAAATTGG TTACCTTAGAAGCAAGCAATGGTGAGAAGATTGCAACTAAACTCCTTGCT TCTGAAAAATTGGTTACCTTAGAAGCAAGCAATGGTGAGAAGATTGCAAC TAAACTCCTTGTAGCAGCTGATGGTTTCAACTCTTTCATTAGAACCAATT CTGGAATCAAAACAATTGATTATGATTATGGACAGTCAGCTGTTGTAGCG ACAATCAAAGTCAAGACGCTTCCTAATAAAACTGCTTGGCAACGATACTT GACAAATGGCCCTGTGGCCCTCTTGCCGGTAGCAGCTGATGGTTTCAACT CTTTCATTAGAACCAATTCTGGAATCAAAACAATTGATTATGATTATGGA CAGTCAGCTGTTGTAGCGACAATCAAAGTCAAGACGCTTCCTAATAAAAC TGCTTGGCAACGATACTTGACAAATGGCCCTGTGGCCCTCTTGCCGCTAT CTGATGAATGGAGTAGTTTAGTTTGGTCAACTTCAAAGGATAAAGCAAAA GAACTGATGCAGCTTTCTGATAGTGAATTTATCGAAAATCTCAATGAAGC TTTCACCAAACCTAACAACTCCCTTATCCCTGTCAATGCACTTTCTGACT TTATGAAAAATGTAATGTCAACAATACAGCCAGCTATCTGATGAATGGAG TAGTTTAGTTTGGTCAACTTCAAAGGATAAAGCAAAAGAACTGATGCAGC TTTCTGATAGTGAATTTATCGAAAATCTCAATGAAGCTTTCACCAAACCT AACAACTCCCTTATCCCTGTCAATGCACTTTCTGACTTTATGAAAAATGT AATGTCAACAATACAGCCAGGGAAGTATGCTAGCAACGTATCACACAAAG TACCCATGCCAATTGATATTCTACCGCAAAGCAGGGGAATGTTTCCTCTA GGAATGAAGCACTCCACGTATTACGTCAAATCAAGAATAGCGCTAATAGG AGACTCAGCCCACAGGATTCATCCAATGGCTGGCCAAGGTGTCAATTTGG GTTTTGGAGATGTAAAATCTTTGGTTGAAAATATCGACAACTCGTGCAGA CTTGGAAGAGATTTCGGGAAGTATGCTAGCAACGTATCACACAAAGTACC CATGCCAATTGATATTCTACCGCAAAGCAGGGGAATGTTTCCTCTAGGAA TGAAGCACTCCACGTATTACGTCAAATCAAGAATAGCGCTAATAGGAGAC TCAGCCCACAGGATTCATCCAATGGCTGGCCAAGGTGTCAATTTGGGTTT TGGAGATGTAAAATCTTTGGTTGAAAATATCGACAACTCGTGCAGACTTG GAAGAGATTTCGGAGCACTTGAAAACCTACTACCTTACGAAACGGAACGT CAACGCCATGTTCTTTCAATTATCGGAGCAATCAATGGATTGAATATGTT GTTTTCTACGGATGCTTTCCCTGTCGTTTTCGCACGTACCCTTGGACTCA CCATGACCGATTCTGTTTCAAATATAAAGGTAAATATTTTCCTGTACTTG TGCAAATCTAAGGCGAAAGACAAGTAGGAGCACTTGAAAACCTACTACCT TACGAAACGGAACGTCAACGCCATGTTCTTTCAATTATCGGAGCAATCAA TGGATTGAATATGTTGTTTTCTACGGATGCTTTCCCTGTCGTTTTCGCAC GTACCCTTGGACTCACCATGACCGATTCTGTTTCAAATATAAAGGTAAAT ATTTTCCTGTACTTGTGCAAATCTAAGGCGAAAGACAAGTAG
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| sc0000130_pilon | genome | sc0000130_pilon:176925..185528 - |
Properties
| Property Name | Value |
| Aaloc | 862-1074:214 |
| Aaloc | 616-858:698 |
| Aaloc | 427-612:1117 |
| Aaloc | 367-426:1329 |
| Aaloc | 256-363:1437 |
| Aaloc | 193-255:4276 |
| Aaloc | 1-192:8605 |
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