XLOC_039479 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_039479
Unique NameXLOC_039479
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000130_pilon:176925..185528-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_039479 ID=XLOC_039479|Name=XLOC_039479|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=8604bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000130_pilon:176925..185528- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TTTCAGGTTTGGGAAGGTTGTGGAAATGGATCAATTTCTTTTGATTCCAG TGACATTGGTAGTCCTTATATCTCACACATAGTGGAAAATAATGCTATCA TTGAAAGTTGTGGAGAACAAGCAAAAGAATGCAAATCTGTTGAAATGATG TATCAAACAAGACTGACAAATTATGCTGCACCAGACTCTTCGGTAAGAAT GAATTATTGTCACTGTATGAAAAATCTTGAATGAACTATACCTACATAAA ATTTGGCTTTTTGGTCTCTTTTTGCCCTAATTCTAGAACTTTCGCATTTT TTTAGAAAATTTACAGAATATATCATGATGTAAATTAATCCATTTTAAGG CAGCAGATATTTGGGCAGAATACTGTTGGTTACAAACAGAGTTCAATAAA TAACTGCAATATGAACATCAAAGGGTTTAACTTTTTTTCATTGCTTTTCA ATATCGGTGGAATTAAGGCTCTTTGCTTACAACCACTCAATTTATTTGTT AATTTATGACTGAAGGCCTTCTTGTGTTAGGTGAATTGTAGTCATTTTAA AATTTAGAAAGGCAGTGTTAGCTAGAGCTGGGAAAGGGCATTTCTTTATG TTGCTTATTCGTGAAAGACTGCTGATATAATTTTTCATATTTTAGGCAGG GCACCATCTTATCACTGCTCTGAAGAACCTTAACCTTTACCACGCCGAGG CCGTAAATTTACGTTCTAATATATAGCCGAGGCCGTAAATATATGTTTTT CATGGGGTGTTAAGAAAACACCTACTTTCGATTTTAACTGTCAAAACAAA CTGGAAAATCAGGCAAAATATTATTTTGGAAATTATGAGCTCATTGATTG CTGTAACTAACTTTTTATGTTTATTTAGTAGAAAATGGTTTGTTTTATTG GTTGGAAATGTTATGTATTGCTTGTTTGTAGTTTAGTCAGTGTTTGAGGT AAGTTTCTGCCTCCTTATTCTTTAGTATGACGGTACATTAAGGGTGAGGA CTGGAGGCTTGTCGGCCGTCATCGACCGTCACCGAAACCCAAGTTAAGGC TTCTGATAAGGCTGCAAAGAGTTTCAAAGTGTATATACTATGTTATTTCT ATTGCTTTCATGCTGGTTGATGATAGGAAAGTCATTTTTAGCTGTTTTTA GTGATATTTCCCATAAAAATTACCTCAAGGGGCCTCTGCCTTACGTGCCT CTGATTTACGTGGAAATTTTCTCGAAAACCAAGGTTTTCTAAAAATGAAT TCTGCCTTTTCTAGTAAAGGTATGATTGTGATTTTTTGGCTAGCAGTTGT AGTTATAATGGTGGAAACAATGAGCCAGAAAATTATGGTATCGCAAATGT TCTCCCCACTTTTTTTTTAACCGGAACTTAAAATTTTGAAAAATATGACA AATTGCGTTTTTAATTTTTTTCAACTCTAAGGCAGAAGACTACTGTGTCA CCATTGATAGAGGAAAATCCTTTATTTTAACATATTTAGAAAGCAGGATA GTTGGGCTTTCCAGAATGGGCTTATTTTTTTGAATCGGTTTAGTAGATCA AAAGTTATGACGGAAAGCGTAAAACTGTCATTTTTCCCAAAAAGACAAGG CGTGCACGGGGTGAAGTTCCCAAAGAGAAGGCGTGGTAAAGGTTAAAAAA TATTGTCTAGTCAATGTGCTCAAAATTCTGCTATAGTCTATATAATAGTC TCGTATTGGCTGTAGTTTGCAAAACATTTTGAACTAAAAAGGTTTTATTT GTGATGTAAATGTTTTCCATCGGGTTAAAAGATTTCCCCAACATGAGTAT AAAGCAGCTATTTGGGCAGAATACTATTGGTTACAAATAGGGAGTTCAAT AAATAACTGCAATATTATTTTGTCAGATTTGGGCAATGCCAGTTTCAGTA ATTGGTTCCTGTTCCCAAAGAAAACTTACACTTTTCTATTTCTCTAGCTC TAAGGGGCCTTACAGGTCCAATATCTTATGATACTCTTTTTGACGATGTC ACTCATTATGCCCAAAATGAGCATAAACCAAAAATTCCCTTTGTTCTTTT AAAATATTATTTTATCCTAAATATTCAATAAATTACGGTTCAAACATATA TTTAACACAAAAATAAATTTGTACTGGAAGAAATGTAATTTTATTGCCAT CTTAGGCAAGACCAATTTAATTTGTTGTTCTACAGGCCCGACCGACCCTA TTTTTGCTAAAATCAAAAAAATAATATCGAATTTCCACTACAATATATTT TACACACTAGTTATTTGTAACAATCAAACTTGAATAAAGCTGAAAATTAA TTCAAGAAATTTAAAAATCATAAAAAGCATTCCATACACTAAAATTTTAT TATTATCTTCATCGAAGATAAAAAACAAAGTGAATTTTTGATCCAGATAC TTTTTGGAAAACATTTTCTCAGTACCTTACAAACCCTGATAAATGAAAAA TCTATTCTTATTTTGCCGACCGACCCATATTTTTCTAACGATTTGTCCGT AGAACAACAAATTAAATTGGTCTCGCCTTACTGTCACAAATGTTATCGTG CTGAATGTCTAAAAGGTGGTGTCAAAATTTCTTTTATTTTGAAGCTATGT AATTGTAAGGAACTTTCAGAAAATTTATATCAAAAGCTTTATTATTTTAG GAGCTATAACCATTAATTTCACCACCAAACAGAAAAAGCTCCCCCCCCCA ACAGTTCAAATAGGGTTAAAACGGGTTTTCACCTGTAATAGAGGCTTTTG TTTATAATTGAAACTTCTGTCACATTTCTTTCTTTAAAGGTTCAAAAACA GTTATCATAGTTCCAGATAGTTCTAAACATGAATTACAAAGCAGCTATTT GGGCAGAATACTATTGGTCACAAATAGGTAGTTCAATAAATAACTGCAAT ATTATTTTGTTAGATTTGGGCAATGCCAGTTTCAGTAACTGGTTCTAATT CCCAAAGAAAACTTACATATTTAAAAAAAATTGGTTTATTGAGCTCTTTC TCCAAAGAGGCATTACCTTGTGAAATTATCCAAACTGTATTACAGCTGAA ATCTTTCTTATTTCTGCTTGCAATTATATACATAGATATTATTGAAAATT TAAAGTTATCTTGTAAGTTACAAAGCAAGTCAACACTCTGTGTCTGGGTC TTGTAGTTCCCAGGTTCAATTTTTCATCTTGCTAGACTAAATCTCACATA ACCAAGTACATTTGTTTTCTGTAGCAATATTGTACAAATAGTAGTGAAAA CATCTGCTGTTCTGTAACATTAACTTTCTGCCTGTTTTACCTTTTAAAAC CCTATTCATACTAGGCTTTTAGGGCAGTTCAAAACTGGGGGGGGGGCTCT TCCTGTACTACCCCTTAACTTTTGATCTAATGGGTTTTTTGAATGAAATT TGAAACACAAGATCCCTGTCATATAAGGTAACTCTTGACAAAAGTTTTTT GATGACATCACTCATCATGCTCAAAGTGAACAAAAACAAAAGTTTCCTTT GTTCTTATAAAAAGCTATTTTATTCTAAAAAAGGCTTTAGAAAAAAGTTG CCTGAGTTTAAAATGCTTTTTTTATCCTAAATATTTAATAAATTACGGTT TAAACAATATATTTGACATAAAAAATAAATTTGTATTGGAAATGTGTCAA TTTTTGTGACACCTTACCGTCAAAAATGCTATCATGCTCAAGGTGTGAAA ATTCTCAGGTGTCAAATTCTTCTTTTTTTTTGAAGCTAAATAAAAGTTTG GAATTTACAGAAAATTTCATGGCAGTTATTATTTCAGGAGCTATCACCAA TAATTTGACCTTGGAACAGAAAGATCCCCCCTCCCTAGGTCGAATAGGTA GGGTTAAAGAAAATTTAGTGCATTTGGGTTGGCCGATTTACCTGAAATCT GCTATATTAAAAGCTACTACCAAATTTTCATGTCCATCCGTCAAGTTTAA TTTATTTTCAGTCTTTCTAATTCAGATTTATTTGCGTCGGCAAAAGCCAA ATTTATGTAATAGCCAAATGCTGACGCAAATTAGAATGGCTGATTTTGTA TATTTCCAATTTCTTGCTATTTCAGGCCCCAAAACAGGTTCAAAACATGA GTTAAAAAGCAGCTATTTGGGCAGAATACTATTGGTTACAAATAGGTAGT TCAATAAATAACTGCAATATTATTTTGTCAGATTTGGGTAAGACCAGTTT CAGTAACTGGTTCTTGTTCCCAAAGAAAACTAACATTTTAATGCTCATTT TTCTTTGTCTCCATGATAAGGCCTTGTATATGTCTGTAAAAGTTTCCCAA AAAATAAGTTATTACATTTTACAATTTAGGCTTCTGAAAAATTGGTTACC TTAGAAGCAAGCAATGGTGAGAAGATTGCAACTAAACTCCTTGTAAGTGA CACCTCTCTTATTTTCATCCTACAATTAACTCCTGATTAGATTAACATAA ATTTGAAGTGAACAAAGTTTGAGGTGGTTTTAAATTACTTTATGCAGGTG GGGGGTCGGTAGTAAAATCTCAGACATATATGAGCAGTAATAGGATTTTT ACGAATTTTTACATACCACCACCCAGACTCTGGGAAGAGGTGTTTTACTA CCCTTGTAGCAGCTTGTAGTAAAATTTGTACAATTTGTCATTGAGCAGCG TTGAGACCACCTATTTTTTGGTTGCTTGTCGGACTGATTTTAGAAATTTT AAAATATTTTACTTTTTTATATTGACAAAAAATTTTAAGATTTTTTCAGA AAAGTCATCCAAAAAATTAAAAGAATTGCAAAACAGTCAAAATTTGCTAA TTTTACCAGTTTTAACCACAGATATCTGTAAAGCCCTTTAGGCAACTTTA AGCTTTCTCCAGCAAAAAAAGTGAAGCAAAAATTTGACTTTTTAAATTTC GTGCCGATGGATAGGATCTAGCATTTTAATTGTTTTCGGAGCGCGAGATA AAAAAAGTAGGCGGCAAACGCTATTTCACATCTCTCAAACTGGTGAAATT GCATATTTTATCAAATCTAGCCCTTCGGGCTTTACAGATCTGTGGTTTTA ACTACCCAGGTAGTAAAAAAAATTTCAACATTTAACACATAGATACCACC CATTTCAGTACCCTGGGTAGTAAAACTAGTCATAGCTTTCACTAAATGCC CCCACATAAAGATCATTTCATGCACTTATAAAGCTTTAATGCTTTAAATA TTAAACATTAAAAAATAATCAGGAATAATTGATTGATTTAATTATTGATT GATTGGTTGATTGATTGATTGATTGATTTATTGATTGATTGAGGCGTTTG CTTGAAAAAAAATTCAGACGTACAGTCGAGAAAAGTTAAAATGCGCCTAA ATTTCTTTTCAAGTGCATAGTCCTTTTTCATAATGCAATCTTTTCTCCAA GCTGATCGCAGCGCAGACAATGAAGAGACGTGCCTTTAGGAAGCTAGACT TTTTGAGTTTATAGCTAGCGATATACTTTCCCTTTATGGTGTTTCTGTAT GACTGTCTGTGTACCTAGTCTAACCACCGTTAAATGCCTTCGGGAAGGTC TCCTAACTGGAGCGTAAGTTATTTAGGCTATCACAACTGCATGAAAAAGT TTAACGTGCGCATGTAAAGTTTAACGAGTAAACAAACTTTTTTCAGGTTT TTGAAAAAGATTTACCACACTGAAAAGACGTAAAAACACTCTAAGTGAGG TAAATTATTTTGAAGACCCAAAAGAAAAAGTCAACCACGTTTGGATTCAA CTTTATGCGTACATTCATCTTTTTTGTATTTTGCCGGTTGTTTTACTAAG TTAAGAAGGACTTTCTCGAGTTACGACCATATGATAGTATTTAAAGCTCA AGAAGCCCTATAAACACGTAAACAATAAAGGTAGTTATCAATAAAATGAC AGACAAAAATAAATTAGAGTTTGAACAAAAATATCAAATGTACATTTGAA AACTTAAGCAAATTTCTTTAAAGATTCTGGAAAAAGAATTGAAATCATTG CTGAAGTGAACTTCTGACTAAATTACAGTAGTTAGTATTCAGTTTCAAAG ACAAGAAACAAAATCTGACATACAAAACACTTTTTCTAGTCAATGAATCA GCTCATCATCATCATAACCAGTCTGCCATTTTGTTTGTTTTGATTTGCAC AAGTAATATTGTAATTCGTGTTATATCATACACTGTTTTGATTTGCATTT ATAACACTCGCTTCAGCTTTTCAAAGCCAAATCAAAACTAAAATTGTAAT ATGTAATAATGATAATACCATATAACGTAATATGAAAATATGTATACTAC CGTCCCGAAAAAAAACCGAACATTTACGGAAGAGACTAACTACGGATATG CTTACGCGACAACAAAACAATTTGCAAAATTTTGAGATTCCAGTCCAATA TCTATGCGTGAAACTATGAGAGCCTCCTCGTCGCTACGCTCCTGCGGGGG CAATTATTTTTCGATTTTTCGTCACACCACCACCGAGTAAACCTCTTATG TCTGAGATTTTACTACCGAAACACCCCCCCCCTGCTTTATGTAAGCCCAA CTTTTGCTATTCTCTTTGGCAATAACAGCTTGTAAAAGGTTGTACACCTT AATTAACTGCATGGAATGATTCGAATATAAACCTTTCTTAACTTATCTTC ATAGTGAACTTTTGTGCAATTACACTAATTTTATGAAATTTGTTTGCAAG ATAACACTCTGTGCCTGGGTGTCTTGGTTTCCAGGTTCAATTTTTCGTCT TGCTAGATAAAGTATCACAAAACCAAAAGCAATCGCCTTTTTATAGCAAT TTGCTTAAATTATAGTGAAGCCATCCATGTTATAGTTATTAAGTTCTGAC TGCTCGTTTGAGTGGTCTTTTTAGCATGCTTTACAAAACCATGTGTTCAT AATGACAACTAGAAACTCGAAAAACATACATCCATTCATATCCATTCATC ATGATCAGTCCTATTGTCTAAATAGATTTTTGAAGCAGCTGCCTCACTTT AATCAGCTTAATTTTTATAGGGCTAATTTTTTTAAGTCATGAGATTCAGT TTAACAATGTGGTGGTATGAAATGAGTACTATTTAGAGTTTTTTTTGCTG TTGACAAGAAAAGTTTAATATTGCATCTCCCATCTTTATTTCTGAAAATT TTTTAATTTTTTTTTCAGGTAGCAGCTGATGGTTTCAACTCTTTCATTAG AACCAATTCTGGAATCAAAACAATTGATTATGATTATGGACAGTCAGCTG TTGTAGCGACAATCAAAGTCAAGACGCTTCCTAATAAAACTGCTTGGCAA CGATACTTGACAAATGGCCCTGTGGCCCTCTTGCCGGTAGGTATTTTTCG ATCCTTCCTTAAAGGGGAATCCTAACCTGTGTATATCCGTCCGTCTGTCT GTTATTAAATTTTTTAGAGTGATTTTTCACCACTATTTGCTTTAATCAGC CAATGATTTTGAAATCAACTAAATCTTTATTTCTACAGCTATCTGATGAA TGGAGTAGTTTAGTTTGGTCAACTTCAAAGGATAAAGCAAAAGAACTGAT GCAGCTTTCTGATAGTGAATTTATCGAAAATCTCAATGAAGCTTTCACCA AACCTAACAACTCCCTTATCCCTGTCAATGCACTTTCTGACTTTATGAAA AATGTAATGTCAACAATACAGCCAGGTAAGCTCATTTCAAGACGCTAAAT CTTTTTCAACCTGTCACTAAACAAAGTATCCTACGCTTGGTTGAACAACC GAATAACAAGCAAGCGAATCTTTAAGAGAAGCCGCCTTACTCGGAATAAC TGGAAGTTTTGAATATTTTGGTATTTAGTAATAAATAGCGTTAAAAGGGA AGTCTTTCATAAAATCATGTGATTTATCTCTAACTTCTCTGATTCTCTGT TACAGGGAAGTATGCTAGCAACGTATCACACAAAGTACCCATGCCAATTG ATATTCTACCGCAAAGCAGGGGAATGTTTCCTCTAGGAATGAAGCACTCC ACGTATTACGTCAAATCAAGAATAGCGCTAATAGGAGACTCAGCCCACAG GATTCATCCAATGGCTGGCCAAGGTGTCAATTTGGGTTTTGGAGATGTAA AATCTTTGGTTGAAAATATCGACAACTCGTGCAGACTTGGAAGAGATTTC GGTATGTTGCTGTCCTTGAACTGTTACGTCAGTAGCTTGTCACGAATGTG TTACTCCAAGCGGTTTCGTGATTACGTGATAGGGATTTTTTTTGCAGCGT GATTGCGTGATGAGAGGTCAAATTGTGATTTGAAAGATTTTTGCTGATTA ACGTGATCGTTATTGAAGAAAAAATCGTGTGATAACGTGATCAGAGTTAC CGCTCGCGAATAATTTCATATACACCTTCTATTCATCAGGAGCACTTGAA AACCTACTACCTTACGAAACGGAACGTCAACGCCATGTTCTTTCAATTAT CGGAGCAATCAATGGATTGAATATGTTGTTTTCTACGGATGCTTTCCCTG TCGTTTTCGCACGTACCCTTGGACTCACCATGACCGATTCTGTTTCAAAT ATAAAGGTAAATATTTTCCTGTACTTGTGCAAATCTAAGGCGAAAGACAA GTAG

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000130_pilon:176925..185528-

>XLOC_039479 ID=XLOC_039479|Name=XLOC_039479|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2142bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000130_pilon:176925..185528- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TTTCAGGTTTGGGAAGGTTGTGGAAATGGATCAATTTCTTTTGATTCCAG
TGACATTGGTAGTCCTTATATCTCACACATAGTGGAAAATAATGCTATCA
TTGAAAGTTGTGGAGAACAAGCAAAAGAATGCAAATCTGTTGAAATGATG
TATCAAACAAGACTGACAAATTATGCTGCACCAGACTCTTCGTTTCAGGT
TTGGGAAGGTTGTGGAAATGGATCAATTTCTTTTGATTCCAGTGACATTG
GTAGTCCTTATATCTCACACATAGTGGAAAATAATGCTATCATTGAAAGT
TGTGGAGAACAAGCAAAAGAATGCAAATCTGTTGAAATGATGTATCAAAC
AAGACTGACAAATTATGCTGCACCAGACTCTTCGGCTTCTGAAAAATTGG
TTACCTTAGAAGCAAGCAATGGTGAGAAGATTGCAACTAAACTCCTTGCT
TCTGAAAAATTGGTTACCTTAGAAGCAAGCAATGGTGAGAAGATTGCAAC
TAAACTCCTTGTAGCAGCTGATGGTTTCAACTCTTTCATTAGAACCAATT
CTGGAATCAAAACAATTGATTATGATTATGGACAGTCAGCTGTTGTAGCG
ACAATCAAAGTCAAGACGCTTCCTAATAAAACTGCTTGGCAACGATACTT
GACAAATGGCCCTGTGGCCCTCTTGCCGGTAGCAGCTGATGGTTTCAACT
CTTTCATTAGAACCAATTCTGGAATCAAAACAATTGATTATGATTATGGA
CAGTCAGCTGTTGTAGCGACAATCAAAGTCAAGACGCTTCCTAATAAAAC
TGCTTGGCAACGATACTTGACAAATGGCCCTGTGGCCCTCTTGCCGCTAT
CTGATGAATGGAGTAGTTTAGTTTGGTCAACTTCAAAGGATAAAGCAAAA
GAACTGATGCAGCTTTCTGATAGTGAATTTATCGAAAATCTCAATGAAGC
TTTCACCAAACCTAACAACTCCCTTATCCCTGTCAATGCACTTTCTGACT
TTATGAAAAATGTAATGTCAACAATACAGCCAGCTATCTGATGAATGGAG
TAGTTTAGTTTGGTCAACTTCAAAGGATAAAGCAAAAGAACTGATGCAGC
TTTCTGATAGTGAATTTATCGAAAATCTCAATGAAGCTTTCACCAAACCT
AACAACTCCCTTATCCCTGTCAATGCACTTTCTGACTTTATGAAAAATGT
AATGTCAACAATACAGCCAGGGAAGTATGCTAGCAACGTATCACACAAAG
TACCCATGCCAATTGATATTCTACCGCAAAGCAGGGGAATGTTTCCTCTA
GGAATGAAGCACTCCACGTATTACGTCAAATCAAGAATAGCGCTAATAGG
AGACTCAGCCCACAGGATTCATCCAATGGCTGGCCAAGGTGTCAATTTGG
GTTTTGGAGATGTAAAATCTTTGGTTGAAAATATCGACAACTCGTGCAGA
CTTGGAAGAGATTTCGGGAAGTATGCTAGCAACGTATCACACAAAGTACC
CATGCCAATTGATATTCTACCGCAAAGCAGGGGAATGTTTCCTCTAGGAA
TGAAGCACTCCACGTATTACGTCAAATCAAGAATAGCGCTAATAGGAGAC
TCAGCCCACAGGATTCATCCAATGGCTGGCCAAGGTGTCAATTTGGGTTT
TGGAGATGTAAAATCTTTGGTTGAAAATATCGACAACTCGTGCAGACTTG
GAAGAGATTTCGGAGCACTTGAAAACCTACTACCTTACGAAACGGAACGT
CAACGCCATGTTCTTTCAATTATCGGAGCAATCAATGGATTGAATATGTT
GTTTTCTACGGATGCTTTCCCTGTCGTTTTCGCACGTACCCTTGGACTCA
CCATGACCGATTCTGTTTCAAATATAAAGGTAAATATTTTCCTGTACTTG
TGCAAATCTAAGGCGAAAGACAAGTAGGAGCACTTGAAAACCTACTACCT
TACGAAACGGAACGTCAACGCCATGTTCTTTCAATTATCGGAGCAATCAA
TGGATTGAATATGTTGTTTTCTACGGATGCTTTCCCTGTCGTTTTCGCAC
GTACCCTTGGACTCACCATGACCGATTCTGTTTCAAATATAAAGGTAAAT
ATTTTCCTGTACTTGTGCAAATCTAAGGCGAAAGACAAGTAG
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_039479XLOC_039479-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000130_pilongenomesc0000130_pilon:176925..185528 -
Properties
Property NameValue
Aaloc862-1074:214
Aaloc616-858:698
Aaloc427-612:1117
Aaloc367-426:1329
Aaloc256-363:1437
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Aaloc1-192:8605