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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000348_pilon:146376..151942+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_039161 ID=XLOC_039161|Name=XLOC_039161|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=5567bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000348_pilon:146376..151942+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) CAACGAAAGAAGTTCTGTGTTCACTTACATTTAGTTGCACTTGCCAGGAA
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GATTTGTTTTTAATTGA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000348_pilon:146376..151942+ >XLOC_039161 ID=XLOC_039161|Name=XLOC_039161|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3846bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000348_pilon:146376..151942+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) CAACGAAAGAAGTTCTGTGTTCACTTACATTTAGTTGCACTTGCCAGGAA GTTGAAAGAAGGAATAATTGATCAATTAAGCTATGCTAAAGTTAATCCCA CTAAGGACTCAAATCTAACTGAAAAAACACCTAAATCAGAATTGGCTGAG ATCTCAACAGCTGTAACCAATACCATATTGATtcagaaatcaagaaaaat tcCATTGGATATTCCACCAACGGTCCTAGCAGAAAGCCTTAAACTGGATG AAACAATTGAAGTTTATGTCCCTGAAGAAACTGATTGTTCACTCTGTGGA AGCGCCTTAACAGATCCAATGAATCAAAAGGGTATGGAACATGGATACCT GATAACAGAGGTTGTCTCATTCAAAAAGATTAAGATAAAgatcaaaaagt gtaaaaattcAGATTGTAATGCTACAGTTGTTCTATTTCCATATAACAAA GCAACGAAAGAAGTTCTGTGTTCACTTACATTTAGTTGCACTTGCCAGGA AGTTGAAAGAAGGAATAATTGATCAATTAAGCTATGCTAAAGTTAATCCC ACTAAGGACTCAAATCTAACTGAAAAAACACCTAAATCAGAATTGGCTGA GATCTCAACAGCTGTAACCAATACCATATTGATtcagaaatcaagaaaaa ttcCATTGGATATTCCACCAACGGTCCTAGCAGAAAGCCTTAAACTGGAT GAAACAATTGAAGTTTATGTCCCTGAAGAAACTGATTGTTCACTCTGTGG AAGCGCCTTAACAGATCCAATGAATCAAAAGGGTATGGAACATGGATACC TGATAACAGAGGTTGTCTCATTCAAAAAGATTAAGATAAAgatcaaaaag tgtaaaaattcAGATTGTAATGCTACAGTTGTTCTATTTCCATATAACAA AGgactTTTCAATATCTCCAACAAAGTTTTGTTAAGTCTAAGCATAATGG TGGAATGGCGTGAATTTTTGAAAGATGGTACACCAGTCACAAACTTCATC ACAAGAAAGCTAAAAGGCCTTCAATTGAAATTACCTGTGgactTTTCAAT ATCTCCAACAAAGTTTTGTTAAGTCTAAGCATAATGGTGGAATGGCGTGA ATTTTTGAAAGATGGTACACCAGTCACAAACTTCATCACAAGAAAGCTAA AAGGCCTTCAATTGAAATTACCTGTGGCATCACGCTTGAAAGCATCAGAA TTTGACTATCTTATCAAAACCATTTATAATGGATACTATGCATTTGAGGC AATGACAGAGAGAAATTTGGTTGATGCCGTTTGTGGGATATGTGGGATTG CAGGAAAATTGTACTTCGGAGATGGCAATGAGAAGAATTGCACCTCAATA AAGGAGGCATCACGCTTGAAAGCATCAGAATTTGACTATCTTATCAAAAC CATTTATAATGGATACTATGCATTTGAGGCAATGACAGAGAGAAATTTGG TTGATGCCGTTTGTGGGATATGTGGGATTGCAGGAAAATTGTACTTCGGA GATGGCAATGAGAAGAATTGCACCTCAATAAAGGAGGTTAATCTAGATGA TAACTTAGAATCAATACATAGTTTGACATCAACCGATTATCAGACAAATA TGATGGATGTATTGACTTCTCACCTTTTGGAAAAGGGGGCATATTTAAAA CATGTACCTAGTCTTTCTTTGAATCTCTCAGACATTCCTCCACTTATTTC CCCATTAATGAGATCGCATGAGATAAACACGGAAACTGAAAAAAGAAGTA CATACCTAGATGATACAGATGAGGTTGAAGGTTAATCTAGATGATAACTT AGAATCAATACATAGTTTGACATCAACCGATTATCAGACAAATATGATGG ATGTATTGACTTCTCACCTTTTGGAAAAGGGGGCATATTTAAAACATGTA CCTAGTCTTTCTTTGAATCTCTCAGACATTCCTCCACTTATTTCCCCATT AATGAGATCGCATGAGATAAACACGGAAACTGAAAAAAGAAGTACATACC TAGATGATACAGATGAGGTTGAAGGAGATGCAATGAtgctttcaaagatt ttaagaGACaaaaaaaCCACAATTGATTCTATTGAAACAATGAGTGCCAA TGAGCTTAAAGATTTGGCCAAATCATGCAAtatcaaaacatcaaagaatG GGTCaaaaaaaTCACAGGAGATGCAATGAtgctttcaaagattttaagaG ACaaaaaaaCCACAATTGATTCTATTGAAACAATGAGTGCCAATGAGCTT AAAGATTTGGCCAAATCATGCAAtatcaaaacatcaaagaatGGGTCaaa aaaaTCACAGGCTATGTTGAAGCTTAACTTAAAACAACTCTATGCAACAA TTCTAGTCGGAACATCTGCTTGTCATCAATTTGTCAAGTCTCCTGGTCAT ACTGGTGGATTCTATCACCTTGTTTGTCCTCACGGAGCTATGTTGAAGCT TAACTTAAAACAACTCTATGCAACAATTCTAGTCGGAACATCTGCTTGTC ATCAATTTGTCAAGTCTCCTGGTCATACTGGTGGATTCTATCACCTTGTT TGTCCTCACGGAactACTGTTGCttcaaaattcatgatattaaCAGAGTC TGTTCGAGATGCTGCAGATCTGTATTTAAGTTTAAAGTTTCCACCGGTGA TGTTTGTATGTGATACGCCTTGCACTCTGGTCCAGCACATCAATAACAGA TCTCCTGAGCATGCTGAACATTTTTGGGGAGAGAATGATGGTTGCTTTGA GAAaccaaacttggaaaatgatccAGAAAAGactACTGTTGCttcaaaat tcatgatattaaCAGAGTCTGTTCGAGATGCTGCAGATCTGTATTTAAGT TTAAAGTTTCCACCGGTGATGTTTGTATGTGATACGCCTTGCACTCTGGT CCAGCACATCAATAACAGATCTCCTGAGCATGCTGAACATTTTTGGGGAG AGAATGATGGTTGCTTTGAGAAaccaaacttggaaaatgatccAGAAAAG ATGATGAATATTCCAATAGTTGTTCCACCTGAATTCCAAGATGAAGATGA GGAAACAAAAGAGATAGCTCTTGATAAACCTTTTTGTCATCCATTGACTC AGAGCAGCAGGCGTTTCATATGCGGTGACcgttttcatacaaaaacaaat ccACATAAGTCTCAACTTTGTGAATTCCACAACATCGATTTGTGTCTCCA AAGCACTTGCATAAAAACAAGCTACCCAGAAAGTTTAAATAACaagaaaa acaataaaagaaatcgCTCAGCTTGCACCCAAAACCTTGCACATCATATT TATTACAATTACCTTATGGACTATTATGATAATCTTGAAATTGTACAAGA ACAGAAGGCAGCTTTATCTATTTATGAAAAAGAAGTAACACGTGATGAAT TGTTGCGATTTGTTTTTAATTGAATGATGAATATTCCAATAGTTGTTCCA CCTGAATTCCAAGATGAAGATGAGGAAACAAAAGAGATAGCTCTTGATAA ACCTTTTTGTCATCCATTGACTCAGAGCAGCAGGCGTTTCATATGCGGTG ACcgttttcatacaaaaacaaatccACATAAGTCTCAACTTTGTGAATTC CACAACATCGATTTGTGTCTCCAAAGCACTTGCATAAAAACAAGCTACCC AGAAAGTTTAAATAACaagaaaaacaataaaagaaatcgCTCAGCTTGCA CCCAAAACCTTGCACATCATATTTATTACAATTACCTTATGGACTATTAT GATAATCTTGAAATTGTACAAGAACAGAAGGCAGCTTTATCTATTTATGA AAAAGAAGTAACACGTGATGAATTGTTGCGATTTGTTTTTAATTGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| sc0000348_pilon | genome | sc0000348_pilon:146376..151942 + |
Properties
| Property Name | Value |
| Aaloc | 1501-1923:5145 |
| Aaloc | 1282-1500:4554 |
| Aaloc | 1156-1281:3575 |
| Aaloc | 1015-1155:2870 |
| Aaloc | 769-1011:2315 |
| Aaloc | 589-768:1608 |
| Aaloc | 454-588:976 |
| Aaloc | 1-450:1 |
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