XLOC_039097 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_039097
Unique NameXLOC_039097
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000041_pilon:289930..297752+

Legend: CDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_039097 ID=XLOC_039097|Name=XLOC_039097|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=7823bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000041_pilon:289930..297752+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCTTTTGGAAACAGTTCTACATTAAACATGACGACATTAAACAACAC TACAGAAAATACTGTATTCGAATGTTTCAAGCTACCCATTACAGTTGGGA ATGATACGTTTTGTGGTAATAATTTAACAAGATGGGAATCTAGATATAGT GAGGATGGTTTGAAAGCTATGGTAATAGTGCCAGCAATTGTAGCTTTGCT TGTCCTCATCTTCAGATTGTGGCGAAGTAAATTTGCTGTCCGAGAAAATC ATGAAATCATGATGGAGTATGAAAGACGTTTATTCAAATTTAGGAAGAAT CATAAACTTGAAAGAACTGATTCAATGATCAGCCAAGAATTTGAGATGTA TCGAGTTGAATTTGATATCAAAGACGAGAGCGAGAATGGAGATAAAGATA AAATCAAATTGAATTGTATCGTGAGATGTTTCCAGGGGATCGGCCGGTGT TTCAAAGTGGAAGATTTAGGGTGGAAATTCATATCACTCAAAACTTTCGT AACAATCAAATTTCTAACATATGTTAAACAAGCTTTGGAAGTTCTGGATG TGATCCTGGATTGTTTCTTGCTTTACCAATTAGAATCTGGTCAAATATTC GATGATGTTGTTCACCGAAACGTTTACGTCACTAATGTAATTTACGCACT CATCTGGTTAAGTATCATGGTCCAATTTTGTTCTTGTGATTGTTGTCCAG TGGATAACATTTTTgttcattggctctgttcagcTTATCTTGGAGTATTT TTATATGGACAAATTTGTCAACCGAAAAACCGATTGGTATTTGTTTGTGA AGAGTGCAATGCAACTGGTCATGACTTGCTGGACTATTTATTCAGCTATT CAGAATGCAAAACGTGCTCGTTTGGTGAAGCTTATGGACAAGGGTGGAAA TGAAGATTCAGGTAATGTCGTCAATGATATCATCGAACAACGTAAACAGG 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TATGAAAGACGTTTATTCAAATTTAGGAAGAATCATAAACTTGAAAGAAC TGATTCTATGATTAGCCGAGAATTTGAGATGTATCGAGTTGAATTTGATA TCAAAGACGAGAGCGAGAATGGAGATAAAGATAAAATCAAATTGAATTGT ATTGTGAGATGTTTCCAGGGGATCGGCCGGTGTTTCAAAGTGGAAGATTT AGGGTGGAAATTCATATCACTCAAAACTTTCGTAACAATCAAATGTCTGA CGTATGTTAAACAAGCTTTGGAAGTTCTGGATGTGATCCTGGATTGCTTC TTGCTATACCAATTAGAATCTGGTCAAATATTCGATAATGTTGTTCACCG AAACGCTTACGTCACTAATGTAATTTACGCACTCATCTGGTTAAGCATCA TGGTCCAATTTTGTTCTTGTGATTGTTGTCCAGTGGGACAATACGATGTT TTTATGAAAGATATGAAATCCTTCATAACATTTTTGTTCATAGGTTCTAT TCAGCTTATCTTGGAGTATTTTTATATGGACAAATTTGTCAACCGAAAAA CCGATTGGTATTTGTTTGTGAAGAGTGCAATGCAACTGGTCATGACTTGC TGGACTATTTATTCAGCTATTCAAAATGCAAAACGTGCTCGTTTGGTGAA GATTATGGACAAGGATGGAAATGAAGATTCAGGTAATGTCGTTAATGATA TCATCGAACAACGTAAACAGGATGGTTTGGAAATCGATTCTGAACTGCTT GCAGCTCAGGCATTACAACAAATGTGTAAAGAAAATATTCAGAAGCTTGA TGAACTGGAGAATCAACATCGAAGACGGGCCAACATGAAACCACTCGACC CTAACCAAGAGAAAGACGGATCAGTCAAGATGAAGtttttttCCTATATG ATGATCCCAATCGCCATGGCAACCATGTGTCGTGTCATTGGTTCCACTTA 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000041_pilon:289930..297752+

>XLOC_039097 ID=XLOC_039097|Name=XLOC_039097|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3018bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000041_pilon:289930..297752+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCTTTTGGAAACAGTTCTACATTAAACATGACGACATTAAACAACAC
TACAGAAAATACTGTATTCGAATGTTTCAAGCTACCCATTACAGTTGGGA
ATGATACGTTTTGTGGTAATAATTTAACAAGATGGGAATCTAGATATAGT
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TGTCCTCATCTTCAGATTGTGGCGAAGTAAATTTGCTGTCCGAGAAAATC
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GACGAGAGCGAGAATGGAGATAAAGATAAAATCAAATTGAATTGTATTGT
GAGATGTTTCCAGGGGATCGGCCGGTGTTTCAAAGTGGAAGATTTAGGGT
GGAAATTCATATCACTCAAAACTTTCGTAACAATCAAATGTCTGACGTAT
GTTAAACAAGCTTTGGAAGTTCTGGATGTGATCCTGGATTGCTTCTTGCT
ATACCAATTAGAATCTGGTCAAATATTCGATAATGTTGTTCACCGAAACG
CTTACGTCACTAATGTAATTTACGCACTCATCTGGTTAAGCATCATGGTC
CAATTTTGTTCTTGTGATTGTTGTCCAGTGGGACAATACGATGTTTTTAT
GAAAGATATGAAATCCTTCATAACATTTTTGTTCATAGGTTCTATTCAGC
TTATCTTGGAGTATTTTTATATGGACAAATTTGTCAACCGAAAAACCGAT
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TGGACAAGGATGGAAATGAAGATTCAGGTAATGTCGTTAATGATATCATC
GAACAACGTAAACAGGATGGTTTGGAAATCGATTCTGAACTGCTTGCAGC
TCAGGCATTACAACAAATGTGTAAAGAAAATATTCAGAAGCTTGATGAAC
TGGAGAATCAACATCGAAGACGGGCCAACATGAAACCACTCGACCCTAAC
CAAGAGAAAGACGGATCAGTCAAGATGAAGtttttttCCTATATGATGAT
CCCAATCGCCATGGCAACCATGTGTCGTGTCATTGGTTCCACTTACCAAT
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CCTTGTGGTGATTCTAACATTCACGCCTTTGGCAACAATTCAAATTGTTT
ACGCTGTCATACATGTTTGGTTTCGGTTGAACCCTCGTTCTTCTACACTG
GAGAAGTATTTCTTCTGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_039097XLOC_039097-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000041_pilongenomesc0000041_pilon:289930..297752 +
Properties
Property NameValue
Aaloc385-1509:6699
Aaloc1-381:1