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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000041_pilon:289930..296894+ Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_039087 ID=XLOC_039087|Name=XLOC_039087|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=6965bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000041_pilon:289930..296894+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCTTTTGGAAACAGTTCTACATTAAACATGACGACATTAAACAACAC
TACAGAAAATACTGTATTCGAATGTTTCAAGCTACCCATTACAGTTGGGA
ATGATACGTTTTGTGGTAATAATTTAACAAGATGGGAATCTAGATATAGT
GAGGATGGTTTGAAAGCTATGGTAATAGTGCCAGCAATTGTAGCTTTGCT
TGTCCTCATCTTCAGATTGTGGCGAAGTAAATTTGCTGTCCGAGAAAATC
ATGAAATCATGATGGAGTATGAAAGACGTTTATTCAAATTTAGGAAGAAT
CATAAACTTGAAAGAACTGATTCAATGATCAGCCAAGAATTTGAGATGTA
TCGAGTTGAATTTGATATCAAAGACGAGAGCGAGAATGGAGATAAAGATA
AAATCAAATTGAATTGTATCGTGAGATGTTTCCAGGGGATCGGCCGGTGT
TTCAAAGTGGAAGATTTAGGGTGGAAATTCATATCACTCAAAACTTTCGT
AACAATCAAATTTCTAACATATGTTAAACAAGCTTTGGAAGTTCTGGATG
TGATCCTGGATTGTTTCTTGCTTTACCAATTAGAATCTGGTCAAATATTC
GATGATGTTGTTCACCGAAACGTTTACGTCACTAATGTAATTTACGCACT
CATCTGGTTAAGTATCATGGTCCAATTTTGTTCTTGTGATTGTTGTCCAG
TGGATAACATTTTTgttcattggctctgttcagcTTATCTTGGAGTATTT
TTATATGGACAAATTTGTCAACCGAAAAACCGATTGGTATTTGTTTGTGA
AGAGTGCAATGCAACTGGTCATGACTTGCTGGACTATTTATTCAGCTATT
CAGAATGCAAAACGTGCTCGTTTGGTGAAGCTTATGGACAAGGGTGGAAA
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ATGGTTTGGAAATCGATTCTGAACTGCTTGCAGCTCAGGCATTACAACAA
ATGTGTAAAGAAAATATTCAGAAGCTTGATGAACTGGAGAATCAACATCG
AAAACGGGCCAACATGAAACCACTCGACCCTAACCAAGAGAAAGACGGAT
CAGTCAAGATGAAGTTTTTCTCCTATATGATGATCCCAATTGCCATGGCA
ACCATGTGTCGTGTCATTGGTTCCACTTTCCAATACGGTACCGGAAAAAT
TGACCGATCCTGTTTCACTGTTGAGGATGGAGGAAAGATATTCCAAAGTC
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TTGGTTTCGGTTGAACCCTCGTTCTTCTACACTGGAGAAATATTTCTTCT
GAAAACTAATTACCATGAACATCGATACAGTTGGATAGTGTGTTGGATGG
ActaattcacttttttgcttcgttttttgcttcgtttttGTAAGatttat
gtataaacaattaattcttttgttattttaaaaattttggtttaaattaa
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TTCgtagaaaaactatttttcaagCCCGTTCTTATGGCTACTAAAAATAA
AGATGGAGATTCAAGGAAAACCCAATCAGGAGGTTCAAATACTTTGTATG
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ttcaaaattttaaacttaaatttgataatttgaaaGTGTAGGAAAATGTG
TATGAGGCTTTTggttaaaaattaaagaattgtTCTACTCggccaaacaa
ttttttatcatacCTTTCTGAAACTTTGAACCCTGCTGATTTCAAACATG
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AGCAATTTATCTCGGAGCTTTGTAACTTATGatccgaaaattgaaaatta
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aaagttcttataaaaaacatcattCCAATGATAGAGTGCGTTTACAGTGT
TGgattttaaaacaagaaaaagtcaaGCTTTAAGTTTCACTCATGTCCAG
TACTGAGGAAAATTTGCGCTGGTCTCCGGCGAAAGACCTTCGCAAATGAT
TTACATCATTATCTCCCTAATATACCATTTTCGACTAAAGTTTCCAGGAT
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CAGCGCATTTCCCCGGAGATTTGTACTGATTTTGAACCAACGAATTTCCC
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TGCtgtgtctgtgtgtgtatgtgtATCTCTAATGTTTTGCATATTTATTT
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ttttcaaggttttcaaggttttcaaggtttttttggtcattttaaagtgg
tttttcaaggttttttggccaaaactttggcacttttcaaggttttttga
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ACCGCAAAAAGAAATACTCCAGCTCCCTAGTCTtccaactgtagaaataa
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GGGCTCGAATGCAAACGAGAAATTAGTGACAAATCTCagctaatgataaa
aaaatatgtgacagaatcgcaacagaaacagggaaatatggaattctcta
aatgttataaaggttttttacttattcttGCTTTTCGATTGACTGGATAG
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TATGGATGACATATTGTATCTagcgttttctttgttttcacccGTCGTTA
GATTTTATTTGCcatctggcgtttgtgtgaaaaccacgctgGTCACACGT
TTTAAATGGGAAATAAGTTGTTTTCTTTCTAGCCCCTTCGGGAGTTCAAA
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ctgaccatagtcggaaaattgattttactatttgaacataaaagttatgt
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ctggtcaaaaagcactattttcaagattttgaagcaaataagcatttaga
aaaattttccgaaaaaataattttagttagGTACACCATCTAGcgcaata
aaaatttcaaaatgttttttcttcgccggaaataagctcttcaaagttga
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ttctatagttttgtacatttttctaaagtagttttgtattttttgttcta
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TTCTACATTAAACATGACGACATTAAACAACACTACAGAAAATACTGTAT
TCGAATGTTTCAAGCTACCCATTACAGTTGGGAATGATACGTTTTGTGGT
AATAATTTAACAAGATGGGAATCTAGATATAGTGAGGATGGTTTGAAAGC
TATGGTAATAGTGCCAGCAATTGTAGCTTTGCTTGTCCTCATCTTCAGAT
TGTGGCGAAGTAAATTTGCTGTCCGAGAAAATCATGAAATCATGATGGAG
TATGAAAGACGTTTATTCAAATTTAGGAAGAATCATAAACTTGAAAGAAC
TGATTCTATGATTAGCCGAGAATTTGAGATGTATCGAGTTGAATTTGATA
TCAAAGACGAGAGCGAGAATGGAGATAAAGATAAAATCAAATTGAATTGT
ATTGTGAGATGTTTCCAGGGGATCGGCCGGTGTTTCAAAGTGGAAGATTT
AGGGTGGAAATTCATATCACTCAAAACTTTCGTAACAATCAAATGTCTGA
CGTATGTTAAACAAGCTTTGGAAGTTCTGGATGTGATCCTGGATTGCTTC
TTGCTATACCAATTA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000041_pilon:289930..296894+ >XLOC_039087 ID=XLOC_039087|Name=XLOC_039087|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1302bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000041_pilon:289930..296894+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGGCTTTTGGAAACAGTTCTACATTAAACATGACGACATTAAACAACAC
TACAGAAAATACTGTATTCGAATGTTTCAAGCTACCCATTACAGTTGGGA
ATGATACGTTTTGTGGTAATAATTTAACAAGATGGGAATCTAGATATAGT
GAGGATGGTTTGAAAGCTATGGTAATAGTGCCAGCAATTGTAGCTTTGCT
TGTCCTCATCTTCAGATTGTGGCGAAGTAAATTTGCTGTCCGAGAAAATC
ATGAAATCATGATGGAGTATGAAAGACGTTTATTCAAATTTAGGAAGAAT
CATAAACTTGAAAGAACTGATTCAATGATCAGCCAAGAATTTGAGATGTA
TCGAGTTGAATTTGATATCAAAGACGAGAGCGAATGGCTTTTGGAAACAG
TTCTACATTAAACATGACGACATTAAACAACACTACAGAAAATACTGTAT
TCGAATGTTTCAAGCTACCCATTACAGTTGGGAATGATACGTTTTGTGGT
AATAATTTAACAAGATGGGAATCTAGATATAGTGAGGATGGTTTGAAAGC
TATGGTAATAGTGCCAGCAATTGTAGCTTTGCTTGTCCTCATCTTCAGAT
TGTGGCGAAGTAAATTTGCTGTCCGAGAAAATCATGAAATCATGATGGAG
TATGAAAGACGTTTATTCAAATTTAGGAAGAATCATAAACTTGAAAGAAC
TGATTCAATGATCAGCCAAGAATTTGAGATGTATCGAGTTGAATTTGATA
TCAAAGACGAGAGCGAAACTGATTCTATGATTAGCCGAGAATTTGAGATG
TATCGAGTTGAATTTGATATCAAAGACGAGAGCGAGAATGGAGATAAAGA
TAAAATCAAATTGAATTGTATTGTGAGATGTTTCCAGGGGATCGGCCGGT
GTTTCAAAGTGGAAGATTTAGGGTGGAAATTCATATCACTCAAAACTTTC
GTAACAATCAAATGTCTGACGTATGTTAAACAAGCTTTGGAAGTTCTGGA
TGTGATCCTGGATTGCTTCTTGCTATACCAATTAAACTGATTCTATGATT
AGCCGAGAATTTGAGATGTATCGAGTTGAATTTGATATCAAAGACGAGAG
CGAGAATGGAGATAAAGATAAAATCAAATTGAATTGTATTGTGAGATGTT
TCCAGGGGATCGGCCGGTGTTTCAAAGTGGAAGATTTAGGGTGGAAATTC
ATATCACTCAAAACTTTCGTAACAATCAAATGTCTGACGTATGTTAAACA
AGCTTTGGAAGTTCTGGATGTGATCCTGGATTGCTTCTTGCTATACCAAT
TA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000041_pilon | genome | sc0000041_pilon:289930..296894 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 385-651:6699 |
| Aaloc | 1-381:1 |
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