XLOC_039067 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_039067
Unique NameXLOC_039067
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000123_pilon:872931..888123-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_039067 ID=XLOC_039067|Name=XLOC_039067|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=15193bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000123_pilon:872931..888123- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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TGATATTGTTCTACGAAAAACCAAATTTTTCGGCTAAGTACTCTTTTGCA GATTTAGATTATAAGTTTTACAAAGCAACAGCAATGGAAAGGAGTTCTTG AATGATGACAGAAAATCGATTTTTCCCAATAATCTTTGTGTATTCTTCTC CTGTAAATTGAATAGAAAATAGAATGTAACAGATGTACGAATTCTATGAA ATAAGCTTATAGCAGCGGGCTTTCCTCAACGCAAACTTTTTCATGAGAAC CCTCGGCTTAAAAAAAAATACAGCCTCAAGTCCATTTAAACAAAGTATCT AAGCCGTTCAAGAATATTTTAAGAGCAATAAACCCTTCCCCGATGCAAAT ACATTGGTTCTTATAATGAAACTTAAACTTTAAACCGAAAATACTAAATT TTTTGGGACACCTTTTACGTTCTCCTTAACTGCAATCTGAGATTGAAAGA TGCTTTTTTGATGCATACCTCTTTTTTTCACCTTCACTTGTTCACAGGGT GCTATTGCTATCGGTTTGTGCGGTGGCAAAAAAGACGGTGGTCTAATACC GATTAATAAAAATCTATGGTATGTAATGTACTTTTTTTCAATTTCAAAGC CACACTTGTGCGATGAAGATCTTAGTAAAATTATTTAGCTCTCACACTCA ATTACTCTGACAACTTTACTGACTTCGCGAATTATAAGACCTTCTATCAT TCAGTTATTTTTATCGGGCATACCAAGAAAGTTTTGCGTGGAAATGCCTG GAAAATAGATCGTTGTAGCTTTGAGACTGAACGCCAAACTAGGCTATTTT AAACTATCCGAATTTCTAGTCTTTTTTCACCATTGTAAATTGTTTAACGT TCTAGATCACCCCCTTCTCAGAGACCCACTTGGACCCTTCCCACTGGGAA ATTTGGCCAAAATATCGTCCCCGGTGGAAAATTATCCTCCAATTTTTGTC 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TTTGAATTACAGAGAGTATTCTATGCGATTCTCCAGTTGAGGGGACCAAT GTTTTAGTTTGAATTACAGAAAGATTTGAATTTACAGGTGTTTAGAATTA GAGAGAGTTAGCTCCAATATTTGACAAATTATTTTTTGAGCTGTAAATCT TAAACCTAATCACCTCCCTACTTTCACGGGTACTTTCTGGTTCAAAAAGC ACCAAATGAAATAGTATCCTATCGTGAACAAAAGGTCTAAAATGTTGAAG AGAAAATATTTTTGAACCTTTAGCACTGAACAAAATAAGGTCTATAGATT TGCAAAAAAAACCACCCAATGCTTAGCTAATTTCGGAAGGTGTCAGCCAA ACTCTCTAAATCAAAATAAAGCAACATTGGATTAAGTAAAAAAGGGTTAA TTAAATTTCATTCATTTTTGAAAAGTCTACGGCCCTTTTCAGAGTCTCTT CAGTAGTATACCGGGTGCGTCAGAAAAAACTTTGGACGTTTGGTGAGCCA CTGGGACCGAGCAAAGTCTTTTTGAAACTCAAAACCACTTTTATTAGAAA GAGGATAGTCTAACTTAAATTTTGAGGTATAGCTTTTTAAGTTGGGTAAA GTATTTCTCAAGTTATAAGCTTTTGAAGTTAAAATTCACTTTTCGAAAAG TGTAAAAAAACGTCCAAAAAGGGTAATTAAAATGTTGTGACAATAGACAG TGTTGTCGAGGTATGTTAACTCTGGCGAACTCAAGGCAAACCCAAACTCT CTGATCTTTAGTGAGACGCGGCATTTTGAGAAAGAGAGATTTTTTTCCAT ACATCACACTCTTCACAGATAGATTCTCTCAAAAATTCACCAAAATAAAA TTTTTAATTGTTGTTTTACAAATTCCCGCTCTGGTATGTTTTATTACCCA GTGGAAACATTAATGACATCGTTAAAAACGTGCACATCAGAACAAAAGAG 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Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000123_pilon:872931..888123-

>XLOC_039067 ID=XLOC_039067|Name=XLOC_039067|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1590bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000123_pilon:872931..888123- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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GTTTGACTTTCTTGTTACCCGTCCCAGGCTGCAAAACACACTTACGATTG
GAGAGACAGCTTCCGTGGTTTCCATTGCAACATTTCATAATGCTCATTTT
GTTAGTGGTTTACCTGTGTTTGACTTTCTTGTTACCCGTCCCAGGCTGCA
AAACTGGATACCTGGGACCAGGTGGTTTATCCGACAATGGAACGCACAGC
GGTTGCACGGGCGGAGCAGCTGCTTACATCGATCGAAAAATATTTGGCTT
GAATCATATGTATAATAGCCCAACATGCAGATGGATACCTGGGACCAGGT
GGTTTATCCGACAATGGAACGCACAGCGGTTGCACGGGCGGAGCAGCTGC
TTACATCGATCGAAAAATATTTGGCTTGAATCATATGTATAATAGCCCAA
CATGCAGACACCCTTATAAATGTGGTCCACATGATCCCGAAGGTTTTCTT
GGTGTCATCCCATCAATTCTGATGACATACTTTGGTTTAATGCACCCTTA
TAAATGTGGTCCACATGATCCCGAAGGTTTTCTTGGTGTCATCCCATCAA
TTCTGATGACATACTTTGGTTTAATGGCAGCTCGTATGTTATTCATGTAT
TCACGACCGAAAAGTCATATTAAACGTTGGATGATTTGGGCTGTTATTAT
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GTTGGATGATTTGGGCTGTTATTATGGGTGCTATTGCTATCGGTTTGTGC
GGTGGCAAAAAAGACGGTGGTCTAATACCGATTAATAAAAATCTATGGGT
GCTATTGCTATCGGTTTGTGCGGTGGCAAAAAAGACGGTGGTCTAATACC
GATTAATAAAAATCTATGGTCAATTTCATTTATATGTGCGACTGCAGCTA
TGGCTTTTGTATTGCTCATTATCTGTTATGTAACCATTGATGTCAAGAAA
TGGTGGAGTGGTGGTCCATTCTATTTCGCTGGTCAATTTCATTTATATGT
GCGACTGCAGCTATGGCTTTTGTATTGCTCATTATCTGTTATGTAACCAT
TGATGTCAAGAAATGGTGGAGTGGTGGTCCATTCTATTTCGCTGGAATGA
ATGCTATCATGTTATATTGCGGACATGAGATACTGTCCGGTTATTTCCCG
TTTGACTTCGATAATAACGGACAACATGACGAGTTAACACAAGCGGCGGT
TGGAACCGGTGTATGGCTTGTTATTGCGTATTCGTGCTTCAAAAGTGATA
TTTTTTGGAAAGTTTGAGAATGAATGCTATCATGTTATATTGCGGACATG
AGATACTGTCCGGTTATTTCCCGTTTGACTTCGATAATAACGGACAACAT
GACGAGTTAACACAAGCGGCGGTTGGAACCGGTGTATGGCTTGTTATTGC
GTATTCGTGCTTCAAAAGTGATATTTTTTGGAAAGTTTGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_039067XLOC_039067-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000123_pilongenomesc0000123_pilon:872931..888123 -
Properties
Property NameValue
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