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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000192_pilon:290776..298335+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_039002 ID=XLOC_039002|Name=XLOC_039002|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=7560bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000192_pilon:290776..298335+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAGAAATGTGTTTAGAGTTTTATCAACGATTGCAACTAAAGAAGTGAT
TTTTACCAGGACGAATCTCACCAGACAAAACTTTCATCAATATCATCAAA
TACTGTTTTTAAACAACGTTCGACATTTAAGTGTAGCTGAACCAAGAAAC
TTAGCTAAGCCTATGGTTAGTATGGTATATATGTCTTTTGCGTTGAATGA
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AAAATGCttatttttgaggatttttaagCATTTCATTCAATACTCTTAAT
GTCCTGACCGAATAGTTTTCCAAATGTTTAAAGAGAGTGGATTTTTGATT
AGCCTGGATGCTTCTTTAGATACTGAGTGGCGAAatgaatacactttttt
atataagaaccagtaaaattttgttgaggctcggctgttcttattttttc
tcgGCACTTTGatcctcaaattgttcttaaatttcgttcttatttatagg
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aattttgggcttacgccaattaagGCCCAAATCCGGGGCCcaaataacgc
caaaacttgtaaaaatcgctattcaggcttcaaaacagtaagtattagct
aaaatttacattaaaatgtcatctttcagtattaaactgttgaaaattct
attaaaaatcattgattttcgtgaagtttTGGAAATGGAGTAAAAAATGG
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CTCaaagcgattttgagcctcattgttgttataaaattgttcttataaaa
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TGATagcacagccaatcaaattttgctattctttcactggtctcactttc
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ATAGAATATATAAATCGGAGTCAGAGATCGCACCCATCCTGCCTATCTAA
TTTATGATGGcatttaaaggttttacttttacgtaagtgttcccgtttca
tatcaggcacatatttcatatcaatcagtgtcttgctattgttatattat
gctgatataagtaattcctctttctgaccaatcttgctccacatccgtgt
caatccaatgtgaaaaagcttgtgaattaaaattgacgagtaagcaaacg
gtatcactcttatttaaaaacaaaacctttaagtcttGACACTCACGTTT
CTTTCAGGGCGGATGGTCTAAAATGTGTATAAAAGGTctcaattattttt
tgttatagcaatttttcctcttattatttttttatctttatttgaaattt
tgagtctcagtgtattttttaGCCAAAACCGAGCATTGTTTTCTAATAGA
AATAACGGCTTGAAAGTTTTAAACCCTGAGTCCAATGAACTTGATTCCAC
AAAATCATATTTCAACATGAAAATTTACACCACCCACCccctttttcaaa
attcacataaaaaaacttgaaacgaaaacttgtaaatgaaaaaGCTGTGT
ACACATAGAAGAAGAATGGGAAGGAAGGAACCCACATGGTAACAAACTGC
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TTTCGAAATCAAACTTGCTTTAAATGAATTATATTTTGTTAATGAGTGGG
TAGGGATAGGTAATGACACAACCTGGCACATAAAATCTTTTGCGATTTTT
CGTATTATAAATTGGCATTTTTCATTTCCATGTTCAGACAAGTTTGGATC
GGATATGTACGCATCGAGTTCGTTTGATTGAAGTGCGCTGTACGAGAAAT
TTATCTATTCGGTTACAGCACAGCTTATTTGAcctttggaactaattttt
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CCAAATAGAGACTTATACGCGTGCGTAATTTATCGTTATTTTAACCTCTA
GTCGTTAAATAGTCACTGACCAGGTCGGGGTTTGGGACGGCAAAATATGT
CTTTCTTTGATAGGTAGGGTTACTGTTAGGGTTTTTCGTTCTTGTTGTCG
CTTTTTAGAtagtctggaaacgttagatgaacagtctctgACATGTGTTT
GAATTTAAACCAGGAATGGCTCAGCATATCCTAAATTCTTCACAAATTGC
ATGATCAAACTTTCCCGAAAATGTTTCGAGTCAGAGTAGAGGGCGTTAAA
GGGGTGGTTAATTGTTTTGTCTGagaagtactcttaggttccaaataaac
gggggggttcgaataaacgggggggttggaaaattttgtagatttcaata
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caaaaataaggtaaaaataggctaaaatcaggctatatagagcaaaataa
ggggccttctcttcgacagctcaaaatattcttagagattaataaacggg
gggtcctaataaggtccgggggggttggaaaattttcgaaaaattaacaa
gcgggggggcccgtttatttggaacctaagagtaaagaaAGAAGGAATAT
GTTTATTGCAAATCCGCCGGagatcattttgaagaatttcgtTTGTTTTC
ATAAACATGAAGTAATACTCAAAGTAAAGTGAAAAGTTTATAACTACAAT
GTTACACAACTTTACTACGAATctaaattaaaagttttaatttgaaTTCA
CACATGGAAAATCTGCTTGGTACTCATCAAGCATTTTAAGGTTGGTGACC
TTTCCTGTTTTGTAGGAAGAAAAGTAAAACACACAAGAATTTACTAAATT
TGTTAtttaaaagttatgaaattTTAGGGTTAGGCTCAAAGTATCCTTGA
AATCTTCTACAATCCCCCAACAAATATCTTGAGACAGAAGATTTCGAAAC
ATTTTTGGAAGATAAAAATCCGTCCCCCGGACCCCACTGTCAGTGTTGAG
TCCGGAAATGGCCGAGAACTCAACGCTGACAGTGGGGGAAAGGGGGACCA
TGTGAAGTGTCTCAGATATAAATTGGGGGATTgtagttaaaggttttatt
ttcatttaagtgttctcgtttcataccagacacatatttcatatcagtac
agtgtcttgctattggttatattatgctgatataagcaaaaaaaaatgtt
ttcttttcctctttttgacaaatcttgctccacatacacgttttttttta
taagaacgtcaaaaatttttgaagccttcggatgttcttagttttttgga
tttgaagcctaaaaatgttcttaaaatgttcttattttcagcattttttg
agcattttgatgtaatttcttaagaaaatgcatgtttttaagtctccaaa
gccttagaattttcttagaatgttcttaaatttttgggcctcgaagcctt
atgttcttatatagtttgttcttataaaaaaaaaacgtgtacgtgtCAAT
CCATTGTTAAAAAGCTtgttaattaaaattgatgagtaagcaaacgatat
cactcttatttaaaaacaaaacctttaaataccATTCATTAGCCACCATT
TGTAGTGAAGTACGTAATGAAGAATttggaaacaaaaacaaacaatgatt
gtttattttgttgaagtttATGTTTGATGCTGGTCATGTGAGTGAGTAAG
AAGGTAAACTGATTTCGAAAATGAGAGATATAATCTTTACTAAATCTGTG
CGGTCAAGAAATCAAGTGGCAAGTGACGATGGAAAAATCAAGGCAAAGGC
ACAAGGAGGCTGATCAAAAAACCTTGTTGATTGTCAATTAGTTCAGGTAC
CAATCAAGCTAAATGTTTGTTGCCAATTTGGCAGCATGTACGGTGTAATA
CGGGAGGGCGTACAGTATGCTGGGCAAGCAACGCTAGTTTTAAATGAAGT
GGGAAATCAAATTAACATTAACAACCTAGAAGATTATCAGTCAAAAATGT
TCCGACGAGTAGTTTTGTAGTAGTATAGGTTTGAATATTGATTGAAATAT
TCTGAGAAAAATTCGAAGAGTGTACCAGTAGAACAAAGATTTCAACAATG
AGAAGAGATTTCGCAATCACGTGAGCTATTCAGCATGATAGataagattt
tcttttgaatgagaTTTCACGAGATTTCTCTCAATCGGGTACAAAGGTCG
CTTAGAATACTATACTATACTGTACGCTGTACTATTGATATAATGTTTTT
CTCTACGACTAGTAGCTTGTGGGTGATAGTAGGCTGAAAACTTTGATGAA
GTTGTTCAGTGTTTGAATCTTTCATGTTTGAccttgaaagttttgaaagt
tgaCCTTTGGAATTGTTATGATCTGATGATATTCACTTTCCAACTTTCTG
ATTTGCGgaaaatttgttgttgttgatgttaTGTAAACTGTTTACAAGTT
AAATGTTGTTTTGTGTGCAACTACTTAATACCGATAACGTAAAGtgaaag
agttgaaaataataACTTCAAGTTTGACGAACAAGTTTGTTGACATTATG
CAATCTCTTTGGCAAAGCTCATCCAACAATATAACGCTCTTTAGGCTTTA
TATCCCTCCATAATATAAAGGATAAGAAAAGatcaaaaatttacattttg
gCATTAGCTTTTTAAAAGATATCCATTATTCGTTTAATACTTGTCCTCAT
ACAATGACCAAattttgtaatgtttgtaaatcatcaaaattggTTCATAA
AAGACATCTTGATGTTTGATGAAAACAGCTTTTGGAAATTCTTTCTTATA
GCAGGAGGTCTAATCGTCTAGAGGCCAGGGAGAATTATGTAGCTGACATT
GATTTGATGTGTTGTGCTACCCAAACTATGATGTAGTAGAATACACCTGA
CGACCCTTAAAAAAGAGATTTGAAGAGCGTGGAGACTGGGTTGAAATGTA
CCAGGGAGGATTGACGTCAAATGTCTATAGTCGCTGAATTGAATTGATAA
CACAGAATTTTGAAAGGATTCCTTCCTGGTAGGTCAACTCAACTAAGCCC
CTTTGTGGCgtttaagaccatgttcagatgtTACGGCTTCGCATAGCGCC
GGTATGGCTTTCGTTACGGATATAGAGCGTTCCGTTTTGGAACGATGTTG
AATCGCAACATCTGAACATGGTCAAATAAGTGTATTAAATCCAATATCTT
ATTCAggcattttttcttctttagataAAGATGACGCAAGTAGCCACACC
AAGCGATTACcaacaacctacaatcaacccaaacaatggtactgataaca
caacaacaacaaacacaaAGGATTCAAAAATCTATATCCACACTGGCAAT
ATTGCGAATTGGACCAATGTCAAATCACGACGATCCAATGAGATGCCAAC
AAATGAACTCTACCAATCGTTGTGTAGGACTATCACCAAACATGGGTCAC
AGCAATTAGGAGGTAAGTCGCCtggacgttcatctaacgttatatggacg
ttagattcatgtgatattcatgacgtaatgttatctACGGAAATAATCTG
GTTTTCGCCAGCAGTGGCAGATTGGGGTgtttttccgtagaaaacattac
gtaatgaatattATGAATTGAGGATTTCATAACTAGTCCTGAGCACATTT
CTCTAACGGATCCAGACTTAAACTAGACCTCTTGAAGGGGCTTGAACTTT
CTTAAAGTCCGCTTGGTATTTAAAACGAACGGTTTGAGAGTTTCTGAAAA
ATCTGGATTCGACAAAAACACAGCCTCGGAATAATATATTTCTCAAGGCT
TAGTTGTCTTTTACAATGTTAATAATTGAATATAACATGGTAACTAAAAT
ACTTCCCATAGGTTGGAATGAAGAGGAAATCCGTATTAATTGTACCAACA
CTGAGAAGATCGATAGCGTGGAACGAGGTCTACTCAAAGTCACtgctaaa
atattcttacaaaaacTGGACACAAAAAGCATGGTGAACTCTGTTAACTC
AACATTGAAACAACTCGGTTTACACTCCATTGATAGTCTATATCTAGCCT
TACCACCGTTCGCAGAAAACCAACCATTTGCTGAGACTATTTTACCACTT
TGGGAAGAGATGGAGCGGTTCCGCGACGCCGGTCTTGCGACGCAAATCTC
AACTTGTGATCTGGACCATGAGAAATTGAAAACGTTGgttgaaatggtca
aaatcAGACCGGAAGTGAATCAAGTCAACTTAACGTCTTGTTGTCACATG
CCTGAAGATTTGGTACAATATGCTAAAGGTAAAatacaaaattcaatttt
ttaaatctacagttgatgctctctaattcgatcttcaaggaatAAGAGaa
cttatcgaataagggagcgtcgtttatgagagtttcttgttgacggggac
tttaaatctcatcgaataagggagcctatcaaatagtagaacgtcgaatt
agagagcatcaactgtatctGCCAATCTCGTTTTCAAATATCATCGCATA
GGTGTTCATGGTCTTCATTACTTAATGTTTTATATGGGAAAACCCCGGCT
TTtatagccagtagtggcaaactTGTCAGAAGTTTTCTCTAACTCTAGCT
TACATTTTTAAATTTGCTAACAggcaaaaaccggggttttTCCGCAGaga
acattacgtaatgaatataATGAATCTCAACACCATTAGACACATACTCT
CGGACACCTTATAATTTTTCCCCGTccgctttttaatttttgggaaaatg
tttttgaaagttccctcttttgccctaattctgttTTATTAgcctatttt
tcaaattgttgatttcaattgttctctttaatgacaacACGTGggtcgcg
caatgtttacatttcaatacttttatgttcttttaatttctttcataGAA
ATCGGTATCGTTCTACACACGCATGGCGATCAAGCTGTCATGTTACCAGA
TGAGAATGTCGAAGCACTCATCAACGTCCTCAAGCCAGACGATGACCGGA
CTTTTTCGACCGATTGGATTGTCCGTTATGCGGTTGTTGTTAAATGCCGG
GGAGTCATCAAGTCTAAAGGTTACATTGCAGCTATCGATGCTCTCACAAA
TACAGAGTAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000192_pilon:290776..298335+ >XLOC_039002 ID=XLOC_039002|Name=XLOC_039002|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2064bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000192_pilon:290776..298335+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAGAAATGTGTTTAGAGTTTTATCAACGATTGCAACTAAAGAAGTGAT
TTTTACCAGGACGAATCTCACCAGACAAAACTTTCATCAATATCATCAAA
TACTGTTTTTAAACAACGTTCGACATTTAAGTGTAGCTGAACCAAGAAAC
TTAGCTAAGCCTATGATGAGAAATGTGTTTAGAGTTTTATCAACGATTGC
AACTAAAGAAGTGATTTTTACCAGGACGAATCTCACCAGACAAAACTTTC
ATCAATATCATCAAATACTGTTTTTAAACAACGTTCGACATTTAAGTGTA
GCTGAACCAAGAAACTTAGCTAAGCCTATGataAAGATGACGCAAGTAGC
CACACCAAGCGATTACcaacaacctacaatcaacccaaacaatggtactg
ataacacaacaacaacaaacacaaAGGATTCAAAAATCTATATCCACACT
GGCAATATTGCGAATTGGACCAATGTCAAATCACGACGATCCAATGAGAT
GCCAACAAATGAACTCTACCAATCGTTGTGTAGGACTATCACCAAACATG
GGTCACAGCAATTAGGAGataAAGATGACGCAAGTAGCCACACCAAGCGA
TTACcaacaacctacaatcaacccaaacaatggtactgataacacaacaa
caacaaacacaaAGGATTCAAAAATCTATATCCACACTGGCAATATTGCG
AATTGGACCAATGTCAAATCACGACGATCCAATGAGATGCCAACAAATGA
ACTCTACCAATCGTTGTGTAGGACTATCACCAAACATGGGTCACAGCAAT
TAGGAGGTTGGAATGAAGAGGAAATCCGTATTAATTGTACCAACACTGAG
AAGATCGATAGCGTGGAACGAGGTCTACTCAAAGTCACtgctaaaatatt
cttacaaaaacTGGACACAAAAAGCATGGTGAACTCTGTTAACTCAACAT
TGAAACAACTCGGTTTACACTCCATTGATAGTCTATATCTAGCCTTACCA
CCGTTCGCAGAAAACCAACCATTTGCTGAGACTATTTTACCACTTTGGGA
AGAGATGGAGCGGTTCCGCGACGCCGGTCTTGCGACGCAAATCTCAACTT
GTGATCTGGACCATGAGAAATTGAAAACGTTGgttgaaatggtcaaaatc
AGACCGGAAGTGAATCAAGTCAACTTAACGTCTTGTTGTCACATGCCTGA
AGATTTGGTACAATATGCTAAAGGTTGGAATGAAGAGGAAATCCGTATTA
ATTGTACCAACACTGAGAAGATCGATAGCGTGGAACGAGGTCTACTCAAA
GTCACtgctaaaatattcttacaaaaacTGGACACAAAAAGCATGGTGAA
CTCTGTTAACTCAACATTGAAACAACTCGGTTTACACTCCATTGATAGTC
TATATCTAGCCTTACCACCGTTCGCAGAAAACCAACCATTTGCTGAGACT
ATTTTACCACTTTGGGAAGAGATGGAGCGGTTCCGCGACGCCGGTCTTGC
GACGCAAATCTCAACTTGTGATCTGGACCATGAGAAATTGAAAACGTTGg
ttgaaatggtcaaaatcAGACCGGAAGTGAATCAAGTCAACTTAACGTCT
TGTTGTCACATGCCTGAAGATTTGGTACAATATGCTAAAGAAATCGGTAT
CGTTCTACACACGCATGGCGATCAAGCTGTCATGTTACCAGATGAGAATG
TCGAAGCACTCATCAACGTCCTCAAGCCAGACGATGACCGGACTTTTTCG
ACCGATTGGATTGTCCGTTATGCGGTTGTTGTTAAATGCCGGGGAGTCAT
CAAGTCTAAAGGTTACATTGCAGCTATCGATGCTCTCACAAATACAGAGT
AAAAATCGGTATCGTTCTACACACGCATGGCGATCAAGCTGTCATGTTAC
CAGATGAGAATGTCGAAGCACTCATCAACGTCCTCAAGCCAGACGATGAC
CGGACTTTTTCGACCGATTGGATTGTCCGTTATGCGGTTGTTGTTAAATG
CCGGGGAGTCATCAAGTCTAAAGGTTACATTGCAGCTATCGATGCTCTCA
CAAATACAGAGTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000192_pilon | genome | sc0000192_pilon:290776..298335 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 823-1032:7351 |
| Aaloc | 406-819:6314 |
| Aaloc | 166-402:5675 |
| Aaloc | 1-165:1 |
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