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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000192_pilon:255324..273058+ Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_039000 ID=XLOC_039000|Name=XLOC_039000|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=17735bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000192_pilon:255324..273058+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ATGGTATCCGACTTCTTTTATCCCAATATGGGAGGCGTTGAAAGTCACAT
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TGACTAAATTTACCGAATTTGTAAATCTTGTCGAGAATCGAACGGGACTG
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ACCGTGGAATCTCGCGTGAACCGACTATACCGTATTCTCCTCAACAGAAC
GGAGTTGCCGAACGTATGAATCGAACTCTTTTAGAAACTGCACGTTCGAT
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TTCAACCGACTGGTTTTGTCACTCTACCAATGTTTCGTGATATCTTTATC
CGTGAGAAGATCACCATCGTTCATGGACACTCAGTAAGTTATCTCATTCA
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ACCGCTTCACTTATCGACCCTAGGATCTCTTTGTTATCCGTCCAATACTG
GGAGAAGagtattttttcatgatttcatgCCTTTTTATTGTCGTTGGACG
TTGAAATAGCATAATAGGTTTCTTCAATGCTGATAGTGGTCTTTAGGTCT
TTGGATATTTCATAAAGCTCAGTGGACCAAACTTCAAACAGTCACTCCTC
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TGTTTggatttgctgatgtcagctcTATTTTAACCAATAAGCTTCTTGAG
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TTTTATATCACGATAATTAAATCGTCCCACACCATGCTGAAAGCCTTTAA
TTGCCTAACCTCACCATCTCATTATTTACTTTTAACTTTCCAGCAAAGAG
AATACCGTATTACGGGCATCCATACATCCGGATAAAGTTTCAGTCATTGC
AAATGCTGTTGATTCTGATGTCTTCACACCGGATCCAACaaaaaaaGATG
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TAATTCACTGAAAAACTCTTAGCAAAGATTTTGGGTAAGCCTGGGGTCGA
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aacaacaaagacaaaagagagaattcagctgatgtttattctcacctcta
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ttgatatataaaaatttgttgttctaaagatatgatcaattaaagagaat
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tgatagacggtgataaacctttcggtaattagttcttacaaagtaaacaa
agtatggcgcacaatatgagcatatttatttttattataagcatatactt
tataagaatcaaatccataactcttgatagacggtgatatacctttcggt
aattagttcttacaaagtaaacaagggatggcgcacattatgagcttact
tatttttcttataagcatttactttataagaatccaatcaataactcttg
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agaatcaaatcaataactattgatagacggtgatatacctttcggtaatt
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gtttgtttattagttcttaaaaattaaacaacagttgttcttaaattggt
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GGATTGACTTGTTGGCTGGCGTTATTCCTATTCTCTGTCAGAAATTTCCT
CAAGTCCAATTCATTATCGGTAAACATTAATTCCATACCTCTATTTATGA
TACTGTCGGCATTGTCTTGGAAAGAGTGGGGGTCTTAGTTAGTCAGGGAA
AAAACTTCGTCAGCTAGAGacaattttgtcaaattttcctggactaaatt
gtccaaaagaaactttttatttCCATAGCTCGAAAATAAATTTCGTATTT
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ttagaATAACAATATTGTGAATTTTAGGTGGTGATGGGCCAAAACGTATT
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ATAGTGTTTTGAGAATTTCGGAAAGCCTCTAGGCTACTGGCATTCACTAA
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ATTGAAACTAGGAGAGCTTCGTTAAACCAGAAACCTTCCCATCGGTCGTA
GGTCAGCTTGAAACCACATGGTTTTCGTCCGACATATCCTCCTTAGAATG
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ATTTTCTATTAGTGAAACGAGCTTCACGTTTGCCTTGTTGCTCTCAGCGC
catgatattcaaaattttcaattttcttgggTTTTCAATTTAGTTGCTTG
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GCAATTGTAGAAGCCGCATCTTGTGGGTGAGTTCAATTTCTCTCGGACTT
CAATTGCTAAAATCTTTTTCCTCTCGGGAATTTCGCTTTATTTGGGATAT
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GTTGTCAAAAGCTTAGTTTTTCCGACTAATGAACTTgcaaattttgatgc
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GTTCATTTTAATGACTAGTAAAATGCACAACTAAAAGTTGTTACCAAGGA
TCTCTGGATACACCACTTATTAATTAAGCTTATTAATCTTATAAACAAct
tcgaaaaaaattaattcgatGATATTTACATTGCTTTTCTTTTCAGCTTG
CAAGTAGTAAGCACCAACGTTGGGGGTGTTTTTGAAGTATTACCTTCAGA
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AACCTATTTCCATGTTTAAAATTCATTCAACCAGAAACCATTTATAAACC
ATTATAATTACTCAACAACTCAAATCAACCATTTGATAAAGGAATTAACA
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caggctcgcattatgcttagcattctattgttctcaaacaatagagccat
tgtttaggtaccaaaaactgagcctgcatatgcttataaacgttatgctt
ataaaagaaaaaacatgtatattcGAGATAATCGAATGAAATGGTATATA
GTAAATTTGACTTGTCGCCAAAATCACCGttcactttgctcgacgacggt
aaaaacacgaAAATGCCGTCGTCTGTTTAAGTGAACAAAGGCGTTAAAAA
CCCTaagattgggctattccagaaaaaaattataccccctatgttgagga
gatctttttttttaaatgtgaccgccctggattttttagcaatttttcag
gacctcgtttgattttttttctcctatttctttgaaccaccctggatttt
ttattttccaagccaccctggacgtcacacctcctcaacatagagGGTAC
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AATCCGGTGTTTTGGGCGTAGATTTAAACAATACATGAGGTGAGATTCAA
GTTGTCCATGACCGAGAATATCTTTCGAAAAGTAATGATATGATAATATC
GATCTATTTATGAAACTCCACTTTAATCCGACACAGATACTTTCCCCTTT
CCAAATTTTAATACTCCTATCTTCAgcaatataccttatcggccaaaact
tagtcggccctaagtgactaaatttttggATTGGTGAAATAGCTATCTCA
TGATCTAACATCGAAACCCTATAGGCGAATCTTCAACTTTTCATAAGCAA
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taacgttaaatggacgttgtgaacgttagattaacgttgaaacaacgttg
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GCcacatttcgaaaaatatatgccgcgtgaaaataaaaaaaatgcttGAT
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ATTGTTTTCAGATATCACACGTGTTATGGAACAAGCAATCAGTGATCGTG
TTAAAGGTCACGTGATTGATCCTTTCGTTCTGTATTGACCAATGTAATGT
ATTCTTCATTGTTTTCAGATATCACACGTGTTATGGAACAAGCAATCAGT
GATCGTCTTAAAGGTCACGTGATTGATCCTTTTGTTCTCAATCAACGAAT
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GTGTACACCAAAAAACCCTTTATAGCTAAGTAAACCTTCCCTTTTATAAT
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AGATCTCGTTAATTCGAATTTCTTTTAatcgaatttttctataattcgaa
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attcgattttttctctatttcgaagaaaaatattttggttccttgaagat
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ATTGAAATTGGAAAGCGATATGGAGATGTTTTTAGTTTGAGTCTAGGTAA
GTGTGTTTGCTTTCTCctagtacagtggagtctcactaactcaagataaa
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GTTGcaatttaaaattaattaacaaattaaaattttctcattcagagaaa
atttaccaagttcaattatttttgaacCCACTCAATTCATAAAGCATCAT
TAtttaaaagtatcaatttttgagaaaaatgaatattCTGTTCTAAACTC
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CAAAATTGGGTGGTCTCTGTGTCAAAATGTACCTAAAATTTTTAGTACAT
aggtactaaaataccacttttctaaaatggggtggtggtatgcaagaaat
tctcgaaaatccttttaataCACATATTTGTCCAAGTTGTCCTAATACAA
CGAATTATTTAATTCTACATTTTTATCCAACATGCTGCGAACAATATTgc
ttctttttcagaaaaaattttttctgtctgtttgttaaatgaaaattgaa
gtttGGCCAAAAGCTTTTGTACAAGAGAAGataatataccgggtgaccca
cgaaaaagttcaaaagtgttttttacacttttcgaaaagtgaattttgac
tttaaaagctcataagtagagaacaagttggtcaaatttgaaaagtgatg
gctcaaattttaagttaggatatctactttctaaatatcaaaactccaag
cactttaggacatttgttcggcctcaagacgtcgggaaacgtctgaactt
tttcgtgggtcacccggtacataTAATCTCACTGTAAGTAATCTCAATTT
TGTAGGAATGACTCGTATAGTCATTATCAACTCCTACACCAATATCAAAG
AAGCATTGATCACGCGAGGAACTGATTTTGCCGGACGTCCGACAGATAGT
ATCGTCAACCGTATTCCATCCAATAATTTCACCAGTGTCATATCCTTTGA
TTACtccaaatcttttgttttcgttCGGAAACTTGCCTTCAAGAGTCTTC
ACTTGTATGGAGCTGGTATGAAGAATATTGAAGACATTGTGATTGAAGAA
GTCGAAAAGATGTGCTCCATACTCACCAAAGAAGCTGGAAAGCCAGTCCC
AATCAGACATCATCTAGGTTGGTTTCAATTTattttcccttttacttcta
ttttgaaagaaagtcgtttgtctttttcttaaagattttatttttacata
agttttcCTGTTTCAtttcagacacatatttcatattgtctgcctattgt
tatattatgctgatataaacaaagaaatgtttttcttttcctctttttga
ccaatcttgccccacatccgtgtcaattcaatttgaaaaagcttgtaaat
taaaactgatgagtaagcaaacgatatcactcttatttaaaaacaaagcc
tTTAAGCATATTTTTCGCTTTTGGAATAGGATAAGGTGGTTTTGGTCAGG
GGTTCAATATTTATAACGGATAGTTTCCTTGTACctcaaatgaaaagaaa
gattcttagtttatatatattttttagcgCATCGCAAATCCGCCACTGCA
CGGACTGTAAAGCTGGGCGATGCATCCAACATTATTGTTGCATGAAATGT
GCAAGTCATAATATTgcaactttttaataaaaatggtggaaatcatgttg
gatgaagtttgagcaccaaacatttcatccaacatttttatgaaattaac
GTCACCTTCATGTTGCTTCcaatgtttgacgtttttgtgcAAATGACTTT
TCGTGCAACTTCGATTTTTTCCACGTGACTTTCATCCAACATTTCGTCTA
ACAAAGAATTTGgaatgttggatcaaatgtcGGATGCATTTGCGCCGCCT
TAAGGTAGGAAGCTTCATTATTTTACCTGCTCAACATCATAGAAATACTT
CTTTTCATTCCCAGGAAATTCTCTGGTCAACACCATATGTCATCTTTGCT
TCAGTAAGAAATACGATTCACACGATCCTGAATTTCAACAGATTCTGGAA
TCCATGAGAATGATTATCCAGGGTCTAGCACCTGGTTAAGCCATCTCCAT
ATTCCCCTGGCTAAAATACCTACCACATAccaagaaattcaaagaattac
TCAAAGGTTCTGAAATACGCGATTCAATCACTCGTAAATTCTTTGAAGAA
CACATCCAAACTTTCAATCCAGAGAAATTACGAGATTTGACAGATAATTT
GTTGTACTTGTCACAAAACAAGGAGATGTGGCAGGATGCTGGTTTTGAAA
AAGTCACACAACTTCAATTGGAATCGATCATCAATTCAATCTTTGTTGCT
GGCATTGAAACCTCTTTATCCACTCTCCGCTGGATGTTGATCTATTTATT
TCACaatccaaaaattcaaaacaagatCTACAATGAATTATACACAAACC
TTGGACCTAAGCATCAAATCACTACTGAAGATATGAGATCATTACCCTAC
ACTCAAGCTGTTCTCCATGAAACCAACCGGTATGCGTCTACGCTACCTCT
TAGCATACCACACAAGACGACTGTCGATACTTCAGTTGCCGGCCTCTCAG
TACCCAAAGGAACACAAGTCCTTTTCAACTTATACAGCATGCATCACGAC
CCAACCCATTGGGATGAACCAGAGAAGTTTAAACCAGAACGTTGGCTCAA
TCCCGATGGTAAtctcaagaaagaaaaagttagCCATTATCTACCCTTCT
CGACAGGTACGCGGGTATGCCTTGGAGAGAGGTTAGCTAAGATGCAAATG
TTTTTGATTGTCACCAAATTGTTTTTAACGTTCGAAGTGGAACTTGCTCC
TGGAGAAAAGGTGCCAGATATGAAAGAAGGCAACATTGGGATTACCCTGG
AACCGAGAGATGACTTCAAAGTGATTCTCAAACCCCGAAAACATTGAAAC
CGAACCCTAGCCTGAACCATAATGTCCAAAAAACgacataaaaaatatat
tagaaaaCAGTTATGTAATACTATTAGGTGGAATTCAGATTTTTTACTGC
GGCAAATGATTCGGAGATCTTCTTCACAAGTTGAATCGTATCCACCACAT
GTTTACGAGTTTAAATAGCATGAGgatttgatattttatgatttatgaGT
TGTAGCTTATTCTAACACATCATAGAAAGATAACATTATAAGAAATAAAA
TCgagttttaaaatattgataccCATTTAACGCGACACTCTTCATCTTCA
AAAGCGTAAAAATAATATCTATCTGTTTTCCTATTTTACAAACTGGCCAG
TATTATACAAAAGGTACTTTTCTGGACAAATGTAACTAGTCTAATTGTCT
TTAGATTTTGATAGAATACTGCATTAAGTATTAACCTTCCCTCCATGAAA
AGATCTACTGAAAGATAAATGTTACTTGGCAAATCAATGCGCCCTAGCCC
GGGTCAGCTAATGTCAAGACAATGGCAGTGCTTACGGCAGCGACCCTTTT
CAGATTCAACCTTGCGAGGAACGCAACTTTTCTCCCGTGTTCAAGTTTCG
GTACATTAAGCCTATACTAGACAACACCTACGCAACTAACGGCTATTCCA
CAAATCGTCACAATCACGCCACCATCCTCAAATAGGTCAATACATAAACT
AACTAATGCTATCCGGGAAATGTGTCCTTTCAACGGCTGGTTTATCATTT
TTGTCCGATTCGTGTAGTTTCATTGACAAGTTGACCtgatgaaaataact
ttttctttaGGTGTACGATTCGATCAGTAACAATGTCGAGTTATCCATCA
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TTACGGGGCAAAATTCCTTGGTGTTAACTTCTTAGAATGCATCACACAAT
CACTCCTTGAATAATCACTTTGTCCTTCTTCCGCCCTGATCTAGATTTGT
TGCGTTGAGCAGACAACGGGACACCATGGGACTtgggtttggaaaaaatc
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TCTCCAAAATACGGTTTGTTTGCTCTAACGCTTGCTTCTATCATTTGTTT
ATTCTTCAGGTTTGAAGGTCGAGCTGTGATTGCTGGCAAGTTTTATGTGT
TCACCGTATTCGTggatttgttgtttttgttcattcttgATTGGCTGTAC
CCAAGAGATGAAGTAAGTTGGTGTTACGCCCATAAAAATTCATTATATTT
TGATTCGAATCGTTATATAATTTTATCATTCCCTTGGGAATTGGATTTCA
ATTGAACGTACAATAGGATTGTACTTTATAcacaatgtttttctttttcg
gaCATGTATAATAACCCCTGAGACTCCGTTGTAAAGTGGGAATCAATGTG
CGCCAGGGTGGTAGTTTAGAAAAAGGGCGCCCCATTCAGCTTAAAATTCT
TCTTACAGAAACTTTTCGTTTTTCACAGTCTCAAAACCACGATACGAAGA
CAGCAAGGCAATCTGATCGAAAGAAGTTTTCTTGA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000192_pilon:255324..273058+ >XLOC_039000 ID=XLOC_039000|Name=XLOC_039000|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2598bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000192_pilon:255324..273058+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) ATGGTATCCGACTTCTTTTATCCCAATATGGGAGGCGTTGAAAGTCACAT TTATCAACTATCACAATGTCTACTTGCAAGAGGACACAAGATGGTATCCG ACTTCTTTTATCCCAATATGGGAGGCGTTGAAAGTCACATTTATCAACTA TCACAATGTCTACTTGCAAGAGGACACAAGGTAATCGTTGTCACACACGC TTATGGTAATCGAAAAGGAGTTCGCTATCTGACCAATAATCTCAAGGTAA TCGTTGTCACACACGCTTATGGTAATCGAAAAGGAGTTCGCTATCTGACC AATAATCTCAAGGTATATTACTTACCATTCAGTATCATGTACATCAATGT CATTCAACCGACTGGTTTTGTCACTCTACCAATGTTTCGTGATATCTTTA TCCGTGAGAAGATCACCATCGTTCATGGACACTCAGTATATTACTTACCA TTCAGTATCATGTACATCAATGTCATTCAACCGACTGGTTTTGTCACTCT ACCAATGTTTCGTGATATCTTTATCCGTGAGAAGATCACCATCGTTCATG GACACTCAGCATTCTCAGTTCTCTGTCAAGAGTCAATCATGCATGGTAAA TCGATGGGATTAAAGACAGTCTTCACGGATCATTCGCTGTTTggatttgc tgatgtcagctcTATTTTAACCAATAAGCTTCTTGAGTTTACTTTGACGG ATATCGATCACGTGATTTGTGTTTCAAACACAAGGCATTCTCAGTTCTCT GTCAAGAGTCAATCATGCATGGTAAATCGATGGGATTAAAGACAGTCTTC ACGGATCATTCGCTGTTTggatttgctgatgtcagctcTATTTTAACCAA TAAGCTTCTTGAGTTTACTTTGACGGATATCGATCACGTGATTTGTGTTT CAAACACAAGCAAAGAGAATACCGTATTACGGGCATCCATACATCCGGAT AAAGTTTCAGTCATTGCAAATGCTGTTGATTCTGATGTCTTCACACCGGA TCCAACaaaaaaaGATGCCAGTAAAACAAAGAGAATACCGTATTACGGGC ATCCATACATCCGGATAAAGTTTCAGTCATTGCAAATGCTGTTGATTCTG ATGTCTTCACACCGGATCCAACaaaaaaaGATGCCAGTAAAATAACGATC GCAGTAGCAAGCCGACTTGTATATCGCAAAGGGATTGACTTGTTGGCTGG CGTTATTCCTATTCTCTGTCAGAAATTTCCTCAAGTCCAATTCATTATCG TAACGATCGCAGTAGCAAGCCGACTTGTATATCGCAAAGGGATTGACTTG TTGGCTGGCGTTATTCCTATTCTCTGTCAGAAATTTCCTCAAGTCCAATT CATTATCGGTGGTGATGGGCCAAAACGTATTTTATTGGAAGAAGTCCGAG AAAAATACCAACTTCATGAGAGAGTGCAATTGCTGGGTGAACTTAAGCAT AAAGATGTGAGAAATGTGGTGATGGGCCAAAACGTATTTTATTGGAAGAA GTCCGAGAAAAATACCAACTTCATGAGAGAGTGCAATTGCTGGGTGAACT TAAGCATAAAGATGTGAGAAATTTGCTTGTACAAGGAGACATCTTTCTTA ACACGTCGCTGACCGAAGCTTTTTGTATTGCAATTGTAGAAGCCGCATCT TGTGGTTGCTTGTACAAGGAGACATCTTTCTTAACACGTCGCTGACCGAA GCTTTTTGTATTGCAATTGTAGAAGCCGCATCTTGTGGCTTGCAAGTAGT AAGCACCAACGTTGGGGGTGTTTTTGAAGTATTACCTTCAGACATGATAT ATTTGGCTGAGCCAAGCGTGCAAGCTTGCAAGTAGTAAGCACCAACGTTG GGGGTGTTTTTGAAGTATTACCTTCAGACATGATATATTTGGCTGAGCCA AGCGTGCAAGATATCACACGTGTTATGGAACAAGCAATCAGTGATCGTCT TAAAGGTCACGTGATTGATCCTTTTGTTCTCAATCAACGAATCAAATCGA TGTACACGTGGCAAAATGTCTCAAGAAAGACAGAAACTATATCACACGTG TTATGGAACAAGCAATCAGTGATCGTCTTAAAGGTCACGTGATTGATCCT TTTGTTCTCAATCAACGAATCAAATCGATGTACACGTGGCAAAATGTCTC AAGAAAGACAGAAACTGTGTACGATTCGATCAGTAACAATGTCGAGTTAT CCATCATGGAACGTCTCGAAAGGTGTACGATTCGATCAGTAACAATGTCG AGTTATCCATCATGGAACGTCTCGAAAGGTTTGAAGGTCGAGCTGTGATT GCTGGCAAGTTTTATGTGTTCACCGTATTCGTggatttgttgtttttgtt cattcttgATTGGCTGTACCCAAGAGATGAAGTTTGAAGGTCGAGCTGTG ATTGCTGGCAAGTTTTATGTGTTCACCGTATTCGTggatttgttgttttt gttcattcttgATTGGCTGTACCCAAGAGATGAATCTCAAAACCACGATA CGAAGACAGCAAGGCAATCTGATCGAAAGAAGTTTTCTTGATCTCAAAAC CACGATACGAAGACAGCAAGGCAATCTGATCGAAAGAAGTTTTCTTGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| sc0000192_pilon | genome | sc0000192_pilon:255324..273058 + |
Properties
| Property Name | Value |
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| Aaloc | 1159-1260:17311 |
| Aaloc | 1102-1155:16961 |
| Aaloc | 976-1101:11821 |
| Aaloc | 889-972:9448 |
| Aaloc | 805-885:8994 |
| Aaloc | 700-804:8480 |
| Aaloc | 592-696:8064 |
| Aaloc | 475-588:4445 |
| Aaloc | 298-471:3822 |
| Aaloc | 175-297:3311 |
| Aaloc | 109-174:432 |
| Aaloc | 19-108:1 |
|