|
|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000019_pilon:1044613..1050048+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_038983 ID=XLOC_038983|Name=XLOC_038983|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=5436bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000019_pilon:1044613..1050048+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
atGATGATCGAAAAAGTCGACAAAGCGAAGtatcatttcaaaaaagaaat
tgcaaaTAACGTCAGAAGATTTTTAATACAATTAATTTTCCTGGGGATCC
TGATTTTCACATCGAcgacaattttcttttttgtggaAGAATGTTATTTT
CATGTTCCACAACCTCCAACAAGTTACAATCAAATGTGCAACCAGCTTTG
CCAAAATACTAAAATAATTAACGAAACACAGTCAAATAACACTGAGATTG
TTAATTTGTTTGGTAACGTTACAAAGTTTTGCGTTCAAGCCAAATGTAAT
TTAGAGGAACATGTTTCACAAAGAAATTGCAAGCTtggtccaaaaaatgt
tttcaaatggtGGGGATTTGTCGTGACAACAATTTTTACGATAGGTAAGT
TGTTCTAGATAACTTTATCATcttcaaaggttttgtttttaaataagagt
gatatcgtttgcttactatgcaattttaattcacaaactTTTTCACGTTG
GATTGACGtgtatgtggagcaagattggccatttttgcttatatcgagca
caatataacaattggcagacactgccctgatatgaaatatgtgtctgata
tgaaacgggaacacttatgtccATCGAATTTCAATGAGGATGAAAAGATA
GTCAGTATCTCATTGAGATTGAAAttattgtagggtatttttccaccagg
gacgaaattttggtcaaaagttTAAGTAGGGTGGGGCTCCCATCATCTCT
GAAACGAAGGAGTGCTATTTCGTATGCACCTTAGATTGAACCTTAAATTC
GCTGTTTATTGTTTTATGGTATCTTTGAAAATATAATCTAATCTATTGCA
TTAATTTTCCTATTCTAGGTTATGGCAGAACCGTGGCAAAATCTACGCTT
GGCAGAGCTTTAACAATAGTGATGGCAATTATCGGTATTCCGATGGCTTC
TgccaatgttttgttttgtggtAAAGCTATCAACAACACAATCAAATATT
TAATCGTATGCTTTGAAAACGCTTGCTTGAAACGCCAAAAAATTGTATGG
CTTAAACGCAAGGTGGCAGCTGTTCAAATTTATTTGACAATATCAACTAT
ATTGCTTCATTCTGTTTTCTACAAAATGACAACTTTGCAGGAAAGCAGCT
TCTTTGAGATAATCTATTACGTTTGTGTCACGATGTTGACTATAGGCTTC
GGCGATGTTTATCCAGACACCACTTATTTATACCAACTCTCAATGGTACA
ACTAGTTATTTTTACTTCACTGGACGTAGCATTTTTCTATTGGACTTTCT
CATTGTTGGGATCAATTATTGATTTTATACGATCTTTAGAAACTGATTTG
GGGACGAAGGAAAACAAAAAGGACATTGATGGAAATGACAGTTATGTGGA
ACAAATTGATAACTCCATAATCTCTTGACCTTGagatgaaaataaattta
ccAGTAAGATGGATATAGATTCAGAATGAACTAacctttttgtttgattt
gattcaaacataaaaatctgACTGGTTGGTTAACTGTATTTGCTCATCAA
CACTTTATTGACTTTTGttgaaagctttatgaaaaagGATTTTGGGTTCA
AGTCTGTCATGCTCGAATGACATCAACATCAACTAGCCGAAATCTGATAT
GCCCACAACTAATATTTAACCTCATTTTCACTATATCAATCATTTTTAGC
AGCCTCTTATCGCCTTTTATCGGCTTAATAGAaaagcctgttagacgaaa
accgcctTTTTGTTGTACAAACGTTTAATAAACAAGCAAAAAGATTGGTA
TGTTTGAAAGGTAATTGCTATGTCATAGGTGGTACCCTAGGTGGCATTGA
AAATTCTTAATCGCAAAGACGTAGGTGCTGTCGAAATATATCAGACTGAG
TTTGATTATTACTCCAAAACATTACCTGTGATTATATAGTTGTTAATTGA
GATGAGCGACGCAACACtttttttGTACATCAGGTCCCACGCTATGAATT
TGAAAGTGGGGGGCaatgaatatagagtctaaAGAGGCGCAACCAAAATc
ttttactttgcaaaaaagtgggggccATGGCCCTGTGccccccccTCCGG
TGGCGTGGGTCCTGTACATGTCTTTTCGTATCGTGGAATTGGTGCTGGAT
TACGTTAATCCTTCTTTGAAGGAGAAACGAAGCGTAACAGAAATCAAATT
TAGatgattattttcttatttttcagattttaaccACATCTTTTAATCCT
TTTAATCTTAATCCAACAATTATGATATACCTATTTCATCTTATTTGTAT
TTCCTGTTGTCCTCAAAGTCAGAGGTGACCATTCTTTGATTAGCCTTTAT
GTTACTGTGAGCACCATTGTTTcgctttttttagatttaacctgttcaaa
cacccccttctcacagacccggtaggattttttcagccgtTATTTTCaca
ataacggactgaaactcaatggggattgagaTTCCCAtttttttATGACC
GGGGATATAAAAGTCttttgtcagaaaattcagtgggaatgtgaaaatag
cataatattttgcagtgaggattggtttatttgattattttcagtgggga
caaaaattagtgtataattttccattggggacaatattttggtcaatttt
tccagtgggaagggctTCCAGTGAGTCTGTGAGAAAGCTGTGTGTTCAAG
ATCTCAAAGTTGTCTCATTATTTTCTATAAAACCGGAAAGTTTTTGCAAA
AGGTATGGGTATTTAGTAGCTTTGTGGGAAtttttttGACATTCTTCTCT
CTTTAATTGATTTCACagattttagaatttcaaaactATTTATCAAACAG
ACCTCAAAGAATTCCAGCCCCCTTTTTATTTTGGACCCTCCCTTTAATTG
AACGTTAAAggatatttttaaaacttagGATGggattttttccctttttt
ttttttttactgagGAGGtttaaaactaatttgaaaTTCTTAGACCATAA
AATGATAACTAATTGAAAATTCCTGGAAATTAGGTTTAAATATCTCATCA
ATAATTAGTTTAAAggttatttatatattttctttacACAATATCATTTG
TAAGAAaaatagcctgattttcaatttaattatttttgagccaTGGTGCG
ACGTATAAAAAGTTAGTTCAGATATTTTGGATTCTTTCTTCAGTATGTGA
AGTctgagaaaaagtttttttccagaTAATTATTGAGTGAATCTGATCTG
AGAagaatgatttattttttcttgtcctttctttttttaagttactgctg
ggtttgaaaaataattttaggttgtgaaatgggcttttccagaaaaaaac
cgtataccccctatgttgaggaggtccatccctaTGTGGCTGGAAATGAT
GtaaccctctggaattctgaattttagtaggatttaaaatcCTACCCCCA
tagaattccagttatttttgacagatttttatatctccctatggaattcc
gccacatatcaaaccttaccccatTGGAACGGAAattgacctcctcaaca
gggggtatacggtttttttctggaaaagcccaattcttTCTGTAGATATC
AACGTTTAacaaaaaacgtttttctttttatcaataatcCTATATCCTAT
TTCAAAGGAAAACAACTGAATCTaacttttgatcatttttgtcCCGATCA
TGATTTATTCGATTCATCGGGAATGAATGAGTATTGATAGCGGTATTAAC
TTTGATGGAATTTATGGATCGAACATCAAATAACAACATTTTCTATTCAG
AGACCACAAAACCTGTAAACTTTTAAACTGATTTCTTTAAGTGTATGGCA
TAGAATCATTTgtagaaaagtttgaaaataaatttcggAAGATGATCATT
GAAAATGTCACTGAAGCAAAATGTGATTTCAAAAAGGAGATCTTCCATAA
TGTCAAACGGTTTCTGAGACAAGTTGGCTTTTTAGCGATCCTGATTTTCA
CATCGAcgacaattttcttttttgtggaagaatgttattttcatgttcta
caacCTCCAACAAGTTACACTCAAATGTGCAACCAGCTTTGCCAAAATAC
TAAAATAATTAACGAAACACAGTCAAATAACACTGAAATCGTTAATTTGT
TTGGTAACGTTACAAAGTTTTGCGTTCAAGTCAAATGTAATTCAACGGAA
AATGTTTCACAAAAGAATTGTAAGCTtggtccaaaaaatgttttcaaatg
gtGGGCATTTGTCACTACCACGATCTTTACGATAGGTATAAagtcttttt
tgaattcttaTGCAGTGTAGACAATGCGCTTACCCAATTTTCAGAACATT
TGAcctttcatcaaaaattataaagttCCCACCTATTTTGGCCAAAACAT
TGAGAAATCGTGGCCCATTGAGAGAGCAATATTCAGATTGTCTTGGACAA
TAGATcggtcccgggggggggggggtactagggcaaaatgggttacgggg
atgctccgctggtcagggtaccttttttaacctccacgagtcccaggtag
ggtcgcaaaaacaccaaaatagaaaaatcagtcccttgtagggtgcctat
tttgggaaaatttggggaaaaagtagaaaatttgagaaaattttggaatt
tcagtcccattcagggtcacttttttcgcaaatttcgagttccacgtagg
gtccatttttcgaacctcagcggagcacccccgtcggtcgacaagggtag
taccccccccgggagatCGGTTTCTGTTAACCCTAAGAGCGATTTTTGCA
TATACCTGTAGGTACCCGGGAAAGATTTGTCAGTTCATCACATTTTCATT
TAGCAATCAATACTTTGTTTTTCCAGGGTATGGCAGAATCGTTCCGAAAT
CGACGCTTGGCAGAGCTTTAACGATAGTAATGGGGATTATTGGTATTCCG
ATGGCTTCTgccaatgttttgttttgtggtAAAGCTATCAACAACACAAT
CAAATATTTAATCGTATGTTTTGAAAACTCTTGCTTGAAACGCCAAAGGA
TTGTATGGTTTAAACGCAAGGTGGCAGCTGTGCAAGTTTATTTGACCATA
TCAACGGTCGTACTTCACGCTGTATATTACAAATACACGTCGTTCCAGGA
GAACGATTTCTTTGAGATAACTTACTTCGTTTGTGTCACCATGTTGACTT
TGGGATTCGGTGATGTTTATCCAGACACAACTTTTTTATACCAGCTGTCA
ACTATCAATCTAGTGTTTGTCACGTCCCTTGATGTTGGACTTTTCTATTG
GAATTTGGCATTATTGGGGTCAATAATTGATTTTATAAGATCTATAGGAA
CTGAGTTGGGAACAGTACCCATGAAGAAAGATCATATCCACGATGACGAT
TCGGTGGTGCAAAATGATAATTCTATAATCTCTTGA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000019_pilon:1044613..1050048+ >XLOC_038983 ID=XLOC_038983|Name=XLOC_038983|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2046bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000019_pilon:1044613..1050048+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
atGATGATCGAAAAAGTCGACAAAGCGAAGtatcatttcaaaaaagaaat
tgcaaaTAACGTCAGAAGATTTTTAATACAATTAATTTTCCTGGGGATCC
TGATTTTCACATCGAcgacaattttcttttttgtggaAGAATGTTATTTT
CATGTTCCACAACCTCCAACAAGTTACAATCAAATGTGCAACCAGCTTTG
CCAAAATACTAAAATAATTAACGAAACACAGTCAAATAACACTGAGATTG
TTAATTTGTTTGGTAACGTTACAAAGTTTTGCGTTCAAGCCAAATGTAAT
TTAGAGGAACATGTTTCACAAAGAAATTGCAAGCTtggtccaaaaaatgt
tttcaaatggtGGGGATTTGTCGTGACAACAATTTTTACGATAGatGATG
ATCGAAAAAGTCGACAAAGCGAAGtatcatttcaaaaaagaaattgcaaa
TAACGTCAGAAGATTTTTAATACAATTAATTTTCCTGGGGATCCTGATTT
TCACATCGAcgacaattttcttttttgtggaAGAATGTTATTTTCATGTT
CCACAACCTCCAACAAGTTACAATCAAATGTGCAACCAGCTTTGCCAAAA
TACTAAAATAATTAACGAAACACAGTCAAATAACACTGAGATTGTTAATT
TGTTTGGTAACGTTACAAAGTTTTGCGTTCAAGCCAAATGTAATTTAGAG
GAACATGTTTCACAAAGAAATTGCAAGCTtggtccaaaaaatgttttcaa
atggtGGGGATTTGTCGTGACAACAATTTTTACGATAGGTTATGGCAGAA
CCGTGGCAAAATCTACGCTTGGCAGAGCTTTAACAATAGTGATGGCAATT
ATCGGTATTCCGATGGCTTCTgccaatgttttgttttgtggtAAAGCTAT
CAACAACACAATCAAATATTTAATCGTATGCTTTGAAAACGCTTGCTTGA
AACGCCAAAAAATTGTATGGCTTAAACGCAAGGTGGCAGCTGTTCAAATT
TATTTGACAATATCAACTATATTGCTTCATTCTGTTTTCTACAAAATGAC
AACTTTGCAGGAAAGCAGCTTCTTTGAGATAATCTATTACGTTTGTGTCA
CGATGTTGACTATAGGCTTCGGCGATGTTTATCCAGACACCACTTATTTA
TACCAACTCTCAATGGTACAACTAGTTATTTTTACTTCACTGGACGTAGC
ATTTTTCTATTGGACTTTCTCATTGTTGGGATCAATTATTGATTTTATAC
GATCGTTATGGCAGAACCGTGGCAAAATCTACGCTTGGCAGAGCTTTAAC
AATAGTGATGGCAATTATCGGTATTCCGATGGCTTCTgccaatgttttgt
tttgtggtAAAGCTATCAACAACACAATCAAATATTTAATCGTATGCTTT
GAAAACGCTTGCTTGAAACGCCAAAAAATTGTATGGCTTAAACGCAAGGT
GGCAGCTGTTCAAATTTATTTGACAATATCAACTATATTGCTTCATTCTG
TTTTCTACAAAATGACAACTTTGCAGGAAAGCAGCTTCTTTGAGATAATC
TATTACGTTTGTGTCACGATGTTGACTATAGGCTTCGGCGATGTTTATCC
AGACACCACTTATTTATACCAACTCTCAATGGTACAACTAGTTATTTTTA
CTTCACTGGACGTAGCATTTTTCTATTGGACTTTCTCATTGTTGGGATCA
ATTATTGATTTTATACGATCGTCCCTTGATGTTGGACTTTTCTATTGGAA
TTTGGCATTATTGGGGTCAATAATTGATTTTATAAGATCTATAGGAACTG
AGTTGGGAACAGTACCCATGAAGAAAGATCATATCCACGATGACGATTCG
GTGGTGCAAAATGATAATTCTATAATCTCTTGAGTCCCTTGATGTTGGAC
TTTTCTATTGGAATTTGGCATTATTGGGGTCAATAATTGATTTTATAAGA
TCTATAGGAACTGAGTTGGGAACAGTACCCATGAAGAAAGATCATATCCA
CGATGACGATTCGGTGGTGCAAAATGATAATTCTATAATCTCTTGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000019_pilon | genome | sc0000019_pilon:1044613..1050048 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 862-1023:5275 |
| Aaloc | 397-858:871 |
| Aaloc | 1-393:1 |
|
