|
|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000019_pilon:733602..736895+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_038970 ID=XLOC_038970|Name=XLOC_038970|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=3294bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000019_pilon:733602..736895+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) GTCTCCAGTACGTGTACTACGTCTTCAATCCTCAGCAGTCGCCATGCCAC
AACTGTTTTGACAGAAATGATGACAGAATCGAATTCTAATGTTTCTGAAA
CAGTCACAAACCGTATTTATCATAGTGAATCTGTATCACATTCGACAGAG
CAACTTATTCGACCAACCAGCACTGGCTATCAAATGTCATCCATTTTATC
CAGTATTTCAACAGAGGAGCCAAATCTAGGTTAGGAAAACtatcattttt
aaatttaaacgATGGAAGTCTTGTCtccacgtttgttcctcttagatgaa
gcTCATCTTAGAGTATATAATAGTCTAAAGATCTCTCAAATTTAactttt
ctggaattttttaacCATGCCTATTCATAGGTTGAATAGCAAGCAGACTT
GTACCATCTTTATTCAATGTAACCTTTCGGCCACACTCAAGCTCAAAATT
ATGTTTTAATCAGGAGTTTTATTAGGCCTGGTAGAAGAGGGTCACCATTC
GAAATCAAAGGACGAAATTTTATGGAACTTTATTACCATCTTCTTCACTA
TTTCAGATTGTGCCTACAAACTTCAAATGAGCCTTATTGATTATTGTAGT
AACTTAATGTACTTATGCGGCCACACCTAACTCAAAATTATGCTCTAACC
AGTGCTATGAAATATGAGTTTCATTAGACCTGGTAGACGGGTCACCATTT
GAAATCGGAGAGCGAAATCTACGAATCTATCGAACTACGGTTACAATTCT
CGTATGATAATTCAAACTTCTTCACTATTTCAGATTGTGACTACAGACTT
GGAATCTACCGATCACCAGACAAAAGCTTTGTAACAATATGGAAAGATCA
ATCAACCAACCAGCTTCTCGTCACCAAAGGGAATCAAACAGGCTTGAATG
GAACTTTTACCGACCGCTGTTCGAAATTCAGTTTCATATCAGATggtgtt
tatatattttttgaagataAATGTTCATTGAAACTGAAATCAGATAATGG
AAACATGACCATTTATCAGAAGTTGGTGTGTTATAAAGGTAAAAAGAGAC
TTTATGAAGCCTTTGCAAGCTTGAAATTCACTGTTTGTACATTTTGAGGC
GCAGTTgtgtagtggtcatcgttcttgacttccgtgctggaggtcagggt
ttgattcccactcggtgctgcgattcacttggcaagtgaatgtaccttgg
cccgggtcaacccataccatgtgaggggaatagggtaccatcactctgat
acaagagtatggggagatatgcTGGACATTGAGTGTGGTGTGGTGATGGT
ATTCATATGTTCGGTACCTGCGAGAATGCAAGGTTCTCCCGTACCGTgcg
agtatcatcatcgatacagcacggatctgatgtgtcgcgagcacaggTTA
GGGCCCGGTTcgatgatatcggagggtcagcttctcttctcttctctata
cattttgttttataaacgACTCAAATTTTCGGCTCTGGTCTGGGGTTAcc
ttttctgagaaatttgctTTGAGCGCACCTAGTATTATACGATATGCTTT
TTGAGTCAAGGGGTACcgtttgccatggttagataatctaaaaagctttt
actttatgAGATAGTGGCAAAAGTTGGCTAATTTGAGCTTTCGAGTCTTA
GTAACCTTCCTTAAGTGGATtgaatttggcgattggccaaaatgaaattt
ttaatttggcaaatgatcaattttctataaattggtggggatttaatttt
gcaaatgatcaattttctataaattggtggggatttaatttggcaaatga
tcaattttctataaatttatggggatttaatttggcaaatgatcaatttt
ctataaattggtggggatttaatttggcaaatgatcaattttctataaat
tggtggggatttaatttggcggatgatcaattttctataaattggtgggg
atttaatttggcaaatgatcaattttctataaatttatggggatttaatt
tggcaaatgatcaattttctataaattggtggggatttaatttggcaaat
gatcaattttctataaattggtggggatttaatttggcggatgataaatt
ttctataaattggtggggatttaatttggcaaatgatcaattttctataa
attggtggggatttaatttggcaaatgatcaattttctataaattggtgg
gatttaatttggcggatgggaAGGTTTAAGGCTTTTATAAATTAAAGATG
ACGtggtattttactaaaaaaatgCATATTATGTAAAGAACTTCTATCCT
AAAAGATTCTGCTAGATTATGCGGGGATTTAATTAGAcgtattaaatttt
gcgaatgatcgattttttaaattttggagggGGTAATAGACCTTtacata
aattacgtcacaaacatcacttgcctcgttttgaaattattgccacgGTG
ATTAACCCCCCtgactcccagcggattttatttaaactactttcttttca
taaaaaatcatgtaaTGCCTTAAGGGACATAATCATCATAgtaattgttt
gaaaacgaggcaagtgatgttcgtggcGTAATTTCTGAAAAGGTCTTTTT
GGCgatttgtatatgtaatcacatgataacgagtgtaattttcgaattgt
acgagttattatgtgattacgagctaatcgcacaatggctttcactactt
tttcccagttaggaaagtaaattacagaaattacaccgagttttatattt
ttctcttctctttatgtctttcttttattgttgtttattgattttctttc
tccacaaaataaatttcgaattcaattaaaacgttcgatgtaagaaaaaa
cattaaaatcaattttgtaaacattggtgcggcattggagagtgtgatta
acgattaattgctttctacaggatgcaattaacgattaattgctcccttt
gagggcgtgccaaataagaaaaaataacccatcgtgcgattattcccaaa
atttactaaatttgccaaatttttaattcccaccaaaattaatccaTTTA
CATTTATTGTtgattatgaaaatgtgtatCATAATTTATAACGATTGTGA
TTGGCTTAAAAACAAACGAGAAGGATAATACGAATTTCTTTACATATATG
TAATATGAAAATTTGTGTCTATATAGTTTATCGTGCAGATAATTAATTAA
GCTATGGTGCACTGCTAGGTATTTTATTAACTAAAATTTGCCTTTAATCT
AtttctttttacaattttattaaGATTCAACCGAGATGAACTGC Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000019_pilon:733602..736895+ >XLOC_038970 ID=XLOC_038970|Name=XLOC_038970|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1008bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000019_pilon:733602..736895+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) GTCTCCAGTACGTGTACTACGTCTTCAATCCTCAGCAGTCGCCATGCCAC AACTGTTTTGACAGAAATGATGACAGAATCGAATTCTAATGTTTCTGAAA CAGTCACAAACCGTATTTATCATAGTGAATCTGTATCACATTCGACAGAG CAACTTATTCGACCAACCAGCACTGGCTATCAAATGTCATCCATTTTATC CAGTATTTCAACAGAGGAGCCAAATCTAGGTCTCCAGTACGTGTACTACG TCTTCAATCCTCAGCAGTCGCCATGCCACAACTGTTTTGACAGAAATGAT GACAGAATCGAATTCTAATGTTTCTGAAACAGTCACAAACCGTATTTATC ATAGTGAATCTGTATCACATTCGACAGAGCAACTTATTCGACCAACCAGC ACTGGCTATCAAATGTCATCCATTTTATCCAGTATTTCAACAGAGGAGCC AAATCTAGATTGTGACTACAGACTTGGAATCTACCGATCACCAGACAAAA GCTTTGTAACAATATGGAAAGATCAATCAACCAACCAGCTTCTCGTCACC AAAGGGAATCAAACAGGCTTGAATGGAACTTTTACCGACCGCTGTTCGAA ATTCAGTTTCATATCAGATggtgtttatatattttttgaagataAATGTT CATTGAAACTGAAATCAGATAATGGAAACATGACCATTTATCAGAAGTTG GTGTGTTATAAAGATTGTGACTACAGACTTGGAATCTACCGATCACCAGA CAAAAGCTTTGTAACAATATGGAAAGATCAATCAACCAACCAGCTTCTCG TCACCAAAGGGAATCAAACAGGCTTGAATGGAACTTTTACCGACCGCTGT TCGAAATTCAGTTTCATATCAGATggtgtttatatattttttgaagataA ATGTTCATTGAAACTGAAATCAGATAATGGAAACATGACCATTTATCAGA AGTTGGTGTGTTATAAAGATTCAACCGAGATGAACTGCATTCAACCGAGA TGAACTGC
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| sc0000019_pilon | genome | sc0000019_pilon:733602..736895 + |
Properties
| Property Name | Value |
| Aaloc | 490-507:3277 |
| Aaloc | 409-486:960 |
| Aaloc | 268-402:825 |
| Aaloc | 232-267:786 |
| Aaloc | 1-228:1 |
|