XLOC_038843 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_038843
Unique NameXLOC_038843
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000323_pilon:140456..156168-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_038843 ID=XLOC_038843|Name=XLOC_038843|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=15713bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000323_pilon:140456..156168- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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CGTTCGTTCGTTCGTTCGTTCGTTCGTTCGTTCGTTCGTTCGTTCGTTCG TTCGTTCGTTCGTTCGTTCGTTCGTTCGTTCTTTCGTTCGTTCGTTCGTT TTCCCCTCTTTGTTATCATATTCGCTAATTTCTACTACAATTATAGTGTC CTAGTAGGTTGGTTCCCCTCCCTTGAAAATCCCTCTGCCCCCCCCCCCCC CCCCATTTAGTTCCCCTCCCTAAGGTTTTTAAAATAATTCCCGCTCCTCT TGAAATTTTTTTTTGATTTTTTGCTCATAACATAATACTCATGTTATCTC GTCCCTATATACAAAGAAAAAATCTAAATTGTCACCACCTCGAATATAAA ACACTATTACATGTTTTTTGCTTGAAGTTGAACAGATATGTTTTATGTTT GACACCAGAGAACAGATACATTTTTTCGTCAGAATTTTCCTCCCAACTCT TGACTTTTTGGAGCTATTTTTTCTCCCCCTCCTTTTGATTGCCACCCACC TAGAATTTTGAAAACAACTTTTCCCACCCTTTTCCCATTTTCTGAACAAA AACTCCCCCCCGCCTTTAAAAAGGGGGGGGCACTATGTACAGTTGAGTCT CCATAACACGAACAAGCACAGGGGACACAAAATTGTTCGAGTTAAGGAAA TCTCGAGTTATGGAGTAAGGTTTATAAGACATTGTTAACTGAACGGACGA TTAAGTATGTTAACCATTAATAGAGGTTCGAGTTAGTTGCTATCGCGTTA GTTGATTTCTGCTTTGTAGTTTAGTGGATGCAGTTGTAGACGGATTTATT GACTTGTTCCGAAATTTCTCCAAAATGTTCCTCCCTGTTTCATTGAAAAG CCTTTTAAGCCATTTAAAGTCCTCTTTCGTTTTAAACCTTGTAATATCTT GTAATTACCAAACTGGATAAAATGACCGTCCGACGTGTTTTTGTTTTCAA 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AGCTTTGGTCCAGTGGTAGCTGGTGTAATCGGCGCTAAGAAGCCACAATA CGATATTTGGGGCGACACTGTCAACGTAGCCAGTCGTATGTACAGCACTG GAAAACCCAATTGTATTCAGGTAAGATATTTTTGTCAATCATGGATCCTT AGACGCCAAAACTAACCAATTTTGTAATATGGTTTGGTGGTAGTGGAGTT TAAAGTCCTATACTTTCTTATTCCTAGTCTGAATGGCAAGACTTTACAAA GTCGCTAATCCTCGGTAATCCAGAAGGAGCACAAATTTGTTAGAGGATTG TAGCAAATTAGGCTTCCATTGGATAGGTGCATCAGAATCATATTTTTCTT TGTCAAATTAACTGAGATTTTATTTATTTTGTAGGTTACCCAGAGCGTGT ACAACCTTTTGTCAAAACGTGGCTTCACTTTCGAATGTCGTGGCCTAGTT GCTGTAAAGGGCAAAGGGAAGATGGTCACCTATTGGCTACTGAAAGGAAA AGAAGGCTCCTGA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000323_pilon:140456..156168-

>XLOC_038843 ID=XLOC_038843|Name=XLOC_038843|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=6960bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000323_pilon:140456..156168- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAGTTCAACATTATTGGCCAAACGTTCGATTTCACCAGAGAGCGTTTC
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TTTCGCGCTAGAAGTTCACTAGATGAAGCAGAAAAGAATTATTCCGTTGA
AATCAAAGACTTGAATGCGGAAATTCCTTCCAATCAAAATGTCGATATCA
ATAAAGTAGCGGCCGATAAAATGCACCCTCATCTACACCCTGTTGAGGAG
AAATTCAACTTGAAATACGCCATCAGTTTGTTTAAGACTATACCCTTTCC
TTCACCGAAGATTGAAGAATTGTACAGGCGATATTTCTTTCACTTGAATC
AACACTTTATCAACTGGTTCCTAGTCATCCTTATTGTGACCTGTATTTGT
GAAATTGGACTTCATTTTCATTTCAACAGGACAGGAAGTTTTCGATACAC
GCGAGGGATATTCTTAGTGGTACAAGTGACAGTATTCGCTGCTCTCTTGA
GCATCATAAATTGGAATGGCTCTTCAGGGCGCTTATTGGTTTTAGTTTCA
TATATCATTGTTTTTTTTAATTGCTTAATGACTATTTTTAACTCGGTGCC
GTTAGAGGGTGATATACACGGAGTGACGAAATCAATGAATTTTGTCATCT
TTGCGATTTATATGACTTATGTAATGCTGCCGCTTCAGTTCCGAATGTCC
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TTCACAAGCTTCCACGCAAAAAGACGTCTGGTGGCTGATGAGTTCAACAT
TATTGGCCAAACGTTCGATTTCACCAGAGAGCGTTTCAGTCAATGGCACC
GCCCTGCCGCCGCATTATCACCCACGTGACGAGTTTTCGGACAACGAATT
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GTTCACTAGATGAAGCAGAAAAGAATTATTCCGTTGAAATCAAAGACTTG
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CGATAAAATGCACCCTCATCTACACCCTGTTGAGGAGAAATTCAACTTGA
AATACGCCATCAGTTTGTTTAAGACTATACCCTTTCCTTCACCGAAGATT
GAAGAATTGTACAGGCGATATTTCTTTCACTTGAATCAACACTTTATCAA
CTGGTTCCTAGTCATCCTTATTGTGACCTGTATTTGTGAAATTGGACTTC
ATTTTCATTTCAACAGGACAGGAAGTTTTCGATACACGCGAGGGATATTC
TTAGTGGTACAAGTGACAGTATTCGCTGCTCTCTTGAGCATCATAAATTG
GAATGGCTCTTCAGGGCGCTTATTGGTTTTAGTTTCATATATCATTGTTT
TTTTTAATTGCTTAATGACTATTTTTAACTCGGTGCCGTTAGAGGGTGAT
ATACACGGAGTGACGAAATCAATGAATTTTGTCATCTTTGCGATTTATAT
GACTTATGTAATGCTGCCGCTTCAGTTCCGAATGTCCATATGTTGCGGCA
TGTTAATCACAACCACACACTTGATCACCTCTGTCGCTTCACAAGCTTCC
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CGCTGTCAACCTGGCCGGTATCTTTTCACATTATCCAGCTGAGCAAGCAC
AACGCGAAGCTTTCTTGGAGACAAGAGGCTTCGTAGAAACCAGGCTGAAG
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AACGCGAAGCTTTCTTGGAGACAAGAGGCTTCGTAGAAACCAGGCTGAAG
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ACGTCATGTTGCCATGGAAATGAAAGCTGACATTGAAGGAGAACTGGAGG
AATCGATGTTTAGCAAGATTTATATTCAACGTCACGCTAATGTGAGGAGC
GTCTTTTGTTGTCAGTGCTTCCACGTCATGTTGCCATGGAAATGAAAGCT
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ACGTCACGCTAATGTGAGCATCTTATTTGCGGATATCGAAGGATTCACAC
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AAGGATTCACACAACTCGCATCACAGTGCACTGCGCATGAACTGGTCAAA
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ACAGGAAAGGTTCATTGCGGTGTACTCGGCCTAAAGAAATGGCAATATGA
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AACCAGGAATCGTACGTGAAGCAGTTGGCGTCAAACTGAACATGCGAGTT
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GACAGTAGCCAATCAATACAACGTTACGCCTCAAGGAACCCAACAGGCAC
CCAATAATGGTAGCGCACGACCGGAAGGTGTCCCGAATGGTGTCAATAAC
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AAAACGGTCAATGACAGTAGCCAATCAATACAACGTTACGCCTCAAGGAA
CCCAACAGGCACCCAATAATGGTAGCGCACGACCGGAAGGTGTCCCGAAT
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GAAAGAAGAAAATGTGAGACCTGTCATCCTCAAGTTCCGAAAACAAGAAT
ACGAAAATAAGACTTGGTTTGACGATGACCACCATGTCCTCGGAAGATGA
AGTCAATGAATTTTTGGAGCGCGCTATCGATGCTCGGAATGTGGAACATT
TGAAAGAAGAAAATGTGAGACCTGTCATCCTCAAGTTCCGAAAACAAGAA
TACGAAAATAAGTATTGCGAAGAAGTGGATTCGTTGTTCATTCCACACAT
GATGTTCATTTTCGTTGTCTTCCTCTTCATAATTATCATCGTCGTCCTTG
TCTTCCCAAGTATTGCGAAGAAGTGGATTCGTTGTTCATTCCACACATGA
TGTTCATTTTCGTTGTCTTCCTCTTCATAATTATCATCGTCGTCCTTGTC
TTCCCAAGGACGACAAAGACTTTACTTCTCTTCACCTCAGTGTTTTGTCT
GCTGCTTCCCACAATTCTTTTCAGCATCTTTCACAAAATGGAGGACGACA
AAGACTTTACTTCTCTTCACCTCAGTGTTTTGTCTGCTGCTTCCCACAAT
TCTTTTCAGCATCTTTCACAAAATGGAGAAAATCTCTCGGCTTTTTTCAC
CGAAGATAGTAAAGAATCAATCGCTTTACCGAGTGCTCTCCATCACTGTC
ATCTTCTTGCTCTACATCTCCGCTACTGGTACTCTGAAAATCTCTCGGCT
TTTTTCACCGAAGATAGTAAAGAATCAATCGCTTTACCGAGTGCTCTCCA
TCACTGTCATCTTCTTGCTCTACATCTCCGCTACTGGTACTCTGTTTATT
TGTCCAGAACAGCCACCCTCCATACACTCGTGCATCTACAATTCCTCCAC
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AATACTGTGTATATCCTCAGTTTATTTGTCCAGAACAGCCACCCTCCATA
CACTCGTGCATCTACAATTCCTCCACCACAACCCCTGTTGAACTCCATAG
AGACGCCATCCCTGGTCTGGCTGATGAATACTGTGTATATCCTCAGTACA
TCACCTACATTATTTCATTGGCCATGATCACTGCAGCAAACTCCTTGAAC
TGTCTTTCCACCAGTAAATTTCTCATCATTCTTGCAGTCGCTCTCTTCTA
CTCCATCGCAATCCCTCTCAAATTCAAACCGCTCTACGATTGGCATGACT
CCTTAGCTCATTGTCTTACATCACCTACATTATTTCATTGGCCATGATCA
CTGCAGCAAACTCCTTGAACTGTCTTTCCACCAGTAAATTTCTCATCATT
CTTGCAGTCGCTCTCTTCTACTCCATCGCAATCCCTCTCAAATTCAAACC
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TACCTTTTCGTTGGCTTGGTCAGTCATACATACATGAAGCGAGGGGATGT
CAAATCAACAATTCGTGCCGTTATACATTCACAGTATCAGCTCTGTCATT
TACCTTTTCGTTGGCTTGGTCAGTCATACATACATGCACGAGAATATTTC
AAGGTTAGACTTCTTATGGAAAGCACAGGCTACACAAGAACGAGATGAGA
TGAATGATAAACGAAAATATAACAAGAAATTATTGTACAATATACTGCCC
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TTCAAGGTTAGACTTCTTATGGAAAGCACAGGCTACACAAGAACGAGATG
AGATGAATGATAAACGAAAATATAACAAGAAATTATTGTACAATATACTG
CCCGTTCACGTTGCTGAACATTTTCTCAAGGATAACAATGAGGATCTTTA
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TCTCGGAGTTTTACATGGAACTGGAAGCAACGGGAGATGGTATGGAATGC
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GCAAGCGTGTTCGTCAGTAGCCGTGTTGTTTTCGAACATTTGTAATTTCT
CGGAGTTTTACATGGAACTGGAAGCAACGGGAGATGGTATGGAATGCTTG
AGGGTTCTTAATCAAATTATCGTCGACTTTGATAATATTCTTCAAGATCC
GAAATTCAAAACGATCGAGAAAATCAAAACCATCGGTGAAACTTATATGG
CAGCTTCTGGCTTAAATCTTCAAAGTGCTATTCTTCAAGATCCGAAATTC
AAAACGATCGAGAAAATCAAAACCATCGGTGAAACTTATATGGCAGCTTC
TGGCTTAAATCTTCAAAGTGCTGAGGAGCTACAAAATTGCGACCACGTGG
AGGAGCTAGCTGCTTTCGCCATGAAAATGGATGACACGTTGGATGAAATG
AATAAAAATGCTTTCAATAATTTCAAACTGAAATCAGGAGGAGCTACAAA
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AGGTTTGAGCTTTGGTCCAGTGGTAGCTGGTGTAATCGGCGCTAAGAAGC
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AGCACTGGAAAACCCAATTGTATTCAGGTTTGAGCTTTGGTCCAGTGGTA
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Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_038843XLOC_038843-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
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Properties
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