XLOC_038814 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_038814
Unique NameXLOC_038814
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000117_pilon:244869..252904+

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_038814 ID=XLOC_038814|Name=XLOC_038814|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=8036bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000117_pilon:244869..252904+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ttgttttcaaaattttattcttcTTGTGGTGGAGCCGGGGGAGCTGGTGC GATAATTTACATATACTTGAGTTTTATAGAAACAATGTCTCTATCATCAC TACTTCCACTAAATCATGTAGAAGACCTTGTAGAAGGATGGCTAAGTGAA GACATTCCACATTTCGACTATGGAGGTTTTGTTGTTGGAGAAAAGCAGTC TTCTGCAGTTATTTTATGTAAATCCAAAGGTAACTACATAAGTGATAAGT CTGATATGTTCTCTCGGGCTCGGGTGACTTTTAGTTTCAAAGTTTCAAAA CCTGACATTTAAGCCTGCAATACACGGGGATCGGAAAGGGTTcttgaaaa tttattattaaAGAGATTGTATTTATGATGCATTGCATTATTGTCATCAT AAGGCGGCCATTAAAAATTTGTTCTGCTTGCAACCAACAACACCAACTTG CATTTCTTTTGGATTTTTCGGTACGGAGAAGTGggaaaaagtcttgaaaa agcaaattgtTCCTTTAACATATAccttaagttggtctaatgtcgacatc cctcagtcagggaaatcctcaattgcggtagtaatttcttactgcaattg cggtataaacgtcacttttaaatttttcatgtaCCGCAATTGCAGTGGCA GTATACCCAAGAAACAGAATccaagattcaaggagaaaacaggcaatttt tgtacataattgatcatatctttttaacgcacagacaaaatatttttccc gtagatcagattcttttagTAAAGAAAAGCTATCTTCTCGTACGATTTTT TACAGTCgatgtttttttatctttgtcgaccagcactatatgtagctgtt ataagcctttgtaggctaatCACGATTGAaaactaccgcaattgcagtat accgcaattgagggatttccctgactgtccctcttctaattttgacatcc CTTTTAAGAGataaaatttatacttagaaatttaatcaaaaatatatttc aaaaccaaaaaatttaaaaaatttaaaaatccataactcggagtttcatg ctctaagcaatcatcagatgtaacatatatatatttgaaatgAACAAGTT CACCATCAACTACTCGACTAAAATCATTCCATTACCATCGACTCCTGGTT GGttttatcgagcactctttgaatatgatttcacCTTATTTGATTGATAC TTCGCTCCAACATTGTTGAGCACTCTCGAACATTGTattctatttttgaa atcaactttttgaaatGAACAAGTTCACCATCAACTACTCTACTAAAAAC ATTCCATTACCATCGACTCCTGGTTGGttttatcgagcactctttgaata tgatttcacCTTATTTGATTGATACTTCGCTCCAACATTGTTGAGCACTC TCGAACATTGTattctatttttgaaatcaactttttgaaatGAACAAGTT CACCATCAACTACTCGACTAAAAACATTCCATTACCATCGACTCCTGGTT GGttttatcgagcactctttgaatatgatttcaccttatttgattgatac ttagaAATTTAGTTAGAATTTCATGTTGATTAATTTTAAACACTCTagca taaaaaaatcaaacttattGAACTCCTATTGCTTcgaaaattgtgagtgt tcaatTAGGTTTGATTATTTTGTTCAGTTAAACTTTAATCTCCCGGATGC AGGAGTTGGTTGGATCCGGATCGGGATCGGGATTGGAATTGGGAGTGCTA TCGACCTCCAATTTggaatttttgatttaaaaaaatctagacAAACCTTA ACTCGCCAAATGTCTGTatgttactttaatgggataaactttcacaggga ttgaatttcgcggataggcccaaccgcaaaatttaatcccaaaaatctct aaaatttaGTCATTGCTACAGCATTGCTGTGGACCTActatattaaataa aataaactaaaatataaataaattttaacggatagatatattataaagat aaatgggctaaaatatGACTTAAAAAGCAGAGGCTTCAGAGATTATGATT ATGTGAATTAGAGTAGGGCTTGCAAAAGCAAAAGTATTACTCAGGAATTG TGTATTGAGTGTTATAGTGTTGTATCTAAGCAAAATCAATGATTAATACT GTGTGAGAAATTAGTCAAACATTAATATTAAGATACatataaacaattta aaaaaagaaaagaactcAACCTAAAAAGGTCATATTTAGGACTTTTTTCA AGCTCAAAATCGCCAAGTAACCTAAAAGGTTCAGGCCATACTAGGGTCAT AACATTGAATATAACAACTTACTACGCAGCATTTTTACAGAACTTGCCCT CAGCCAGGACAAAagactacacgctttttcttataagaattatGTACTTT GACTGAGGGtgaagtattcttaagaaattgctaaaattgagggtgaaata ttcttaacgtattcttattatttcagagaaaaatttcCTTTCTAGACAGC TTATGTGAATAATTCTAATATACGTATACATACACAACAGAAAGTATACG ATATCTCTTTTGTTAATTGATTtgtgtcacttttgttttcccattttttg aaaaatggcagTTTTATTCTTATTGATTGATTAAAACTCAATACAATTAC TTCCATGAAATAAAGAAGGCACTGCACTCATTACCAGTGTCAGGTAGGTT GAGGCAAGTTCGAAAGCAtccaaaaattattgaaattattgCTGTTTTCA ATATGATGTCAGCAAAAACTTTAAATGCTATTGCCAAGATGCtggtttga aatttgaaaaattgaaacaactaaaaacgaaagtgaaatctaGCCGCACG GTAAATCCTGTAATGTTGATATCGGAGATTTAGTCTAAAGCTATCGTTAT AGCATGTTTCACTATCAACCTTTTAGGCAATCGATGTCAAATTAGCTTAG TAAAGTCATAATTGCAAATGTAGAACGATGAATTCGGTATACATACATAA ATGTTGTCTGTGAGTTCCTTGTAAATTGTTTATTAAAAACATTCtatatg ttttttgttttttttgttgtttttttttaaacattattatttccttgatc tccaaaaatattggttcttcttacaagaaaagtgttatataatgtatatg ctgtgtgtataaaatatataaataactaaCAACTCGAACAGATACGGGAA GAAGGACTCAATCGGAAGGAATAAGGAAAACTAAGTGAAGCTCGGAATCA GAATACTGAGATATGACGTTTGGAAGTTTTTTCGATTAGTAATAATTAAA CTGGATAACGGCTTGTTCGCAAGATAGTCGTCCTAGATAAATTATGGCAG AcagtaagaaataaataaactattCTTAGATGAATAATATCTCGTAAATA TATTATGATTTTATATAGGCCGAGGACTAGGCATAGAAACAAGATTGTGA GAAgtgtgaaaaaataaataaaaaatattgtagTTAATTCGATATGTAAA GTTTTTAAGTTTGATAAGTTTGTATGGTACTGTAAATCAGTTGACCGTAA ATCCTTGCTCTAAGAAAAGATCTCATTGTTTATGATtaaatgaaactttt cattttcaagctcATGTCTAatgtttgtatatttttgggATTTTGTGGGA ATGCTCTAATTTGATGATCAATATCATATTATCGTATGTATACTCTGAAA GTGCCAGGTTTTTTAGTGTCTTGACCCTGAGTCCCATCATCACAGTCTAG ACGATTTGGCAACACAACAAAATGAACTTTGGAGCTCAAACCATTAGGCC AATAATCAGCCCACACTGGGTGATCATAAAGTCTTTGATTTGGTGTGAAC CAGCTGCTTCCACCAAAACAGTTAATATTACGTGATAGAAAGCTAGTATC ATCATCCAATGTTCTGACAGATTCGGTTCGACCTATTGCACGGTTACATA ACCCACCATTATTGAGACCTAAGATATATTCTTTTAGCTCAACACCAACT GCATTATGGTTTGTGACGAAGCTTATTGTTCTTCCAACGTTTGGCTTGTG ACAATAAAACCTGATTTCTGTGATTGGAGTTTGAGAATGAATTTGCGGAA GATAGTGTCCCCATCCAATAGAAAATCTCCATTTTGAAGCTGAAGAAATG AATCCAAGTCACCAATTGTCATTTCAGTTGCAGTTGAGCTTGCAAATTTG TTTGTATAGTTAGCCAACATCATCCATCCACCTTGAAAAATATAGAAAcg cttttgaatattttattatCTTTAACACACTgaacaatttatttttgaaa gaaacatCAATCCCTATGATCAGAGTCAAGATAAAATTGAGGATCCTGCA GAACatatctcaaaacttaataagcatgaggggttggaataaaaatgtcc tgggtggaaaatttttgaaaaggaggctaatacagcagaattaggacaaa agagggacctttcaaaaacattttcccaaaaattaataagcgggggggga cggctattaggtacccgagagtactcaACTATATAGTATCTAAAACAAAG TGAAACAGGAATTATATTTTACGGTACTCACCATGATCAGTGTCCATATC ACAGTAAACATCTCGCATTTTCCCGTTCAAATTGATCTTGTAATATCCTG ATGTTGCTAAAGGCTTTCTATCTTTCATCTCTTTGCACGTTCGTGCGTCT ACAGAAAAGAAACTCAAACGAattttaatttgaagatcatATCGTTTCAA CCAATGTTTTGAATCGATAATAATAGAAAGTATTGAATGTCTTCACCCGA CCTACTTACCccgaaacctgccgacccaaaatatttattgccattttata gtagaattattttttcttcaaaaatttcaaaccttcaTATCAAAACCTGT ATCTTGCCTGTCCTGTTCTATCTTAAGCTtaagaaattatattttctaTT ATATTATCCCTTTCCCTTTTACAACTACCTgctgttttgaaaagttgaaa tcttCAAAGTAAACTCtttttttAAGTGCAGCCTAACGCATGACGACATG AAGTTCCAAGACTTTGCATAAAGGTTTTTAAAGCTCTCATGAAGCGTATT GATATAGGAAATAAGATCGGGCATGATCAGAGTCAAGGTCCAACTTTCTC CAAAATTGTAATTGTCATAAAAACCCTAACTTTAGGCCATTAATTAGTTA TGTGGTACTTACTTATGTTCACGCATGCGTACGAGTCATCCTGGTAGTTT GGTACACAATTCTCCTCTCTTTGACAAGGATCTTTACTACAaccattctt ttaaaaaaaaacaaagaaaaataattttttcgttTAATTAGCTATTAAGT TCTTTCTAGACCACATTTCCCGTTCCCCTATTTCACGAAGTTCACACGAG GAGTTCGGTAAGAATCAACGGGTTTCCGTCTATGAAAAAATGTTATTCTT CtttcctttcatttttttcatttatttcttaAGCATTGTGTAATGCTCTA CCGTgtttactctgtaccagagtgtatctcacgactATCGTAgcgcaatg aattttgaaattagccgtagatattgggttttTGTACAGACAATACCGTG TTAGGCCCGTGTTAGGCGATTACAAAGACGGTTTCAATAAATTCCCGTTT CAGCCTATACATCGTAAAGTTTTGAAGAGATCTAGGCCTTTCTGtgtaaa atgaaattgatttttccgGCTTCAAAGAAATTCTTTAAGATCCGaaaaaa aGACCTTTCTTTTGTTAGAAATCTATTAACTCTAAAAACTATATCAGCAT GGCTTTATAGTTTTAATATATGAAGATACTTACAACAATAACGACATGGA TAGACCCTACATCTGCGGTCAGATTATTTGAGGTATAAATATCTGTTTGT AAAATTTCACAATCAAATCCACTCAAAGTTAATTTGAGATTCATACTCTG GCATTTTCCACTTGTTAATAAGCACTCTTTCACGCAGCCTTCCTTATCGT TTGTTGTTAAAGCCTTTATTGGGGGGTCGACCATTCGATGACCTGTCATA TATTTAACACGAATGTAACTGATATTGACTGAGATTTTTGTTCCCTCTGG CTTATGAATAACGCGTGAAGATTGGTAGCAATAAAGTGTTGCAATACTTG AGAAAATGATAGCCAGATAACTCACTGGAaaaataatattcaatttttca aacattttttcagcGTTGTTGTCTATATTTTTTGACCCCTGAAAAATCTT TATTCTTTTCATACAtgagaaattttgtaattttttttctcaagtatcac aataataatgatatatatcATGAATCAAGCCATTCTGTAGCTACGGTAAA ATTTTTCATTCGATTTAatccaatatttaaaaaaaacttttataatgAAT GAGCATTTTTGTCTTTGAATATATGAAATCCTTTTGAATCTGCGTGCTGA AAAAATAGGACTCAATTGAACAGGTCTCTTCATTTCATAAAACTAAGTCA CTTTCAAGCCTCTCTTCCGAAGAAATACTATGACAACTTATTGTCAACAG GtttttttAAATGTGCATTGtacaaaaatatcgaaaaaggtTGTGTCTGT CTAGTCTACACAATTGACAGCTCCATGCTTTTAGATTTTTTAGGCCTTCG TTTTGTGCTCAAAACGATAATATGTGACGTCACGTAGCGTCTGTCAAACC TTTATCAAATCATCGACTCCTGATCACTGTATAAAATTTGCATTTTAAGT AGTGTTAGAAAAGCAGTTAATGTAAATGATCATGAATGAAACCCTAAAAA GTATCGATCCAGATTCGATCCACTCTGAAAatggaaataaaaagaaaagg gtTTTTAACCTTCGCTGCTGTCTTTCCTATCAACATGAATTCGTTTGATA TCCCACACTTGAGTTAATAATCCATTTGTATAATATATGTCGAATATGTG ACATACCGGAGCTGCAACGTCTTCATTTTGCTAATTATTCCATTCGCTTT TATCCTATAGGTGTTCTGTGTGGGCAGCCCTTCGTCAACACTATATTCGA AAAACTTGGCTGTAAAGTTCAATGGCATCACAGTGATGGTACCCTGCTGG AACCTATTTGCCGGGTGGCTGAAGTCTCTGGTCCCGTCAATAAGTTACTT CAAGGAGAACGTCTGGCGTTGAACGTTTTAACAAGAGCGAGTGGAATAGC CACTATAGGCCATCAATATCAAGAAATTCGTACGAAGAATGGTTGGAAGG GTGAAATAGCGGCCACCAGGAAGACAACACCTGGTTTTCGTCTTGTGGAG AAGTATGCTGTGTTAGTTGGCGGTTGCTCTACACACAGGTAATTTCCTTT CGTCAAATGCCGAATTAAGCTTGTTCAAACACCAGtatacaattttcaga atttcgaGCTTCtcctaaaaattttattgatcCTAGAAGTCGACCATTAC TAGCGGTTTCTATTATATTAAAATCTACTTCTAGTTTTTAACCTTTAAGA AGCAACTAGAAGAAGGTGGTGGTATgataccatatactaccgggccctTT GATCGCATCATCCAAAAAAGCTCTTTTGTGGACCACGGAATGATTACCTA TATTCGTTTTCTGTTTAGGCATGATTTGTCATCCATGGTCATGTTAAAAG ACAATCATATTTGGTCTGTTGGTGACATCAAAAAATCCGTTCAAAAGGCT CGGTCTGTATGTGGCTTCTCTACAAAAATTGAAGTCGAATGTCGCAGTGT AAAAGAGGCTTTAGAAGCTTGTAGTGCTggtgctgacgtcatcatgttGG ATAATTTTGACGCGGCAATCACTGAGAAATCAGCTCAAGAGATTAAAGGA CACTATCCACATGTGATATTGGAGGTTAGTGGAGGTGTGACTCTTCAGAA TGCAAGTGATTACATGACTCCCACTATTGATGTGTTATCCAGCAGTAGTT TAACTCAAGGATATTCAACTCTAGATTTCTCCATGAAAATCATGAAAGAC GGCAAAGACCCCACAAATCCACTCGTGACGGCGTAA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000117_pilon:244869..252904+

>XLOC_038814 ID=XLOC_038814|Name=XLOC_038814|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1950bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000117_pilon:244869..252904+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ttgttttcaaaattttattcttcTTGTGGTGGAGCCGGGGGAGCTGGTGC
GATAATTTACATATACTTGAGTTTTATAGAAACAATGTCTCTATCATCAC
TACTTCCACTAAATCATGTAGAAGACCTTGTAGAAGGATGGCTAAGTGAA
GACATTCCACATTTCGACTATGGAGGTTTTGTTGTTGGAGAAAAGCAGTC
TTCTGCAGTTATTTTATGTAAATCCAAAGttgttttcaaaattttattct
tcTTGTGGTGGAGCCGGGGGAGCTGGTGCGATAATTTACATATACTTGAG
TTTTATAGAAACAATGTCTCTATCATCACTACTTCCACTAAATCATGTAG
AAGACCTTGTAGAAGGATGGCTAAGTGAAGACATTCCACATTTCGACTAT
GGAGGTTTTGTTGTTGGAGAAAAGCAGTCTTCTGCAGTTATTTTATGTAA
ATCCAAAGGTGTTCTGTGTGGGCAGCCCTTCGTCAACACTATATTCGAAA
AACTTGGCTGTAAAGTTCAATGGCATCACAGTGATGGTACCCTGCTGGAA
CCTATTTGCCGGGTGGCTGAAGTCTCTGGTCCCGTCAATAAGTTACTTCA
AGGAGAACGTCTGGCGTTGAACGTTTTAACAAGAGCGAGTGGAATAGCCA
CTATAGGCCATCAATATCAAGAAATTCGTACGAAGAATGGTTGGAAGGGT
GAAATAGCGGCCACCAGGAAGACAACACCTGGTTTTCGTCTTGTGGAGAA
GTATGCTGTGTTAGTTGGCGGTTGCTCTACACACAGGTGTTCTGTGTGGG
CAGCCCTTCGTCAACACTATATTCGAAAAACTTGGCTGTAAAGTTCAATG
GCATCACAGTGATGGTACCCTGCTGGAACCTATTTGCCGGGTGGCTGAAG
TCTCTGGTCCCGTCAATAAGTTACTTCAAGGAGAACGTCTGGCGTTGAAC
GTTTTAACAAGAGCGAGTGGAATAGCCACTATAGGCCATCAATATCAAGA
AATTCGTACGAAGAATGGTTGGAAGGGTGAAATAGCGGCCACCAGGAAGA
CAACACCTGGTTTTCGTCTTGTGGAGAAGTATGCTGTGTTAGTTGGCGGT
TGCTCTACACACAGGCATGATTTGTCATCCATGGTCATGTTAAAAGACAA
TCATATTTGGTCTGTTGGTGACATCAAAAAATCCGTTCAAAAGGCTCGGT
CTGTATGTGGCTTCTCTACAAAAATTGAAGTCGAATGTCGCAGTGTAAAA
GAGGCTTTAGAAGCTTGTAGTGCTggtgctgacgtcatcatgttGGATAA
TTTTGACGCGGCAATCACTGAGAAATCAGCTCAAGAGATTAAAGGACACT
ATCCACATGTGATATTGGAGGTTAGTGGAGGTGTGACTCTTCAGAATGCA
AGTGATTACATGACTCCCACTATTGATGTGTTATCCAGCAGTAGTTTAAC
TCAAGGATATTCAACTCTAGATTTCTCCATGAAAATCATGAAAGACGGCA
AAGACCCCACAAATCCACTCGTGACGGCGTAAGCATGATTTGTCATCCAT
GGTCATGTTAAAAGACAATCATATTTGGTCTGTTGGTGACATCAAAAAAT
CCGTTCAAAAGGCTCGGTCTGTATGTGGCTTCTCTACAAAAATTGAAGTC
GAATGTCGCAGTGTAAAAGAGGCTTTAGAAGCTTGTAGTGCTggtgctga
cgtcatcatgttGGATAATTTTGACGCGGCAATCACTGAGAAATCAGCTC
AAGAGATTAAAGGACACTATCCACATGTGATATTGGAGGTTAGTGGAGGT
GTGACTCTTCAGAATGCAAGTGATTACATGACTCCCACTATTGATGTGTT
ATCCAGCAGTAGTTTAACTCAAGGATATTCAACTCTAGATTTCTCCATGA
AAATCATGAAAGACGGCAAAGACCCCACAAATCCACTCGTGACGGCGTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_038814XLOC_038814-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000117_pilongenomesc0000117_pilon:244869..252904 +
Properties
Property NameValue
Aaloc559-975:7620
Aaloc232-555:7013
Aaloc1-228:1