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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000726_pilon:11666..19636+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_038767 ID=XLOC_038767|Name=XLOC_038767|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=7971bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000726_pilon:11666..19636+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGACTCAAAGGAGAAGTGGTGGTCTTGTCCAAAGAAATAAGGGATTGGC
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AAAATATGAGACACCACCCTTAAAACTTGCCAAGCATGGTCCCAATCTTT
CAAAAGCCAGCAAAAGCAGCACTTTGTTGTTATTATGACTTGTATATACC
ATATTTTTAACTCAGATCctctaaaaagttctttaaatcaAACACAATTT
TTAATTACAAAGGTAAAACAACGAAATTCttggcaaaagtaaaatattat
aaGCTGTAATAACggcaataaaaagtatatatatCTATCAGAATAAGTAA
AAATCAAGTGATAACTGAAGAATAGTATGAAGCTTGGATTGGAtggattt
ccttatttttttcttcaatagatTGGTAATTTATTAAATTATTCAAAAGT
GTCAATCTTATGAAgaagttgaaataaaaagtgcATTGTTGGCTCTGGTT
GGCTTTGCTTAGTTACCTGCCCTCCGTCTTAATTGTCATAAACagacaac
aaacaaacaaaaagacaGAGATAGCTAGGGATAATATAAACTGcaacaaa
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ttttgtttaaaagacaGATTGTATCACTTTGGATGCCAACAGCTTGTATT
TTTTCATCAGAAGGCAATGAAACATACCTCGTTCTACTTAAGATATCAAA
GATGAACTATCCTTCTCACTAATGAAAACATACTGATTTTGAACAATAGT
TTCTTTACATTAGCTATTTCATATTGTATAACTTAGGTCATCAAATTCTC
CTCTTAGGGAAAGTACCCatgaatttgaaataaaataattctttattgat
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TTCCCTACATACTTGATAAGCAGGGAAAGTACCTTCAATTGGAAGGGGGA
ACTTTTCAATACTGTCAGATACTGTAAGCCATAACAAAGAAatcttttct
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AGGGAGTGAGTACTTGAAATGATAACCCCACCCTAAAATTGGTACACTGA
AAATTGGAGATAAccccccccACCCCAAAATTATTACCGTgaggtactaa
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aatagccttgaagtgctggaaaaagaaaattgtattgaaagttggtttat
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TTGGCCAGTGAAGTTCCCCCATCAAAATCTCCGAatttatgttttccccc
atctttattttccccagcaaatttcaaatttttcattttcccccatactt
taaaaaaagggccaaaatcagaatccccccccctttataagggggggggg
aggacactatgcgtaaacgtcattatgtctgagattttactaccgacccc
ccccccctgagtctATAGCGTTTCAGAGAAAAGGAGGTTCGGAGTCTTTA
GAGGGGTATCTTTTAGTggcttagctctagtttagacggccgactttctg
ccctgcatATTCTAATTGTTAATGTAGGCAGATGTTGGGCAAAAAGTTGG
CAGCTAAAAttcttgcttggaaaagctaAAAGAAGttattgcattgacgt
caaaagagggcaatgcattgactttagacaccctactttatgcccacttt
aattcacaattagaataggcagggcaacaAGAGAgctgtctaaactagag
cttatagATAAACGGGAATCTTTATAAACTCACGCCAACTGGATATCTAT
ATGCTTGCAATTGATCATATTTTACATGGAATTTTAGCATCTAAATTTAC
GTCATTTTCGCTCCCCGCTTATCGGATTAACCTTCGTGATACTAAATCTC
GTACTATCGCAAATTTTTTCTCTCCTGATTTCACGTGAGAATACCGACAC
GCGAAATCAAATCCAATGAAATATCTATAGTACTTTCTGTGTAAAAATCC
TATCTTATTTTTTCTCTGATTTCAATGTCCTTTTGGAAGTTAAACCCAAC
AAACTTGCGTTTCCTTGTTTGGCCTGAGTAATCTATACCTCAAGGGAGCT
AATTTtcgcaggaactaattttcgcggtgcgAGGGTTCtaaatttgttca
ttttgcggaactaattttcgcggttgacacactttttgccaaaattccTT
CATTTTTGTTGGGGTTTTTGAGGATAtttagtaaaaattgcatttcgtgG
AACTAACTTTCGCagtagacacccaaaaacgtGGAAAGTTTCGGGGAAAA
TTAGTTCCTTCACTTAGGGTTTTCAGAattattgtgtttttttttgtcta
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GATTAGCGAAGAATTTGGTTGAGAAAGGTGTACTGACAACAGAAAAGCAG
AACTTTTTATTATTTGACATGACAACACATCCAGTGAACGATGGGCAAAT
CAAACAACGTGTCGtaaaaaaagttcaagaatCAGTTCTCACAAGATGGG
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GCGCATTCGTCTGACGTTCTCGAAAACGCGTTCGCTCCGCTCAACGATGA
AGATTATGATTTAGCGACGAAAAGAGTTCGCGAACTTTTAGATTTGGATC
CTGAGGTGGAAGCTCAAAAACCGAATGCTAATGAAGTTATGTGGTCCGTT
ATTGCGTCATTCATCAAATAG Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000726_pilon:11666..19636+ >XLOC_038767 ID=XLOC_038767|Name=XLOC_038767|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1740bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000726_pilon:11666..19636+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGACTCAAAGGAGAAGTGGTGGTCTTGTCCAAAGAAATAAGGGATTGGC
ACAACAAGATGCACCATCATTTGGAGATAATCACAAAGTTATCACAAGTC
CTGATCAAAATGATGAAGAATCAGAAGAATCTATGGATAAACAGACTAGA
TTAACATTAATGGAGGAGGTTTTGTTGTTGGGACTTAAAGATAAAGAGAT
GACTCAAAGGAGAAGTGGTGGTCTTGTCCAAAGAAATAAGGGATTGGCAC
AACAAGATGCACCATCATTTGGAGATAATCACAAAGTTATCACAAGTCCT
GATCAAAATGATGAAGAATCAGAAGAATCTATGGATAAACAGACTAGATT
AACATTAATGGAGGAGGTTTTGTTGTTGGGACTTAAAGATAAAGAGGGTT
ACACATCCTTCTGGAACGATTGTATTTCCTCGGGTCTTCGTGGTTGTATG
ATGATCGAACTTGGTTTACGCGGTCGTGTTGATCTGGAAAAAACTGGAAT
GCGACGTAAAAGTTTGCTTAATCGTAAAGTGATGTTTTTAAACGAATCAC
CTACGGGAGATACCATATTAGATGAAGCACAGAAGCTGATTAAGGATACC
GATCCTCAAGAAACTATACCTACGTGGATTGAATTGCTCAGTGGGTTACA
CATCCTTCTGGAACGATTGTATTTCCTCGGGTCTTCGTGGTTGTATGATG
ATCGAACTTGGTTTACGCGGTCGTGTTGATCTGGAAAAAACTGGAATGCG
ACGTAAAAGTTTGCTTAATCGTAAAGTGATGTTTTTAAACGAATCACCTA
CGGGAGATACCATATTAGATGAAGCACAGAAGCTGATTAAGGATACCGAT
CCTCAAGAAACTATACCTACGTGGATTGAATTGCTCAGTGgCGAGACATG
GAATCCATTGAAGTTGAAATATCAATTACGTAATGTTCGTGAAAGATTAG
CGAAGAATTTGGTTGAGAAAGGTGTACTGACAACAGAAAAGCAGAACTTT
TTATTATTTGACATGACAACACATCCAGTGAACGATGGGCAAATCAAACA
ACGTGTCGtaaaaaaagttcaagaatCAGTTCTCACAAGATGGGTCAATG
ATCCGCATCGAATGGATAAGCGTACGCTCGCTCTCATTTATTTGGCGCAT
TCGTCTGACGTTCTCGAAAACGCGTTCGCTCCGCTCAACGATGAAGATTA
TGATTTAGCGACGAAAAGAGTTCGCGAACTTTTAGATTTGGATCCTGAGG
TGGAAGCTCAAAAACCGAATGCTAATGAAGTTATGTGGTCCGTTATTGCG
TCATTCATCAAATAGgCGAGACATGGAATCCATTGAAGTTGAAATATCAA
TTACGTAATGTTCGTGAAAGATTAGCGAAGAATTTGGTTGAGAAAGGTGT
ACTGACAACAGAAAAGCAGAACTTTTTATTATTTGACATGACAACACATC
CAGTGAACGATGGGCAAATCAAACAACGTGTCGtaaaaaaagttcaagaa
tCAGTTCTCACAAGATGGGTCAATGATCCGCATCGAATGGATAAGCGTAC
GCTCGCTCTCATTTATTTGGCGCATTCGTCTGACGTTCTCGAAAACGCGT
TCGCTCCGCTCAACGATGAAGATTATGATTTAGCGACGAAAAGAGTTCGC
GAACTTTTAGATTTGGATCCTGAGGTGGAAGCTCAAAAACCGAATGCTAA
TGAAGTTATGTGGTCCGTTATTGCGTCATTCATCAAATAG
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000726_pilon | genome | sc0000726_pilon:11666..19636 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 448-870:7549 |
| Aaloc | 199-444:3335 |
| Aaloc | 1-198:1 |
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