XLOC_038677 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_038677
Unique NameXLOC_038677
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000115_pilon:451696..465609-

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_038677 ID=XLOC_038677|Name=XLOC_038677|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=13914bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000115_pilon:451696..465609- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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GTCCATACAACGTCAATCTTGAAGTGAAAAAGTGGGGAAATTGGGGCAAA GGGGAAGCTAAAAGATGGATCAATGGAAAGATAAATGAATTTATTAACTT TTGACCGAATGATTTTAAAATTGACCAACAAAATTTTAAAATATTCTACT GAAACTTGACTGAAAAACGGAAAAACATTTTGCTCTTGTCTTTTTATTAA AGATAAAGGACTTTCTTACATATCGGATATATTCTAGACCATCTGTTTAG ATCATAACTTGCTACTACTTTTGACAACGCGGTGATATGGACAATTAGTC TACACAGTTTCGAAAAAATTGAGCCTTTTTTTGTGCATTTCGTTAATTCA AAAAGTGGATTCCATAAATAAAAGGGGAGTTTCTAGTGGGGTGAACTTTT GATGTGAGAATTCTACTGGGGTACGTCAAAAAAAAATTTTGAGTGGGGTA TGTGTGAATTCTTCGTATCTTTCAATGGGGTCATTTTCAGTTACAGTATT CCAGTGGGGTGAGTGATTTATCTACTGGGGTGAAAAAATGGGCGATTTTT GGGAATATTTTTCACTGGTGTGACGAGTGGGGTGGATCCCACTGGGTCAT AGAGGCAGGGGTGTTATTTTAACCATAATTGTGATTTTGGAGATAAAATG ATTAAAAATTTCATATTGTCAAAATCCAATCCTGGTCATGCTTTATATGT TGATCGTTAAGAGCGTGTACTAGGTAGATATTTACGAGTTCTTCTTGTTC ATATATCTGGGTTACTATTCCTAACAGAAACACCGCAAGTTGCAAATATA TTGAAAGTTTTTAGGATTGTTATTTTTTTCTTCATTTATAGGTGAACAGT GGGGAATCGCTGCATTGTAAGCTAATACTTTTTTGCAGTTTTTATATTTG AAATTTTCTTATAGCCATACAATTCAACCAAATTTGATTCCAACCTTTGA 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GATATCCCAAAAGACATTCTGCTTCTATTGATCTTCCGATTGGATAAGTG TATTTTGATGAGAAATGCAATCAAAATGCTACGAAAAATTGTTTAATACT AATTATACCTCGTTATGACGTTTTAAATTTTGAGAAAGATGCAAAAACAT GCTATGTATAAGAAATTGAATATTGACACCAGATATTTTGAAACTTCAAC CTCAAGAAAGCCACCGTGCCACCACGTGCCACCAAAAGATTTTCATACCA CAGTGGAGCTATGAGACTCATGTCTAATATATATCAATCTCAGCTCTTCT CGGAGATATATTGGAAAGATATCCTCAATTGAAAATGTTGTGTCACTATA TGCATTTTGTTTGATTTTACTCGTCTGATGATGTTTTTCTCACACCAAAT TTCATAAATGTATTCGCTTGGTATTCTAGCATTTATTTTCAAACTTTTAG CCAGCAAAAGTACGATCAGAAAAAGTTAGAGAACTTTTTAGAATTAAGAG TATTAATTATTTTTCAAAATCAGAGTCCTTCGAGCCGCCTTGAAAGTTGT CCTTTGCGGACAAAGCCTGTACATCGATTGTTTTCTGAAACAATAGAAAG ATAATACTCCGCTCTCCACCGTTTCATTCGATGTTTATCCAGAGTCTCTA TAATAAATCCATGCTAAAACAAAGCAGAATTTCTGAAAATTGAATTCTGT TGAGTTTGTGAAAATCACTAATTTTTTTCAGGTTGCGAGTAGACGTGTCA TTCAAATTGGCGCCATTTTCATGATTATACTTTCAATCCTTGGTAAATTT GGTGCAGTGTTTACATTGATCCCTAAACCTGTTATTGGAGGGATGTTTTG GTGTTTGTTTGGTCTGATCGTCGCCGTAGGATTGTCTTCGTTACAATTTG TTAACTTGAACGATTCTAGAAATCTCTTTGTTCTTGGCTTCTCATTCTTC AATGGAATGGTCGTACCATCATGGATTAGTGCCAACCCACAAGCTATTGA TAGTAAGTACAGATTTTTTTATCCTAATACATTAAAGGAAAGGATTTTGG TGGCAATTCAATTTGGTGAAATGGTCGAAAAAGTTTTTCAGAGGAAATTT AATTTTGTGGATGATAAAATGGTAAAATATGACTTACTAAACAGGCCCTT CAAGGAGAAAAGTATCAGTGTTCAAACATGGTTTACTGATGCTAAGGGTA ATACACTAATCAGAAGGTACTCGGCCCTGTTTAATGTATGCTTTTTTCGT TTCATCTACTAGCTGGCGTAACAGAACTCGATCAAATCATAGGCGTCCTT CTTGGAACCAACATGGCGGTCGGTGGAATCACTGCATGTCTTCTAGATAA CATTTTACCGGGATCGAAAAAAGATCGTGGTATCGAAGCATGGCGTAACA ACGAGGCTTCCGCAGAAGAGAACTCTGCCACGTACGATTTACCTTATATA CAAAAATATCTAGATCGTACTTCTTGGATCCGGTATGTTCCATTTTTACC GTATAACGGAAATCGTTCCGGAACTGAACAAAACAATCAATATAACATGC AAGAAGTGGCTTGA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000115_pilon:451696..465609-

>XLOC_038677 ID=XLOC_038677|Name=XLOC_038677|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3402bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000115_pilon:451696..465609- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
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TAATGGCTTCATCAGCAAAGAAAGAAGAAGGAGCTGATGAACCTCAGAAT
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GGCCATCGTGCTCGGTTTTCAGCAATACATGACAATGTTTGGATCAACTA
TTGCTGTACCCTTCATCCTTGCTGGTCCTTTATGTATCGCTGACAACAAT
CTTGCCAAGAGTGAACTCATCAGTACCATCTTCCTTGTCTCTGGTATCGC
AACTCTCATACAATCATGTCTTGGAACAAGCAATACATGACAATGTTTGG
ATCAACTATTGCTGTACCCTTCATCCTTGCTGGTCCTTTATGTATCGCTG
ACAACAATCTTGCCAAGAGTGAACTCATCAGTACCATCTTCCTTGTCTCT
GGTATCGCAACTCTCATACAATCATGTCTTGGAACAAGATTGCCCATCGT
TCAAGGAGCAACATTTTCGTTCATCGGGCCTACCATTGCAATTTTAAACC
TCCCGGAATACAAATGTCCAACTGCTGTTAATGGAACTGTCCCGGATTGC
CCATCGTTCAAGGAGCAACATTTTCGTTCATCGGGCCTACCATTGCAATT
TTAAACCTCCCGGAATACAAATGTCCAACTGCTGTTAATGGAACTGTCCC
GGACTATGATTGGAAGATCGGCATGCGAGAGACTATGATTGGAAGATCGG
CATGCGAGAGATTCAAGGAGCAATAGCAGTGTCATCTTTATTTCAAGTAT
TTGTGGGCTGTACAGGTATCATAGGGTTTGTGATGAGATTCATTGGTCCT
TTGACGGTCGCTCCCACCATCGCTTTGGTTGGATTGGCCTTGTTTGGTGC
TGCTGGAAGTTTTGCAAATTCAAGGAGCAATAGCAGTGTCATCTTTATTT
CAAGTATTTGTGGGCTGTACAGGTATCATAGGGTTTGTGATGAGATTCAT
TGGTCCTTTGACGGTCGCTCCCACCATCGCTTTGGTTGGATTGGCCTTGT
TTGGTGCTGCTGGAAGTTTTGCAAGTGAACAGTGGGGAATCGCTGCATTG
TGAACAGTGGGGAATCGCTGCATTGACAGTATTTTGTATTGCTTTATTCT
CGCAAGTTTTGGGAAAAAAATTTGCCGTCTTCAGATTGTTTCCGGACAGT
ATTTTGTATTGCTTTATTCTCGCAAGTTTTGGGAAAAAAATTTGCCGTCT
TCAGATTGTTTCCGGTCATTTTAGCAATTTTGATTTCATGGGCATTATCG
GGGATCATCACAGCTGCAGGAGGATACAAAGAAGGTTCAGAAGCAAGGAC
CGATCACAATCTTGAAGTTCTTAATCAAGCCAAATGGATTCGCGTACCTT
ATCCAGGTCATTTTAGCAATTTTGATTTCATGGGCATTATCGGGGATCAT
CACAGCTGCAGGAGGATACAAAGAAGGTTCAGAAGCAAGGACCGATCACA
ATCTTGAAGTTCTTAATCAAGCCAAATGGATTCGCGTACCTTATCCAGGA
CAATGGGGAACACCAACGGTCCACGTTGCTGGTGTCTTTGGAATGCTTGC
AGGTGTTTTTGCTTCCATGATCGAATCGATCGGTGATTACTACGCATGCG
CTAGACTGTCAGGTGCGCCTCCTCCACCAAAACATGCAGTCAATAGAGGA
ATCTTCTTGGAAGGACAATGGGGAACACCAACGGTCCACGTTGCTGGTGT
CTTTGGAATGCTTGCAGGTGTTTTTGCTTCCATGATCGAATCGATCGGTG
ATTACTACGCATGCGCTAGACTGTCAGGTGCGCCTCCTCCACCAAAACAT
GCAGTCAATAGAGGAATCTTCTTGGAAGGCATTTCATGTGTATTGGCTGG
TCTATTTGGTTCAGGGAATGGCACAACTTCTTACAGTGAAAATATTGCTG
CAATCGGTGTAACCAAGGCATTTCATGTGTATTGGCTGGTCTATTTGGTT
CAGGGAATGGCACAACTTCTTACAGTGAAAATATTGCTGCAATCGGTGTA
ACCAAGGTTGCGAGTAGACGTGTCATTCAAATTGGCGCCATTTTCATGAT
TATACTTTCAATCCTTGGTAAATTTGGTGCAGTGTTTACATTGATCCCTA
AACCTGTTATTGGAGGGATGTTTTGGTGTTTGTTTGGTCTGATCGTCGCC
GTAGGATTGTCTTCGTTACAATTTGTTAACTTGAACGATTCTAGAAATCT
CTTTGTTCTTGGCTTCTCATTCTTCAATGGAATGGTCGTACCATCATGGA
TTAGTGCCAACCCACAAGCTATTGATAGTTGCGAGTAGACGTGTCATTCA
AATTGGCGCCATTTTCATGATTATACTTTCAATCCTTGGTAAATTTGGTG
CAGTGTTTACATTGATCCCTAAACCTGTTATTGGAGGGATGTTTTGGTGT
TTGTTTGGTCTGATCGTCGCCGTAGGATTGTCTTCGTTACAATTTGTTAA
CTTGAACGATTCTAGAAATCTCTTTGTTCTTGGCTTCTCATTCTTCAATG
GAATGGTCGTACCATCATGGATTAGTGCCAACCCACAAGCTATTGATACT
GGCGTAACAGAACTCGATCAAATCATAGGCGTCCTTCTTGGAACCAACAT
GGCGGTCGGTGGAATCACTGCATGTCTTCTAGATAACATTTTACCGGGAT
CGAAAAAAGATCGTGGTATCGAAGCATGGCGTAACAACGAGGCTTCCGCA
GAAGAGAACTCTGCCACGTACGATTTACCTTATATACAAAAATATCTAGA
TCGTACTTCTTGGATCCGGTATGTTCCATTTTTACCGTATAACGGAAATC
GTTCCGGAACTGAACAAAACAATCAATATAACATGCAAGAAGTGGCTTGA
CTGGCGTAACAGAACTCGATCAAATCATAGGCGTCCTTCTTGGAACCAAC
ATGGCGGTCGGTGGAATCACTGCATGTCTTCTAGATAACATTTTACCGGG
ATCGAAAAAAGATCGTGGTATCGAAGCATGGCGTAACAACGAGGCTTCCG
CAGAAGAGAACTCTGCCACGTACGATTTACCTTATATACAAAAATATCTA
GATCGTACTTCTTGGATCCGGTATGTTCCATTTTTACCGTATAACGGAAA
TCGTTCCGGAACTGAACAAAACAATCAATATAACATGCAAGAAGTGGCTT
GA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_038677XLOC_038677-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000115_pilongenomesc0000115_pilon:451696..465609 -
Properties
Property NameValue
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