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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000115_pilon:443379..451131+ Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_038647 ID=XLOC_038647|Name=XLOC_038647|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=7753bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000115_pilon:443379..451131+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAACGGTAAAAAAGTAAATGCTGTTTTGCCAGCTGCTGGTATTGGCAC
AAGATTTGGTGCTCAAAAGCCTAAACAGgtaattttgaattgtttttaga
CAAAGAAAAATCCCCTTTATACCTAAGGAACACATTTTGGCGGGCATTAA
ATATCctgaaataaattaattttggtgggaacttattttggcgaatggcg
aaatttttaaattttggcgggaactaattttggcgaatgacagcgtaaat
ttgttctattttgccttattttgagcaactttgatgaatttcagggttct
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atttcgtctaaattcgtctaaattcgccaaatccgccaaaattagttccc
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cttttaggccttactcttggtctataggcactgctatgggcgaccactag
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gggacccttagaTCTCCCACATACCCGGTACCCATTTTGCTTAAGTACCC
CCTCCTCGGgagttaaaatattttcataagaaCTCTCTGCTTtcatttta
taaatattttcaactgaCAGTAAATTCAATCTTTCAAAGTTTTGTAAACT
GAGGTTCGAAttatgtatattttttgaataatttgagcCAAACGTGATGA
TTATAAAGatacacttttctttttctagttTACTGAAGTAGATGGAAAGC
CTATCATTTGTTACACAATAGAAGCATTCCAAAGGTTTggttcaaaacaa
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TGCACCACTCACCACCACTATTGAGTGAGTGCACTCAATAGTGCTGCATT
GCATCGaggcgctagatctacttttcctgggatacttttgatgatgtagc
gctgtTAAACCTTACTTTTTAATattacaatggcttctttatgGTCAGTG
CATTGTATCTATCTTTTTATGATGAATcacaaatttttggtttttatctT
CATTCGAAGTGCCATCAATATAAAGTTTCAAGTTCAAAAACCTTGGCTTA
TTAAGGcttaaaaccaaacaaaaaaaaccttgactaaaagtttcatttca
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ttgtttttatttagtttagtATACCGTGGATAGAAAAAGTGGTTGTTGTC
ATTTCTGAAGATTGGATGGAATTTACTCAAGAAGtattttacttttcatc
atcACAACACCTTTGATCTGAGTCCGAATAacaatagcgagattatgtat
ctggaattctctacggctacgttTAAAGCGGtgagggaaatggcgagtaa
ggcaagtaatggcgggtgaaagcaagttcgatatttgacgtacggcatta
tgtcgactttgcttatacggtgtattggtgtttttcccgtatagagcaaa
gtagacaacgacatgtcgcctttggtgacgacccgcatgggcagccccgc
aaccccgtagccgtagaatatctccaatacataatctcgctaataaACCT
TCCATTTATAGTTCTTGATCTGTCATTGGcgagttttcttttttgaagac
aGGGGAAGGACTTAAGTGATTTGGAAAAATCTGCAGTTTTGACCTGCAAA
TTCGAGGGCGGTTAAATTGCTGATTTATCGTCGTGTTCAGTCAGTCAGGT
CTAGGCAAATTAGAACAGACGTTTACGTCCTCGTTGTCAAACTCACACGT
ACAGAAACTCGCTATTACAGTACCCAGTTCCTTTATCTCCAGGCCTGTTT
CCCATCTCGGTTACATTATATTATACTGGTCACGTTACGTAAATGTCACA
GTAACATTAATTTTCGTTGTAACTAATTTTCGTGGAAAACAACTTTCTGA
AATCAATTTTTGTCTTTTAGATCATTGACATCAACAAATATGATAAAGTT
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GTAAGTGGCTGTCTTTTCGAATTGTGCTCTGAAGTGGAGATTTTTTAGGG
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GTTTTCCAGGCCTCCACTTTGAGGAAATACGTATcataataaatttcaaa
agctgTCAAAAGTATTTCAAGATTCGACATACATATTTTTCATTAGACAT
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TGTGAGTTTTTCTATAGCTGCCTGTGTTTGAATAATTGAatgaggcgaaa
ataaaaaaatgtagtgtttccggaaaccggccgggtgaaaagaatatttt
ttctaacccggccgcagactatgggttcatctattatggttcatcataaa
gaaaatcaaaacgaccgttcaagctatcaaacgtcgtttggttagatatt
cctgcttgtaaatcaagttttgttcgttagtagttgatgcattagtattc
agggcttacttcatactgtttgtacataaaagttatgtttttaaagttct
atttcaatgatcttaagttatcaaaaatagaaaaaaaaaattttccggcc
ggctgCATGAGAGTTTTATttcttcacccgcattccggaaacactacatt
tttttatttttgccttatAATAAGATTTTTCCATATTTACAACCTGGTCT
CGATTTCTGGTGGAATAGAACcagctaccttaaaggaagaaattttggcg
gaaagaaaatttggcggatttggcggatttgactgaaatccgccaaatta
agttcctgccaaaatttcttttttccgccatccgccaaattgtctgtaca
caaacccaatatctacggctaatttcaaaattcattgccgtagaactacg
ctacgataatcgtgagatacactctggtacagagtatccgccaaattaaa
ttcccgccaaattaaatattttgaaaatataatctcttttaaggtgtttt
tgctattttttcgctgttttgacgccatcttaaggttaaatttttaagcg
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attaaattccctctgaaaaaacttttttggccatccgccaaattaaattc
ccgccaaaatttcttcctttaaggtagaacAAATTCATAGGACTCCATTT
CCAATAGGAACCACAATGGGAGTGATACAATTTCTCTATTTCATTACGAT
AATTAAAGGAGTGATTATAGGGAGGCGGGCCGCTAGCTGAGGTGGGTGGA
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ATCATACCTTGCTTATAAAGAGCCCCTTAATAGGGTTGCCAGGAGGAAAC
CAGGTTATTTAGAGCAGGATAAAATGAGACACTTTTCTTTCCACAACCAA
ATATTTGTTGAATAAAACTCGAAAAAACGGGGGAGGGATCCTAACGAGAT
CCGAAGGGGTTGTGAGTTTGTAAAAATGGAATACTTAAGAAATAGGGGgt
gtgtttttataagaaatctgAGAGTTACAAATTCTTCGTTGCCGCctgaa
aaaactatcagtgtagccttagcttaagAGTCTTAAAGGTCTTAAAGGTT
AATTTCATAGCCAAAAAATATTAACTTCTGGAATTGAAATACGGTTTTCT
CTTATTAGGTTATCGTGCATGATGCTGTTAGACCATTCCTTAAAGAAGAT
TTCTTGAAGCAACTTGTAGAGCAAGCTATCATTAACAAGGTTTGCTACAA
AATATGTACAAGATGCCCTCTTCTATAAGAACCAGTAGAATTTTCTAACT
GTCAGTTCTTATCAATGATGCtatgagcctcattgttcttataatattAT
TCCTCTAACAAAATACATTTTGTGattaaaatttagttttgaaATTGAAC
GATTGTCAATTTCgtttaatttcaaaaagtatgtCTCGCgtatcttcaaa
ttttcaaacaaatttttttcaaatttaaggaGTGAAATCGACTTTTATAA
TTAacgaactttttttatttccaaaaggCAGCAGGAGCTGTTCGAGCGTT
AGTTTCAACGGTCGTCAAATGTGATGTTGATGGATTTATGGAAAGCTCTC
TTGTTAGGTAACTTATTTTTCATAACATTTTTAATTGGTCACTATTGGAA
AAGAGGATGTCtcaaaactttctgtttacggCGTTTTAAAAATAAGCTGT
TGTAGTAGAAGATCAGCTCaaacatataaaaaatacaGATATTTGAAGTT
TAAAGTTCTGTCAATTGAGTACGATTAagtcaaatttttattaaaacgtA
AGAGATTTCACAGGATTCGAACTTCAAACGACGATATCTTTTTGTGTGTT
TGAGTACAAGAATTTCATGCTTCATCTGATGATAACAATCATTCTCGTTG
AATTTAACTTCGTCATCTTTTACCTTAATTTAGCGTTAAGAGATTTTTAC
TGTAAGGCGAAAATAAATATATGTTTcatttccggaatgcgggtgaagga
aaaaagttctCATGCGGGcggccggaaaatatttttttttgctatttctg
ATAACTTTATATAACCGAACTTATATATAAATATAGTGTAAATTCAGTCA
ATATGTGTAACTAGCTAACTAACGAAGCTCAAAGCTCCATTTAGAGGGCA
ATAACCAAATAACTTTATTGACAGATAGGGCAGCTAACCCACATATTGGt
cgaaatgttgaaaaaaatgtcTGCGGCTGGatgaggaaaaaaaatttcac
ccggccgctttccggaaacaagacatatatttattttcgcctaatgccag
attttttattcataaaaacCAGGCCAACTTTTCGGCGcccccctctcaaa
aaagtttcattaTCCTATCTGCACGTACGCAAAacttttccaaatatttg
acatcCCTTCCCccttcattgttttttttttcagatcgCAGTATCGTGAG
AGTCATACTCCACAAGCTTTTCAATTCGAAGTCTTAGAAAACGCCTATAA
ACAGgtacaatttttgttttattagggAATAAGTGTTATATACACAGAAC
CAGTTGGACACCCTCTTTTCTGGAAAAGCGCGCAAAATCGTTCCTGCTGA
GAAAAAGTACCCTGAAATCACAAAATCGAAAGATACATCATTCGATTTTG
TGTCCTTAtccagggtgtcccgaaaaaggTTTTATGTTAGACTATATCTA
CGATTAGAGTTGTAATAGGGACCCTGCCCTAACAACAGTCACGTCTTTGT
ATCTCTTGCCTGTGCGACCTCTCCCCCTCATGTTGAATCGTGTGGTAAAA
TCTGGCGGTAAACTAAAACTTATAATTCTGTGGAGCCCATAACtggaaca
cgcacggggaatttaaatttgttcaagttaacgaaattttgagttatgtc
tGAACATTTATATCTgaactgaaatgaaaaaagaacgtgttcgagttaaa
gagtaaactctagtttagacggccgactttctgccctgcctattctaatt
tttAGGGTAGGCagaaagtgggcacaaagttggcagttaatatctttgct
tgaaaaagattgaaagaagacattgcattgacgtcaaaagtgggcaatgc
attgactttagacagcccactttaagcccactttaattcacaataatTAG
AATAGGTAGAGCGAAAAgggggccgtctaaactagagctaattcGAGTTT
AGGTTCGAGTTAAACACGAGTTAAAGATGGtcaaagagactccactgtat
attaAAAGACAACCGCGTGTAACTTTTAACTTGTTTGAATGCACTTTCAG
TTTCTAGttattctctttttctttgttgtcAGTGTTCACAAGAAGATTTT
AACCATGGTACAGAGTGTTTGGATTTAGTTCAAAAATATTGTGGTGTTCG
TCCAAAACTTGTCGATGGTCCCGAATATCTTTGGAAGGTGtgatttcttt
atttatttcttatttacaGCGAGGAAGCTTGACAAAATAAGAAGAATTGT
CCTATATTCTAATCTAGCGACTCACTCAAATGAAATATGAGacaaatatt
ttgcaaaaactTTTACACTTAATTTTCGACAAGAAACTTCTTAGCTTTAG
CTTCAAAAAGAAGGGAAATTATTATACGCTAAGGGAACATTTTTGTCATT
ATTATGAGTACATGCACAATTAAAGGATGTCATTTAACGTATcacctacc
atttgcttactcaGCATTTTCAAACCAACCAAAGAAAGGACAACTTCTCT
CCCTGCGCgagttaaaattttgataaattattttgtttattctaCTTTGT
CAGTATAGAGGCGCATTGATTAGCACATGAATTCATTTGTTATTGTAAta
acccaaaaaaaaaaacactctgagcatgttttttttcattttgttttcag
GTAACTCACCAGAAAGATATCATTTTAATGGAATCGTTTTTACAACGTGA
GTCATTATCacatttctttgatttttacaATCGCTAAAATAGATTTGGAT
GAAATACTGCATTGCTTTCAATCGTGACGTTTTTTGACGACATGGTGCAC
CTGCATTAGGTGAATGGGGGAGGGGCATGATTAAACAATAGGAGCTGGTC
TGAGGAAATGTTTCAAATTTGATAACCAGGTATTTTGTGAaggtgaaaaa
tcaatttattttgagCAAATAAGGCACTTTCCCGCCCCCGGAGGGGTACC
AAGGTAAAAGGAGGGTAGGGCTATGTGTCGCCCCAAACGGTTCGTTTTTT
AGATCTTCACAAAATCCCAATAAGGGtcatgaaaatattattttcatgtc
ttttgtcgttttttgacgttttatcGAATAATTCGAAAAGTAAGTGTTTA
GAGaaaaaaaCGTGGCAAGGTATTTTTCGTCTATTATTCTGGATCATGAT
CatataaaaagttttattaaatTGCCTACTTATCACTTTTTGAAGATGAC
ATGGTAATCTTTCTTTTGTCATCTTTTATTCCTTTgtcaaattgacaaaa
tttattgttgtcaGCCTTAATCGATAGAGAATTTAATAAGCTTTTCAAAA
TATACTTTTACTATTGAAATATATTTGTATCGAAAGCTGTTAATAAAAGA
GTCAAGTGTGGTGTCGAAGGTTTCCACCTTTCCATACCTTAAGACCTTAT
AAGGGTTCTAAAAACAGCTCAAATTCCACATCGTGACCCTCAAAAGacaa
aattttaagtaaaatagTCATAAAATTTACAACAATTTGTGTTTTTCCTC
GATTTAAGCCCCTCTAAGGGTCTCCGTTTTGATGGTCCTTCTAAGGGCCC
GGCTGCCAAAAGTCGGTTGGCATGGCACACACCCGTCATCCcgcaaaccc
cccccccctctgacTTTTTCTCACTGTTGAAAATATAGTAAATAGTAAGA
AACATCAGAGGGCTGTTCATTAGGCACCATGGTAAGTGAACGTACGAGCA
GAAACATAAAAGgttatctcttttttttttcaggagaaAAGGAGCATCGA
TGA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000115_pilon:443379..451131+ >XLOC_038647 ID=XLOC_038647|Name=XLOC_038647|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1422bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000115_pilon:443379..451131+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAACGGTAAAAAAGTAAATGCTGTTTTGCCAGCTGCTGGTATTGGCAC
AAGATTTGGTGCTCAAAAGCCTAAACAGATGAACGGTAAAAAAGTAAATG
CTGTTTTGCCAGCTGCTGGTATTGGCACAAGATTTGGTGCTCAAAAGCCT
AAACAGttTACTGAAGTAGATGGAAAGCCTATCATTTGTTACACAATAGA
AGCATTCCAAAGttTACTGAAGTAGATGGAAAGCCTATCATTTGTTACAC
AATAGAAGCATTCCAAAGtATACCGTGGATAGAAAAAGTGGTTGTTGTCA
TTTCTGAAGATTGGATGGAATTTACTCAAGAAtATACCGTGGATAGAAAA
AGTGGTTGTTGTCATTTCTGAAGATTGGATGGAATTTACTCAAGAAATCA
TTGACATCAACAAATATGATAAAGTTAAATTAGTTATTGGCAAAGACACA
AGATCATTGACATCAACAAATATGATAAAGTTAAATTAGTTATTGGCAAA
GACACAAGACATCGAAGCATAAATGTTGGTGTCAACTCAATAGAGAGTTC
TGCAGATGATATTACATCGAAGCATAAATGTTGGTGTCAACTCAATAGAG
AGTTCTGCAGATGATATTGTTATCGTGCATGATGCTGTTAGACCATTCCT
TAAAGAAGATTTCTTGAAGCAACTTGTAGAGCAAGCTATCATTAACAAGG
TTATCGTGCATGATGCTGTTAGACCATTCCTTAAAGAAGATTTCTTGAAG
CAACTTGTAGAGCAAGCTATCATTAACAAGgCAGCAGGAGCTGTTCGAGC
GTTAGTTTCAACGGTCGTCAAATGTGATGTTGATGGATTTATGGAAAGCT
CTCTTGTTAGgCAGCAGGAGCTGTTCGAGCGTTAGTTTCAACGGTCGTCA
AATGTGATGTTGATGGATTTATGGAAAGCTCTCTTGTTAGatcgCAGTAT
CGTGAGAGTCATACTCCACAAGCTTTTCAATTCGAAGTCTTAGAAAACGC
CTATAAACAGatcgCAGTATCGTGAGAGTCATACTCCACAAGCTTTTCAA
TTCGAAGTCTTAGAAAACGCCTATAAACAGTGTTCACAAGAAGATTTTAA
CCATGGTACAGAGTGTTTGGATTTAGTTCAAAAATATTGTGGTGTTCGTC
CAAAACTTGTCGATGGTCCCGAATATCTTTGGAAGTGTTCACAAGAAGAT
TTTAACCATGGTACAGAGTGTTTGGATTTAGTTCAAAAATATTGTGGTGT
TCGTCCAAAACTTGTCGATGGTCCCGAATATCTTTGGAAGGTAACTCACC
AGAAAGATATCATTTTAATGGAATCGTTTTTACAACGTAACTCACCAGAA
AGATATCATTTTAATGGAATCGTTTTTACAACgagaaAAGGAGCATCGAT
GAgagaaAAGGAGCATCGATGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000115_pilon | genome | sc0000115_pilon:443379..451131 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 694-711:7736 |
| Aaloc | 646-690:6651 |
| Aaloc | 541-645:6083 |
| Aaloc | 472-540:5186 |
| Aaloc | 391-468:4278 |
| Aaloc | 310-390:3909 |
| Aaloc | 256-309:2398 |
| Aaloc | 199-252:2121 |
| Aaloc | 136-198:1371 |
| Aaloc | 79-132:779 |
| Aaloc | 1-78:1 |
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