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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000115_pilon:345467..352505+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_038643 ID=XLOC_038643|Name=XLOC_038643|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=7039bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000115_pilon:345467..352505+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTTGGCAATCTATATTCTAGTTGTTGCTTTGGGTGAGTGCTTTATCAA
GCCTTAAACAGAACATCTTTATCTTTAgtgacaatagaatttctattcgt
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TCTACGATGAGAAAGCTTATGGAGGATATGGAGCTTGCATTTATAAAGCT
GAATCTAACTGTCTTCAATTCCAAGGAGAAGTTTGCTACGGATCCACTCA
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TCATagccaaattttaagaaaataagaatatttatacAGGTTTAGTGAAA
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TCGTCTCCAAATCTGGAAGTGTTGGATGTTACAAAGGTGTCACGCCTGGT
TACTGGGGTGGATGCCCACACGCCCCACCAATCAACGTCTGGATCACCGA
GCACAGAGCTGACAACTtcaaatacgtcaaaaaatcaTACTACGACATTA
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AATGTAGGCAAACACTGCGTTTACGTCTACGCATCGTTCTACAAATACTA
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TGATATCTAACATAAATGGTCCCTCAGCCAATCCTCTAATGTTTTCGTGC
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CAAACCGCAAACTTTTGTATTATTTCTGTTTATTGTTTGTAAACAGAAAA
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AACATGAAGCTAATTAACAATCTGCCAGGATGGCTAATTAGATATccgtg
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TGATTAATTTCCTTGGTTCTCACAACAATTTGGTGTATAAAAGGGGGAAG
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AACCACCCTCACTAAGATTTttaatttaagaacaatagaatttccccatt
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TTTCTGTGGCATAAAGCTTAGACAATGCCGGGTgtaaaaatgttataaat
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attggatttttttgagtgaaacaaaaatttctttgcaGCCGaaaaaaaCT
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TTCCTTCTCTATGTTATAGTGACGATCCATGTGCAAGCCAGTGCTAATAA
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GTCTATGAGAGGAGGAGAGTTCAATTTGAGTGTTATTTGCTTTAATGGAA
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AGTTGtcgaaatacgcattattagcgcttctttgataaCACTAAACATTC
AAATTGTTATTCGGGACTTTCATCAAAACGATTTCGTGTTTGGGGTCAAA
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ATTGAGAAATTCATCATCACTATAATTCccttctttttatattttagttG
ATGCATACTTTTGTAAGGGAAAATCTGGCAATTATCGTCATCCAAATGGA
GCCTGTGATCACTACATAGCCTGCGGTGTTGGAtgtaaaaatgctaaaaa
cagACGATCCTACAAACGTCTTTGTACACAAAACATCATGCCGTGCCCAG
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TATAAAGCTGAATCTAACTGTCTTCAATTCCAAGGTGAAGTTTGCTATGG
ATCCACTCAAGAGTCATAGTAAGTACTTGTTTCCGTCACAACTGGCGGCC
ATCTTAAAATCATagccaaattttaagaaaataagaatatttatgcAGGT
TTAGGAAAGTATTTCTTGCGCCCATCCCTTGCAAGAGAACaagaacaaaa
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CTCATCACTTAACTTTCATTCCTTAAgaagcttttccttaaaacaattta
atttaCCTTTACAGTGGCACTTATACTCATCAGTGTACTGGACAAGTCAC
CTTATTGAAGCTGGTCTCCAAATCTGGAAGTGTTGGATGTTACAAAGGTG
TCACGCCTGGTTACTGGGGTGGATGTCCAAACGCCCCACCAATCAACGTC
TGGATCACCGAGCACAGAGGTGACAACTTCAAATACGTCAAAAAGTCATA
CTATGACATTAAACACGACATCAAATTTCCCGAACCATTCACTGCTTACG
ACGCCAACAAATACGGATTCTACTATTTGAATGAATTCCATGACAAATCA
TCCTTCATCTATTTCACTGCAGAACATAATGATTATTACACCTACTTTGT
CAAAGGAAAGAAATACCGTGTCTATTATGGTGAAGATTTGTTTGATCAAG
GAGTCGGAAACAATGTAGGCAAACACTGCGTTTACGTCTACGCATCGTTC
TACAAATACTACAAAccaaatcaagttatcaaattttaa Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000115_pilon:345467..352505+ >XLOC_038643 ID=XLOC_038643|Name=XLOC_038643|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=1686bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000115_pilon:345467..352505+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGTTGGCAATCTATATTCTAGTTGTTGCTTTGGATGTTGGCAATCTATA
TTCTAGTTGTTGCTTTGGCGACGATCCAAGTGCAAGCCAGTGCTGATAAT
CCTTTCACATACGAAGACAATTTGAAAGCTGCGACGATCCAAGTGCAAGC
CAGTGCTGATAATCCTTTCACATACGAAGACAATTTGAAAGCTGTCGATG
CATACTTTTGTAGGGGAAAATCTGGCAATTATCGTCATCCAAATGGAGCC
TGTGATCACTACATAGCCTGCGGTGTTGGAtgtaaaaatgctaaaaacag
ACGATCCTACAAACATCTTTGTACACAAAACATCATGCCGTGCCCAGGTG
GTCTTTTCTACGATGAGAAAGCTTATGGAGGATATGGAGCTTGCATTTAT
AAAGCTGAATCTAACTGTCTTCAATTCCAAGGAGAAGTTTGCTACGGATC
CACTCAAGAGTCATATCGATGCATACTTTTGTAGGGGAAAATCTGGCAAT
TATCGTCATCCAAATGGAGCCTGTGATCACTACATAGCCTGCGGTGTTGG
AtgtaaaaatgctaaaaacagACGATCCTACAAACATCTTTGTACACAAA
ACATCATGCCGTGCCCAGGTGGTCTTTTCTACGATGAGAAAGCTTATGGA
GGATATGGAGCTTGCATTTATAAAGCTGAATCTAACTGTCTTCAATTCCA
AGGAGAAGTTTGCTACGGATCCACTCAAGAGTCATATGGCACTTATACTC
ATCAGTGTACTGGACAAGTCACCTTATTGAAGCTGGTCTCCAAATCTGGA
AGTGTTGGATGTTACAAAGGTGTCACGCCTGGTTACTGGGGTGGATGTCC
AAACGCCCCACCAATCAACGTCTGGATCACCGAGCACAGAGGTGACAACT
TCAAATACGTCAAAAAGTCATACTATGACATTAAACACGACATCAAATTT
CCCGAACCATTCACTGCTTACGACGCCAACAAATACGGATTCTACTATTT
GAATGAATTCCATGACAAATCATCCTTCATCTATTTCACTGCAGAACATA
ATGATTATTACACCTACTTTGTCAAAGGAAAGAAATACCGTGTCTATTAT
GGTGAAGATTTGTTTGATCAAGGAGTCGGAAACAATGTAGGCAAACACTG
CGTTTACGTCTACGCATCGTTCTACAAATACTACAAAccaaatcaagtta
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ATTGAAGCTGGTCTCCAAATCTGGAAGTGTTGGATGTTACAAAGGTGTCA
CGCCTGGTTACTGGGGTGGATGTCCAAACGCCCCACCAATCAACGTCTGG
ATCACCGAGCACAGAGGTGACAACTTCAAATACGTCAAAAAGTCATACTA
TGACATTAAACACGACATCAAATTTCCCGAACCATTCACTGCTTACGACG
CCAACAAATACGGATTCTACTATTTGAATGAATTCCATGACAAATCATCC
TTCATCTATTTCACTGCAGAACATAATGATTATTACACCTACTTTGTCAA
AGGAAAGAAATACCGTGTCTATTATGGTGAAGATTTGTTTGATCAAGGAG
TCGGAAACAATGTAGGCAAACACTGCGTTTACGTCTACGCATCGTTCTAC
AAATACTACAAAccaaatcaagttatcaaattttaa
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000115_pilon | genome | sc0000115_pilon:345467..352505 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 370-843:6566 |
| Aaloc | 100-366:1091 |
| Aaloc | 37-96:358 |
| Aaloc | 1-33:1 |
|
