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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000115_pilon:312508..320696+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_038641 ID=XLOC_038641|Name=XLOC_038641|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=8189bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000115_pilon:312508..320696+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) atgacaTCATCCAATCAAGGCTCTTTGCACACTTTGGGTGATGAGGGTGC
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ATTATCAACTCTTATTAATGGAATGAGAAATCTTGGTCATGATTTTATGA
GGGAAGTAATTAGGGAATTATCTAATTGCAAATTTCTGGTAAAACTCTAG
TTTTTAGCCTTATTACACGTTGAAAAAGGAGTACATTCGGTAGTGTTTGC
CAACTCGATAATACCAAGCTTTTCTTGCTTGTTTTGTAACtgattcttgt
ttttttttatgtcaaCAGAGGGAAGAACGGCCCTGGAGGCTGGGTTCTCC
GTGATATTCCTGGTGAACCAAATAAAACAGAATTCATTTGGTTATTGAAT
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tttttaatatgctTTGTCATGATTTCTGACAATTAcaataagaccatgtt
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GTATGTTCACATGAtctcggaacgtttcggagcaagaaagcggagcagtt
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AATATATAAGCCAATGGTTTACCTGGCTATGTGGAATGGTTGCTAAAACT
TGCTAGGTTCGATCAAGCGAGGACGCATTGTCCTCCCGAGTCGTTCGAGT
ATATAGTTACTATAcaattagactggagtcgtttataatgcgtgtaatac
tgataataccaatactaataataataataataataatacgggatttagtt
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AACTGGTAGAAACATCTCTGGCAGGTGTTATGGTGGATACTGTAAGAGAT
ATTCGTCAACATGTATCAACTACACTGTTACCTACGTAA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000115_pilon:312508..320696+ >XLOC_038641 ID=XLOC_038641|Name=XLOC_038641|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3126bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000115_pilon:312508..320696+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon) atgacaTCATCCAATCAAGGCTCTTTGCACACTTTGGGTGATGAGGGTGC AGCAAATTATATTGAAGAAACCTTGAGTGACCAAGAACCATTACTGTCCA ATGAAATCCCACCACCATTGCACCCAGACCCTTTTCATAATGTCCCAAGA CAAGCAGACTACGAGAATCCTCCAATCAACCCTTACTACATTCAACAGTC TTATGATGATCGGATGAAATCAACTATTTACGATGAAGACACACACTGTT TTTCAATGTCTCGTGTTCGACGAATGTTTTGTTTGTTGTCACTATTTGAT TGTTTAATGACTTTCTTGATGTGGGTTATTTATCTTCAGatgacaTCATC CAATCAAGGCTCTTTGCACACTTTGGGTGATGAGGGTGCAGCAAATTATA TTGAAGAAACCTTGAGTGACCAAGAACCATTACTGTCCAATGAAATCCCA CCACCATTGCACCCAGACCCTTTTCATAATGTCCCAAGACAAGCAGACTA CGAGAATCCTCCAATCAACCCTTACTACATTCAACAGTCTTATGATGATC GGATGAAATCAACTATTTACGATGAAGACACACACTGTTTTTCAATGTCT CGTGTTCGACGAATGTTTTGTTTGTTGTCACTATTTGATTGTTTAATGAC TTTCTTGATGTGGGTTATTTATCTTCAGctttcagatggtggaATTACAG ATAATTTGGCACCTGAAGTTAAAAACCTCACAATCCACACTTCACTATTT GATATAGTTctttcagatggtggaATTACAGATAATTTGGCACCTGAAGT TAAAAACCTCACAATCCACACTTCACTATTTGATATAGTTTTATGTTCAA TTACGAGGTCACTTGTTTTGTTATTATTCTATTCTTGTTTGATCAAAAGC ACAAAATGGTATGCTGTCGCATTATGTTCAATTACGAGGTCACTTGTTTT GTTATTATTCTATTCTTGTTTGATCAAAAGCACAAAATGGTATGCTGTCG CAttaACTACTTCGGCAAGTACAATATTTCTATTGATGAAGGTCTTCTTG CTCAAAGGAGAATATttaACTACTTCGGCAAGTACAATATTTCTATTGAT GAAGGTCTTCTTGCTCAAAGGAGAATATTATCACAAAGGAAACCCGATCA ATTTTTTCCTGATTATATTCTCATTTATTATTACGTGGTGTGAAGCTTGG CATTTCGATTTCAAATATCACAAAGGAAACCCGATCAATTTTTTCCTGAT TATATTCTCATTTATTATTACGTGGTGTGAAGCTTGGCATTTCGATTTCA AAGTTATCCCGCAAGAATTACAAACCAAAAACTTGGGAGATATCAGAACA AGTTATCCCGCAAGAATTACAAACCAAAAACTTGGGAGATATCAGAACAA GTTCTTTACCACCGATCGCTGGAGGTAGCTTCTTAGCAAGCGATCAACAA AGGAGACAGAATAACCGGGGTGGAAGGTTCTTTACCACCGATCGCTGGAG GTAGCTTCTTAGCAAGCGATCAACAAAGGAGACAGAATAACCGGGGTGGA AGATCACGTTTTGGCGCGCCATCAAGCTTTTACACTCCTTATGCTGGGTC CAATTATTATGGTGGAGATCACGTTTTGGCGCGCCATCAAGCTTTTACAC TCCTTATGCTGGGTCCAATTATTATGGTGGAGGTAAATCACACATCAGCG AGGAGAGTGAAGATGATAGTCAATGCAGTGATATCTCCGCCGAACTTGGT AGACTCTCCGATCAAGAGGTAAATCACACATCAGCGAGGAGAGTGAAGAT GATAGTCAATGCAGTGATATCTCCGCCGAACTTGGTAGACTCTCCGATCA AGAGGATCACGCATTGATTCGTAAAGCCAACGATACTTTACATATGGTCT TCCGAATGCTCTATATCAGTGATGGATGGAATATGTGTCGCGAGGAAGAT CACGCATTGATTCGTAAAGCCAACGATACTTTACATATGGTCTTCCGAAT GCTCTATATCAGTGATGGATGGAATATGTGTCGCGAGGAAAAAGACAATA TCATTGTACAATCTCGTAATTTTGATGGTGTTGGTAAAGTTTATAAGCTA GAGAAAGACAATATCATTGTACAATCTCGTAATTTTGATGGTGTTGGTAA AGTTTATAAGCTAGAGgcaGTAATTGACGTAAATAGCTCAGTGTTGGATC AAGTATTTTGGGTGGATGTAGATTCTCAACCTTCTTGGAATGCCTCCGTC AAAGAATGCAGGgcaGTAATTGACGTAAATAGCTCAGTGTTGGATCAAGT ATTTTGGGTGGATGTAGATTCTCAACCTTCTTGGAATGCCTCCGTCAAAG AATGCAGGATTCTCCGAAAGATCAATAAACTATCAGATATAATTTACAGT GTGGCGGCAGAAGCCGGCGGTGGCATTATCTCTTCAAGATTCTCCGAAAG ATCAATAAACTATCAGATATAATTTACAGTGTGGCGGCAGAAGCCGGCGG TGGCATTATCTCTTCAAGaGATTTTGTCAGTCTGAGACGACGTAAGCGTA AAGGACCGCTAACTTTACTTTGTAATGTCAGTATTGAAACACCTCTTATG CCACCTGTATCAAGTATTGTCAGaGATTTTGTCAGTCTGAGACGACGTAA GCGTAAAGGACCGCTAACTTTACTTTGTAATGTCAGTATTGAAACACCTC TTATGCCACCTGTATCAAGTATTGTCAGAGGGAAGAACGGCCCTGGAGGC TGGGTTCTCCGTGATATTCCTGGTGAACCAAATAAAACAGAATTCATTTG GTTATTGAATACAAAATTAGGTAGGGAAGAACGGCCCTGGAGGCTGGGTT CTCCGTGATATTCCTGGTGAACCAAATAAAACAGAATTCATTTGGTTATT GAATACAAAATTAGGTGGCTGGTTACCTCAAAAACTGGTAGAAACATCTC TGGCAGGTGTTATGGTGGATACTGTAAGAGATATTCGTCAACATGTATCA ACTACACTGTTACCTACGTAAGGCTGGTTACCTCAAAAACTGGTAGAAAC ATCTCTGGCAGGTGTTATGGTGGATACTGTAAGAGATATTCGTCAACATG TATCAACTACACTGTTACCTACGTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| sc0000115_pilon | genome | sc0000115_pilon:312508..320696 + |
Properties
| Property Name | Value |
| Aaloc | 1459-1563:8085 |
| Aaloc | 1366-1458:6920 |
| Aaloc | 1261-1362:6384 |
| Aaloc | 1180-1257:5715 |
| Aaloc | 1084-1179:4992 |
| Aaloc | 1021-1083:4632 |
| Aaloc | 928-1020:4168 |
| Aaloc | 844-927:3594 |
| Aaloc | 778-840:3239 |
| Aaloc | 703-774:2991 |
| Aaloc | 652-699:2694 |
| Aaloc | 565-651:2325 |
| Aaloc | 502-564:1956 |
| Aaloc | 421-501:1435 |
| Aaloc | 340-420:1021 |
| Aaloc | 1-339:1 |
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