XLOC_038641 (mRNA) -

Overview
NameXLOC_038641
Unique NameXLOC_038641
TypemRNA
OrganismClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at sc0000115_pilon:312508..320696+

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_038641 ID=XLOC_038641|Name=XLOC_038641|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=8189bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000115_pilon:312508..320696+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
atgacaTCATCCAATCAAGGCTCTTTGCACACTTTGGGTGATGAGGGTGC AGCAAATTATATTGAAGAAACCTTGAGTGACCAAGAACCATTACTGTCCA ATGAAATCCCACCACCATTGCACCCAGACCCTTTTCATAATGTCCCAAGA CAAGCAGACTACGAGAATCCTCCAATCAACCCTTACTACATTCAACAGTC TTATGATGATCGGATGAAATCAACTATTTACGATGAAGACACACACTGTT TTTCAATGTCTCGTGTTCGACGAATGTTTTGTTTGTTGTCACTATTTGAT TGTTTAATGACTTTCTTGATGTGGGTTATTTATCTTCAGGTTTGTTATAA TGTTCATCCCAAATTATTCTGAAGAATGCATTTGCTTTTCCAATCAATGA CCCAAACTGATAATATAGTAtttttttCAGTGTGTCCagacaaaaagaac aaaatataaaaataaaaatccttatatactttataaggtttatagcccag gcaaaaataaaaaaatctaggTTTCTGGAAACTGGCCggatgaaagaaag aaattttctgaCCTGTTGGCAGACTGTatagttcatcataaagaaaatta agtttgccgttcaagctatcaaacgttgtttggttagatattcccacttg taaatcaagtttgttcgttagtagttgatatattagtattcagggcttac tttaTACTGTTTTTACAtgaaagttatctttaaagttctatttcaatgat cttaagttaatATAGTATCaaatatagcaaaaaaaaatcttttccggccA GCCGCATGAgatcttttttccttcacccgcattctggaaacactacattt ttttatttttgccctatgttcatttatttattaaatGTCTGTTTTTATAA GGATTAAATAAATTCCATCTTATTTCAAGTAATGGAACTCAGAgagtttt 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CCTAGTTGACTTCTGTGTATCTAATCCCATCTTCATGGGGCCAAGAATTT TTTCGAAtcatagaaagattcaaattatgGAGAGCATTTTATATCACTTT CAAGCTACGTGGACAAATGCTGATTGACTAAATGAAGAATCAGCTGACAA TTGCTTTATAACTTCGTTGTTTTGTATTATgctagaaaaatttttcaggt cattaatttatttaattgtagatgtatctttcatttttcaggcaGTAATT GACGTAAATAGCTCAGTGTTGGATCAAGTATTTTGGGTGGATGTAGATTC TCAACCTTCTTGGAATGCCTCCGTCAAAGAATGCAGGGTAATAAAGTCTT CCTTAAGGTCGATATTTCATTACAAAAAATGTAGTTATTCCATTGTTGGA TCTTACTTgaatgttgaaaattgaaatggaCTCATCTAGTCTAGCAtgcc aaaaaaagaaaaagtagtcTGCATTTGCTAGATGGGTATGTCTCTTCAGC GGTGCAATTTGCTCCATCTGGCCCTATACCAACAGCTATCAGAGCTACTT CAAGCGACCGTAGCacgaaggtagagcatccagctgcggtgcgcaaggtt gtgggctcgatccccagccgggtcataccaaagattcccaaaatggtact tgatgcctctctgcttggtACCTCTCtgtttgatgctcagcaactaaaga gacggatcaagggtaagtggagaaatccagggaaaggagtggcgccctcc cctaccttcgggtagacagctatacgaaaagggagccttcgggtcgccct cgactgcggtcgcaaacttacttactttactttAATCTAGCATTCTATTC GTTTTGTAAGCACGCTTCTTTCTTTATGGCATAAGCTTTTCTCCGATCAG TTGCGTTTCATCTGAGACCTCTTTTTCCTCCAGTACTGACATTTTGTCCT CGATTTGGTTTTAGATTCTCCGAAAGATCAATAAACTATCAGATATAATT TACAGTGTGGCGGCAGAAGCCGGCGGTGGCATTATCTCTTCAAGGTAATA TGTTATTTAAAGCGCTTGGGAAGATATTTATTATGCAAGCTTTAACGTTT TGTTAAAAAACATCGGTTAAACAGATGGTTAAGCTCGAGATattcaagtt tttattttattgtcgtGCGGAATCTTGATTTTGAAAGTAgttagataaaa aaaagaaggatGAAAATAGTTGAACCTGAAACTTTTGTCATCGATATTAC AACAAATACTGAAAGGGAATAGATCGCAATTGTAGTTTACGCACGCGCTG ACTCGCGGTGGTTTGATTGCAAAAGGTAGATTACACTGATGATGAAACCA TTTTTGCCatcattcaaaaaataaaatacacaccttttttgtaagaacac gAGCCTGAAATTTGGGAATAAATCTAAGAACAAGTCATGAACAATCTGAG CATCCACTTTTGAATAGAGAAGGAAGCTAAGTGTATTAAGAACACATTGA GAACATctgaaaaccttaaaaatttcaagaaaaactgaGCAACCAAGTGA GACTCCGTCTAAATCTTCTGGTTTTTAGTATAAAAAGCCTGTATCTTATT TAATCACACAACtattctgttgtttttttcagaGATTTTGTCAGTCTGAG ACGACGTAAGCGTAAAGGACCGCTAACTTTACTTTGTAATGTCAGTATTG AAACACCTCTTATGCCACCTGTATCAAGTATTGTCAGGTTTGTAAAGCAA TTACTCTCAGGTTCCAAATAAATAGGGGGGTCGGAATAAACGAGGGTTTT GGAAAttatgttggaaaaaaatcttaatAAATTGAGGGACCTTACTGTTG TAGATCAAAACAAGGACTTGATAGTTTTAATCTAAATCTTTCTGAAaacc attttatgattttaacggTTGCTTGGAATCACTTACTTGTTATTAGTCCT ATTATCAACTCTTATTAATGGAATGAGAAATCTTGGTCATGATTTTATGA GGGAAGTAATTAGGGAATTATCTAATTGCAAATTTCTGGTAAAACTCTAG TTTTTAGCCTTATTACACGTTGAAAAAGGAGTACATTCGGTAGTGTTTGC CAACTCGATAATACCAAGCTTTTCTTGCTTGTTTTGTAACtgattcttgt ttttttttatgtcaaCAGAGGGAAGAACGGCCCTGGAGGCTGGGTTCTCC GTGATATTCCTGGTGAACCAAATAAAACAGAATTCATTTGGTTATTGAAT ACAAAATTAGGTGTAAGTAAACgaactttctttctttatttttttagttt tttttaatatgctTTGTCATGATTTCTGACAATTAcaataagaccatgtt cacacgttactgttccgtttcgctccggtatgatttccGTTACGTATCGA GTATGTTCACATGAtctcggaacgtttcggagcaagaaagcggagcagtt ccgttccgatgaaaaaagtggagcgaaacagTTTCGATCTGtattgcttt gtaacgtcttctttttgacgtttcgaattttgacgttcataccatagatt tataaattttgacgttcatacttgtttcggaaccgtttcgtttcggaacg gaacagAACCGtgacgtctgaacatggtctaagtaTAGAGTAGTTGGCGA AATATATAAGCCAATGGTTTACCTGGCTATGTGGAATGGTTGCTAAAACT TGCTAGGTTCGATCAAGCGAGGACGCATTGTCCTCCCGAGTCGTTCGAGT ATATAGTTACTATAcaattagactggagtcgtttataatgcgtgtaatac tgataataccaatactaataataataataataataatacgggatttagtt tgtataaacgactggaagaatccggtgttccagccttacagataccccgg ctagctacgcagaaacttgcgtagcgagaaaacaatttatcaagcaacaa caaactctcaaaacgaaatcaactcaaatgaaaaactttcaatacacaaa tccagacatattttttttctcaagaattattttgagaaggaaaaaatcat aattgcaatattgacacttttcttttgtttggagttagtgcacaaaggtt tctagacgactaaaattgttccattcattactttttgctttatttctact atgtataaattagtcgtctagcttgctagactactaTACAATAGCAGCTC TTTTAGTCGAAGATGATCCTCCAAACGGTGGcataaaatttcatgctctg tgaaaaaaaacaactcttTTTCCTTTTCATATTGTTTGGTAGTGATCAAA TAgaattctttatttcttgatattttgtcTTCAGGGCTGGTTACCTCAAA AACTGGTAGAAACATCTCTGGCAGGTGTTATGGTGGATACTGTAAGAGAT ATTCGTCAACATGTATCAACTACACTGTTACCTACGTAA

Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000115_pilon:312508..320696+

>XLOC_038641 ID=XLOC_038641|Name=XLOC_038641|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3126bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000115_pilon:312508..320696+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
atgacaTCATCCAATCAAGGCTCTTTGCACACTTTGGGTGATGAGGGTGC
AGCAAATTATATTGAAGAAACCTTGAGTGACCAAGAACCATTACTGTCCA
ATGAAATCCCACCACCATTGCACCCAGACCCTTTTCATAATGTCCCAAGA
CAAGCAGACTACGAGAATCCTCCAATCAACCCTTACTACATTCAACAGTC
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TAAAAACCTCACAATCCACACTTCACTATTTGATATAGTTTTATGTTCAA
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GATAGTCAATGCAGTGATATCTCCGCCGAACTTGGTAGACTCTCCGATCA
AGAGGATCACGCATTGATTCGTAAAGCCAACGATACTTTACATATGGTCT
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CCACCTGTATCAAGTATTGTCAGaGATTTTGTCAGTCTGAGACGACGTAA
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TGGCAGGTGTTATGGTGGATACTGTAAGAGATATTCGTCAACATGTATCA
ACTACACTGTTACCTACGTAAGGCTGGTTACCTCAAAAACTGGTAGAAAC
ATCTCTGGCAGGTGTTATGGTGGATACTGTAAGAGATATTCGTCAACATG
TATCAACTACACTGTTACCTACGTAA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_038641XLOC_038641-proteinClytia hemisphaerica_ch_hm2_pilonpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000115_pilongenomesc0000115_pilon:312508..320696 +
Properties
Property NameValue
Aaloc1459-1563:8085
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