|
|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000249_pilon:194674..200834+ Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_038626 ID=XLOC_038626|Name=XLOC_038626|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=6161bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000249_pilon:194674..200834+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAAGGGTACAAAGACTTTGCTATCGTACTTGTTGTTTATTATTGGATT
GCAATGGAAGACTGTCTATGGTAGGTTTGGAATTACAATTGATTTCCCTC
CATGAAAGAGGAATTTCAAATGCTTTGGAGAGAAGAAAGCCATAACTTTT
TAATGTTCCAACCATCCTCGCCTTTAAACACAatgtttgtgatttttttc
tctggaaTGTCTAGAATCTTAAGGCGGATATTGACAGACTTCATTTCATA
AATGtcatactttttttatttatcttgtCAGCTTCTTTGCAgagttgttt
atatttcttttttgggATGTATCAAATTCTAttgcttgtttattttgatt
tgtagCATTACCGCCAACTTGTAATGAGCATGAGTTTATGTGCGAATTAG
ATAAGCGATGTCTGAATGGTGCTTGGAAGTGTGATGGAGAAGACGATTGT
GGTGATAACAGTGATGAAGAAAATTGCCCAGGTATAAATCCTTAAGAATT
TACTTAAGCTTCAGGGATTGTTCGACAACAGGCAATCTCAATCATTCCAT
ATTTTTGCAAgacaatttttttatctgtaacaCGTTTAAGGACTTTCTGA
TTATTAAACTGGATCTTCACAGGGTGTCTACAGTACGGTACTTTTGAAAC
CTTGAAAAGTTAACATATTTTAAAAGAAtgccttgaaaaccttgaaaaac
atGATTTTGATAGCAAAAGTCTGGTTTTGACTTGAGTTATTACTTAATTC
TTGGTGTGGACTAAAGttgcaaaaattttctatttctagcAAAAATTCTG
TGATTTTAATCAATTTGAGCctcaaaaccttttttaaaataatatcCTAT
AAAGGGccagaaaaccttgaaaatgtttgaaaaaaattcctttaACACCC
CGGTGTAGTGTTTGCTTCTAATCCAGCAATATTTGTCTGTCTTGCTTGTT
GATCCTCTGTTAGTCAAGCATACAGGATTTTATTCTGGAATCTAAATTTT
CATAGTGGATTCATTGATACTTTAACTAGTAGTAGTTTTGTGAAtgaaac
tgaaaattaaaaatttaactaACCATGAATAAAATTGAGTTTTGCATTCA
CAGTGTTGAAATTTGTCTAGATCTCATAATTTATACAAAACACTTTGAAT
TGGCATTCAGatttgtttattaaaattttattgtaCCTGATATGAGATTA
TATTGTTCTACCCTACTCTTGGAAATGTGCACCTAAATATGTTGCCTTGG
TAAatcagttttaaaaacaaatactgCATGCATTTGCTTCGTAGTCCTTA
TCATATTCAACATAGATTTTGCAGGATGTCAAGACGTCAAAGCTTCAGTC
ATGTAATAAGTACTCTTGTACAAATTCCTATTCggaatttgttttcttct
ttatttaagTACTCTTGTGTTTATCATCTTTATGATAAAACCCAAGTTAG
CATGACGAAAGTGTATACAATAATACTTAACCTCATACAATGGAAAGTTG
TCTCCATTCTTAAAAAgttattataatatagataataTCCCTCTTAAGAG
ACAAaaggaaaaaatcttaattatgCAAAACGGCTATCAGAAACAGGCTA
TCGTTTTTACATTGTTACAGAGTTTCAGCCTATTACATTGTAAAActtta
aatgtgaaaaagttcTCTTAATTCTTGCTTACAAGTTTTTACattgactt
aaaaaattgtatgattttttcctgtttttcttcATTTGTATTACTCCAGT
TAATGCTGAGAGCAATTTAAAAAACATAAAGTTGGGTCTAGTTTAGACTT
CTTGAAACTTATATTACTATCTTAGTACCAGTACCAGAAAGTGTCTACAA
ATGGCTAGCCTTTTTCaacaatcaagattttccttaGGCTTAACCCTTTT
AGAATTTGATTTCACTTTGGAGGAAAACAGACAACATTGTAGACAAATGC
TCCCCTCttctttgttattcttttaaaatataCACTTATGAgcaaagtta
aaaacatctgcATATTGCTTCTCTCTTACTactataatattttcaaaata
attcctTTTTGGAGGTGTGTCTAGGGgtttttacaatatttcatcATTTT
CGTCACTTCCCTATAAACTAGAAATATCAGCCTACTATGAATTAGTGAGA
AAAAAGAAAGCTGCACTCTCATGAATGATAACCTTCCCCTTTTTCTTCTA
ATAGTAAGATTGATGTTTTGACAAGCAGGTAGATAGAGAAACTATTCTGA
TATTATAAAAGTTTATCAGTATACTATGTTTCttcttctcaatttttttt
accggATAAATTGAAAATATGACAGGAAAAGGaacttccttttttccctt
gtCAATCATGTAcacaaattaattaaaaaactgTCAAAAGAGGAAGCTTC
TAGAAAGAATGTTTATAAATCCCCATGTTATATAATTGAAAGGTGTGTGT
TTATCTAAGCTTGAAGTGGGCTAACTCATTTTGAACTATCCCCTAATCAG
CCCTAATTTTGCTCAAAATCTTGTCTTTGTTTGTATATACTTCCCTGAAT
TATAATGGAATACAATATTACCTTATTTCTTAAAAAGACTAAGAGGTTTA
TAAGATTTATAACTTAATTTAAAGGCTGGTTGTGtgtatgttgaaaaatt
ttatcCAACTGAAACATAAGCACAGCTTGTAACTGTGTACTTATTGTTAA
CTCTCCAATATACCTTAGAAGTTTCTAGAATAAGAAGAATTATGACTTAT
TTCTCAAATCTTTTACTTCACATGATATTTGCAGGTGTCAAAtacaaaaa
gaaagtgaaagagggaagaaaaattttcaagctctttatttgttttaatt
tttttgaatgaaacttCACAGAAAATATTGAGTCATATAGCTGAAAAGAA
TAACAATGAATATGGTACGACTTCTGAAAGGGttattcttgttttgtttt
ctaaCAGACATTTGTCTAAACAGGCCTAAAGATTTCATCAGCAAGTTTCT
TTAACATAGAATTTTCTCCATTGTGGCCTCTTTTGACAAAACAACAGAAA
CTGAAagtaaaataattattgaaGTGCCTATATTTTTAGCGAAAAAGTTT
TGATCAAAGACTTTCTGTCAAAGCAAACCCAGAAAAAATCCTAATGTTTA
GTTATCAACACCAATGAAAAGTAACTTCAAAAGTTACATGATCTTTACAT
TACTTCAACAAAATATcacttaaaatttgaataatataAATCAAAATGTA
GTTTGAATTCATAAAGtaaacaatttcaatttatcctttaatcaagaaaa
atttgaaatacgtTAATCTGATTTCTAAGAAACTGATGTCCATTCCTTCT
AATTTTACAGCTAAGACATGCCCACCCAATAAGTTCAAATGTGGAAATGG
ACGCTGTATACCTGAAAGTTGGACCTGTGACAATATGGACGATTGCGGAG
ACAACACAGACGAGTCCACACCTTGGCTTCATTGTCCCGTAACTCCTTAT
TGTGACTCAGACCACTTTCAGTGTGAGAAAACCAAACAGTGCATCTTTCG
TTATGAACACTGTGATGGGCACAATGACTGTGGCGAGGGTGATGATTCGG
ATGAACGCAACTGTGAAAAGAAGACTTGTGCCACTGACGAGTTCCAATGT
AACAACGGACATTGTATCACTGACACATGGAAGTGTGATGGAAGCAAAGA
CTGCACTGATGGAAGTGATGAAGTCAACTGCAGTAAGTGTTTTATGGTTT
TAATATTTAATGACTTGTTACAGACATGTTTGTCAGTCACTGATTAAAAT
GATATTCTCgttaaataaaaaatccaggtcACTCATTTAACCCTAATTCA
GACACCACTTTTCTTGTTTTACAACCATACAGAAGATTTTTACAACCATA
CAAAAGATTTATCCTTGACACAATAACCACTATTCAAGTCTTGCGAACCT
GCATTCATTAGGATTAAATTTAAATCCTTCATTTTAGATAACAAAACTTG
CAAAGCAGACCAATTCAAGTGTGTCACCAGTGGACATTGTATCTCGGCTG
ATTCTCGATGTGATGGTGTTAGTGAATGTATTGACAATTCTGACGAAGCT
GGATGTGGAAAAAGTAAGAAAGGATAAGTTCAAAATCATGTTGACTTAAA
TATTTTTGGACTACTAAGTGCCTTTGTATCAGAACTGTTCCAAGCAAgca
ttatttttatgaaaattcttacaatatttttagctagattcaatattttt
caaatgagtgacatttttttagttccacagaatttttgtaatttgaataG
TTATAGTTTTAATAAAAGTTCACAAACGTGTTGTGTGAAATGTATGTTGT
TAATTTCTTAACACTACACACAAAATACACATACATACACTACCTGCACT
AAGTTGAATCTTTGTAATTGAACTGCTTGTTATGAAAATAACAGTATTTT
TTAACCCTGTAATCATAAGCAAGACTAGTGTGGCAATGTTTTGTTAATGT
AAATCTAACTGTTAACTTTATAGCCACTGCACCACCAAAAGGTATAGAGA
AAAAGGCACTGAAGTCAATAAAAACTAACCACCCTATCAATTCTACTAAA
CAATTAACTTCAACCACTactacaacaacgacaacaaccACCATGGCCCC
ATGTCATGATTATCAattcaaatgttcaaaaagTGGAAAATGTATACACA
AATCTTGGATGTGCGATGGGGAACCTGATTGTCCAGATTACGAAGACGAA
GCTAAAGAGACATGCTCAGCAAACGAATGTGCGAGTGATGAATTTAGATG
CTCAAACGGAAAATGTATAGATAGTATtcaaaaatgtgacggaactAACC
ATTGCTCAGATGGCTCAGATGAAAAAGATTGCAGTAAGTTATCTAGTTTT
TGTTAAAACTTTGTAATTTTGATTTACATCGATCATGTGCAccttattat
ttttcaatttctgttTAGCAAACAAGATTATTATTCTATGATTGCAAAAA
GTCGTGGTTCCTTTCCAACCAGacaatatatatatttaaaaaatatattt
ttgctttcaggCACAAATATTGAAATCCCATGCCACAAAGGAACTTTCCA
ATGTAGAAACTCAACAAAGTGTATTGACTTTTCAATGGTATGTAACAACG
TACCAAACTGTCCAATGGGCGATGATGAAGATGCAAAATGTggtaagaaa
aatttgattttatgaaCTTTTTTCCAGTGAATTTCTGTTTATAGTTAAAA
TGGAACGATCAATCATTATGTATAATCTGAGCAGGCCAAGTCAGTTGTTA
AATTAATTTCTAGAACCATAATGAAAGTAACCTCCGGGGCATGAAATAAC
GGTTGGACATcagacattgtccgacccaaattgctccttgtccgacccaa
aaatcaatatttttcaagctaaagcaaccctgattgGACATTTTGTCTGa
ccacttgaaatcgttatttcaaGCCTTGAACCTCACAAAATATCTtaaag
taaatttttaatgttagtattttttaaatttttttcaggaatcaATGAAT
GTGAAATTGGTAACGATGGATGTCACCATGATTGTGTAGATAAAGATATT
GGTTATGAATGTAAATGTAGATTAGGATATAAACTTGCCAAGGACGGAAA
GAGCTGTGAAGATTTGGATGATTGTCAAGAATTTGGAATCTGTTCGCAGA
AATGTCTCAACACGAAAGGATCATACAAATGTCAGTGTGGAAAAGGATAT
CATTTGGCACCAAACAAAAGATCTTGTAAAGCAGAAGGTACAAATCATGT
TGTTTTTTACTAATAGACGCccctttttttagctttttaaaacTAACATT
AATAGTAATTCGACTTGGCCAATTTTGTGGTTTTGTTCCTGCCAATTTGA
CAATTTATTAACTGATTTCTACAGATgcaattgaatttcaattaaCATTG
ATTCTACCTTTCTTTTTCAGCCCCAGAACCATTCCTTGTATTTGCCAATC
AATATGATGTTCGTTCTATCTCAACAAGTGGAAAAGATTATCGTCAAATC
TCTGAAAGTAAAAGTGCATCTGCAGTCGCAGTCGATATTGAAGACTCAAT
GATATATTGGACTGATACAATTGAAAAAACCATaaacagaagaaaaatta
acaaggaCTTG Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000249_pilon:194674..200834+ >XLOC_038626 ID=XLOC_038626|Name=XLOC_038626|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=3252bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000249_pilon:194674..200834+ (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
ATGAAGGGTACAAAGACTTTGCTATCGTACTTGTTGTTTATTATTGGATT
GCAATGGAAGACTGTCTATGATGAAGGGTACAAAGACTTTGCTATCGTAC
TTGTTGTTTATTATTGGATTGCAATGGAAGACTGTCTATGCATTACCGCC
AACTTGTAATGAGCATGAGTTTATGTGCGAATTAGATAAGCGATGTCTGA
ATGGTGCTTGGAAGTGTGATGGAGAAGACGATTGTGGTGATAACAGTGAT
GAAGAAAATTGCCCAGCATTACCGCCAACTTGTAATGAGCATGAGTTTAT
GTGCGAATTAGATAAGCGATGTCTGAATGGTGCTTGGAAGTGTGATGGAG
AAGACGATTGTGGTGATAACAGTGATGAAGAAAATTGCCCAGCTAAGACA
TGCCCACCCAATAAGTTCAAATGTGGAAATGGACGCTGTATACCTGAAAG
TTGGACCTGTGACAATATGGACGATTGCGGAGACAACACAGACGAGTCCA
CACCTTGGCTTCATTGTCCCGTAACTCCTTATTGTGACTCAGACCACTTT
CAGTGTGAGAAAACCAAACAGTGCATCTTTCGTTATGAACACTGTGATGG
GCACAATGACTGTGGCGAGGGTGATGATTCGGATGAACGCAACTGTGAAA
AGAAGACTTGTGCCACTGACGAGTTCCAATGTAACAACGGACATTGTATC
ACTGACACATGGAAGTGTGATGGAAGCAAAGACTGCACTGATGGAAGTGA
TGAAGTCAACTGCACTAAGACATGCCCACCCAATAAGTTCAAATGTGGAA
ATGGACGCTGTATACCTGAAAGTTGGACCTGTGACAATATGGACGATTGC
GGAGACAACACAGACGAGTCCACACCTTGGCTTCATTGTCCCGTAACTCC
TTATTGTGACTCAGACCACTTTCAGTGTGAGAAAACCAAACAGTGCATCT
TTCGTTATGAACACTGTGATGGGCACAATGACTGTGGCGAGGGTGATGAT
TCGGATGAACGCAACTGTGAAAAGAAGACTTGTGCCACTGACGAGTTCCA
ATGTAACAACGGACATTGTATCACTGACACATGGAAGTGTGATGGAAGCA
AAGACTGCACTGATGGAAGTGATGAAGTCAACTGCAATAACAAAACTTGC
AAAGCAGACCAATTCAAGTGTGTCACCAGTGGACATTGTATCTCGGCTGA
TTCTCGATGTGATGGTGTTAGTGAATGTATTGACAATTCTGACGAAGCTG
GATGTGGAAAAAATAACAAAACTTGCAAAGCAGACCAATTCAAGTGTGTC
ACCAGTGGACATTGTATCTCGGCTGATTCTCGATGTGATGGTGTTAGTGA
ATGTATTGACAATTCTGACGAAGCTGGATGTGGAAAAACCACTGCACCAC
CAAAAGGTATAGAGAAAAAGGCACTGAAGTCAATAAAAACTAACCACCCT
ATCAATTCTACTAAACAATTAACTTCAACCACTactacaacaacgacaac
aaccACCATGGCCCCATGTCATGATTATCAattcaaatgttcaaaaagTG
GAAAATGTATACACAAATCTTGGATGTGCGATGGGGAACCTGATTGTCCA
GATTACGAAGACGAAGCTAAAGAGACATGCTCAGCAAACGAATGTGCGAG
TGATGAATTTAGATGCTCAAACGGAAAATGTATAGATAGTATtcaaaaat
gtgacggaactAACCATTGCTCAGATGGCTCAGATGAAAAAGATTGCACC
ACTGCACCACCAAAAGGTATAGAGAAAAAGGCACTGAAGTCAATAAAAAC
TAACCACCCTATCAATTCTACTAAACAATTAACTTCAACCACTactacaa
caacgacaacaaccACCATGGCCCCATGTCATGATTATCAattcaaatgt
tcaaaaagTGGAAAATGTATACACAAATCTTGGATGTGCGATGGGGAACC
TGATTGTCCAGATTACGAAGACGAAGCTAAAGAGACATGCTCAGCAAACG
AATGTGCGAGTGATGAATTTAGATGCTCAAACGGAAAATGTATAGATAGT
ATtcaaaaatgtgacggaactAACCATTGCTCAGATGGCTCAGATGAAAA
AGATTGCAgCACAAATATTGAAATCCCATGCCACAAAGGAACTTTCCAAT
GTAGAAACTCAACAAAGTGTATTGACTTTTCAATGGTATGTAACAACGTA
CCAAACTGTCCAATGGGCGATGATGAAGATGCAAAATGTggCACAAATAT
TGAAATCCCATGCCACAAAGGAACTTTCCAATGTAGAAACTCAACAAAGT
GTATTGACTTTTCAATGGTATGTAACAACGTACCAAACTGTCCAATGGGC
GATGATGAAGATGCAAAATGTggaatcaATGAATGTGAAATTGGTAACGA
TGGATGTCACCATGATTGTGTAGATAAAGATATTGGTTATGAATGTAAAT
GTAGATTAGGATATAAACTTGCCAAGGACGGAAAGAGCTGTGAAGATTTG
GATGATTGTCAAGAATTTGGAATCTGTTCGCAGAAATGTCTCAACACGAA
AGGATCATACAAATGTCAGTGTGGAAAAGGATATCATTTGGCACCAAACA
AAAGATCTTGTAAAGCAGAAGgaatcaATGAATGTGAAATTGGTAACGAT
GGATGTCACCATGATTGTGTAGATAAAGATATTGGTTATGAATGTAAATG
TAGATTAGGATATAAACTTGCCAAGGACGGAAAGAGCTGTGAAGATTTGG
ATGATTGTCAAGAATTTGGAATCTGTTCGCAGAAATGTCTCAACACGAAA
GGATCATACAAATGTCAGTGTGGAAAAGGATATCATTTGGCACCAAACAA
AAGATCTTGTAAAGCAGAAGCCCCAGAACCATTCCTTGTATTTGCCAATC
AATATGATGTTCGTTCTATCTCAACAAGTGGAAAAGATTATCGTCAAATC
TCTGAAAGTAAAAGTGCATCTGCAGTCGCAGTCGATATTGAAGACTCAAT
GATATATTGGACTGATACAATTGAAAAAACCATaaacagaagaaaaatta
acaaggaCTTGCCCCAGAACCATTCCTTGTATTTGCCAATCAATATGATG
TTCGTTCTATCTCAACAAGTGGAAAAGATTATCGTCAAATCTCTGAAAGT
AAAAGTGCATCTGCAGTCGCAGTCGATATTGAAGACTCAATGATATATTG
GACTGATACAATTGAAAAAACCATaaacagaagaaaaattaacaaggaCT
TG
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000249_pilon | genome | sc0000249_pilon:194674..200834 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 1438-1626:5973 |
| Aaloc | 1189-1434:5541 |
| Aaloc | 1057-1185:5063 |
| Aaloc | 697-1053:4526 |
| Aaloc | 571-693:3990 |
| Aaloc | 199-567:3363 |
| Aaloc | 73-195:358 |
| Aaloc | 1-69:1 |
|
