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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at sc0000003_pilon:949365..952745- Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_038484 ID=XLOC_038484|Name=XLOC_038484|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=mRNA|length=3381bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000003_pilon:949365..952745- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TTGAACGATACTGTAATTGATTCCTACATTAAGTACCTGCTCGAAAATGT
AAGACATTATTATTTTTTAATTTTGTTTTTTTATTTTCAAATTTTATTTT
TAATAATTATGTTCATCGACCATATCTTTGCAGTGTTTCTGGAAAAACTT
AATCCCCGTAATGGCAAATGATTTTTATTGTTTGTTGAAAAAAAAAGGAG
AATGTTATTTTCTTTTGGATAAATTCCACAGTATATCTGCGATGCTATTT
TAGATTTCATCCACTGCCTACATAGAATCAGCTATTATGCACGAATTGAT
TAATGGAAGTAAACAATATGTTATGCCCCCTACAGTGCAGGTGATAATTG
AATACATTATATTTACCATGAAAAAGACACTTTGTATCCAATTTTCTCAA
CTTCTACGAATGTTAAAGAATGAAATCAATTATCAATTTATTGGTGCACC
CGGGGTGCACCCGGTGTTTCATTCTTTCATTTGTTCGTTCGCTTTGAGAT
AAGGCTTTGGACATTTCTCTTTTTTGAAGTCGTTTTCAAGCGATATGTTG
TTTAATTTTGTACTTTCTTTATTTGATCAATTTTACTATTTTTCCATTGT
AGGACCTATTCTTAACCGACCAGTTGATTGGATTGTATAGTGTTGGAAAA
CATTGGCGCTTATTGGTGAGACGCTTTTTGGTAACTAACTCCTATCTTGG
GAGATGAAACACTTGCATATTTCAACGCCACGAATTTCAGTACTTCTCGG
TTATATAACGAAAAACTTTGACATTTTTCAAGAAATAAGAGTAAGAAATA
TTACGGGTATTTCTTTCTTACGAGTCTTAGACATCGATCAAAGTGCCTGA
AAAAGGTCTTGCATGCGAAGCGTTACCAATAAAATTTTGAAACTTAATTT
CAATTTTTTATTTCAAAATTATCATAGGTTGTATATCCCAAAAAACAAAT
TATTTGGTTAATCGACCCTTTTGGAGAATCCAGCAATATCATGGAGGAAA
CCAAGCGAGCTTGGGAGTAAGTTGTATATTGTTTCTCCTTTAATTTATTC
ATTAATTTTAATTTTTTTGAAGTTGAATTGTAACAGTAGCAACCAGGCTA
ATAAAGTTCAACTCTTTATTTACAATAAGCAACTATTCAATGGGTTAACA
TTGGTTTTTGAGATTTATTAAACCGGGATGCCGCGATATTCTCTATTCTC
AGTATTTCTCAACTGTAAAATATGTTCATTTGTAGTTGTAAACTAACTTT
ATCCGTCAGTTGGTAGATAGAGGTTTGAAAATGTTTTTTGTCAATTACAC
TCGACGGTCGTCATTTCGACCTTTCAAGCGACCAAAAGGAAGGTTAGAGA
TGGAAAGAGTGAAAGTTCGAGATGACGAAGGTTTTGAAGAAAAGATAGTC
GATCACGCAATGTATGGCTTAATACGAATTTTAATACAACTTTTTAGAGC
AAGCATGTTGAGAAGTTTCCCTTCAAACAAGAATAAAGCGTGGGATATCA
TCCAGGTCGAGCATGCAAAACAATCTGACGCTATTTCATGTGGTGTCATT
TGCATAAAGGTGAAGGGAGATTTTCGTTTTGTGGAAAAACCAATAACTCA
AAAATTTCTCAAGGAATTATTTCCGCAAAAACGGCCAAAATTAACCCTTG
AAGGTAATTTTGGCTGACCTGGATTTTGTGAGCGTCAAATATTCATTTTG
TGGGAATGAATTTGCCATTTTTTGGTCAATCTCTTGTGTTTTCATAGGAC
TTTTTCAAGCGTGAATTTTTCTTTAGATTCAGTAATGCTGAAAATTATGT
CTTACTAGAAATTCACTCTTATCTTCTAGTTTGCGGAGTGTGTTTTAAGG
CACGAAAACCTTCCAAGTCATTTTCATTCGGATGAATTGATGAACCACCG
TCAAAAGATCGCTGTAAAATTGATTGAATTAGGAAGTAAGTTTATCAGTA
TTATCAGACCGTTTTATTAGTATTTTTACATTGCTGACTTGTGAATGATA
AATATTGTAATCAAATTGTTGGTCAAACAATATTTCTGTCAAGAGAATCG
CCTTAATTAGATAAGTATTTAAATTTTTATTTGACTTCTTTTTACGCAGG
CAACGGTGACTGGTGCACAAAGATTTGCCGAATATGCGATCGGTGCGATT
CCCCTCCATTGTCAAAACAGACTGGAATAAAACCAAAGAAATGGCCATGG
GTAATTATCGTGTTAATTAGCTAAAACAATTCTCTATTTACTGTGATGAA
CTTTAAGAACTAAAACTTAATATAATTTGATGGTTATATGAAAATGGAAG
ATTTTCTGCATTGAAACAGTTGAAAGTGTTCTATTAAAATGAGAAGAGGT
TCTTGTCAAATGCTTTCGTATTGTACTTTCTATTGTGCTTTGTATTGTGT
TCGTATCGTTTCTTTGTAGGTTTGTTGTGACATTTGCTCACCGGTAATGT
GGTACCATGGTCATTGCGTCGGGGTAACAAAAACACAAAATATGAAAAAC
ATATCATTTTATTGCAATAAAGTAAGTTTAAAATAAAAAATCCGACAATT
TTGAAAATTGCCAATATAAAACATAAATTTTTTCGTCGCTGAAATTGATT
TGTAATTTTTAATTTTTTCATGTAGTAAAAGCAAAGTTTACCTTATTTTT
TGCCAAGTTATTTTAGAACTGGCTTACTCGCTAAATGAAATCTCCACCAA
AAACGCACTTCCGTTATTCGCCAAATATAATACACGCAAAAATTAATTTT
CTTATAAGCTATCGATCGAATTCACCAATTTTGCCCGAACTTCTCTTTAG
GAAATTTTGTTCTGTAGAAGATTCTTCTTTCTAACCATCTTCAAGAATAT
ATCTGATTGGAAAAGACTCTTCCTACTGTGAAAAAATTGTAAATGCACGG
TTAAATTTAATTTTGGTAATTTTGGTTCAAAAATAGGATTCATTATCTCC
AATTTCACACGATAGGTCAGCTAAAAAAATGCAGTACAAACTTGCAGTAC
ACTAATAATTTTTACAATGTTTTCGTATTTCAGACAATTATACAGGACGA
AATTGTTTCTTTGCAAATCGGTGAGACACTTATTCGCCAAAGAAAAAATC
GCAGAATAAAAAGATGCTACGGATGCTCAGACGAGATTAGCGAGTCGCCC
CTTGATCCGCCTCACGATATGGTGCTCCTCCAATTAATGAGACGTCCCAA
GCAAAAGTGCACCTGGGATTCCGTTAAGGAAAAGGACTTTGCGATTTTTC
GTTTGCATTATCATGCGAAAAAATATTGCATAAGAAATTTGTCGTTGGAT
AAAGTCAAACTGTCTCGTGATTTCCAACTTACTGAGGTTCACCGTCATCA
ACTCAAATATTTGGGTATTTCATATACATGA Coding sequence (CDS) from alignment at sc0000003_pilon:949365..952745- >XLOC_038484 ID=XLOC_038484|Name=XLOC_038484|organism=Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon|type=CDS|length=2112bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000003_pilon:949365..952745- (Clytia hemisphaerica_ch_hm2_pilon)
TTGAACGATACTGTAATTGATTCCTACATTAAGTACCTGCTCGAAAATTT
GAACGATACTGTAATTGATTCCTACATTAAGTACCTGCTCGAAAATATTT
CATCCACTGCCTACATAGAATCAGCTATTATGCACGAATTGATTAATGGA
AGTAAACAATATGTTATGCCCCCTACAGTGCAGATTTCATCCACTGCCTA
CATAGAATCAGCTATTATGCACGAATTGATTAATGGAAGTAAACAATATG
TTATGCCCCCTACAGTGCAGGACCTATTCTTAACCGACCAGTTGATTGGA
TTGTATAGTGTTGGAAAACATTGGCGCTTATTGGACCTATTCTTAACCGA
CCAGTTGATTGGATTGTATAGTGTTGGAAAACATTGGCGCTTATTGGTTG
TATATCCCAAAAAACAAATTATTTGGTTAATCGACCCTTTTGGAGAATCC
AGCAATATCATGGAGGAAACCAAGCGAGCTTGGGAGTTGTATATCCCAAA
AAACAAATTATTTGGTTAATCGACCCTTTTGGAGAATCCAGCAATATCAT
GGAGGAAACCAAGCGAGCTTGGGAAGCAAGCATGTTGAGAAGTTTCCCTT
CAAACAAGAATAAAGCGTGGGATATCATCCAGGTCGAGCATGCAAAACAA
TCTGACGCTATTTCATGTGGTGTCATTTGCATAAAGAGCAAGCATGTTGA
GAAGTTTCCCTTCAAACAAGAATAAAGCGTGGGATATCATCCAGGTCGAG
CATGCAAAACAATCTGACGCTATTTCATGTGGTGTCATTTGCATAAAGTT
TGCGGAGTGTGTTTTAAGGCACGAAAACCTTCCAAGTCATTTTCATTCGG
ATGAATTGATGAACCACCGTCAAAAGATCGCTGTAAAATTGATTGAATTA
GGAATTTGCGGAGTGTGTTTTAAGGCACGAAAACCTTCCAAGTCATTTTC
ATTCGGATGAATTGATGAACCACCGTCAAAAGATCGCTGTAAAATTGATT
GAATTAGGAAGCAACGGTGACTGGTGCACAAAGATTTGCCGAATATGCGA
TCGGTGCGATTCCCCTCCATTGTCAAAACAGACTGGAATAAAACCAAAGA
AATGGCCATGGGCAACGGTGACTGGTGCACAAAGATTTGCCGAATATGCG
ATCGGTGCGATTCCCCTCCATTGTCAAAACAGACTGGAATAAAACCAAAG
AAATGGCCATGGGTTTGTTGTGACATTTGCTCACCGGTAATGTGGTACCA
TGGTCATTGCGTCGGGGTAACAAAAACACAAAATATGAAAAACATATCAT
TTTATTGCAATAAAGTTTGTTGTGACATTTGCTCACCGGTAATGTGGTAC
CATGGTCATTGCGTCGGGGTAACAAAAACACAAAATATGAAAAACATATC
ATTTTATTGCAATAAAACAATTATACAGGACGAAATTGTTTCTTTGCAAA
TCGGTGAGACACTTATTCGCCAAAGAAAAAATCGCAGAATAAAAAGATGC
TACGGATGCTCAGACGAGATTAGCGAGTCGCCCCTTGATCCGCCTCACGA
TATGGTGCTCCTCCAATTAATGAGACGTCCCAAGCAAAAGTGCACCTGGG
ATTCCGTTAAGGAAAAGGACTTTGCGATTTTTCGTTTGCATTATCATGCG
AAAAAATATTGCATAAGAAATTTGTCGTTGGATAAAGTCAAACTGTCTCG
TGATTTCCAACTTACTGAGGTTCACCGTCATCAACTCAAATATTTGGGTA
TTTCATATACATGAACAATTATACAGGACGAAATTGTTTCTTTGCAAATC
GGTGAGACACTTATTCGCCAAAGAAAAAATCGCAGAATAAAAAGATGCTA
CGGATGCTCAGACGAGATTAGCGAGTCGCCCCTTGATCCGCCTCACGATA
TGGTGCTCCTCCAATTAATGAGACGTCCCAAGCAAAAGTGCACCTGGGAT
TCCGTTAAGGAAAAGGACTTTGCGATTTTTCGTTTGCATTATCATGCGAA
AAAATATTGCATAAGAAATTTGTCGTTGGATAAAGTCAAACTGTCTCGTG
ATTTCCAACTTACTGAGGTTCACCGTCATCAACTCAAATATTTGGGTATT
TCATATACATGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000003_pilon | genome | sc0000003_pilon:949365..952745 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Aaloc | 709-1056:349 |
| Aaloc | 607-708:963 |
| Aaloc | 508-606:1281 |
| Aaloc | 400-504:1553 |
| Aaloc | 289-399:1934 |
| Aaloc | 199-285:2455 |
| Aaloc | 136-198:2780 |
| Aaloc | 49-135:3129 |
| Aaloc | 1-48:3382 |
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